Recuento varietal de ácidos nucleicos para obtener información del número de copias genómicas.
Método para obtener, a partir de material genómico, información del número de copias genómicas no afectada por distorsión por amplificación,
que comprende:
a) obtener segmentos del material genómico;
b) etiquetar los segmentos con etiquetas de ácido nucleico para generar moléculas de ácido nucleico con etiqueta únicas, de manera que cada una de las moléculas de ácido nucleico con etiqueta únicas comprende un segmento del material genómico de la etapa (a) y una etiqueta;
c) someter las moléculas de ácido nucleico con etiqueta a amplificación mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR);
d) generar lecturas de secuencias asociadas a etiquetas mediante secuenciación del producto de la etapa (c);
e) asignar cada molécula de ácido nucleico con etiqueta a una ubicación en un genoma asociado con el material genómico mediante mapeo de la subsecuencia de cada lectura de secuencia asociada a etiqueta correspondiente a un segmento del material genómico a una ubicación en el genoma; y
f) contar el número de moléculas de ácido nucleico con etiqueta que tienen una etiqueta diferente que se han asignado a la misma ubicación en el genoma,
obteniendo así información del número de copias genómicas no afectada por distorsión por amplificación.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2011/057350.
Solicitante: COLD SPRING HARBOR LABORATORY.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 1 BUNGTOWN ROAD COLD SPRING HARBOR, NY 11724 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: HICKS,JAMES, WANG,ZIHUA, NAVIN,NICHOLAS, TROGE,JENNIFER, WIGLER,MICHAEL.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/683 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › implicando enzimas de restricción, p. ej. polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción [RFLP].
- C12Q1/6886 C12Q 1/00 […] › para el cáncer (ensayos inmunológicos para el cáncer G01N 33/574).
PDF original: ES-2688458_T3.pdf
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