Análisis biomolecular a gran escala con marcadores de secuencia.
(22/07/2020) Un método para controlar la enfermedad residual mínima de un cáncer en un paciente después del tratamiento, en donde el método comprende las etapas de:
(a) unir marcadores de secuencias a moléculas de ácidos nucleicos recombinados de genes de receptores de linfocitos T o genes de inmunoglobulina a partir de una muestra obtenida del paciente para formar conjugados marcador-ácido nucleico, en donde la muestra comprende linfocitos T y/o linfocitos B y/o ADN libre de células, en donde al menos un ácido nucleico recombinado o copias del mismo tienen etiquetas de secuencia diferentes unidas y son características del cáncer del paciente;
(b) amplificar los conjugados de marcador-ácido…
Métodos para supervisar las condiciones por análisis de secuencia.
(18/03/2020) Un método para supervisar una enfermedad en un sujeto que comprende:
(a) generar uno o más perfiles de clonotipos de al menos una muestra obtenida del sujeto, en donde la al menos una muestra comprende linfocitos T y/o linfocitos B y está relacionada con un primer estado de la enfermedad y en donde cada perfil de clonotipo se determina mediante un método que comprende
i. aislar espacialmente moléculas individuales de ácido nucleico de dichas células;
ii. secuenciar dichas moléculas individuales aisladas espacialmente de ácido nucleico mediante secuenciación por síntesis usando nucleótidos marcados terminados de manera reversible, pirosecuenciación, secuenciación de 454, hibridación…
Determinación de células T y células B específicas de antígeno.
(19/02/2020) Un método para identificar clonotipos de células T específicas de antígeno en una muestra que comprende células T, comprendiendo el método las etapas de:
(a) exponer la muestra a una pluralidad de antígenos en una pluralidad de mezclas de reacción diferentes, en las que cada antígeno de dicha pluralidad de antígenos está presente en una subpluralidad única predeterminada de la pluralidad de mezclas de reacción;
(b) seleccionar células T específicas de antígeno de cada una de la pluralidad de mezclas de reacción;
(c) secuenciar ácidos nucleicos recombinados que codifican clonotipos del mismo segmento del receptor de células T a partir de:
(i) las células T específicas…
Procedimiento para seleccionar clonotipos raros.
(18/09/2019) Un procedimiento para seleccionar uno o más clonotipos específicos del paciente correlacionados con una neoplasia linfoide para controlar una enfermedad residual mínima de la misma, comprendiendo el procedimiento las etapas de:
(a) amplificar moléculas de ácido nucleico de linfocitos T y/o linfocitos B de una muestra obtenida de un paciente, comprendiendo las moléculas de ácido nucleico secuencias de ADN recombinadas de genes del receptor de linfocitos T o genes de inmunoglobulina;
(b) secuenciar las moléculas amplificadas de ácido nucleico para formar un perfil de clonotipo;
(c) comparar clonotipos del perfil de clonotipo con los clonotipos de una base de datos de clonotipos, en el que la base de datos de clonotipos comprende clonotipos…
Monitorización del estadio de neoplasia linfoide usando perfiles de clonotipo.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(10/07/2019). Solicitante/s: Adaptive Biotechnologies Corporation. Clasificación: C12Q1/6886.
Un método para monitorizar una neoplasia linfoide en un paciente con clonotipos de cáncer definidos que comprende los pasos de:
(a) determinar un perfil de secuencias de ADN recombinadas en células T y/o células B de una muestra obtenida del paciente, en donde el perfil se determina mediante la secuenciación de la siguiente generación; y
(b) determinar los niveles de los clonotipos de cáncer definidos en el perfil para monitorizar la neoplasia linfoide.
PDF original: ES-2740802_T3.pdf
Análisis biomolecular a gran escala con marcadores de secuencia.
(15/04/2019) Un método de determinación de un perfil de clonotipo de ácidos nucleicos recombinados que codifican una pluralidad de cadenas de receptor inmunitario en una muestra, comprendiendo el método las etapas de:
(a) unir marcadores de secuencia a moléculas de ácido nucleico recombinadas de genes de receptores de linfocitos T o genes de inmunoglobulina a partir de una muestra de un individuo que comprende linfocitos T y/o linfocitos B y/o ADN sin células para formar conjugados de marcador-ácido nucleico, en donde al menos un ácido nucleico recombinado o copias del mismo tienen distintos marcadores de secuencia unidos;
(b) amplificar los conjugados de marcador-ácido nucleico;
(c) secuenciar una muestra de los conjugados de marcador-ácido nucleico para proporcionar lecturas de secuencias teniendo…
Clonotipos de receptores de células T compartidos entre pacientes con espondilitis anquilosante.
Secciones de la CIP Química y metalurgia Necesidades corrientes de la vida
(11/01/2017). Solicitante/s: Adaptive Biotechnologies Corporation. Clasificación: C12N15/12, A61K39/395, C12Q1/68, C07K16/18.
Un método para determinar un estado de la enfermedad de un paciente que sufre, o es sospechoso de sufrir, espondilitis anquilosante, donde el método comprende las etapas de:
(a) amplificar moléculas de ácido nucleico de las células T de una muestra obtenida del paciente, teniendo las moléculas de ácido nucleico secuencias de ADN recombinadas de genes de los receptores de las células T;
(b) secuenciar las moléculas amplificadas de ácido nucleico para formar un perfil de clonotipos;
(c) determinar a partir del perfil de clonotipos una presencia, una ausencia y/o un nivel de clonotipos codificantes de segmentos de un receptor de las células T al menos un setenta por ciento idéntico a un segmento en el grupo consistente en LCASSLEASGSSYNEQFFGPGTRLTV (SEC. Nº ID. 1) y VYFCASSDSSGSTDTQYFGPGTRLTV (SEC. Nº ID. 2); y
(d) correlacionar la presencia, ausencia y/o nivel de dichos clonotipos con un estado de espondilitis anquilosante en el paciente.
PDF original: ES-2619713_T3.pdf
Monitorización de estados de salud y enfermedad usando perfiles de clonotipos.
Sección de la CIP Física
(10/08/2016). Solicitante/s: Adaptive Biotechnologies Corporation. Clasificación: G01N33/48.
Un método para detectar la recurrencia de un neoplasma linfoide en un paciente con clonotipos de cáncer definidos que comprende las etapas de:
(a) determinar un perfil de secuencias de ADN recombinadas en células T y/o células B que comprende las etapas de:
(i) amplificar moléculas de ácido nucleico de células T y/o células B de una muestra obtenida del paciente;
(ii) aislar espacialmente moléculas individuales del ácido nucleico amplificado;
y
(iii) secuenciar las moléculas individuales del ácido nucleico por secuenciación de nueva generación para formar el perfil de secuencias de ADN recombinadas;
(b) evaluar el perfil de secuencias de ADN recombinadas para determinar los niveles de los clonotipos de cáncer definidos y los clones que evolucionan a partir de éstos; y
(c) usar los niveles para detectar la recurrencia del neoplasma linfoide.
PDF original: ES-2593614_T3.pdf
Determinación de cadenas de receptor inmunitario emparejadas a partir de la frecuencia de subunidades coincidentes.
(06/07/2016) Un método de determinación de cadenas de receptor inmunitario emparejadas en una muestra, comprendiendo el método las etapas de:
(a) dividir una muestra que contiene linfocitos que expresan parejas de cadenas de receptor inmunitario en una pluralidad de subconjuntos;
(b) determinar las secuencias de nucleótidos de una primera cadena de cada pareja de cadenas de receptor inmunitario de linfocitos que tienen dichas parejas en una porción de la pluralidad de subconjuntos;
(c) determinar las secuencias de nucleótidos de una segunda cadena de cada pareja de cadenas de receptor inmunitario de linfocitos que tienen dichas parejas de la misma porción de la pluralidad de subconjuntos;
(d) identificar como cadenas de receptor inmunitario emparejadas las parejas de primeras cadenas y segundas cadenas (i) que, para cada subconjunto…
Métodos para supervisar las condiciones por análisis de secuencia.
(15/01/2014) Un método para determinar un perfil de secuencias de ADN recombinado en linfocitos T y/o linfocitos B que comprende:
(a) obtener una muestra de un sujeto que comprende linfocitos T y/o linfocitos B;
(b) aislar espacialmente moléculas individuales de ácido nucleico de dichas células en un sustrato sólido;
(c) secuenciar dichas moléculas individuales aisladas espacialmente de ácido nucleico secuenciando por síntesis usando nucleótidos marcados en el extremo de forma reversible, pirosecuenciación, secuenciación 454, hibridación específica de alelo con una biblioteca de sondas oligonucleotídicas marcadas, secuenciación por síntesis usando hibridación específica de alelo con una biblioteca de clones marcados que se sigue…