Cebadores con fosfato y base modificados en PCR específica de alelo.

Un procedimiento de amplificación específica de alelo de una variante de una secuencia diana,

existiendo la diana en forma de varias secuencias variantes, comprendiendo el procedimiento:

(a) hibridar un primer oligonucleótido y un segundo oligonucleótido con al menos una variante de la secuencia diana; en el que el primer oligonucleótido es al menos parcialmente complementario de una o más variantes de la secuencia diana y el segundo oligonucleótido es al menos parcialmente complementario de una o más variantes de la secuencia diana y tiene al menos un nucleótido selectivo complementario de una única variante de la secuencia diana; en el que dicho segundo oligonucleótido comprende tanto un nucleótido con una base modificada covalentemente en el grupo amino exocíclico como un fosfato modificado que tiene una estructura:**Fórmula**

en la que A y B representan una cadena de nucleótidos, D es OH o CH3 y Acc es un aceptor de electrones o un aceptor de electrones sustituido con un residuo R en el que R es un sustituyente orgánico, en la que Acc se selecciona del grupo que consiste en CN, SO2-R', en el que R' comprende al menos un alquilo aminosustituido, un arilo opcionalmente sustituido o un heterociclo opcionalmente sustituido y un heterociclo N+ de seis miembros con al menos un átomo de N alquilado en posición orto o para, estando dicho heterociclo seleccionado del grupo que consiste en piridinio, pirimidinio y quinolinio;

(b) proporcionar condiciones adecuadas para la extensión de oligonucleótidos por una polimerasa de ácidos nucleicos;

(c) extender dicho primer oligonucleótido y dicho segundo oligonucleótido por dicha polimerasa de ácidos nucleicos, en el que dicha polimerasa de ácidos nucleicos es capaz de extender dicho segundo oligonucleótido eficientemente cuando dicho oligonucleótido hibrida con una variante de la secuencia diana que es complementaria de al menos dicho nucleótido selectivo y sustancialmente menos eficientemente cuando dicho segundo oligonucleótido hibrida con una variante de la secuencia diana que no es complementaria de al menos dicho nucleótido selectivo.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2013/076148.

Solicitante: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG.

Nacionalidad solicitante: Suiza.

Dirección: GRENZACHERSTRASSE 124 4070 BASEL SUIZA.

Inventor/es: HEINDL, DIETER, KESSLER,DIRK, SCHOENBRUNNER,NANCY, TSAN,ALISON, FROEHNER,STEFANIE.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2627523_T3.pdf

 

Patentes similares o relacionadas:

Marcadores de diagnóstico para el tratamiento de los trastornos proliferativos celulares con inhibidores de la telomerasa, del 13 de Marzo de 2019, de GERON CORPORATION: Un método de selección de un individuo diagnosticado o sospechoso de tener cáncer que se beneficiará del tratamiento con un inhibidor de la telomerasa, […]

Métodos de identificación, evaluación, prevención y terapia de enfermedades pulmonares y kits de los mismos, incluida la identificación, evaluación, prevención y terapia de enfermedades en base al género, del 12 de Marzo de 2019, de CANCER PREVENTION AND CURE, LTD: Un método ex vivo de caracterización fisiológica en un sujeto que comprende determinar el grado de expresión de los siguientes tres biomarcadores leptina, IL-10, y MCP-1 […]

Biomarcadores de ácidos nucleicos en circulación asociados al cáncer de mama, del 12 de Marzo de 2019, de Chronix Biomedical: Un método de detección del nivel de una molécula de ADN extracelular en circulación asociada con cáncer de mama en el ADN extracelular en circulación en una muestra de sangre, […]

MÉTODO Y DISPOSITIVO PARA EL ANÁLISIS DE ÁCIDOS NUCLEICOS, del 7 de Marzo de 2019, de MEDINA VENEGAS, Pedro Manuel: Constituido a partir de un conjunto de sistemas de recepción y procesamiento de muestras, de captura, concentración y purificación de moléculas diana […]

B3GNT5 para su uso como biomarcador para nacimiento prematuro, del 6 de Marzo de 2019, de THE CHINESE UNIVERSITY OF HONG KONG: Un método para determinar el riesgo de nacimiento prematuro, que comprende las etapas de: (a) medir el nivel de ARNm de un gen marcador en una muestra […]

Material poroso para la detección de Candida albicans, método de diagnóstico que lo utiliza y método de preparación del mismo, del 6 de Marzo de 2019, de UNIVERSITAT POLITECNICA DE VALENCIA: Material poroso para la detección de Candida albicans, método de diagnóstico que lo utiliza y método de preparación del mismo. Concretamente, […]

Qtl responsable de la firmeza de los frutos del tomate, del 6 de Marzo de 2019, de SYNGENTA PARTICIPATIONS AG: Un método para seleccionar una planta de tomate cultivada que comprende QTL1 ligado a firmeza de los frutos aumentada en comparación con frutos de una planta de tomate […]

Agentes de ARNi modificados, del 6 de Marzo de 2019, de ALNYLAM PHARMACEUTICALS, INC: Un agente de ARNi que comprende una primera cadena y una segunda cadena, en el que al menos una subunidad que tiene una fórmula (I) se incorpora […]

Otras patentes de F. HOFFMANN-LA ROCHE AG