(22/07/2020) Un método para controlar la enfermedad residual mínima de un cáncer en un paciente después del tratamiento, en donde el método comprende las etapas de: (a) unir marcadores de secuencias a moléculas de ácidos nucleicos recombinados de genes de receptores de linfocitos T o genes de inmunoglobulina a partir de una muestra obtenida del paciente para formar conjugados marcador-ácido nucleico, en donde la muestra comprende linfocitos T y/o linfocitos B y/o ADN libre de células, en donde al menos un ácido nucleico recombinado o copias del mismo tienen etiquetas de secuencia diferentes unidas y son características del cáncer del paciente; (b) amplificar los conjugados de marcador-ácido…

(25/03/2020) Un método para asignar un par de polipéptidos primero y segundo que forman un receptor de linfocitos T (TCR) o un heterodímero de inmunoglobulina (Ig) a una muestra de fuente única entre una pluralidad de muestras de la fuente, que comprende: para cada una de una pluralidad de muestras de la fuente cada una de las cuales comprende linfocitos T o linfocitos B, determinando las primeras secuencias de ácido nucleico reorganizadas que codifican los primeros polipéptidos de los heterodímeros de TCR o Ig presentes en la muestra de la fuente y asignar las primeras secuencias de ácido nucleico reorganizadas a la muestra de la fuente; agrupar la pluralidad de muestras de la fuente para formar una población combinada de células; determinar a partir de la población combinada de células, una pluralidad de pares afines de secuencias de…

(19/02/2020) Un método para identificar clonotipos de células T específicas de antígeno en una muestra que comprende células T, comprendiendo el método las etapas de: (a) exponer la muestra a una pluralidad de antígenos en una pluralidad de mezclas de reacción diferentes, en las que cada antígeno de dicha pluralidad de antígenos está presente en una subpluralidad única predeterminada de la pluralidad de mezclas de reacción; (b) seleccionar células T específicas de antígeno de cada una de la pluralidad de mezclas de reacción; (c) secuenciar ácidos nucleicos recombinados que codifican clonotipos del mismo segmento del receptor de células T a partir de: (i) las células T específicas…

(29/01/2020) Un procedimiento para detectar granulocitos neutrófilos (nGRC) en una muestra biológica que proviene de un mamífero, que comprende detectar epigenéticamente células sanguíneas en una muestra biológica, y cuantificar dichas células sanguíneas según lo detectado, utilizando un estándar de normalización, en el que dicho estándar de normalización es una molécula de ácido nucleico que comprende al menos una región de marcador que es específico para los nGRC a detectar, y al menos una región de control que no es específica de la célula, en el que dichas regiones están presentes en el mismo número de copias en dicha molécula y/o una muestra de células sanguíneas naturales de composición conocida, y en el que dicha detección epigenética…

(08/01/2020) Un método de determinación de una proporción de linfocitos T o linfocitos B en una muestra en relación con el número total de genomas de entrada contenidos en dicha muestra que comprende: A) amplificar por PCR multiplexada y secuenciar: i) secuencias oligonucleotídicas de CDR3 reordenadas de locus de receptores de linfocitos T (TCR) de linfocitos T o locus de inmunoglobulinas (Ig) de linfocitos B en dicha muestra para obtener un número total de secuencias biológicas de salida, comprendiendo cada secuencia oligonucleotídica un segmento V y un segmento J; ii) un primer conjunto de moldes sintéticos que representan esencialmente todas las combinaciones posibles de segmentos V y segmentos…

(27/11/2019) Un método para la estimación de si una hembra está gestante, comprendiendo dicho método: - la medición de presencias alélicas (D) para una pluralidad de marcadores genéticos de al menos un cromosoma, diferente del cromosoma X e Y, en una muestra de ADN libre de células de una hembra potencialmente gestante; representando cada presencia alélica la presencia en un marcador genético de al menos uno de: un alelo de referencia de origen maternal o fetal, y un alelo alternativo de origen maternal o fetal; - basándose en dichas presencias alélicas medidas, la determinación de una fracción homocigota (Fho) de las mismas que se asocian con marcadores genéticos puramente homocigotos; y - la estimación de si la hembra está gestante basándose en dicha fracción, donde la estimación comprende: la estimación de que la hembra está gestante si la fracción…

(06/11/2019) Método de fabricación de una línea celular de linfocitos T citotóxicos (CTL) específicos de cáncer para su uso en el tratamiento de un paciente con cáncer, en el que dicho método comprende - identificar antígenos de cáncer a partir de ácido nucleico obtenido de células cancerosas del paciente con cáncer usando las etapas de a) obtener una pluralidad de secuencias mutantes a partir del ácido nucleico de células cancerosas de un paciente con cáncer, codificando dichas secuencias mutantes para la totalidad o una parte de un gen expresado y en el que las secuencias mutantes tienen, cada una, un aminoácido de posición mutante que sustituye a un aminoácido de posición silvestre ubicado en la misma…

(06/11/2019) Un método para desarrollar una prueba de diagnóstico para una enfermedad en particular, comprendiendo el método las etapas de: en una muestra recogida de cada uno de los múltiples sujetos en un grupo de pacientes y un grupo de control, en donde el grupo de pacientes comprende sujetos que tienen la misma enfermedad y el grupo de control comprende sujetos que están sanos; amplificar y secuenciar el repertorio inmunitario de cada sujeto en cada uno de los dos grupos para identificar cada secuencia de CDR3 exclusiva presente en las muestras y determinar la frecuencia de aparición de cada secuencia de CDR3 exclusiva; identificar secuencias de CDR3 que se comparten entre al menos dos sujetos en cada uno de los grupos de control y el…

(05/11/2019) Un procedimiento de producción de un leucocitograma epigenético o un citograma de linfocitos T epigenético, que comprende las etapas de a) determinar y proporcionar factores de corrección específicos del ensayo de qPCR, con el fin de normalizar los ensayos de qPCR como se realizan y corregir las diferencias en la eficacia de los ensayos b) detectar epigenéticamente células sanguíneas en una muestra biológica, que comprende la conversión con bisulfito de al menos una región marcadora que es específica para cada una de las células sanguíneas a detectar; y c) cuantificar dichas células sanguíneas según lo detectado, que comprende la evaluación de la…

(30/10/2019) Un método para detectar restricción de cadena ligera de inmunoglobulina y clonalidad en linfocitos B, comprendiendo el método: (a) realizar uno o más ensayos de hibridación in situ en una muestra de linfocitos B de un sujeto usando al menos un conjunto de sondas que se diseña para hibridar específicamente con ARN de la región constante de la cadena kappa de inmunoglobulina (IGKCR); al menos un conjunto de sondas que se diseña para hibridar específicamente con ARN de la región constante de la cadena lambda de inmunoglobulina (IGLCR); y al menos un conjunto de sondas que se diseña para hibridar específicamente con ARN del polipéptido…

(02/10/2019) Un método para genotipar alelos en al menos un conjunto de loci genéticos homólogos, que comprende: (i) proporcionar una muestra que contiene ADN que incluye dicho al menos un conjunto de loci genéticos homólogos, en donde dicho conjunto de loci genéticos homólogos comprende: (a) el gen RHD y el gen RHCE que codifican el antígeno eritrocitario; o (b) dos o más genes del sistema del antígeno leucocitario humano (HLA); o (c) dos de más de los genes que codifican la glucoforina seleccionados del gen GYPA, el gen GYPB y el gen GYPE; (ii) realizar la amplificación por PCR de regiones de dicho conjunto de loci genéticos homólogos usando cebadores específicos…

(18/09/2019) Un procedimiento de cribado rápido por PCR múltiplex de grupos sanguíneos humanos poco comunes, en el que el procedimiento comprende las siguientes etapas: A. preparar una muestra para analizar: construir un grupo con múltiples muestras de sangre, extrayendo respectivamente plantillas de ADN de las muestras de sangre que forman el grupo y mezclar las plantillas de ADN para obtener una muestra para analizar del grupo; B. cribar un grupo positivo: utilizando las etapas i)-v) para realizar la detección por PCR múltiplex en la muestra a analizar del grupo obtenido en la etapa A, y cribar el grupo cuyo resultado de detección es positivo: i) preparar un sistema de reacción PCR múltiplex: el sistema de reacción PCR múltiplex comprende pares múltiples de cebadores específicos, solución tampón de PCR, dNTP, enzima Taq y ddH2O, y las secuencias…

(24/07/2019) Procedimiento in vitro para determinar si un paciente alérgico, que se somete a una inmunoterapia con alérgenos que es una terapia de desensibilización, está desarrollando una respuesta inmune orientada hacia una respuesta a células T reguladoras o hacia una respuesta a células T efectoras, cuyo procedimiento comprende: a) determinar el nivel de expresión de al menos la proteína STAB1, o un ARNm de la misma, en PBMC del paciente; b) comparar dicho nivel de expresión con el de un control que consiste en (i) células dendríticas inmaduras que no se han polarizado hacia subconjuntos tolerogénicos o efectores, o (ii) PBMC del paciente obtenidas antes de que dicho paciente se someta a inmunoterapia con alérgenos; c) basado en la comparación con el control, identificar que la respuesta inmune desarrollada por el paciente…

(08/05/2019) Un método de detección diferencial de secuencias objetivo en una mezcla de material genético materno y fetal, en donde la mezcla de material genético materno y fetal es una mezcla de ADN genómico materno y fetal obtenido a partir de plasma sanguíneo materno, que comprende los pasos de: a) distribuir el material genético en muestras discretas de tal manera que la medición de una secuencia objetivo pueda cuantificarse como múltiplos binarios o simples; b) medir la presencia de diferentes secuencias objetivo en muestras discretas usando reactantes específicos de secuencia, en donde una de las diferentes secuencias objetivo está en un cromosoma…

(08/05/2019) Un método de detección diferencial de secuencias diana en una mezcla de material genético materno y fetal, en donde la mezcla de material genético materno y fetal es una mezcla de ADN genómico materno y fetal obtenido de plasma sanguíneo materno, que comprende los pasos de: a) distribuir el material genético en muestras discretas, cada muestra conteniendo de media no más de aproximadamente una secuencia diana por muestra; b) medir la presencia de diferentes secuencias diana en las muestras discretas, en donde una de las diferentes secuencias diana es diploide en el material genético materno y posiblemente aneuploide en el material genético fetal…

(13/03/2019) Un método de detección de una célula individual de un tipo determinado en una muestra que comprende una mezcla de tipos celulares, que comprende al menos una célula del tipo determinado, en donde la célula comprende una primera diana de ácido nucleico y una segunda diana de ácido nucleico, en donde las primeras y segundas dianas de ácidos nucleicos siempre coexisten en la célula, en donde el método comprende: (a) proporcionar una primera sonda de etiqueta que comprende una primera etiqueta, y proporcionar una segunda sonda de etiqueta que comprende una segunda etiqueta, en donde una primera señal de la primera etiqueta no se puede distinguir de una segunda señal de la segunda etiqueta; …

(23/01/2019) Un método para determinar el potencial de amplificación de ácido nucleico no uniforme entre los miembros de un conjunto de cebadores oligonucleotídicos que es capaz de amplificar moléculas de ácido nucleico reordenadas que codifican uno o más receptores inmunitarios adaptativos en una muestra biológica que comprende moléculas de ácido nucleico reordenadas de células linfoides de sujeto mamífero, comprendiendo el método: (a) amplificar una composición que comprende una pluralidad de oligonucleótidos molde utilizando el conjunto de cebadores oligonucleotídicos en una reacción de PCR múltiple para obtener una pluralidad de oligonucleótidos molde amplificados, en donde…

(21/11/2018) Un método para seleccionar un ovocito que, cuando se fecunda, produce un embrión viable con una elevada tasa de implantación que produce embarazo, que comprende una etapa de: a) medir el nivel de expresión de 45 genes en una célula del cumulus que rodea dicho ovocito, en el que dichos 45 genes son miembro 6 de la familia tipo wingless con un sitio de integración para MMTV (WNT6), dominio que contiene repeticiones ricas en leucina y homología calponina (HC) (LRCH4), caja pareada 8 (PAX8), proteína de unión a calcio 4 (CABP4), fosfodiesterasa 5A específica para GMPc (PDE5A), BCL2 tipo 11 (BCL2L11), fosfoenolpiruvato carboxiquinasa 1 (PCK1), factor de transcripción 20 (TCF20), miembro 6 de la familia SLAM (SLAMF6), receptor de eritropoyetina (EPOR), subunidad gamma 6 del canal de calcio dependiente de…

(15/10/2018) Método para determinar la composición de ácidos nucleicos en una mezcla de ácidos nucleicos totales que comprende un primer ácido nucleico y un segundo ácido nucleico, en el que dicho primer ácido nucleico y dicho segundo ácido nucleico se derivan de fuentes diferentes, comprendiendo dicho método: 1) tratar dicha mezcla de ácidos nucleicos totales con un bisulfito, para convertir citosina no metilada en dicha mezcla de ácidos nucleicos totales en uracilo, y obtener una mezcla de ácidos nucleicos totales convertidos; 2) someter dicha mezcla de ácidos nucleicos totales convertidos a PCR cuantitativa fluorescente multiplexada usando un primer conjunto de cebadores de amplificación y un segundo conjunto de cebadores de amplificación, para capturar y amplificar un fragmento de ácido…