Captura de conformación cromosómica circular (4C).

Un método para analizar la frecuencia de interacción de dos o más secuencias de nucleótidos cebo con una o más secuencias de nucleótidos de interés (por ejemplo uno o más locus genómicos) que comprende las etapas de:



(a) proporcionar una muestra de ADN entrecruzado;

(b) digerir el ADN entrecruzado con una enzima de restricción primaria;

(c) ligar las secuencias de nucleótidos entrecruzadas;

(d) invertir el entrecruzamiento;

(e) opcionalmente, digerir las secuencias de nucleótidos con una enzima de restricción secundaria;

(f) opcionalmente, ligar una o más secuencias de ADN de composición nucleotídica conocida, con el sitio o sitios de digestión de la enzima de restricción secundaria disponibles que flanquea(n) la una o más secuencias de nucleótidos de interés;

(g) amplificar la una o más secuencias de nucleótidos de interés utilizando al menos dos cebadores oligonucleotídicos, hibridándose cada cebador con las secuencias de ADN que flanquean las secuencias de nucleótidos de interés utilizando PCR múltiple;

(h) hibridar la secuencia o secuencias amplificadas con una matriz; y

(i) determinar la frecuencia de interacción entre las secuencias de ADN, en el que los productos de ligamiento entre las secuencias cebo y las secuencias entrecruzadas se analizan mediante secuenciación de alto rendimiento.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/IB2008/000625.

Solicitante: ERASMUS UNIVERSITY MEDICAL CENTER.

Inventor/es: GROSVELD,FRANK, DE LAAT,WOUTER.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2634266_T3.pdf

 

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