Ensayo de captura en chip (4C) de conformación cromosómica.
Un método para analizar la frecuencia de interacción de una secuencia nucleotídica diana con una o más secuencias nucleotídicas de interés (por ejemplo,
uno o más loci genómicos) que comprende las etapas de:
(a) proporcionar una muestra de ADN entrecruzado;
(b) digerir el ADN entrecruzado con una enzima de restricción primaria;
(c) ligar las secuencias nucleotídicas entrecruzadas;
(d) revertir el entrecruzamiento;
(e) digerir las secuencias nucleotídicas con una enzima de restricción secundaria;
(f) ligar una o más secuencias de ADN de composición nucleotídica conocida con el sitio o sitios disponibles de digestión por enzima de restricción secundaria que flanquean la una o más secuencias nucleotídicas de interés;
(g) amplificar la una o más secuencias nucleotídicas de interés usando al menos dos cebadores oligonucleotídicos, en el que cada cebador hibrida con las secuencias de ADN que flanquean las secuencias nucleotídicas de interés;
(h) hibridar la secuencias o secuencias amplificadas en una serie; y
(i) determinar la frecuencia de interacción entre las secuencias de ADN.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/IB2006/002268.
Solicitante: ERASMUS UNIVERSITY MEDICAL CENTER.
Inventor/es: GROSVELD,FRANK, DE LAAT,WOUTER.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/68 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
PDF original: ES-2556113_T3.pdf
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