ENZIMAS QUE TIENEN ACTIVIDAD DE ALFA-AMILASA Y MÉTODOS DE USO DE LAS MISMAS.

Enzimas que tienen actividad de alfa-amilasa y métodos de uso de las mismas Campo de la Invención [0001] Esta invención se refiere en general a las enzimas, a los polinucleótidos que codifican las enzimas, al uso de tales polinucleótidos y polipéptidos, y más específicamente, a las enzimas que tienen actividad de alfa-amilasa. Antecedentes de la Invención [0002] El almidón es un carbohidrato complejo que se encuentra a menudo en la dieta humana. La estructura del almidón es polímeros de glucosa enlazados por enlaces -1,4 y -1,6 glucosídicos. La amilasa es una enzima que cataliza la hidrólisis de los almidones para su transformación en azúcares. Las amilasas hidrolizan enlaces -1,4- glucosídicos internos en el almidón, en gran medida aleatoriamente, para así producir maltodextrinas de menor peso molecular. La descomposición del almidón es importante en el sistema digestivo y comercialmente. Las amilasas son de considerable valor comercial, siendo usadas en las etapas iniciales (licuefacción) del procesamiento de almidón; en la molienda de maíz en húmedo; en la producción de alcohol; como agentes limpiadores en matrices de detergente; en la industria textil para el desalmidonado; en aplicaciones de horneo; en la industria de las bebidas; en campos petrolíferos en procesos de perforación; en el entintado de papel reciclado y en piensos para animales. Las amilasas son también útiles en el desencolado textil, en procesos de fermentación, en la modificación del almidón en la industria del papel y de la pasta papelera y en otros procesos descritos en la técnica. [0003] Las amilasas son producidas por una amplia variedad de microorganismos entre los que se incluyen los Bacillus y los Aspergillus, siendo las de la mayoría de las amilasas comerciales producidas a partir de fuentes bacterianas tales como Bacillus licheniformis, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus subtilis o Bacillus stearothermophilus. En los últimos años, las enzimas que han venido siendo usadas comercialmente han venido siendo las obtenidas de Bacillus licheniformis debido a su estabilidad térmica y a su actuación, al menos a pHs neutros y moderadamente alcalinos. [0004] La FR 2 778 412 A1 y Lévêque et al., FEMS Microbiol Lett. 1 mayo 2000; 186(1):67-71 describen un proceso para producir -amilasa termofílica que comprende la expresión del gen de -amilasa de Thermococcus hydrothermalis en E. coli. [0005] En general, el procesamiento del almidón para su conversión en fructosa consta de cuatro pasos: licuefacción del almidón granular, sacarificación del almidón licuado para su conversión en dextrosa, purificación e isomerización a fructosa. El objeto de un proceso de licuefacción de almidón es el de convertir una suspensión concentrada de gránulos de polímero de almidón en una solución de dextrinas solubles de baja viscosidad y de menor longitud de cadena. Este paso es esencial para la cómoda manipulación con equipos estándar y para una eficiente conversión en glucosa u otros azúcares. Para licuar el almidón granular es necesario gelatinizar los gránulos aumentando la temperatura del almidón granular hasta más de aproximadamente 72ºC. El proceso de calentamiento rompe instantáneamente los gránulos de almidón insolubles para así producir una solución de almidón hidrosoluble. La solución de almidón solubilizada es luego licuada por amilasa. Un gránulo de almidón se compone de: un 69-74% de amilopectina, un 26-31% de amilosa, un 11- 14% de agua, un 0,2-0,4% de proteína, un 0,5-0,9% de lípido, un 0,05-0,1% de ceniza, un 0,02-0,03% de fósforo y un 0,1% de pentosan. Aproximadamente un 70% de un gránulo es amorfo y un 30% es cristalino. [0006] Un proceso de licuefacción enzimática común supone ajustar el pH de una lechada de almidón granular a un valor situado entre 6,0 y 6,5, que es el óptimo valor pH de la alfa-amilasa derivada de Bacillus licheniformis, con adición de hidróxido de calcio, hidróxido sódico o carbonato sódico. La adición de hidróxido de calcio tiene la ventaja de proporcionar también iones de calcio, que se sabe que estabilizan a la alfa-amilasa contra la inactivación. Tras la adición de alfa-amilasa, la suspensión es bombeada a través de un chorro de vapor para aumentar instantáneamente la temperatura hasta un valor situado entre 80 grados y 115 grados C. El almidón es inmediatamente gelatinizado y, debido a la presencia de la alfa-amilasa, despolimerizado por la alfa-amilasa mediante hidrólisis aleatoria de enlaces glicosídicos a-(1-4), siendo así convertido en una masa fluida que se bombea fácilmente. [0007] En una segunda variación del proceso de licuefacción, la alfa-amilasa es añadida a la suspensión de almidón, la suspensión es mantenida a una temperatura de 80-100 grados C para hidrolizar parcialmente los gránulos de almidón, y la suspensión de almidón parcialmente hidrolizado es bombeada a través de un chorro que está a temperaturas de más de aproximadamente 105 grados C para así gelatinizar a fondo toda estructura granular restante. Tras haber enfriado el almidón gelatinizado, puede hacerse una segunda adición de alfa-amilasa para hidrolizar adicionalmente el almidón. [0008] Una tercera variación de este proceso es el llamado proceso de molienda en seco. En la molienda en seco se muele grano entero y se le combina con agua. El germen es opcionalmente eliminado mediante separación por flotación o bien mediante técnicas equivalentes. La mezcla resultante, que contiene almidón, fibra, proteína y otros componentes del grano, es licuada usando alfa-amilasa. La práctica general en la técnica es la de realizar la licuefacción enzimática a una temperatura más baja cuando se usa el proceso de molienda en seco. En general se cree que la licuefacción a baja 2   temperatura es menos eficiente que la licuefacción a alta temperatura para la conversión de almidón en dextrinas solubles. [0009] Típicamente, tras la gelatinización la solución de almidón es mantenida a una temperatura elevada en presencia de alfa-amilasa hasta ser alcanzado un DE de 10-20, lo cual representa habitualmente un periodo de tiempo de 1-3 horas. El equivalente de dextrosa (DE) es el estándar industrial para medir la concentración de azúcares reductores totales, calculada como D-glucosa sobre la base del peso en seco. El almidón granular no hidrolizado tiene un DE de virtualmente cero, mientras que el DE de la D-glucosa es por definición de 100. [0010] La molienda de maíz en húmedo es un proceso que produce aceite de maíz, harina de gluten, pienso de gluten y almidón. A menudo se usa amilasa alcalina en la licuefacción de almidón y se usa glucoamilasa en la sacarificación, produciendo glucosa. El maíz, que es un grano que consta de un revestimiento exterior de la semilla (fibra), almidón, una combinación de almidón y glucosa y el germen interior, es sometido a un proceso que se desarrolla en cuatro pasos y redunda en la producción de almidón. El maíz es puesto en remojo, desgerminado y desfibrado, y finalmente se separa el gluten. En el proceso de maceración se quitan los solubles. El producto que queda tras haber quitado los solubles es desgerminado, lo cual redunda en una producción de aceite de maíz y una producción de una torta de aceite que es añadida a los solubles del paso de maceración. El producto que queda es desfibrado y los sólidos de fibra son añadidos a la mezcla de torta de aceite y solubles. La mezcla de sólidos de fibra, torta de aceite y solubles forma un pienso de gluten. Tras el desfibrado, el producto que queda es sometido a separación del gluten. Esta separación redunda en harina de gluten y almidón. El almidón es luego sometido a licuefacción y sacarificación para producir glucosa. [0011] El enranciamiento de los productos horneados (tal como el pan) ha sido reconocido como un problema que se agrava en la medida en que media un mayor espacio de tiempo entre el momento de preparación del producto de panificación y el momento de su consumo. El vocablo enranciamiento se usa para describir cambios indeseables para el consumidor en las propiedades del producto de panificación tras haber salido el mismo del horno, tales como un incremento de la firmeza de la miga, una disminución de la elasticidad de la miga y cambios en la costra, que deviene dura y correosa. La firmeza de la miga del pan sigue aumentando durante el almacenamiento hasta llegar a alcanzar un nivel que se considera negativo. El incremento de la firmeza de la miga, que es considerado como el aspecto más importante del enranciamiento, es reconocido por el consumidor mucho tiempo antes de que el producto de panificación haya llegado a ser de otra manera inadecuado para el consumo. [0012] El proceso de preparación de jarabe contiene proporciones de polímeros con grados de polimerización (DP) de 4 o más, lo cual podría ser perjudicial.... [Seguir leyendo]

1. Ácido nucleico aislado, sintético o recombinante que comprende una secuencia seleccionada de entre los miembros del grupo que consta de: (a) la ID SEC Nº: 1, (b) que codifica un polipéptido que tiene una secuencia como la expuesta en la ID SEC Nº: 2, o un fragmento enzimáticamente activo que tiene actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2 de una longitud de al menos 75, 100 o 150 residuos de aminoácidos; (c) que codifica un polipéptido que tiene actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2 y (I) tiene al menos una identidad secuencial de un 90% en toda la longitud de la ID SEC Nº: 1, o (II) tiene una longitud de al menos 200 nucleótidos de la ID SEC Nº: 1 y tiene una identidad secuencial de al menos un 95% con la ID SEC Nº: 1, o (III) tiene una longitud de al menos 150 nucleótidos de la ID SEC Nº: 1 y tiene una identidad secuencial de al menos un 97% con la ID SEC Nº: 1, o (IV) tiene una longitud de al menos 75 nucleótidos de la ID SEC Nº: 1 y tiene una identidad secuencial de al menos un 99% con la ID SEC Nº: 1; (d) que codifica un polipéptido que tiene actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2 y (I) tiene una identidad secuencial de al menos un 95% con la ID SEC Nº: 2, o (II) tiene un fragmento enzimáticamente activo de (I) y al menos una longitud de 150 residuos de aminoácidos y tiene una identidad secuencial de al menos un 95% con la ID SEC Nº: 2, o un fragmento enzimáticamente activo de (I) una longitud de al menos 75 residuos de aminoácidos y tiene una identidad secuencial de al menos un 98% con la ID SEC Nº: 2; o bien (e) secuencias plenamente complementarias de (a), (b), (c) o (d), en donde la identidad secuencial se determina usando un algoritmo de comparación de secuencias que consta del algoritmo FASTA, versión 3.0t78, con los parámetros por defecto. 2. Polipéptido aislado, sintético o recombinante seleccionado de entre los miembros del grupo que consta de: (a) una secuencia de aminoácidos como la expuesta en la ID SEC Nº: 2 o un fragmento enzimáticamente activo de la ID SEC Nº: 2 que tenga actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2 de una longitud de al menos 75, 100 o 150 residuos de aminoácidos; (b) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico de la reivindicación 1 (a) a 1 (d) que tenga actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2; (c) una secuencia de aminoácidos (I) que tenga al menos una identidad secuencial de un 95% a todo lo largo de la ID SEC Nº: 2; o (II) que tenga un fragmento enzimáticamente activo de (I) una longitud de al menos 150 residuos de aminoácidos y tenga una identidad secuencial de al menos un 95% con la ID SEC Nº: 2, o un fragmento enzimáticamente activo de (I) una longitud de al menos 75 residuos de aminoácidos y que tenga una identidad secuencial de al menos un 98% con la ID SEC Nº: 2, en donde el polipéptido de (I) o (II) tiene una actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2; en donde la identidad secuencial se determina usando un algoritmo de comparación de secuencias que consta del algoritmo FASTA, versión 3.0t7, con los parámetros por defecto 3. Ácido nucleico según la reivindicación 1 que codifica un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos de (a), (b), (c), (d) o (e) de la reivindicación 1, que comprende una secuencia señal o un péptido o polipéptido heterólogo. 4. Polipéptido según la reivindicación 2 que comprende una secuencia de aminoácidos de (a), (b) o (c) de la reivindicación 2 que comprende una secuencia señal o un péptido o polipéptido heterólogo. 5. Anticuerpo aislado o recombinante que se une específicamente a un polipéptido seleccionado de entre los miembros del grupo que consta de: (a) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; y (b) un polipéptido codificado por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1. 6. El anticuerpo de la reivindicación 5, en donde los anticuerpos son policlonales o monoclonales. 7. Método que es para producir un polipéptido y comprende los pasos de introducir en una célula huésped un ácido nucleico que codifica un polipéptido, y cultivar la célula huésped bajo condiciones que permitan la expresión del polipéptido, en donde el polipéptido es seleccionado de entre los miembros del grupo que consta de: (a) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; y (b) un polipéptido codificado por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1. 8. Método que es para generar un polinucleótido variante y comprende los pasos de: obtener un ácido nucleico que comprenda a un polinucleótido como el que se expone en la reivindicación 1 o que codifique un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; y 52   modificar uno o varios nucleótidos de dicho polinucleótido para convertirlo en otro nucleótido, delecionar uno o varios nucleótidos de dicho polinucleótido, o añadir uno o varios nucleótidos a dicho polinucleótido. 9. El método de la reivindicación 8, en donde las modificaciones son introducidas por un método que se selecciona de entre los miembros del grupo que consta de PCR sujeta a error, reordenamiento, mutagénesis dirigida por oligonucleótidos, PCR de ensamblaje, mutagénesis por PCR sexual, mutagénesis in vivo, mutagénesis en casete, mutagénesis de ensamblaje recursivo, mutagénesis de ensamblaje exponencial, mutagénesis específica de sitio, reensamblaje de genes, mutagénesis a saturación en sitio génico y cualquier combinación de estos métodos. 10. Método que es para hidrolizar un enlace de almidón o un enlace glicosídico en una sustancia que contiene un enlace glicosídico y comprende el paso de poner a una sustancia que contenga el enlace de almidón o enlace glicosídico en contacto con un polipéptido seleccionado de entre los miembros del grupo que consta de (a) un polipéptido capaz de hidrolizar un enlace de almidón y codificado por un polinucleótido que tiene una secuencia como la que se expone en la reivindicación 1; y (b) un polipéptido capaz de hidrolizar un enlace de almidón y que tiene una secuencia como la que se expone en la reivindicación 2 bajo condiciones que facilitan la hidrólisis del enlace de almidón. 11. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de catalizar la hidrólisis de un enlace alfa- 1,4-glucosídico, que comprende el paso de poner a una muestra que contiene una composición que comprende un enlace alfa-1,4-glucosídico en contacto con un polipéptido que tiene una secuencia seleccionada de entre los miembros del grupo que consta de: (a) un polipéptido que es capaz de hidrolizar un enlace alfa-1,4-glucosídico y es codificado por un polinucleótido que tiene una secuencia como la que se expone en la reivindicación 1; y (b) un polipéptido que es capaz de hidrolizar un enlace alfa-1,4-glucosídico y que tiene una secuencia como se expone en la reivindicación 2 bajo condiciones que faciliten la hidrólisis del enlace alfa-1,4-glucosídico. 12. Ensayo para identificar a un polipéptido enzimáticamente activo, comprendiendo dicho ensayo los pasos de: poner a un polipéptido que tenga una secuencia como la que se expone en la reivindicación 2 en contacto con una molécula de sustrato bajo condiciones que le permitan al polipéptido funcionar; y detectar ya sea una disminución de la cantidad del sustrato o bien un incremento de una cantidad de un producto de reacción que resulta de una reacción entre dicho polipéptido y dicho sustrato; en donde una disminución de la cantidad del sustrato o un incremento de la cantidad del producto de reacción es indicativa(o) de un polipéptido funcional. 13. Sonda de ácido nucleico que comprende una secuencia de ácido nucleico como la que se expone en la reivindicación 1 o codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 14. La sonda de la reivindicación 13, en donde es oligonucleótido es DNA o RNA o un ácido nucleico peptídico (PNA). 15. Sonda de la reivindicación 13 o 14, en donde la sonda comprende además una etiqueta isotópica detectable, o bien comprende además una etiqueta no isotópica detectable seleccionada de entre los miembros del grupo que consta de una molécula fluorescente, una molécula quimioluminiscente, una enzima, un cofactor, un sustrato enzimático y un hapteno. 16. Preparación proteica que comprende un polipéptido seleccionado de entre los miembros del grupo que consta de: (a) un polipéptido codificado por un polinucleótido que tiene una secuencia como la que se expone en la reivindicación 1; y (b) un polipéptido que tiene una secuencia como la que se expone en la reivindicación 2. 17. La preparación proteica de la reivindicación 16, en donde la preparación proteica comprende un sólido o un líquido. 18. Vector de clonación que comprende un polinucleótido que tiene una secuencia seleccionada de entre los miembros del grupo que consta de: (a) una secuencia de ácido nucleico como la que se expone en la reivindicación 1; y (b) una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 19. Célula huésped que comprende un vector de clonación como el que se reivindica en la reivindicación 18. 53   20. Vector de expresión que es capaz de replicarse en una célula huésped y comprende un polinucleótido que tiene una secuencia seleccionada de entre los miembros del grupo que consta de (a) una secuencia de ácido nucleico como la que se expone en la reivindicación 1; y (b) una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 21. Vector como el que se reivindica en las reivindicaciones 18 a 20, en donde el vector es seleccionado de entre los miembros del grupo que consta de vectores virales, vectores plasmídicos, vectores de fago, vectores de fagémido, cósmidos, fósmidos, bacteriófagos, cromosomas artificiales, vectores de adenovirus, vectores retrovirales y vectores virales adeno-asociados. 22. Célula huésped que comprende un vector de expresión como el que se reivindica en la reivindicación 21. 23. Célula huésped como la que se reivindica en la reivindicación 19 o 22, en donde la célula huésped es una célula procariótica, una célula eucariótica, una célula fungal, una célula de levadura, una célula de insecto, una célula de mamífero o una célula vegetal. 24. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de licuar una composición con contenido de almidón, que comprende el paso de poner al almidón en contacto con un polipéptido (a) codificado por una secuencia de ácido nucleico como la que se expone en la reivindicación 1 o por un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) como el que se expone en la reivindicación 2. 25. Jarabe licuado que es producido por el método de la reivindicación 24 y tiene una relación Mn/Mw de menos de aproximadamente 2,0 al nivel de un DE de 18 y de menos de aproximadamente 4,0 al nivel de un DE de 12. 26. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de lavar un objeto, que comprende el paso de poner a dicho objeto en contacto con un polipéptido de la reivindicación 2 bajo condiciones suficientes para dicho lavado. 27. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de desencolar un textil, que comprende el paso de poner a dicho textil en contacto con un polipéptido de la reivindicación 2 bajo condiciones suficientes para dicho desencolado. 28. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende un tratamiento de fibras lignocelulósicas, en donde las fibras son tratadas con un polipéptido de la reivindicación 2. 29. El método según la reivindicación 28 para el desentintado enzimático de pasta papelera reciclada, en donde el polipéptido de la reivindicación 2 es aplicado en una cantidad que es eficiente para un efectivo desentintado de la superficie de las fibras. 30. Aditivo detergente que comprende un polipéptido de la reivindicación 2. 31. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de producir un jarabe con alto contenido de maltosa o un jarabe con alto contenido de glucosa o un jarabe mixto, comprendiendo los pasos de: licuar almidón usando una cantidad eficaz de un polipéptido de la reivindicación 2 para así obtener un hidrolizado de almidón soluble; y sacarificar el hidrolizado de almidón soluble, obteniéndose con ello un jarabe. 32. El método de las reivindicaciones 10 o 24, en donde el almidón es de un material seleccionado de entre los miembros del grupo que consta de arroz, arroz germinado, maíz, cebada, trigo, legumbres, batata, sorgo, centeno, bulgur o una combinación de los mismos. 33. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de incrementar el flujo de fluidos de producción de una formación subterránea eliminando un fluido perjudicial viscoso con contenido de almidón formado durante las operaciones de producción y que se encuentra dentro de la formación subterránea que rodea a una perforación de pozo completada, comprendiendo dicho paso los pasos de: dejar que los fluidos de producción fluyan desde la perforación del pozo; reducir el flujo de fluidos de producción de la formación a caudales inferiores a los previstos; hacer un tratamiento enzimático mezclando juntamente a un fluido acuoso y un polipéptido de la reivindicación 2; bombear el fluido de tratamiento enzimático a un punto deseado dentro de la perforación del pozo; dejar que el tratamiento enzimático degrade al fluido perjudicial viscoso con contenido de almidón, con lo cual el fluido puede sacarse de la formación subterránea a la superficie del pozo; y 54   en donde el tratamiento enzimático es eficaz para atacar los enlaces alfa-glucosídicos en el fluido con contenido de almidón. 34. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de licuar una composición que comprende almidón, comprendiendo el método el paso de poner al almidón en contacto con un polipéptido que tiene actividad de amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2, o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 35. Almidón licuado que es producido por el método de la reivindicación 34 y comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 36. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de hacer un aditivo alimentario, un espesante, un ingrediente para carga de bajo nivel calórico o un agente peliculígeno, comprendiendo dicho paso el paso de poner a una composición que comprende almidón en contacto con suficiente polipéptido que tenga actividad de alfaamilasa para licuar el almidón, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 37. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de hacer un pienso, comprendiendo dicho paso el paso de poner a una composición de pienso que comprende almidón en contacto con una cantidad de un polipéptido que tenga actividad de alfa-amilasa suficiente para licuar almidón en el pienso, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 38. El método de cualquiera de las reivindicaciones 31, 34-36, en donde el almidón es un material seleccionado de entre los miembros del grupo que consta de arroz, arroz germinado, maíz, cebada, trigo, legumbres, batata, milo, sorgo, centeno y/o bulgur o una combinación de los mismos. 39. El método de cualquiera de las reivindicaciones 26-27, 31, 33-38, que comprende además la adición de una segunda alfa-amilasa o de una beta-amilasa o de una combinación de las mismas. 40. Pienso animal que comprende un polipéptido que tiene actividad de amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 41. Composición que comprende una composición de maltodextrina uniforme hecha por un método que comprende el paso de licuar una composición que comprende almidón con un polipéptido que tiene actividad de alfaamilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 42. Aditivo alimentario, espesante, ingrediente para carga de bajo nivel calórico o agente peliculígeno que comprende jarabes licuados, jarabes licuados tratados con carbón o jarabes licuados secados por pulverización que comprenden un polipéptido que tiene actividad de amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que expone en la reivindicación 2, o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 43. Composición de pienso que comprende jarabes licuados, jarabes licuados tratados con carbón o jarabes licuados secados por pulverización que comprenden un polipéptido que tiene actividad de amilasa, en donde el polipéptido comprende   (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 44. La composición de pienso de la reivindicación 43, en donde la composición de pienso comprende un pienso que comprende almidón, o la composición de pienso comprende maíz, trigo, milo, sorgo, centeno y/o bulgur. 45. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de hacer un pienso, que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2, o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 46. El método de la reivindicación 8, en donde la variación comprende a una variación en especificidad por sustrato, unión a sustrato, patrón de escisión de sustrato, estabilidad térmica, perfil de pH/actividad, perfil de pH/estabilidad, incrementada estabilidad a un bajo pH de < 6, incrementada estabilidad a un bajo pH de < 5, incrementada estabilidad a un alto pH de > 9, estabilidad frente a la oxidación, dependencia del Ca 2+ o actividad específica, o bien es menos sensible a las condiciones depletoras de los iones de calcio. 47. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende el paso de hacer un alcohol, que comprende el paso de poner a una composición que comprende almidón en contacto con un polipéptido que tiene actividad de alfaamilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 48. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende a un proceso de molienda de maíz en húmedo que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 49. El proceso de molienda de maíz en húmedo de la reivindicación 48, en donde el proceso adicionalmente comprende el uso de un segundo polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, o de una beta-amilasa, o de otra enzima. 50. Detergente que comprende un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 51. Proceso de horneo que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 52. Bebida que comprende un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 53. Masa, producto de panadería o producto horneado que comprende un polipéptido que tiene actividad de alfaamilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 56   54. Premezcla para hornear que comprende una harina que comprende un polipéptido que tiene actividad de alfaamilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 55. Aditivo para horneo que comprende un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 56. Textil que comprende un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 57. Papel, pasta papelera o papel reciclado que comprende un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 58. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende a un proceso de perforación que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 59. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende un proceso de molienda en seco que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa para la licuefacción de grano entero molido, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 60. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende un proceso de fermentación que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 61. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende un método de procesamiento de textiles que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 62. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende a un método de procesamiento de papel, pasta papelera o papel reciclado que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 63. El método de la reivindicación 10, en donde el método comprende a un método que es para hacer una bebida y comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de alfa-amilasa, en donde el polipéptido comprende 57   (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 64. El polipéptido de la reivindicación 2, en donde la secuencia señal tiene una longitud de 13 a 36 residuos de aminoácidos. 65. Método que es para hacer un aditivo alimentario, un espesante, un ingrediente para carga de bajo nivel calórico o un agente peliculígeno y comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 66. Método que es para hacer un etanol combustible y comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 67. Proceso de campo petrolífero que comprende el uso de un polipéptido que tiene actividad de amilasa, en donde el polipéptido comprende (a) una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico como el que se expone en la reivindicación 1, o un ácido nucleico que codifica un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2; o (b) un polipéptido como el que se expone en la reivindicación 2. 68. Ácido nucleico aislado, sintético o recombinante según la reivindicación 1 que codifica un polipéptido que tiene actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2 y tiene una identidad secuencial de al menos un 97% con la ID SEC Nº: 2. 69. Ácido nucleico aislado, sintético o recombinante según la reivindicación 1 que codifica un polipéptido que tiene actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2 y tiene una identidad secuencial de al menos un 98% con la ID SEC Nº: 2. 70. Polipéptido aislado, sintético o recombinante según la reivindicación 2, que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene una identidad secuencial de al menos un 97% dentro de toda la longitud de la ID SEC Nº: 2 y tiene actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2. 71. Polipéptido aislado, sintético o recombinante según la reivindicación 2, que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene una identidad secuencial de al menos un 98% dentro de toda la longitud de la ID SEC Nº: 2 y tiene actividad de amilasa de la ID SEC Nº: 2. 72. Polipéptido aislado, sintético o recombinante según la reivindicación 2, que carece de secuencia señal. 73. Polipéptido aislado, sintético o recombinante según la reivindicación 2 que carece de secuencia señal y adicionalmente comprende una secuencia peptídica o polipeptídica heteróloga, en donde la secuencia peptídica o polipeptídica heteróloga preferiblemente comprende a una secuencia conductora, una secuencia secretora o una secuencia proproteína. 74. Polipéptido aislado, sintético o recombinante según la reivindicación 2, 72 o 73, que comprende una modificación que comprende a los miembros del grupo que consta de glicosilación, acetilación, acilación, ribosilación del ADP, amidación, unión covalente de flavina, unión covalente de una mitad heme, unión covalente de un nucleótido o un derivado nucleotídico, unión covalente de un lípido o un derivado lipídico, unión covalente de un fosfatidilinositol, ciclización reticulante, formación de enlaces disulfuro, desmetilación, formación de uniones intermoleculares covalentes, formación de cisteína, formación de piroglutamato, formilación, gamma-carboxilación, glicoxilación, un anclaje GPI, hidroxilación, yodación, metilación, miristoilación, oxidación, pegilación, procesamiento proteolítico, fosforilación, prenilación, racemización, selenoilación o sulfatación. 58   59     61   62   63   64     66   67   68   69     71   72