Método para preparar una biblioteca de moléculas de ácido nucleico.

Método para generar una biblioteca de partes de ácido nucleico amplificadas de un ácido nucleico molde,

que comprende

A) obtener dicho ácido nucleico molde, que es ARN, emparejar al menos un cebador oligonucleotídico con dicho ARN molde, emparejar al menos un finalizador oligonucleotídico y/o cebador adicional con dicho ARN molde, preferentemente en el que el finalizador oligonucleotídico se hibrida con al menos un cebador oligonucleotídico adicional por un par de marcadores de secuencia complementarios en el finalizador y cebador,

en el que uno cualquiera de los finalizadores oligonucleotídicos comprende un marcador de secuencia o se hibrida con un marcador de secuencia, y uno cualquiera de los cebadores oligonucleotídicos comprende un marcador de secuencia o se hibrida con un marcador de secuencia, y en el que el marcador de secuencia no se empareja con el molde,

elongar el al menos un cebador oligonucleotídico de una manera específica de molde hasta que el ácido nucleico producto de elongación alcanza la posición de un finalizador oligonucleotídico o cebador adicional emparejado, por lo que se detiene la reacción de elongación, en el que en dicha reacción de elongación dicho finalizador oligonucleotídico opcional no se elonga y/o dicho cebador oligonucleotídico adicional se elonga de una manera específica de molde,

en el que el ácido nucleico producto elongado se liga con (i) el extremo 5' de dicho finalizador oligonucleotídico que se hibrida con la cadena molde o (ii) el extremo 5' de dicho cebador adicional que se hibrida con la cadena molde o con (iii) un marcador de secuencia que se hibrida con dicho finalizador o cebador adicional en las cercanías del extremo 3' del producto elongado proporcionando el marcador de secuencia hibridado a una región complementaria del finalizador oligonucleotídico o cebador adicional que está unido al extremo 5' de la región hibridada con el molde del finalizador o cebador adicional; o

B) obtener dicho ácido nucleico molde, que es preferentemente ARN o ADN, emparejar al menos un cebador oligonucleotídico con dicho ácido nucleico molde, emparejar al menos un finalizador oligonucleotídico con dicho ácido nucleico molde, opcionalmente en el que el finalizador oligonucleotídico se hibrida con al menos un cebador oligonucleotídico adicional por un par de marcadores de secuencia complementarios en el finalizador y cebador, en el que uno cualquiera de los finalizadores oligonucleotídicos comprende un marcador de secuencia o se hibrida con un marcador de secuencia, y uno cualquiera de los cebadores oligonucleotídicos comprende un marcador de secuencia o se hibrida con un marcador de secuencia, y en el que el marcador de secuencia no se empareja con el molde, elongar el al menos un cebador oligonucleotídico de una manera específica de molde hasta que el ácido nucleico producto de elongación alcanza la posición de un finalizador oligonucleotídico, por lo que se detiene la reacción de elongación, en el que en dicha reacción de elongación dicho finalizador oligonucleotídico no se elonga, y en el que el ácido nucleico producto elongado se liga con (i) el extremo 5' de dicho finalizador oligonucleotídico que se hibrida con la cadena molde o con (ii) un marcador de secuencia que se hibrida con dicho finalizador en las cercanías del extremo 3' del producto elongado proporcionando el marcador de secuencia hibridado a una región complementaria del finalizador oligonucleotídico que está unido al extremo 5' de la región hibridada con el molde del finalizador; o

C) obtener dicho ácido nucleico molde, que es preferentemente ARN o ADN, emparejar un primer cebador oligonucleotídico con dicho ácido nucleico molde, emparejar al menos un cebador oligonucleotídico adicional con dicho ácido nucleico molde, en el que uno cualquiera de los cebadores oligonucleotídicos y uno cualquiera de los cebadores oligonucleotídicos adicionales comprende un marcador de secuencia o se hibrida con un marcador de secuencia, y en el que el marcador de secuencia no se empareja con el molde,

elongar dicho primer cebador oligonucleotídico de una manera específica de molde hasta que el ácido nucleico producto de elongación alcanza la posición de uno de dichos cebadores oligonucleotídicos adicionales, por lo que se detiene la reacción de elongación, y se elonga al menos un cebador oligonucleotídico adicional de una manera específica de molde, en el que el ácido nucleico producto elongado detenido se liga con (i) el extremo 5' de dicho cebador oligonucleotídico adicional que se hibrida con la cadena molde o con (ii) un marcador de secuencia que se hibrida con dicho cebador en las cercanías del extremo 3' del producto elongado proporcionando el marcador de secuencia hibridado a una región complementaria del cebador adicional que está unido al extremo 5' de la región hibridada con el molde del cebador adicional;

en el que en A, B y C el producto de elongación se selecciona o amplifica usando un cebador que hibrida con el marcador de secuencia en el finalizador o cebador adicional.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2012/068250.

Solicitante: Lexogen GmbH.

Nacionalidad solicitante: Austria.

Dirección: Campus-Vienna-Biocenter 5, Helmut Qualtinger-Gasse 6 1030 Vienna AUSTRIA.

Inventor/es: MOLL,PAMELA, SEITZ,ALEXANDER, NAPORA,MAGDALENA ANNA.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2686043_T3.pdf

 

Patentes similares o relacionadas:

Dispositivo de captura directa desechable, del 20 de Febrero de 2019, de EMD Millipore Corporation: Un dispositivo 20 de preparación de muestras líquidas, flexible, desechable, que comprende: un cuerpo plegable que tiene un compartimiento interno definido […]

Métodos para tratar o prevenir el asma administrando un antagonista de IL-4R, del 20 de Febrero de 2019, de Sanofi Biotechnology: Una composición farmacéutica que comprende un anticuerpo o un fragmento de unión al antígeno del mismo que se une específicamente a receptor de interleuquina-4 (IL-4R) […]

Materiales y métodos para pronóstico de evolución de esófago de Barrett, del 20 de Febrero de 2019, de Academisch Medisch Centrum: Un método de progresión de pronóstico de esófago de Barrett en un paciente, comprendiendo dicho método: (a) contactar una muestra de células esofágicas obtenidas […]

Materiales y métodos para evaluar la progresión del cáncer de próstata, del 20 de Febrero de 2019, de Abbott Molecular Inc: Un método para distinguir entre un paciente con adenocarcinoma prostático agresivo y un paciente con adenocarcinoma prostático indolente, método […]

Sistema de detección molecular mejorado, del 20 de Febrero de 2019, de THE UNIVERSITY OF BIRMINGHAM: Un sensor molecular para detectar moléculas diana en una solución que fluye usando dicroísmo, comprendiendo el sensor molecular: un canal de flujo […]

Procedimientos de ensayo asistidos por coagente de unión, del 19 de Febrero de 2019, de Glezer, Eli N: Procedimiento para llevar a cabo un ensayo de unión que comprende: (a) poner en contacto una muestra que comprende un analito de interés con: (i) una superficie […]

Marcador epigenético para la identificación de linfocitos T il17 positivos en muestras complejas, del 19 de Febrero de 2019, de Epiontis GmbH: Un procedimiento para identificar y cuantificar linfocitos T CD4 positivos IL-17 positivos en una muestra de sangre y/o tejido obtenida de un mamífero, que comprende […]

Fosfodiesterasa 4D7 como marcador de cáncer de próstata, del 19 de Febrero de 2019, de KONINKLIJKE PHILIPS N.V: Fosfodiesterasa 4D7 (PDE4D7) para uso en un método de diagnóstico, detección, monitorización o pronóstico in vivo del cáncer de próstata, o de diagnóstico, […]

Otras patentes de la CIP C12Q1/68