Un método para detección prenatal no-invasiva de aneuploidía cromosómica fetal de sangre materna.

Un método para determinar la aneuploidía fetal del cromosoma de interés desde una muestra de sangre materna que incluye una mezcla de moléculas de ADN libres de células y de origen materno,

dicho método comprende:

a) aislamiento del ADN libre de células de la sangre materna;

b) realizar una secuenciación aleatoria en al menos una porción de una pluralidad de las moléculas de ADN libres de células contenidas en la sangre, la porción incluye ADN correspondiente al menos a un cromosoma de interés y una pluralidad de cromosomas presumiblemente euploides, por lo tanto, se obtendría una pluralidad de lecturas de secuencia;

c) trazado de lecturas de secuencia al genoma humano de referencia, así se obtendría una pluralidad de indicadores trazados;

d) dividir dicho genoma de referencia humano en 1 Mbp posterior y depósitos que no se superpusieran;

e) determinación de la distribución de los indicadores a dichos depósitos y cromosomas completos de acuerdo con su ubicación de trazado;

f) determinar el valor de depósito fraccional FB como un ratio de número de indicadores trazados a los depósitos para el cromosoma de interés en la muestra al número de indicadores trazados a depósitos de referencia interna IRB;

g) determinar medio de muestra multinomial μ(n) y desviación estándar multinomial μ(n); de donde μ(n) y σ(n) se calculan para una variable aleatoria definida como un ratio entre el número de indicadores trazados a depósitos de referencia interna IRB, de donde la probabilidad de distribución de trazado de los indicadores al cromosoma de interés y a los depósitos de referencia interna IRB es multinomial, y los parámetros de dicha distribución multinomial se determinan del grupo de capacitación de muestras de sangre euploides;

h) determinar el valor nivel z como una diferencia entre valor de depósito fraccional FB y medio multinomial μ(n) dividido por la desviación multinomial estándar σ(n); y

i) comparar el valor nivel z con al menos un valor límite para determinar si una aneuploidía existe para el cromosoma de interés; así, como prerrequisito de los pasos f)-i), un grupo de capacitación de muestras de sangre euploides está sujeto a esencialmente los mismos procedimientos que consisten en pasos a)-e) mencionados y después los siguientes pasos se llevan a cabo:

f') elegir autosomas de referencia interna IRA de autosomas de referencia interna candidata basándose en el coeficiente de variación CV del mismo, mientras que los cromosomas aneuploides quedan excluidos;

g') elegir los depósitos de referencia interna IRB mediante un algoritmo genético de dos grupos candidatos, el primer grupo candidato se establece de depósitos seleccionados aleatoriamente, mientras que depósitos que corresponden a cromosomas potencialmente aneuploides quedan excluidos, y el segundo grupo candidato es el grupo de depósitos que corresponde con los mejores autosomas de referencia interna IRA determinados en el paso anterior f'.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2016/064604.

Solicitante: Trisomytest, s.r.o.

Nacionalidad solicitante: Eslovaquia.

Dirección: Ilkovicova 8 841 04 Bratislava - Karlova Ves ESLOVAQUIA.

Inventor/es: DURIS,FRANTISEK, BUDIS,JAROSLAV, SZEMES,TOMÁS, MINÁRIK,GABRIEL.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2708376_T3.pdf

 

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