18 patentes, modelos y diseños de BRANDEIS UNIVERSITY

(29/07/2020) Un método para analizar secuencias diana de ácido nucleico de cadena sencilla en una muestra, que comprende: (a) poner en contacto una muestra que comprende una primera secuencia diana de ácido nucleico de cadena sencilla y al menos una segunda secuencia diana de ácido nucleico de cadena sencilla, con reactivos de detección en un tubo único, comprendiendo dichos reactivos de detección conjuntos de pares de sondas para cada una de las secuencias diana, comprendiendo cada uno de dichos pares de sondas: (i) al menos una sonda amortiguadora marcada con un amortiguador no fluorescente, y (ii) al menos una sonda señalizadora marcada con un colorante fluorescente, …

(03/07/2019) Un kit para la identificación de un organismo que comprende: a) un conjunto de cebadores para la amplificación de una secuencia de ácido nucleico diana que comprende una secuencia de ácido nucleico variable, en donde la secuencia de ácido nucleico variable varía entre un grupo de organismos y está flanqueada por secuencias que se conservan al menos relativamente entre los miembros de un grupo de organismos, en donde los cebadores en el conjunto de cebadores hibridan con las secuencias flanqueantes, y b) múltiples conjuntos de sondas distinguibles de manera detectable, donde las sondas de los conjuntos de sondas se hibridan de manera adyacente con cada nucleótido de la secuencia de ácido nucleico variable, y donde cada conjunto de sondas comprende …

(10/04/2019) Una mezcla de reacción de amplificación de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) que incluye, además de al menos una cadena de ácido nucleico que contiene al menos una secuencia diana, al menos un par de cebadores, una ADN polimerasa y dNTP en un tampón de reacción de la PCR, al menos un reactivo agregado que comprende almenos un par de oligonucleótidos complementarios con la capacidad de formar una concentración de 50-800 nM de un híbrido bicatenario de 6-50 pares de bases de longitud con una temperatura de fusión (Tm) de al menos 32 °C, teniendo dicho híbrido bicatenario un extremo que incluye fracciones de etiqueta unidos covalentemente, interactivos, una fracción fluorescente no plana voluminosa en una cadena y en la otra cadena, ya sea una fracción fluorescente voluminosa no plana o una fracción no voluminosa…

(12/11/2018) Un kit de reactivos para identificar uno o más tipos de micobacterias en una muestra que comprende: (a) al menos un par de cebadores configurados para unirse a regiones de ácido nucleico de micobacterias conservado entre dos o más tipos de micobacterias y en el que dichos cebadores están configurados para amplificar una región variable de ácido nucleico de micobacterias, en el que dichos cebadores se seleccionan entre el grupo que consiste en: (i) un cebador que tiene una secuencia de SEQ ID NO: 51 y un cebador que tiene una secuencia de SEQ ID NO: 52; (ii) un cebador que tiene una secuencia de SEQ ID NO: 57 y un cebador que tiene una secuencia de SEQ ID NO: 58; (iii) un cebador que tiene una secuencia de SEQ ID NO: 28 y un cebador que tiene una…

(05/10/2016) Procedimiento de identificación de uno o más tipos de micobacterias en una muestra, que comprende: (a) proporcionar: (i) una muestra que se sospecha que comprende una o más micobacterias e (ii) reactivos de detección que comprenden al menos un par de cebadores configurados para hibridarse con regiones de ácido nucleico de micobacteria conservadas entre dos o más tipos de micobacterias y en el que dichos cebadores están configurados para amplificar una región variable de ácido nucleico de micobacteria y al menos dos conjuntos de sondas distinguibles de forma detectable de una sonda de señalización y una sonda de desactivación asociada que se hibridan a secuencias de ácido nucleico adyacentes en el ácido nucleico de micobacterias amplificado, emitiendo la sonda de señalización una señal fluorescente cuando se hibrida con una secuencia…

(30/09/2015) Un método de ensayo homogéneo para analizar al menos una única secuencia diana de ácido nucleico monocatenario en una muestra, que comprende a) proporcionar una muestra que contiene dicha al menos una secuencia diana de ácido nucleico y múltiples conjuntos de sondas distinguibles de manera detectable, donde las sondas de los conjuntos de sondas se hibridan de manera adyacente de forma que cada nucleótido de la secuencia diana está cubierto, y donde cada conjunto de sondas comprende (i) una sonda marcada con un inactivador no fluorescente, y (ii) una sonda marcada con un resto fluorescente; donde tras la hibridación de dicha sonda marcada con un resto fluorescente con dicha al menos una secuencia diana en dicha muestra en ausencia de dicha sonda marcada con un inactivador no fluorescente, dicho resto fluorescente emite una señal sobre el fondo, donde,…

(25/02/2015) Un análogo de superóxido dismutasa estabilizado, en donde dicho análogo tiene una estructura terciaria y comprende un primer monómero de SOD1, un segundo monómero de SOD1, y un entrecruzador; dicho entrecruzador comprende un brazo espaciador con una longitud desde 3 Å hasta 15 Å; en donde dicho primer monómero de SOD1 comprende una primera cisteína en una primera posición correspondiente a la posición 111 de SOD1 humana de tipo salvaje, y dicho segundo monómero de SOD1 comprende una segunda cisteína en una segunda posición correspondiente a la posición 111 de SOD1 humana de tipo salvaje; y la primera cisteína está covalentemente unida a la segunda cisteína por el entrecruzador.

(03/12/2014) Un método de detección homogéneo para detectar variantes alélicas de al menos una secuencia objetivo de ácido nucleico mediante el uso de un método de amplificación por PCR no simétrica, que comprende: (a) formar una mezcla de reacción de amplificación que incluye dicha al menos una secuencia objetivo de ácido nucleico, iniciadores para la amplificación por PCR no simétrica, y al menos una sonda de hibridación marcada con fluoróforo, tolerante a desajustes; (b) amplificar dicha secuencia objetivo de ácido nucleico mediante dicho método de amplificación por PCR no simétrica generando moléculas de amplicón monocatenarias; (c) detectar la emisión de fluorescencia a partir…

(26/03/2014) Un extracto soluble en agua de un fruto del genero Elaeis para uso en el tratamiento de un desequilibrio metabólico en un mamífero.

(19/03/2014) Una baliza de aptámero que se une a una molécula diana de ácido no nucleico específica, comprendiendo la baliza de aptámero un oligonucleótido que comprende una porción de bucle, un primer segmento, y un segundo segmento complementario al primer segmento, en el que los primero y segundo segmentos conectados por la parte de bucle forman una porción de tallo en ausencia de cualquier ácido no nucleico específico diana; en el que una porción del oligonucleótido comprende una región de unión que tiene una conformación secundaria o terciaria que cambia a una conformación secundaria o terciaria diferente tras la unión a la molécula de ácido no nucleico diana específica;…

(18/05/2012) Reactivo que no contribuye a la fluorescencia de fondo pero que puede evitar por lo menos una manifestación del cebado defectuoso en una amplificación mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), para producir por lo menos un producto de ADN amplificado cuando es añadido a una concentración no superior a 650 nM a una mezcla de amplificación por PCR que incluye 1,25 unidades de una ADN polimerasa termoestable por 25 μl de mezcla de reacción, siendo dicho reactivo un oligonucleótido no extensible que presenta un extremo 3' y una estructura de tallo-bucle, que no es una sonda de hibridación para dicho por lo menos un producto de ADN amplificado, que presenta un tallo que comprende una región de doble cadena que presenta una longitud…

(20/05/2011) Procedimiento homogéneo de detección y amplificación mediante LATE-PCR no simétrica que reduce la dispersión entre ensayos repetidos que comprende: (i) realizar una reacción de amplificación mediante LATE-PCR que incluye una temperatura de apareamiento de cebadores para generar por lo menos un producto de amplificación monocatenario en presencia de: (a) un molde, (b) un par de cebadores de LATE-PCR que comprende un cebador limitante y un cebador en exceso que se hibridan con sus secuencias diana a la temperatura de apareamiento de cebadores, (c) un tinte de ADN fluorescente que resulta excitable de manera fluorescente cuando se asocia con ADN bicatenario a temperaturas que incluyen, y…

(01/04/2011) Procedimiento para tratar enzimáticamente moléculas ácido nucleicas en una mezcla que incluye un agente caotrópico, proteínas degradadas y desnaturalizadas y moléculas de ADN y ARN liberadas de las proteínas unidas, que comprende la dilución de dicha mezcla con por lo menos un reactivo acuoso para reducir la concentración del agente caotrópico a menos de 0,05 M, preferentemente a menos de 0,01 M, y someter por lo menos algunas de dichas moléculas de ARN y ADN a por lo menos un tratamiento enzimático sin extraer o aislar dichas moléculas de ARN y ADN unas de otras, o de los otros componentes de la mezcla de reacción

(16/11/2008) Procedimiento de amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) no simétrica que comprende termociclar una mezcla de reacción de PCR que contiene una secuencia diana de amplificación de ácido desoxirribonucleico (ADN), un par de cebadores para PCR, dNTP y una polimerasa termoestable de manera repetida a través de las etapas de PCR de fundido de la cadena, apareamiento de cebador y extensión de cebador, en el que, al principio de la amplificación (a) la mezcla de reacción contiene hasta 1.000.000 de copias de la secuencia diana de amplificación, (b) el par de cebadores para PCR comprende un cebador limitativo y un cebador en exceso, estando presente el cebador limitativo en una concentración de hasta 200 nM y estando presente el cebador en exceso en una concentración por lo menos cinco veces superior que el…