Conjunto de sondas oligonucleotídicas y métodos para realizar el perfil de microbiota.
Un conjunto de sondas oligonucleotídicas, comprendiendo dicho conjunto:
(a) un oligonucleótido que consiste en (ai) una secuencia de nucleótidos seleccionada de ACGCTTGCACCCT (SEQ ID NO 1), opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y AGGGTGCAAGCGT (SEQ ID NO 27), opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y (aii) 0-5 nucleótidos además de (ai), en el que el oligonucleótido (a) es capaz de hibridar con una SEQ ID NO 27 o SEQ ID NO 1, respectivamente, en condiciones de alta rigurosidad;
(b) un oligonucleótido que consiste en (bi) una secuencia de nucleótidos seleccionada de CGATCCGAAAACCTTCTTCACT (SEQ ID NO 2), opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y AGTGAAGAAGGTTTTCGGATCG (SEQ ID NO 28), opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y (bii) 0-5 nucleótidos además de (bi), en el que el oligonucleótido (b) es capaz de hibridar con una SEQ ID NO 28 o SEQ ID NO 2, respectivamente, en condiciones de alta rigurosidad;
(c) un oligonucleótido que consiste en (ci) una secuencia de nucleótidos seleccionada de GGACAACGCTTGCCAC (SEQ ID NO 3), opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y GTGGCAAGCGTTGTCC (SEQ ID NO 29), opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y (cii) 0-5 nucleótidos además de (ci), en el que el oligonucleótido (c) es capaz de hibridar con una SEQ ID NO 29 o SEQ ID NO 3, respectivamente, en condiciones de alta rigurosidad;
(d) un oligonucleótido que consiste en (di) una secuencia de nucleótidos seleccionada de CGTAGGCGGTTCGTCGCGT (SEQ ID NO 4), opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y ACGCGACGAACCGCCTACG (SEQ ID NO 30), opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y (dii) 0-5 nucleótidos además de (di), en el que el oligonucleótido (d) es capaz de hibridar con SEQ ID NO 30 o SEQ ID NO 4, respectivamente, en condiciones de alta rigurosidad; y
(e) uno o más oligonucleótidos que consisten en (ei) una secuencia de nucleótidos seleccionada de las enumeradas como SEQ ID NO 5-8 y 31-34 en la Tabla 1, opcionalmente con hasta tres bases sustituidas, y (eii) 0-5 nucleótidos además de (ei), en el que el oligonucleótido (e) es capaz de hibridar con la secuencia de nucleótidos complementaria a SEQ ID NO 5-8 y 31-34, respectivamente, en condiciones de alta rigurosidad; y opcionalmente
(f) uno o más oligonucleótidos que consisten en (fi) una secuencia de nucleótidos seleccionada de las enumeradas como SEQ ID NO 9-26 y 35-52 en la Tabla 2 y Tabla 3, opcionalmente con hasta tres bases sustituidas y (fii) 0-5 nucleótidos además de (fi), en el que el oligonucleótido (f) es capaz de hibridar con la secuencia de nucleótidos complementaria a SEQ ID NO 9-26 y 35-52, respectivamente, en condiciones de alta rigurosidad.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/GB2011/052509.
Solicitante: Genetic Analysis AS.
Nacionalidad solicitante: Noruega.
Dirección: Pb 4239 Nydalen 0401 Oslo NORUEGA.
Inventor/es: RUDI, KNUT, VEBØ,HEIDI, SEKELJA,MONIKA.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/68 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
PDF original: ES-2573133_T3.pdf
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