Identificación de epítopos protectores contra tumores para el tratamiento de cánceres.

Un método de identificación de epítopos tumorales en un paciente con cáncer,

que comprende secuenciar al menos una porción del ARN o ADN del paciente con cáncer tanto en un tejido sano como en un tejido canceroso, para producir una secuencia de ARN o ADN de tejido sano y una secuencia de ARN o ADN de tejido canceroso,

comparar la secuencia de ARN o ADN de tejido sano y la secuencia de ADN o ARN de tejido canceroso e identificar las diferencias entre la secuencia de ARN o ADN de tejido sano y la secuencia de ARN o ADN de tejido canceroso para producir un conjunto de marcadores de ADN de diferencia,

analizar el conjunto de marcadores de ADN de diferencia para producir un conjunto de epítopos específicos de tumor, en el que el conjunto de epítopos específicos de tumor comprende uno o más epítopos específicos de tumor,

proporcionar un valor numérico denominado Índice Agretópico Diferencial para cada epítopo en el conjunto de epítopos específicos de tumor, en el que el índice Agretópico Diferencial se calcula restando una puntuación numérica para un epítopo normal de una puntuación numérica para el epítopo específico de tumor, donde las puntuaciones numéricas se producen usando un algoritmo predictivo que determina la unión de los péptidos de epítopo a las moléculas del CMH, y

clasificar el conjunto de epítopos específicos de tumor mediante el Índice Agretópico Diferencial para cada epítopo del conjunto.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2013/062100.

Solicitante: THE UNIVERSITY OF CONNECTICUT.

Inventor/es: SRIVASTAVA, PRAMOD, K., MANDOIU,ION, DUAN,FEI.

Fecha de Publicación: 10 de Abril de 2019.

Clasificación Internacional de Patentes:

A61K38/00 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA. › A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE. › A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00).
A61K39/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53).
C12Q1/68 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
G01N33/573 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › para enzimas o isoenzimas.

PDF original: ES-2737757_T3.pdf

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