Composiciones que contienen, procedimientos que implican y usos de aminoácidos no naturales y polipéptidos.

Un polipéptido o sal del mismo, que contiene al menos un compuesto seleccionado del grupo que consiste en: **Fórmula**

en el que cada Ra está seleccionado independientemente del grupo que consiste en H, halógeno, alquilo, -NO2, -CN, alquilo sustituido, -N

(R')2, -C(O)kR', -C(O)N(R')2, -OR' y -S(O)kR' en la que k es 1, 2 ó 3;

M es H o -CH2R5; R1 es H, un grupo protector de amino, resina, aminoácido, polipéptido o polinucleótido;

R2 es OH, un grupo protector de éster, resina, aminoácido, polipéptido o polinucleótido;

R5 es L-X, en la que X es un polímero que comprende alquilo, alquenilo, alquinilo, alcoxi, alquilalcoxi, poli(óxido de alquileno), arilo, heteroarilo, alcarilo o aralquilo; y

L es opcional, y cuando está presente es un conector seleccionadodel grupo que consiste en alquileno,alquenileno,-O-, -O-(alquilen)-, -(alquilen)-O-, - C(O)-, -C(O)-(alquilen)-, -(alquilen)-C(O)-, -C(O)N(R')-, -C(O)N(R')-(alquilen)-, -(alquilen)-C(O)N(R'), - OC(O)N(R')-, -OC(O)N(R')-(alquilen)-, -(alquilen)-OC(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -NR'C(O)-(alquilen)-, -(alquilen)- NR'C(O)-, -S-, -S-(alquilen)-, -S(O)k- en la que k es 1, 2 ó 3, -S(O)k(alquilen)-, -C(S)-, -C(S)-(alquilen)-, - CSN(R')-, -CSN(R')-(alquilen)-, -N(R')CO-(alquilen)-, -N(R')C(O)O-, -(alquilen)-ON≥CR'-, -(alquilen)- C(O)NR'-(alquilen)-, -(alquilen)-S(O)k-(alquilen o alquilen sustituido)-S-, -(alquilen)-S-S-, -S(O)kN(R')-, - N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(S)N(R')-, -N(R')S(O)kN(R')-, -N(R')-N≥, -C(R')≥N-, -C(R')≥N-N(R')-, -C(R')≥N-N≥, - C(R')2-N≥N- y -C(R')2-N(R')-N(R')-; y

cadaR' es independientemente H, alquilo o alquilo sustituido;

en el que el compuesto está seleccionado del grupo:

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2006/047822.

Solicitante: AMBRX, INC.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 10975 NORTH TORREY PINES ROAD, SUITE 100 LA JOLLA CA 92037 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: NORMAN,THEA, MIAO,ZHENWEI, LIU,JUNJIE.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • SECCION A — NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA > CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE > PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO... > Preparaciones medicinales que contienen antígenos... > A61K39/395 (Anticuerpos (aglutininas A61K 38/36 ); Inmunoglobulinas; Inmunosuero, p. ej. suero antilinfocitario)
  • SECCION C — QUIMICA; METALURGIA > BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE;... > PROCESOS DE FERMENTACION O PROCESOS QUE UTILIZAN... > Preparación de péptidos o de proteínas (proteína... > C12P21/06 (preparados por hidrólisis de un enlace peptídico, p. ej. hidrolizados)

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Fragmento de la descripción:

SOLICITUDES RELACIONADAS

CAMPO DE LA INVENCIÓN

En el presente documento se describen procedimientos y composiciones de preparación y uso de agentes de aminoácidos no naturales.

ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN

La capacidad para incorporar aminoácidos no genéticamente codificados (es decir, “aminoácidos no naturales”) en proteínas permite la introducción de grupos funcionales químicos que podrían proporcionar valiosas alternativas a los grupos funcionales que se producen naturalmente, tales como el épsilon -NH2 de lisina, el sulfhidrilo -SH de cisteína, el grupo imino de histidina, etc. Ciertos grupos funcionales químicos son conocidos por ser inertes a los grupos funcionales encontrados en los 20 aminoácidos comunes genéticamente codificados, pero reaccionan limpia y eficazmente para formar enlaces estables con grupos funcionales que pueden incorporarse sobre aminoácidos no naturales.

Ahora están disponibles procedimientos para introducir selectivamente grupos funcionales químicos que no se encuentran en proteínas, que son químicamente inertes a todos de los grupos funcionales encontrados en los 20 aminoácidos comunes genéticamente codificados y que pueden usarse para reaccionar eficazmente y selectivamente con reactivos que comprenden ciertos grupos funcionales para formar enlaces covalentes estables.

En un aspecto, la presente invención proporciona un compuesto o sal del mismo seleccionado del grupo que 30 consiste en:

en el que cada Ra está seleccionado independientemente del grupo que consiste en H, halógeno, alquilo, -NO2, -CN, alquilo sustituido, -N (R') 2, -C (O) kR', -C (O) N (R') 2, -OR' y -S (O) kR' en la que k es 1, 2 ó 3;

M es H o -CH2R5;

R1 es H, un grupo protector de amino, resina, aminoácido, polipéptido o polinucleótido;

R2 es OH, un grupo protector de éster, resina, aminoácido, polipéptido o polinucleótido;

R5 es L-X, en la que X es un polímero que comprende alquilo, alquenilo, alquinilo, alcoxi, alquilalcoxi, poli (óxido de alquileno) , arilo, heteroarilo, alcarilo o aralquilo; y L es opcional, y cuando está presente es un conector seleccionado del grupo que consiste en alquileno, alquenileno, -O-, -O- (alquilen) -, - (alquilen) -O-, -C (O) -, -C (O) - (alquilen) -, (alquilen) -C (O) -, -C (O) N (R') -, -C (O) N (R') - (alquilen) -, - (alquilen) -C (O) N (R') , -OC (O) N (R') -, -OC (O) N (R') - (alquilen) -, (alquilen) -OC (O) N (R') -, -N (R') C (O) -, -NR'C (O) - (alquilen) -, - (alquilen) -NR'C (O) -, -S-, -S- (alquilen) -, -S (O) k-en la que k

es 1, 2 ó 3, -S (O) k (alquilen) -, -C (S) -, -C (S) - (alquilen) -, -CSN (R') -, -CSN (R') - (alquilen) -, -N (R') CO- (alquilen) -, -N (R') C (O) O-, - (alquilen) -O-N=CR'-, - (alquilen) -C (O) NR'- (alquilen) -, - (alquilen) -S (O) k- (alquilen o alquilen sustituido) -S, - (alquilen) -S-S-, -S (O) kN (R') -, -N (R') C (O) N (R') -, -N (R') C (S) N (R') -, -N (R') S (O) kN (R') -, -N (R') -N=, -C (R') =N-, -C (R') =N-N (R') -, -C (R') =N-N=, -C (R') 2-N=N-y -C (R') 2-N (R') -N (R') -; y

cada R' es independientemente H, alquilo o alquilo sustituido.

en el que el compuesto está seleccionado del grupo:

En otro aspecto, la presente invención proporciona un procedimiento de preparación de un compuesto que contiene al menos un aminoácido no natural seleccionado del grupo que consiste en:

en el que el compuesto se forma por una alquilación reductora de un resto amino aromático sobre al menos un aminoácido no natural con al menos un reactante que comprende al menos un resto de aldehído, en el que R1, R2, R5, Ra y M son como antes, en el que el al menos un aminoácido no natural está seleccionado de un grupo:

RESUMEN DE LA INVENCIÓN

En el presente documento se describen procedimientos, composiciones, técnicas y estrategias de preparación, purificación, caracterización y uso de aminoácidos no naturales, polipéptidos de aminoácidos no naturales y polipéptidos de aminoácidos no naturales modificados. Un aspecto de la invención es un procedimiento de 40 derivatización de un aminoácido no natural y/o un polipéptido de aminoácidos no naturales. El procedimiento, implica derivatización química. Tales derivatizaciones pueden ser regioselectivas. Tales derivatizaciones pueden ser regioespecíficas. Tales derivaciones pueden ser estequiométricas, casi estequiométricas o similares a estequiométricas en tanto el reactivo que contiene el aminoácido no natural como el reactivo derivatizante. El procedimiento permite la incorporación estequiométrica, casi estequiométrica o similar a estequiométrica de un 45 grupo deseado sobre un polipéptido de aminoácidos no naturales. También se desvelan estrategias, mezclas de reacción, condiciones sintéticas que permiten la incorporación estequiométrica, casi estequiométrica o similar a estequiométrica de un grupo deseado sobre el polipéptido de aminoácidos no naturales. Tales derivatizaciones pueden ser rápidas a temperatura ambiente. Tales derivatizaciones pueden producirse en disoluciones acuosas. En otras realizaciones o realizaciones adicionales, tales derivatizaciones se producen a un pH entre aproximadamente 4 50 y aproximadamente 10. En otras realizaciones o realizaciones adicionales, tales derivatizaciones se producen a un pH entre aproximadamente 4 y aproximadamente 7. En otras realizaciones o realizaciones adicionales, tales derivatizaciones se producen a un pH entre aproximadamente 4 y aproximadamente 5. En otras realizaciones o realizaciones adicionales, tales derivatizaciones se producen a un pH de aproximadamente 5. En otras realizaciones o realizaciones adicionales, tales derivatizaciones se producen a un pH de aproximadamente 4.

En un aspecto de la invención son aminoácidos no naturales para la derivatización química de péptidos y proteínas basada en la reactividad de un grupo de amina aromática. En otras realizaciones o realizaciones adicionales, al menos uno de los aminoácidos no naturales anteriormente mencionados se incorpora en un polipéptido, es decir, tales realizaciones son polipéptidos de aminoácidos no naturales. Los aminoácidos no naturales pueden 60 funcionalizarse en sus cadenas laterales de forma que su reacción con una molécula derivatizante genere un enlace

de amina. Los aminoácidos no naturales están seleccionados de aminoácidos que tienen cadenas laterales de amina aromática. Los aminoácidos no naturales pueden comprender una cadena lateral enmascarada, que incluye un grupo de amina aromática enmascarada.

Los aminoácidos no naturales comprenden cadenas laterales de amina aromática en las que la amina aromática es una arilamina o realización adicional, los aminoácidos no naturales se parecen a un aminoácido natural en la estructura, pero contienen grupos amina aromática. Los aminoácidos no naturales se parecen a fenilalanina o tirosina (aminoácidos aromáticos) . Los aminoácidos no naturales pueden tener propiedades que son distintas de aquellas de los aminoácidos naturales. Tales propiedades distintas son la reactividad química de la cadena lateral; esta reactividad química distinta permite que la cadena lateral del aminoácido no natural se someta a una reacción mientras que es una unidad de un polipéptido aún cuando las cadenas laterales de las unidades de aminoácido que se producen naturalmente en el mismo polipéptido no se someten a la reacción anteriormente mencionada. En otra realización, la cadena lateral del aminoácido no natural tiene una química ortogonal a las de los aminoácidos que se producen naturalmente. En otra realización, la cadena lateral del aminoácido no natural comprende un resto que contiene nucleófilo; en otra realización, el resto que contiene nucleófilo sobre la cadena lateral... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un polipéptido o sal del mismo, que contiene al menos un compuesto seleccionado del grupo que consiste en:

en el que cada Ra está seleccionado independientemente del grupo que consiste en H, halógeno, alquilo, -NO2, -CN, alquilo sustituido, -N (R') 2, -C (O) kR', -C (O) N (R') 2, -OR' y -S (O) kR' en la que k es 1, 2 ó 3;

M es H o -CH2R5; R1 es H, un grupo protector de amino, resina, aminoácido, polipéptido o polinucleótido; R2 es OH, un grupo protector de éster, resina, aminoácido, polipéptido o polinucleótido; R5 es L-X, en la que X es un polímero que comprende alquilo, alquenilo, alquinilo, alcoxi, alquilalcoxi, poli (óxido de alquileno) , arilo, heteroarilo, alcarilo o aralquilo; y L es opcional, y cuando está presente es un conector seleccionado del grupo que consiste en alquileno, alquenileno, -O-, -O- (alquilen) -, - (alquilen) -O-, -C (O) -, -C (O) - (alquilen) -, - (alquilen) -C (O) -, -C (O) N (R') -, -C (O) N (R') - (alquilen) -, - (alquilen) -C (O) N (R') , OC (O) N (R') -, -OC (O) N (R') - (alquilen) -, - (alquilen) -OC (O) N (R') -, -N (R') C (O) -, -NR'C (O) - (alquilen) -, - (alquilen) NR'C (O) -, -S-, -S- (alquilen) -, -S (O) k-en la que k es 1, 2 ó 3, -S (O) k (alquilen) -, -C (S) -, -C (S) - (alquilen) -, -CSN (R') -, -CSN (R') - (alquilen) -, -N (R') CO- (alquilen) -, -N (R') C (O) O-, - (alquilen) -ON=CR'-, - (alquilen) C (O) NR'- (alquilen) -, - (alquilen) -S (O) k- (alquilen o alquilen sustituido) -S-, - (alquilen) -S-S-, -S (O) kN (R') -, -N (R') C (O) N (R') -, -N (R') C (S) N (R') -, -N (R') S (O) kN (R') -, -N (R') -N=, -C (R') =N-, -C (R') =N-N (R') -, -C (R') =N-N=, C (R') 2-N=N-y -C (R') 2-N (R') -N (R') -; y cada R' es independientemente H, alquilo o alquilo sustituido;

en el que el compuesto está seleccionado del grupo:

2. El compuesto de la reivindicación 1, en el que el polímero comprende poli (óxido de alquileno) .

3. El compuesto de la reivindicación 1, en el que el polímero comprende -[ (alquilen) -O- (hidrógeno o alquilo) ]x, en el que x es d.

2. 10.000.

4. El compuesto de la reivindicación 1, en el que el polímero es m-PEG que tiene un peso molecular que oscila de aproximadamente 2 a aproximadamente 40 KDa.

5. Un procedimiento de preparación de un compuesto que contiene al menos un aminoácido no natural seleccionado del grupo que consiste en:

en el que el compuesto se forma por una alquilación reductora de un resto amino aromático sobre al menos un aminoácido no natural con al menos un reactante que comprende al menos un resto de aldehído, en el que R1, R2, R5, Ra y M son como se han definido en la reivindicación 1; en el que el al menos un aminoácido no natural está seleccionado de un grupo:

6. El procedimiento de la reivindicación 5, en el que el polímero comprende poli (óxido de alquileno) o un poli (óxido de alquileno) sustituido.

7. El procedimiento de la reivindicación 5, en el que el polímero comprende -