Determinación de haplotipos de KIR por amplificación de exones.

Un procedimiento para determinar genotipos de KIR mediante el análisis de uno y el mismo exón en los 16 genes KIR para uno o más individuos en paralelo,

comprendiendo el procedimiento:

(a) para cada individuo, realizar una reacción de amplificación con al menos un par de cebadores que consisten en un cebador directo y un cebador inverso, comprendiendo cada cebador una secuencia adaptadora, una secuencia de identificación individual y una secuencia de hibridación con KIR, para amplificar las secuencias de exones de los genes KIR que comprenden sitios polimórficos para obtener amplicones de KIR;

(b) combinar los amplicones de KIR de cada uno de los uno o más individuos obtenidos en la etapa (a); (c) realizar PCR en emulsión;

(d) determinar la secuencia de cada amplicón de KIR para cada individuo usando pirosecuenciación en paralelo; y

(e) asignar los alelos de KIR a cada individuo comparando la secuencia de los amplicones de KIR determinada en la etapa (d) con secuencias de KIR conocidas para determinar qué alelos de KIR están presentes en el individuo,

en el que al menos uno de dichos cebadores es genérico para todos o para un subconjunto de genes KIR y en el que dichos cebadores se seleccionan de manera que cada uno de los al menos un exón en cada uno de los 16 genes KIR se amplifica con especificidad suficiente para permitir la determinación inequívoca del genotipo de KIR a partir de los amplicones.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2010/005721.

Solicitante: Roche Diagniostics GmbH.

Nacionalidad solicitante: Alemania.

Dirección: Sandhofer Straße 116 68305 Mannheim ALEMANIA.

Inventor/es: ERLICH, HENRY, A., BENTLEY,Gordon, GOODRIDGE,DAMIAN, LADNER,MARTHA, TRACHTENBERG,ELIZABETH.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2661055_T3.pdf

 

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