Determinación de células T y células B específicas de antígeno.

Un método para identificar clonotipos de células T específicas de antígeno en una muestra que comprende células T,

comprendiendo el método las etapas de:

(a) exponer la muestra a una pluralidad de antígenos en una pluralidad de mezclas de reacción diferentes, en las que cada antígeno de dicha pluralidad de antígenos está presente en una subpluralidad única predeterminada de la pluralidad de mezclas de reacción;

(b) seleccionar células T específicas de antígeno de cada una de la pluralidad de mezclas de reacción;

(c) secuenciar ácidos nucleicos recombinados que codifican clonotipos del mismo segmento del receptor de células T a partir de:

(i) las células T específicas de antígeno seleccionadas en la etapa (b) de cada una de la pluralidad de mezclas de reacción, en la que la secuenciación produce una pluralidad de lecturas de secuencia para cada mezcla de reacción a partir de la cual se determinan los clonotipos y las frecuencias de clonotipos, y

(ii) células T obtenidas de la muestra antes de la etapa (a), en la que la secuenciación produce una pluralidad de lecturas de secuencia a partir de las cuales se determinan los clonotipos y las frecuencias de clonotipos;

(d) para cada mezcla de reacción, comparar las frecuencias de clonotipos determinadas en la etapa (c) (i) con las frecuencias de clonotipos determinadas en la etapa (c) (ii); y

(e) para cada uno de la pluralidad de antígenos, identificar un clonotipo de una célula T específica de antígeno que tiene una mayor frecuencia aumentada en cada una de las mezclas de reacción en las que estaba presente el antígeno y no tiene una mayor frecuencia en cada una de las mezclas de reacción en las que el antígeno estaba ausente.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2015/023915.

Solicitante: Adaptive Biotechnologies Corp.

Inventor/es: FAHAM,MALEK, KLINGER,MARK.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/6881

PDF original: ES-2774065_T3.pdf

 

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