Diseño racional de componentes de la glucosilación con asparagina unida catalizada por oligosacariltransferasa.

Un método para identificar un posible componente para la glucosilación con asparagina unida ("unida por N") catalizada por oligosacariltransferasa (OST) seleccionado del grupo que consiste en

(a) un posible donante de oligosacáridos,

preferiblemente un oligosacárido unido a un lípido (OUL) o

un donante de oligosacárido unido a pirofosfato de undecaprenilo,

(b) una posible oligosacariltransferasa (OST),

(c) un posible polipéptido con motivo de secuencia consenso, y

(d) un posible inhibidor de glucosilación,

que comprende las etapas siguientes

(i) utilizar las coordenadas atómicas de la Tabla 1, preferiblemente ±2, más preferiblemente ±1,5, aún más preferiblemente ±1,0 Å de error cuadrático medio (ecm) de los átomos de la cadena principal, para generar un modelo tridimensional del dominio catalítico de la oligosacariltransferasa (OST) de Campylobacter lari, que comprende al menos uno, dos, tres, cuatro, cinco, seis, siete, más preferiblemente todos los amino ácidos D56, R147, D154, D156, E319, R375, Y468 y H485, y/o, preferiblemente y

(ii) utilizar las coordenadas atómicas de la Tabla 1, preferiblemente ±2, más preferiblemente ±1,5, aún más preferiblemente 1,0 Å de error cuadrático medio (ecm) de los átomos de la cadena principal, para generar un modelo tridimensional del punto de unión al polipéptido de la oligosacariltransferasa (OST) de Campylobacter lari, que comprende al menos uno, dos, tres, cuatro, cinco, más preferiblemente todos los aminoácidos M318, R331, W463, W464, D465 e I572,

(iii) llevar a cabo preferiblemente traslaciones y/o rotaciones de todo el conjunto en las coordenadas de los aminoácidos de los modelos tridimensionales de (i) y/o (ii),

(iv) utilizar dicho(s) modelo(s) tridimensional(es) de (i), (ii) y/o (iii) para diseñar o seleccionar al menos uno de los posibles componentes (a) a (d),

(v) proporcionar al menos uno de dichos componentes posibles (a) a (d), y

(vi) poner en contacto al menos uno de dichos posibles componentes (a) a (d) con los demás componentes funcionales necesarios para una glucosilación con asparagina unida ("unida por N") catalizada por oligosacariltransferasa (OST),

(vii) identificar un componente funcional seleccionado del grupo que consiste en

(A) un donante de oligosacárido funcional, preferiblemente un donante de oligosacáridos unido a un lípido funcional (OUL) o un donante de oligosacáridos unido a pirofosfato de undecaprenilo,

(B) una oligosacariltransferasa funcional (OST),

(C) un polipéptido funcional con motivo de secuencia consenso, y

(D) un inhibidor de glucosilación funcional.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2012/001902.

Solicitante: ETH ZURICH.

Nacionalidad solicitante: Suiza.

Dirección: RÄEMISTRASSE 101/ETH TRANSFER 8092 ZURICH SUIZA.

Inventor/es: AEBI, MARKUS, LOCHER,KASPAR, LIZAK,CHRISTIAN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/48 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que interviene una transferasa.

PDF original: ES-2587302_T3.pdf

 

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