Método de monitorización de la inestabilidad genómica utilizando microscopía y análisis 3D.
Un método de monitorización o detección de cáncer en una célula de test obtenida de una muestra que comprende la célula de test,
comprendiendo el método:
(a) caracterizar la organización de telómeros 3D en la célula de test utilizando análisis tridimensional (3D); y
(b) comparar la organización de telómeros 3D en la célula del test con la de una célula de control no cancerosa, en donde un cambio en la organización de telómeros 3D en la célula de test comparada con la célula de control indica la presencia de cáncer en la célula de test, donde la caracterización de la organización de telómeros 3D comprende al menos uno de:
A.
(i) introducir datos de imagen de la organización 3D de los telómeros;
(ii) procesar los datos de imagen para encontrar un conjunto de coordenadas {(xi, yi, zi)}, i ≥ 1,..., N, en donde (xi,yi,zi) es una posición del telómero y/o cromosoma i-ésimo;
(iii) encontrar un plano que está más próximo al conjunto de coordenadas; y
(iv) encontrar un conjunto de distancias {di}, i ≥ 1,..., N, donde di es la distancia entre (xi,yi,zi) y el plano, en donde se utiliza el conjunto {di} para caracterizar la organización 3D;
B.
(i) introducir datos de imagen de la organización 3D de estructuras de los telómeros; y
(ii) encontrar un elipsoide que tiene ejes principales a1, a2, y a3 en donde el elipsoide es un esferoide achatado con a1 aproximadamente igual a a2 y en donde se utiliza una ratio de achatamiento, a3/a1 o a1/a3 para caracterizar la organización 3D; y/o
C.
(i) introducir datos de imagen de la organización 3D de telómeros; y
(ii) obtener a partir de los datos de imagen al menos uno de un conjunto de intensidades {Ii}, un conjunto de volúmenes {Vi} y un conjunto de tres dimensiones {(Dxi, Dyi, Dzi)}, i ≥ 1,..., N, donde Ii es una intensidad total o media, Vi es un volumen, y (Dxi, Dyi, Dzi) son los ejes principales de un elipsoide que describe el telómero y/o cromosoma i-ésimo, respectivamente, en donde el al menos uno se utiliza para caracterizar la organización 3D.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/CA2004/000241.
Solicitante: 3D Signatures Inc.
Nacionalidad solicitante: Canadá.
Dirección: 175 Hargrave Street, Suite 211 Winnipeg, MB R3C 3R8 CANADA.
Inventor/es: GARINI, YUVAL, MAI,SABINE, CHUANG,TONY CHIH YUAN, MOSHIR,SHARAREH, VERMOLEN,BARTHOLOMEUS J.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/68 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
PDF original: ES-2567199_T3.pdf
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