Marcador del tratamiento con inhibidor de EGFR.

Método in vitro para predecir la respuesta de un paciente con NSCLC al tratamiento con erlotinib,

que comprende:determinar un nivel de expresión de un gen PSPH en una muestra tumoral de un paciente y comparar el nivel deexpresión del gen PSPH con un valor representativo de un nivel de expresión del gen PSPH en tumores de unapoblación de pacientes no respondedores, en el que un nivel de expresión más alto del gen PSPH en la muestratumoral del paciente es indicativo de un paciente que responderá al tratamiento, en el que se ha definido el beneficioclínico como manifestar una respuesta objetiva o la estabilización de la enfermedad durante 12 semanas

Marcador del tratamiento con inhibidor de EGFR

La presente invención proporciona un biomarcador que es predictivo de la respuesta al tratamiento con erlotinib en pacientes con NSCLC.

Varios tumores malignos humanos se asocian a la expresión aberrante o a la sobreexpresión del receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR) . El EGF, el factor a de crecimiento transformante (TGF-a) , y algunos otros ligandos, se unen al EGFR, estimulando la autofosforilación del dominio intracelular de tirosina quinasa del receptor. Seguidamente se activa una diversidad de rutas intracelulares, y estos sucesos posteriores resultan en la proliferación de las células tumorales in vitro. Se ha planteado que la estimulación de las células tumorales mediante el EGFR podria resultar importante para el crecimiento y la supervivencia tumorales in vivo.

Los primeros datos clinicos con Tarceva, un inhibidor de la EGFR tirosina quinasa, indican que el compuesto es seguro y que generalmente resulta bien tolerado a dosis que proporcionan la concentracion efectiva objetivo (determinada a partir de datos preclínicos) . Los ensayos clinicos de fase I y II en paciente con enfermedad avanzada han demostrado que Tarceva presenta una actividad clinica prometedora en un abanico de tumores epiteliales. En efecto se ha demostrado que Tarceva es capaz de inducir remisiones parciales duraderas en pacientes previamente tratados con cancer de cabeza y cuello y NSCLC (cancer pulmonar de celulas no pequenas) de un orden similar a la quimioterapia de segunda linea establecida, aunque con el beneficio anadido de un mejor perfil de seguridad que la quimioterapia y una mayor comodidad (administracion con tableta en lugar de intravenosa [i.v.]) . Un ensayo aleatorizado, de doble ciego y controlado con placebo completado recientemente (BR.21) ha demostrado que el agente unico Tarceva prolonga y mejora significativamente la supervivencia de los pacientes con NSCLC para los que la terapia estandar para la enfermedad avanzada ha fracasado.

Tarceva (erlotinib) es una molecula quimica pequena; es un inhibidor selectivo potente activo oralmente de la EGFR tirosina quinasa (EGFR-TKI) .

El cancer de pulmon es la causa principal de muertes relacionadas con el cancer en Norteamerica y Europa. En los Estados Unidos, el número de muertes secundarias a cáncer de pulmón excede el número combinado total de muertes de la segunda (colon) , tercera (mama) y cuarta (prostata) causas principales del total de muertes por cáncer. Aproximadamente 75% a 80% del total de cánceres de pulmón son cáncer pulmonar de células no pequenas (NSCLC) , presentando aproximadamente 40% de los pacientes una enfermedad localmente avanzada y/o irresecable. Este grupo tipicamente incluye los pacientes con enfermedad voluminosa de estadios IIIA y IIIB, excluyendo las efusiones pleurales malignas.

La incidencia bruta del cáncer de pulmón en la Union Europea es de 52, 5 y la tasa de mortalidad, de 48, 7 casos/100.000/ano. Entre hombres, las tasas son de 79, 3 y 78, 3, y entre mujeres, de 21, 6 y 20, 5, respectivamente. NSCLC representa 80% de todos los casos de cáncer de pulmón. Aproximadamente 90% de la mortalidad por cancer de pulmon en hombres, y 80% en mujeres, es atribuible al tabaquismo.

En los EUA, segun la American Cancer Society, durante 2004 se produjeron aproximadamente 173.800 nuevos casos de cancer de pulmon (93.100 en hombres y 80.700 en mujeres) , representando aproximadamente 13% de todos los nuevos cánceres. La mayoria de pacientes muere como consecuencia de su enfermedad en los dos anos posteriores al diagnóstico. Para muchos pacientes con NSCLC, el tratamiento con éxito sigue siendo inalcanzable. Los tumores avanzados con frecuencia no admiten la cirugia y tambien pueden ser resistentes a dosis tolerables de radioterapia y quimioterapia. En ensayos aleatorizados, las quimioterapias de combinacion actualmente mas activas consiguieron tasas de respuesta de aproximadamente 30% a 40% y una tasa de supervivencia a 1 ano de entre 35% y 40%. Esto constituye un avance respecto a la tasa de supervivencia a 1 ano del 10% observada con solo cuidados de apoyo.

Hasta recientemente las opciones terapeuticas para los pacientes despues de la recaida se limitaban al mejor cuidado de apoyo disponible o a la paliacion. Un ensayo reciente que compara el docetaxel (Taxotere) con los mejores cuidados de apoyo ha demostrado que los pacientes con NSCLC podrian beneficiarse de la quimioterapia de segunda línea tras el fracaso de los regímenes de primera línea basados en cisplatino. Los pacientes de todas las edades y con estado funcional ECOG de 0, 1 o 2 mostraron una supervivencia mejorada con el docetaxel, al igual que aquellos refractarios al tratamiento previo basado en platino. Entre los pacientes que no se beneficiaron de la terapia se incluian aquellos con una perdida de peso del 10%, niveles elevados de lactato deshidrogenasa, compromiso multiorgánico o compromiso hepático. Además, el beneficio de la monoterapia con docetaxel no se extendió más allá del tratamiento de segunda línea. Los pacientes que recibieron docetaxel como tratamiento de tercera línea o posteriormente no mostraron ninguna prolongación de la supervivencia. El docetaxel como único agente se ha convertido en una terapia de segunda línea estándar para el NSCLC. Recientemente, otro ensayo de fase III aleatorizado en la terapia de segunda linea del NSCLC ha comparado el pemetrexed (Alimta®) con el docetaxel. El tratamiento con pemetrexed resultó en una eficacia clínicamente equivalente aunque con significativamente menos efectos secundarios que el docetaxel.

Se admite desde hace mucho que existe una necesidad de desarrollar métodos para individualizar el tratamiento del cáncer. Con el desarrollo de los tratamientos personalizados del cancer, existe un particular interes en las metodologías que podrían proporcionar un perfil molecular de la diana tumoral (es decir, aquéllas que son predictivas de beneficio clínico) . Ya se ha establecido la prueba de principio para el perfilado de la expresión génica en el NSCLC, con la clasificacion molecular de tipos tumorales que no resultan evidentes basandose en los ensayos morfológicos e inmunohistoquímicos actuales.

Por lo tanto, es un objetivo de la presente invencion proporcionar biomarcadores de expresion que sean predictivos del beneficio clínico del tratamiento con erlotinib en los pacientes con NSCLC.

En un primer objetivo, la presente invención proporciona un método in vitro para predecir el beneficio clínico de un paciente con NSCLC en respuesta al tratamiento con erlotinib, que comprende las etapas siguientes:

determinar un nivel de expresión de un gen PSPH en una muestra tumoral de un paciente y comparar el nivel de expresión del gen PSPH con un valor representativo de un nivel de expresión del gen PSPH en tumores de una población de pacientes no respondedores, en el que un nivel de expresión más alto del gen PSPH en la muestra tumoral del paciente es indicativo de un paciente que responderá al tratamiento, en el que se ha definido el beneficio clinico como manifestar una respuesta objetiva o la estabilizacion de la enfermedad durante 12 semanas.

La expresión “un valor representativo de un nivel de expresión de PSPH en tumores de una población de pacientes no respondedores” se refiere a una estimación del nivel de expresión medio del gen marcador en una población de pacientes que no responden al tratamiento con erlotinib.

En una realizacion preferente, el gen marcador PSPH (SEC ID nº muestra típicamente un nivel de expresión entre 1, 8 y 3, 7 o mas veces superior en la muestra tumoral del paciente respondedor que un valor representativo del nivel de expresión del gen PSPH en tumores de una población de pacientes no respondedores.

En una realizacion preferente, el nivel de expresion del gen PSPH se determina mediante tecnologia de micromatrices u otras tecnologias que evaluan los niveles de expresion del ARN, tales como la RT-PCR cuantitativa o mediante cualquier metodo que analice el nivel de expresion de la proteina respectiva, por ejemplo la inmunohistoquímica (IHC) . La construccion y utilizacion de chips genicos es bien conocida de la tecnica, ver las patentes US nº 5.202.231, n° 5.445.934, n° 5.525.464, n° 5.695.940, n° 5.744.305, n° 5.795.716 y n° 5.800.992. Ver tambien Johnston M., Curr. Biol. 8:R171-174, 1998; Lyer V.R. et al., Science 283:83-87, 1999. Evidentemente el nivel de expresión génica puede determinarse mediante otros métodos que son conocidos por el experto en la materia, tales como, por ejemplo, transferencias northern, RT-PCR, PCR cuantitativa en tiempo real, extensión de cebadores, proteccion frente a ARNasa y perfilado de expresion del ARN.

1.Método in vitro para predecir la respuesta de un paciente con NSCLC al tratamiento con erlotinib, que comprende:

determinar un nivel de expresion de un gen PSPH en una muestra tumoral de un paciente y comparar el nivel de expresión del gen PSPH con un valor representativo de un nivel de expresión del gen PSPH en tumores de una población de pacientes no respondedores, en el que un nivel de expresión más alto del gen PSPH en la muestra tumoral del paciente es indicativo de un paciente que responderá al tratamiento, en el que se ha definido el beneficio clinico como manifestar una respuesta objetiva o la estabilizacion de la enfermedad durante 12 semanas.

2.Metodo segun la reivindicacion 1, en el que se determina el nivel de expresion mediante tecnología de micromatrices.

3. Metodo segun la reivindicacion 1 o 2, en el que el gen marcador muestra un nivel de expresion entre 1, 8 y 3, 7 o más veces superior en la muestra tumoral del paciente respondedor que el valor representativo de un nivel de expresión del gen PSPH en tumores de una población de pacientes no respondedores, en el que se define la poblacion beneficiada como la que manifiesta una respuesta objetiva o la estabilizacion de la enfermedad durante 12 semanas