Método para predecir la unión fuera de diana de un péptido que se une a un péptido diana presentado por un complejo mayor de histocompatibilidad.

Método para predecir si un péptido de unión que se une a un péptido diana presentado por un complejo mayor de histocompatibilidad (CMH) y está destinado a la administración en un sujeto,

presenta el potencial de reaccionar cruzadamente con otro péptido en el sujeto in vivo, comprendiendo el método:

identificar por lo menos un motivo de unión en el péptido diana al que se une el péptido de unión, buscar los péptidos presentes en el sujeto que comprenden por lo menos un motivo de unión y que no son el péptido diana, y

someter a ensayo la unión de cualquiera de tales péptidos al péptido de unión in vitro,

en el que la presencia de uno o más de tales péptidos que se unen al péptido de unión indica que el péptido de unión presenta el potencial de reaccionar cruzadamente in vivo,

identificando el motivo o motivos de unión mediante:

(i) la creación de una serie de mutantes del péptido diana, presentando cada mutante el residuo aminoácido en una posición en la secuencia de unión del mismo que participa en la unión al péptido de unión sustituido por alanina o glicina, de manera que, en la serie de mutantes, el residuo aminoácido en cada posición en la secuencia de unión se sustituye por alanina o glicina, y el ensayo de cada mutante en la serie para su actividad respecto al péptido diana de tipo salvaje,

en el que se identifica un residuo aminoácido en una posición dentro de la secuencia de unión como parte del motivo de unión si el mutante en que el aminoácido en esa posición se ha mutado a alanina o glicina presenta una pérdida de actividad de 50% o superior respecto al péptido diana de tipo salvaje, o

(ii) la creación de una serie de mutantes, presentando cada mutante el residuo aminoácido en una posición en la secuencia de unión sustituida por un aminoácido alternativo, de manera que en la serie de mutantes, el residuo aminoácido en cada posición en la secuencia de unión se sustituye por todos los aminoácidos alternativos, y el ensayo de cada mutante en la serie para su actividad respecto al péptido de tipo salvaje, en el que las sustituciones de aminoácidos que resultan en una pérdida de actividad de 50% o superior respecto al péptido diana de tipo salvaje se considera que son aminoácidos no tolerados y no parte del motivo de unión y/o sustituciones de aminoácidos que no resultan en una pérdida de actividad de 50% o superior respecto al péptido diana de tipo salvaje se consideran parte del motivo de unión.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/GB2013/053320.

Solicitante: Immunocore Limited.

Inventor/es: JAKOBSEN,BENT KARSTEN, VUIDEPOT,ANNELISE BRIGITTE, CAMERON,BRIAN JOHN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K14/725 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02;   proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › receptores de células T.
  • G01N33/50 SECCION G — FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Análisis químico de material biológico, p. ej. de sangre, de orina; Investigación o análisis por métodos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas con grupos coordinadores; Investigación o análisis inmunológico (procedimientos de medida, de investigación o análisis diferentes de los procedimientos inmunológicos en los que intervienen enzimas o microorganismos, composiciones o papeles reactivos a este efecto; procedimientos para preparar estas composiciones, procedimientos de control sensibles a las condiciones del medio en los procedimientos microbiológicos o enzimáticos C12Q).
  • G01N33/68 G01N 33/00 […] › en los que intervienen proteínas, péptidos o aminoácidos.

PDF original: ES-2718302_T3.pdf

 

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