Método para la cuantificación diferencial de péptidos restringidos a HLA procesados de forma natural que están destinados al desarrollo de inmunoterapias contra el cáncer y contra enfermedades autoinmunitarias e infecciosas.

Método para la identificación y la cuantificación sin marcaje de al menos un ligando peptídico del MHC en una o más muestras de tejido primario procedentes de al menos un mamífero,

en que dicho método comprende:

a) Aislamiento de al menos un ligando peptídico del MHC a partir de como mínimo una primera muestra de tejido sano y de una segunda muestra de tejido enfermo correspondiente a dicho tejido enfermo primario,

b) Realización de un análisis por HPLC-EM de dichos ligandos peptídicos del MHC con el fin de generar una señal de tales péptidos

c) Determinación del área de la señal del ión precursor para cada una de dichas señales de ligandos peptídicos del MHC

d) identificación de las secuencias de cada uno de los citados ligandos peptídicos del MHC, mediante el agrupamiento de los espectros de fragmentación y/o la búsqueda en base de datos

e) Determinación de una cantidad promedio del ligando peptídico del MHC mediante la agrupación de las áreas obtenidas en diferentes series de análisis repetidos y la normalización de dichas áreas dentro de cada una de las series de análisis, con el fin de crear un valor promedio para cada muestra

f) Determinación de cantidades relativas del ligando peptídico del MHC que sean comparables entre las muestras, la cual comprende

f1) Asignación del ligando peptídico del MHC a un subgrupo de secuencias específicas de alelo para efectuar una comparación entre distintas muestras mediante la identificación de al menos un alelo del MHC al cual se prevé que el ligando peptídico del MHC se uniría, y

f2) Normalización entre diferentes muestras por medio de los subgrupos específicos de alelo para tener en cuenta los distintos tamaños de muestra y/o niveles de expresión del MHC; y

f3) Ejecución de un control de calidad de los datos basado en la reproducibilidad del péptido en cada muestra g) Determinación de la sobrepresentación del ligando peptídico del MHC mediante el cálculo de un perfil de presentación y/o de una puntuación de presentación correspondientes al ligando peptídico del MHC de la citada muestra de tejido enfermo y de la citada muestra de tejido sano basados en el citado promedio y en las cantidades relativas del ligando peptídico del MHC, y

h) Cuantificación sin marcaje del ligando peptídico del MHC.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2011/056056.

Solicitante: IMMATICS BIOTECHNOLOGIES GMBH.

Nacionalidad solicitante: Alemania.

Dirección: PAUL-EHRLICH-STRASSE 15 72076 TUBINGEN ALEMANIA.

Inventor/es: WEINSCHENK,TONI, FRITSCHE,JENS.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G01N33/68 SECCION G — FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › en los que intervienen proteínas, péptidos o aminoácidos.

PDF original: ES-2658268_T3.pdf

 

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