Procedimiento para clonar ARNm y visualizar transcriptores diferencialmente expresados (DODETS).

Un procedimiento para la preparación de una genoteca subdividida normalizada de fragmentos de ADNc amplificados de la región de codificación del ARNm contenido en una muestra,

comprendiendo el procedimiento las etapas de a)someter el ARNm derivado de la muestra a transcripción inversa utilizando al menos un cebador de ADNc, obteniendo así fragmentos de ADNc de la primera cadena, b) sintetizar la segunda cadena de ADNc complementaria con los fragmentos de ADNc de la primera cadena mediante el uso de los fragmentos de ADN de la primera cadena como moldes, obteniendo así fragmentos de ADNc de doble cadena, c) digerir los fragmentos de ADNc de doble cadena con al menos una endonucleasa de restricción, defi jando la citada endonucleasa de restricción extremos protuberantes (extremos cohesivos) de tamaño similar en los extremos del ADN después de digestión, obteniendo así fragmentos de ADNc cortados, d) anadir al menos dos fragmentos adaptadores que contienen secuencias conocidas a los fragmentos de ADNc cortados obtenidos en la etapa c), siendo capaces al menos dos de estos fragmentos adaptadores de unirse específicamente a los extremos cohesivos del ADNc de doble cadena producido en la etapa c), siendo capaz un fragmento adaptador de reasociarse con el cebador de fórmula I en la etapa e), y siendo el segundo fragmento adaptador un fragmento de terminación que introduce un bloqueo frente a la polimerización de ADN en la dirección 5'!3' partiendo del citado fragmento de terminación, y siendo incapaz el citado fragmento de terminación de reasociarse con ningún cebador de al menos dos conjuntos de cebadores de la etapa e) durante el procedimiento de amplificación molecular, estando ligado el menos dos fragmentos adaptadores a los fragmentos de ADNc cortados obtenidos en la etapa c), de modo que se obtienen fragmentos de ADNc ligados, e) subdividir los fragmentos de ADNc ligados obtenidos en la etapa d) en 4 n1 conjuntos en los que 1 n1 4, y f) someter cada conjunto de fragmentos de ADNc ligados obtenidos en la etapa e) a un procedimiento de amplificación molecular de modo que se obtienen fragmentos de ADN amplicados en los que se utiliza, para un fragmento adaptador utilizado en la etapa d), un conjunto de cebadores de amplificación de fórmula general 5'-Com-Nn1-3' I en la que Com es una secuencia complementaria con al menos el extremo 5' de un fragmento adaptador que está ligado al extremo 3' de un fragmento de ADNc cortado, N es A, G, T ó C, teniendo un cebador la fórmula general I en la que n1 0, y teniendo el segundo cebador la fórmula general I enlaque1n1 4, siendo el citado primer cebador capaz de cebar la amplificación de cualquier secuencia de nucleótidos ligada por su extremo 3' al fragmento de adaptador complementario en su extremo 5' a Com.

Tipo: Resumen de patente/invención.

Solicitante: DISPLAY SYSTEMS BIOTECH A/S.

Nacionalidad solicitante: Dinamarca.

Dirección: LERSO PARK ALLE 40,,2100 COPENHAGEN.

Inventor/es: WARTHOE, PETER, ROLF.

Fecha de Publicación: .

Fecha Solicitud PCT: 13 de Mayo de 1998.

Fecha Concesión Europea: 19 de Septiembre de 2001.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N15/10 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).
  • C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Finlandia, Chipre, Oficina Europea de Patentes, Armenia, Azerbayán, Bielorusia, Ghana, Gambia, Kenya, Kirguistán, Kazajstán, Lesotho, República del Moldova, Malawi, Federación de Rusia, Sudán, Tayikistán, Turkmenistán, Uganda, Zimbabwe, Burkina Faso, Benin, República Centroafricana, Congo, Costa de Marfil, Camerún, Gabón, Guinea, Malí, Mauritania, Niger, Senegal, Chad, Togo, Organización Regional Africana de la Propiedad Industrial, Swazilandia, Organización Africana de la Propiedad Intelectual, Organización Eurasiática de Patentes.

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