Sistema para aplicar una red convolucional a datos espaciales.

Un sistema informático para predecir afinidad de unión de un compuesto químico a un polímero objetivo usando datos espaciales,

comprendiendo el sistema informático:

al menos un procesador general (74); y

memoria general (90/92) accesible por el al menos un procesador general, almacenando la memoria general al menos un programa (56) para ejecución por el al menos un procesador general, comprendiendo el al menos un programa instrucciones para:

(A) obtener coordenadas espaciales (60) para el polímero objetivo;

(B) modelizar el compuesto químico con el polímero objetivo en cada pose de una pluralidad de diferentes poses, creando de este modo una pluralidad de mapas de vóxel, en donde cada respectivo mapa de vóxel (40) en la pluralidad de mapas de vóxel comprende el compuesto químico en una respectiva pose en la pluralidad de diferentes poses;

(C) desplegar cada mapa de vóxel en la pluralidad de mapas de vóxel en un correspondiente vector, creando de este modo una pluralidad de vectores, en el que cada vector en la pluralidad de vectores es del mismo tamaño;

(D) introducir cada vector respectivo en la pluralidad de vectores en una arquitectura de red que incluye (i) una capa de entrada (26) para recibir secuencialmente la pluralidad de vectores, (ii) una pluralidad de capas convolucionales (28) y (iii) un calificador (30), en donde

la pluralidad de capas convolucionales incluye una capa convolucional inicial y una capa convolucional final, cada capa convolucional en la pluralidad de capas convolucionales está asociada a un conjunto diferente de pesos, en respuesta a entrada de un vector respectivo en la pluralidad de vectores, la capa de entrada proporciona una primera pluralidad de valores en la capa convolucional inicial como una primera función de valores en el vector respectivo,

cada capa convolucional respectiva, distinta de la capa convolucional final, proporciona valores intermedios, como una segunda función respectiva de (i) el conjunto diferente de pesos asociados a la capa convolucional respectiva y (ii) valores de entrada recibidos por la capa convolucional respectiva, en otra capa convolucional en la pluralidad de capas convolucionales, y

la capa convolucional final proporciona valores finales, como una tercera función de (i) el conjunto diferente de pesos asociados a la capa convolucional final y (ii) valores de entrada recibidos por la capa convolucional final, en el calificador;

(E) obtener una pluralidad de puntuaciones desde el calificador, en donde cada puntuación en la pluralidad de puntuaciones corresponde a la entrada de un vector en la pluralidad de vectores en la capa de entrada; y

(F) usar la pluralidad de puntuaciones para predecir la afinidad de unión del compuesto químico con el polímero objetivo.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2016/055369.

Solicitante: Atomwise Inc.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 717 Market Street, Suite 800 San Francisco, CA 94103 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: HEIFETS,ABRAHAM SAMUEL, WALLACH,IZHAR, DZAMBA,MICHAEL.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G06K9/46 SECCION G — FISICA.G06 COMPUTO; CALCULO; CONTEO.G06K RECONOCIMIENTO DE DATOS; PRESENTACION DE DATOS; SOPORTES DE REGISTROS; MANIPULACION DE SOPORTES DE REGISTROS (impresión per se B41J, G01V). › G06K 9/00 Métodos o disposiciones para la lectura o el reconocimiento de caracteres impresos o escritos o el reconocimiento de formas, p. ej. de huellas dactilares (métodos y disposiciones para la lectura de grafos o para la conversión de patrones de parámetros mecánicos, p.e. la fuerza o la presencia, en señales eléctricas G06K 11/00; reconocimiento de la voz G10L 15/00). › Extracción de elementos o de características de la imagen.
  • G06K9/62 G06K 9/00 […] › Métodos o disposiciones para el reconocimiento que utilizan medios electrónicos.
  • G06N20/00
  • G06N3/04 G06 […] › G06N SISTEMAS DE COMPUTADORES BASADOS EN MODELOS DE CALCULO ESPECIFICOS.G06N 3/00 Sistemas de computadores basados en modelos biológicos (computadores análogos que simulan aspectos funcionales de seres vivos G06G 7/60). › Arquitectura, p. ej. topología de interconexión.
  • G06N3/08 G06N 3/00 […] › Métodos de aprendizaje.

PDF original: ES-2772687_T3.pdf

 

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