Métodos y aparatos que aumentan la eficacia de la secuenciación por unión.
Un método para identificar el tipo de base en una posición en un ácido nucleico de plantilla,
que comprende las etapas de:
(a) poner en contacto un ácido nucleico de plantilla cebado con una polimerasa y una primera mezcla de nucleótidos en condiciones para estabilizar un complejo ternario en una posición de nucleótido en la plantilla, en donde la primera mezcla comprende un análogo de nucleótido de un primer tipo de base y un análogo de nucleótido de un segundo tipo de base, en donde dichos análogos de nucleótido están unidos a marcadores exógenos de la misma estructura química o a diferentes marcadores exógenos que producen una señal superpuesta de modo que las señales son ambiguas;
b) poner en contacto el ácido nucleico de plantilla cebado con una polimerasa y una segunda mezcla de nucleótidos en condiciones para estabilizar un complejo ternario en la posición de nucleótido en la plantilla, en donde la segunda mezcla comprende un análogo de nucleótido del primer tipo de base y un análogo de nucleótido de un tercer tipo de base, en donde dichos análogos de nucleótido están unidos a marcadores exógenos de la misma estructura química o a diferentes marcadores exógenos que producen una señal superpuesta de modo que las señales son ambiguas;
(c) examinar los productos de las etapas (a) y (b) para detectar señales producidas por un complejo ternario que comprende el ácido nucleico de plantilla cebado, una polimerasa y un siguiente nucleótido correcto, en donde las señales adquiridas para el producto de la etapa (a) son ambiguas para el primer y el segundo tipo de base, y en donde las señales adquiridas para el producto de la etapa (b) son ambiguas para el primer y el tercer tipo de base;
(d) desambiguación de señales adquiridas en la etapa (c) para identificar un tipo de base que se une al siguiente nucleótido correcto.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2018/029420.
Solicitante: Omniome, Inc.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 6965 Lusk Blvd. San Diego, CA 92121 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: OLIPHANT,ARNOLD, VIJAYAN,KANDASWAMY, STROMBERG,SEAN, VIECELI,JOHN.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/6832 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › Optimización de la reacción de hibridación.
- C12Q1/6869 C12Q 1/00 […] › Métodos de secuenciación.
PDF original: ES-2802809_T3.pdf
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