Procedimientos, kits y composiciones para la detección de mrsa.

Un ensayo multiplex para identificar y diferenciar MRSA, MSSA,

MRSE, MSSE, MRCNS o MSCNS, que comprende tres conjuntos de cebadores para detectar la expresión de tres genes diana directamente de una muestra, una o más sondas diferenciales de secuencia asociadas con cada uno de los conjuntos de cebadores, un gen de referencia y un conjunto de cebadores para detectar la expresión del gen de referencia;

en el que el ensayo multiplex está configurado para evaluar un nivel de expresión de cada uno de los genes diana para determinar la presencia de cada gen diana en la muestra, en el que el nivel de expresión de cada uno de los genes diana se evalúa mediante la comparación de uno del valor de ciclo umbral y el valor de punto de cruce de los genes diana y el gen de referencia; en el que un gen diana comprende un gen mecA y dos de los genes diana comprenden genes seleccionados del grupo que comprende un gen femA-S. epidermidis, un gen tuf-S. aureus y un gen tuf-CNS;

en el que un conjunto de cebadores para detectar el gen femA-S. epidermidis comprende oligonucleótidos que incluyen la SEQ ID NO. 7 y la SEQ ID NO. 8;

en el que un conjunto de cebadores para detectar el gen tuf-S. aureus comprende oligonucleótidos que incluyen la SEQ ID NO. 10 y la SEQ ID NO. 11;

en el que un conjunto de cebadores para detectar el gen tuf-CNS comprende oligonucleótidos que incluyen la SEQ ID NO. 13 y la SEQ ID NO. 14;

en el que un conjunto de cebadores para detectar el gen mecA comprende oligonucleótidos que incluyen la SEQ ID NO. 16 y la SEQ ID NO. 17;

en el que el ensayo multiplex comprende además al menos una sonda que comprende un oligonucleótido que incluye la SEQ ID NO. 9, la SEQ ID NO. 12, la SEQ ID NO. 15 o la SEQ ID NO. 18;

en el que la SEQ ID NO. 9 está asociada con un conjunto de cebadores para la detección del gen femA-S. epidermidis y diferencia S. epidermidis de otras especies de estafilococo;

en el que la SEQ ID NO. 12 está asociada con un conjunto de cebadores para la detección del gen tuf-S. aureus y diferencia S. aureus de CNS y otras especies;

en el que la SEQ ID NO. 15 está asociada con un conjunto de cebadores para la detección del gen tuf-CNS y diferencia CNS de la especie S. aureus y otras especies; y

en el que la SEQ ID NO. 18 está asociada con un conjunto de cebadores para la detección del gen mecA y diferencia la resistencia a meticilina y penicilina de fenotipos sensibles de las especies de S. aureus o CNS.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2011/029043.

Solicitante: The Translational Genomics Research Institute.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 445 N. 5th Street, Suite 600 Phoenix, Arizona 85004 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: DRIEBE,ELIZABETH, ENGELTHALER,DAVID, BOWERS,JOLENE, KEIM,PAUL.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07H21/04 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07H AZUCARES; SUS DERIVADOS; NUCLEOSIDOS; NUCLEOTIDOS; ACIDOS NUCLEICOS (derivados de ácidos aldónicos o sacáricos C07C, C07D; ácidos aldónicos, ácidos sacáricos C07C 59/105, C07C 59/285; cianohidrinas C07C 255/16; glicales C07D; compuestos de constitución indeterminada C07G; polisacáridos, sus derivados C08B; ADN o ARN concerniente a la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos o su aislamiento, preparación o purificación C12N 15/00; industria del azúcar C13). › C07H 21/00 Compuestos que contienen al menos dos unidades mononucleótido que tienen cada una grupos fosfato o polifosfato distintos unidos a los radicales sacárido de los grupos nucleósido, p. ej. ácidos nucleicos. › con desoxirribosilo como radical sacárido.
  • C12P19/34 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12P PROCESOS DE FERMENTACION O PROCESOS QUE UTILIZAN ENZIMAS PARA LA SINTESIS DE UN COMPUESTO QUIMICO DADO O DE UNA COMPOSICION DADA, O PARA LA SEPARACION DE ISOMEROS OPTICOS A PARTIR DE UNA MEZCLA RACEMICA.C12P 19/00 Preparación de compuestos que contienen radicales sacárido (ácido cetoaldónico C12P 7/58). › Polinucleótidos, p. ej. ácidos nucleicos, oligorribonucleótidos.

PDF original: ES-2689953_T3.pdf

 

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