Ensayo de captura en chip (4C) de conformación cromosómica.

Un método para analizar la frecuencia de interacción de una secuencia nucleotídica diana con una o más secuencias nucleotídicas de interés (por ejemplo,

uno o más loci genómicos) que comprende las etapas de:

(a) proporcionar una muestra de ADN entrecruzado;

(b) digerir el ADN entrecruzado con una enzima de restricción primaria;

(c) ligar las secuencias nucleotídicas entrecruzadas;

(d) revertir el entrecruzamiento;

(e) digerir las secuencias nucleotídicas con una enzima de restricción secundaria;

(f) ligar una o más secuencias de ADN de composición nucleotídica conocida con el sitio o sitios disponibles de digestión por enzima de restricción secundaria que flanquean la una o más secuencias nucleotídicas de interés;

(g) amplificar la una o más secuencias nucleotídicas de interés usando al menos dos cebadores oligonucleotídicos, en el que cada cebador hibrida con las secuencias de ADN que flanquean las secuencias nucleotídicas de interés;

(h) hibridar la secuencias o secuencias amplificadas en una serie; y

(i) determinar la frecuencia de interacción entre las secuencias de ADN.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/IB2006/002268.

Solicitante: ERASMUS UNIVERSITY MEDICAL CENTER.

Inventor/es: GROSVELD,FRANK, DE LAAT,WOUTER.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2556113_T3.pdf

 

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