Dipéptidos de pseudoprolina.

Proceso para la fabricación de un compuesto de fórmula

En el que R1 es una cadena lateral de un aminoácido alfa,

R2 es un grupo protector amino y R3 y R4 están independientemente seleccionados de hidrogeno o alquilo-C1-4, con la condición que ninguno de R3 y R4 sean hidrógeno, R5 es hidrógeno o metilo que comprende

a) convertir un derivado de aminoácido de fórmula

En el que R1 y R2 son como anteriormente se convierten con serina o treonina en un dipéptido de fórmula

Utilizando así una carbodiimida soluble en agua como agente activador y

b) efectuar el cierre del anillo del dipéptido de fórmula III con un compuesto de fórmula

En el que R3 y R4 se seleccionan independientemente de hidrógeno o alquilo C1-4, con la condición de que ninguno de R3 y R4 sean hidrógeno y R9a y R9b es independientemente alquilo C1-4, en presencia de un catalizador ácido, en el que el compuesto diana de la fórmula I se obtiene mediante un procedimiento de tratamiento que comprende

a) extraer la mezcla de reacción con agua, mientras se mantiene un pH en el intervalo de 7,0 a 9,0;

b) extraer la fase de agua con un disolvente orgánico inmiscible en agua, mientras se mantiene un pH en el intervalo de 5,5 a 6,0;

c) obtener el producto diana de la fórmula I a partir de la fase orgánica y, opcionalmente, mediante

d) cristalización del producto diana de fórmula I en un disolvente orgánico.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2009/062568.

Solicitante: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG.

Nacionalidad solicitante: Suiza.

Dirección: GRENZACHERSTRASSE 124 4070 BASEL SUIZA.

Inventor/es: HILDBRAND, STEFAN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K1/02 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 1/00 Procedimientos generales de preparación de péptidos. › en solución.
  • C07K5/06 C07K […] › C07K 5/00 Péptidos con hasta cuatro aminoácidos en una secuencia totalmente determinada; Sus derivados. › Dipéptidos.
  • C07K5/062 C07K 5/00 […] › la cadena lateral del primer aminoácido es acíclica, p. ej. Gly, Ala.

PDF original: ES-2410267_T3.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Dipéptidos de pseudoprolina La invención se refiere a un nuevo procedimiento para la fabricación de un compuesto con la fórmula Los dipéptidos de pseudoprolina de fórmula I pueden utilizarse como grupos protectores reversibles para Ser, Thr, y

Cys y han demostrado ser herramientas versátiles para superar algunos problemas intrínsecos en el campo de la química de los péptidos [JACS 1996, 118, 9218-9227]. La presencia de Ψ Pro dentro de una secuencia peptídica da como resultado la interrupción de las estructuras de lámina β considerados como una fuente de agregación intermolecular. El aumento de la solvatación resultante y la cinética de acoplamiento en el montaje de péptidos tales como la síntesis de péptidos en fase sólida con Fmoc facilita la elongación de la cadena especialmente para los péptidos que contienen "secuencias difíciles".

Una aproximación de síntesis de dipéptidos de pseudoprolina se publica en la publicación PCT WO 2008/000641. El acceso al compuesto de fórmula I se lleva a cabo a través de un intermediario de la sal de amonio de fórmula en el que R1, R2, R5, R6, R7 y R8 se definen en la publicación PCT mencionada anteriormente.

Una desventaja importante de la aproximación conocida en la técnica es la necesidad de purificar el dipéptido mediante el aislamiento de su intermediario de la sal de amonio, que debe ser liberado al dipéptido antes del cierre del anillo. En consecuencia, esta síntesis resultó no ser adecuada para la aplicación en una escala técnica.

El objeto de la presente invención es proporcionar una síntesis corta y técnicamente viable de los dipéptidos de pseudoprolina de fórmula I que permita la obtención del producto con un alto rendimiento.

El objeto se ha conseguido con el proceso como se describe a continuación. El proceso para la fabricación de un compuesto de fórmula en el que R1 es una cadena lateral de un alfa aminoácido, R2 es un grupo protector de amino y R3 y R4 se seleccionan independientemente de hidrógeno o alquilo C1-4 con la condición de que ninguno de R3 y R4 sean hidrógeno, R5 sea hidrógeno o metilo que comprende a) convertir un derivado de aminoácido de fórmula en el que R1 y R2 son como anteriormente, con serina o treonina en el dipéptido de fórmula Usando así una carbodiimida soluble en agua como agente de activación y b) efectuar el cierre del anillo del dipéptido de fórmula III con un compuesto de fórmula

En el que R3 y R4 se seleccionan independientemente de hidrógeno o alquilo C1-4, con la condición de que ninguno de R3 y R4 sean hidrógeno y R9a y R9b sea independientemente alquilo C1-4, en presencia de un catalizador acídico,

en el que el compuesto diana de la fórmula I se obtiene mediante un procedimiento de tratamiento que comprende a) extraer la mezcla de reacción con agua, mientras se mantiene un pH en el rango de 7, 0 a 9, 0; b) extraer la fase de agua con un disolvente orgánico inmiscible en agua, mientras se mantiene un pH en el rango de 5, 5 a 6, 0;

c) obtener el producto diana de la fórmula I a partir de la fase orgánica y, opcionalmente, mediante d) cristalización del producto diana de fórmula I en un disolvente orgánico.

Se entiende además que la serina o treonina pueden utilizarse ya sea en su configuración L o D, como racemato o en diversas mezclas de sus isómeros. Preferiblemente se utiliza la configuración L.

El término "alquilo C1-4" se refiere a un radical hidrocarburo alifático saturado monovalente de cadena ramificada o recta de uno a cuatro átomos de carbono. Este término se ejemplifica además por radicales como metilo, etilo, npropilo, isopropilo, n-butilo, s-butilo y t-butilo.

El término "cadena lateral de un aminoácido" utilizado para el sustituyente R1 se refiere particularmente a las cadenas laterales de los alfa aminoácidos seleccionados de entre valina, leucina, isoleucina, metionina, fenilalanina, asparagina, glutamina, ácido glutámico, histidina, lisina , arginina, ácido aspártico, alanina, serina, treonina, tirosina, triptófano, cisteína, glicina, ácido aminoisobutírico y prolina.

Se entiende que en las cadenas laterales de los aminoácidos que llevan un grupo hidroxi, el grupo hidroxi está opcionalmente protegido por un grupo protector de hidroxi tal como se define a continuación. En las cadenas laterales que llevan grupos amino adicionales el grupo amino está opcionalmente protegido por un grupo protector de amino como se define a continuación.

R1 representa preferiblemente una cadena lateral de valina, leucina, isoleucina, fenilalanina, asparagina, glutamina, ácido glutámico, lisina, ácido aspártico, alanina, serina, treonina, tirosina y triptófano. En una realización más preferida R1 representa una cadena lateral de serina o treonina.

El término "grupo protector de amino" se refiere a cualquiera de los sustituyentes utilizados convencionalmente para 45 impedir la reactividad del grupo amino. Grupos protectores de amino adecuados se describen en Green T., "Protective Groups in Organic Synthesis", Capítulo 7, John Wiley and Sons, Inc., 1991, 309-385. Los grupos protectores de amino adecuados que se definen en R2 deben soportar condiciones ácidas. Preferiblemente Fmoc, Z, Moz, Troc, Teoc o Voc, más preferiblemente se utiliza Fmoc.

El término "grupo protector de hidroxi" se refiere a cualquiera de los sustituyentes utilizados convencionalmente para impedir la reactividad del grupo hidroxi. Grupos protectores de hidroxi adecuados se describen en Green T., "Protective Groups in Organic Synthesis", Capítulo 1, John Wiley and Sons, Inc., 1991, 10-142. Grupos protectores de hidroxi adecuados son t-butilo, bencilo, TBDMS o TBDPS. Es un grupo protector de hidroxi preferido el t-butilo.

El significado de las abreviaturas utilizadas en la descripción y en las reivindicaciones es tal como se indica en la siguiente tabla:

Fmoc 9-fluorenilmetoxicarbonilo

Z benciloxicarbonilo

Fmoc 9-fluorenilmetoxicarbonilo

tBu t-butilo

Moz p-metoxibenciloxicarbonilo

Troc 2, 2, 2-tricloro etoxicarbonilo

Teoc 2- (trimetilsilil) etoxicarbonilo

Voc viniloxicarbonilo

TBDMS éter de t-butildimetilsililo

TBDPS éter de t-butildifenilsililo

HOBt 1-hidroxibenzotriazol

HOSu N-hidroxisuccinimida

EAC 1-etil-3- (4-azonia-4, 4-dimetilpentil) -carbodiimida (yoduro)

EDC (3-dimetilamino-propil) -etil-carbodiimida (clorhidrato)

Paso a) En el primer paso a) el derivado de aminoácido de fórmula

En el que R1 y R2 son como anteriormente se convierte con serina o treonina en el dipéptido de fórmula usando así una carbodiimida soluble en agua como agente de activación.

Los derivados de aminoácidos de fórmula II son como regla, compuestos disponibles comercialmente. Los derivados de aminoácidos adecuados de fórmula II de acuerdo con las preferencias dadas para R1 y R2 son Fmoc-L-Ser (tBu) -OH, Fmoc-o L-Thr (tBu) -OH.

Agentes de activación de carbodiimida solubles en agua adecuados son EDC o EAC o sales de los mismos, preferiblemente la sal de clorhidrato de EDC.

Por regla general se aplica el agente de activación de carbodiimida soluble en agua junto con un agente de 30 activación adicional seleccionado de HOSu o HOBt.

El agente de activación preferible es EDC.HCl/HOSu.

El EDC se aplica por lo general en una cantidad de 1, 0 a 1, 5 equivalentes y el HOSu se aplica por lo general en una 35 cantidad de 1, 0 a 1, 5 equivalentes relacionados con un equivalente del derivado de aminoácido de fórmula II.

Como regla general, la reacción de activación se lleva a cabo en presencia de un disolvente orgánico adecuado, tal como acetato de etilo, N, N-dimetilformamida, acetona o tetrahidrofurano, preferiblemente tetrahidrofurano y / o N, Ndimetilformamida a una temperatura de -10°C a 25°C.

El acoplamiento con serina o treonina, preferiblemente con L-serina o L-treonina, se puede realizar entonces a una temperatura de -10°C a 25°C en presencia de una base inorgánica. Por lo general, el acoplamiento se lleva a cabo mediante la adición de una solución del éster activado obtenido a partir de la reacción de activación a una suspensión acuosa de serina o treonina y la base inorgánica.

Las bases inorgánicas adecuadas son carbonatos alcalinos, tales como carbonatos o hidróxidos de litio, sodio o potasio o mezclas de los mismos. Es preferible el carbonato de litio y / o hidróxido de litio, las mezclas más preferibles son las de carbonato de litio e hidróxido de litio. La base inorgánica como regla general se aplica estequiométricamente en relación con la serina o treonina. La proporción de serina o treonina con el derivado de aminoácido de fórmula... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Proceso para la fabricación de un compuesto de fórmula

En el que R1 es una cadena lateral de un aminoácido alfa, R2 es un grupo protector amino y R3 y R4 están independientemente seleccionados de hidrogeno o alquilo-C1-4, con la condición que ninguno de R3 y R4 sean 10 hidrógeno, R5 es hidrógeno o metilo que comprende

a) convertir un derivado de aminoácido de fórmula

En el que R1 y R2 son como anteriormente se convierten con serina o treonina en un dipéptido de fórmula

Utilizando así una carbodiimida soluble en agua como agente activador y b) efectuar el cierre del anillo del dipéptido de fórmula III con un compuesto de fórmula En el que R3 y R4 se seleccionan independientemente de hidrógeno o alquilo C1-4, con la condición de que ninguno de R3 y R4 sean hidrógeno y R9a y R9b es independientemente alquilo C1-4, en presencia de un catalizador ácido, en el que el compuesto diana de la fórmula I se obtiene mediante un procedimiento de tratamiento que comprende a) extraer la mezcla de reacción con agua, mientras se mantiene un pH en el intervalo de 7, 0 a 9, 0;

b) extraer la fase de agua con un disolvente orgánico inmiscible en agua, mientras se mantiene un pH en el intervalo de 5, 5 a 6, 0; c) obtener el producto diana de la fórmula I a partir de la fase orgánica y, opcionalmente, mediante d) cristalización del producto diana de fórmula I en un disolvente orgánico.

2. El proceso de la reivindicación 1, que se caracteriza en que R1 es una cadena lateral seleccionada entre valina, leucina, isoleucina, metionina, fenilalanina, asparagina, glutamina, ácido glutámico, histidina, lisina, arginina, ácido aspártico, alanina, serina, treonina, tirosina, triptófano, cisteína, glicina y ácido aminoisobutírico.

3. El proceso de la reivindicación 1 o 2, que se caracteriza en que R2 se selecciona entre Fmoc, Z, Moz, Troc, Teoc y 40 Voc.

4. El proceso de las reivindicaciones 1 a 3, que se caracteriza en que la carbodiimida soluble en agua es EDC o una

sal de la misma.

5. El proceso de la reivindicación 4, que se caracteriza en que EDC o una sal de la misma se aplica junto con HOSu.

6. El proceso de las reivindicaciones 1 a 5, que se caracteriza en que la proporción de serina o treonina respecto a un derivado de aminoácido de fórmula II se selecciona en el rango de 1, 5 a 4, 0 a 1.

7. El proceso de las reivindicaciones 1 a 6, que se caracteriza en que la conversión en el paso a) se realiza en presencia de una base inorgánica.

8. El proceso de la reivindicación 7, que se caracteriza en que la base inorgánica se selecciona entre un carbonato alcalino o un hidróxido alcalino y de mezclas de los mismos.

9. El proceso de las reivindicaciones 1 a 8, que se caracteriza en que la conversión en el paso a) se realiza a un pH en el rango de 7, 5 a 9, 5.

10. El proceso de las reivindicaciones 1 a 9 que se caracteriza en que la conversión en el paso a) se realiza a una temperatura en el rango de -10°C a 25°C.

11. El proceso de las reivindicaciones 1 a 10, que se caracteriza en que la mezcla de reacción, tres la conversión en el paso a) se acidifica con un ácido mineral.

12. El proceso de las reivindicaciones 1 a 11, que se caracteriza en que el dipéptido de fórmula III se utiliza directamente, sin ser aislado, en el proceso del paso b) .

13. El proceso de las reivindicaciones 1 a 12, que se caracteriza en que el compuesto de fórmula IV utilizado para el cierre del anillo en el paso b) es 2, 2-dimetoxipropano.

14. El proceso de la reivindicación 13, que se caracteriza en que 2, 2-dimetoxipropano se añade de forma continua a la mezcla de reacción mientras en paralelo el metanol generado se elimina continuamente mediante destilación.

15. El proceso de las reivindicaciones 1 a 14, que se caracteriza en que el catalizador acídico para el cierre del anillo en el paso b) se selecciona entre ácido metanosulfónico, (+) ácido camfor-10-sulfónico, ácido p-toluenosulfónico, ptoluenosulfonato de piridinio.

16. El proceso de las reivindicaciones 1 a 15, que se caracteriza en que el cierre del anillo en el paso b) se efectúa en presencia de tolueno o tetrahidrofurano o de mezclas de los mismos.

17. El proceso de las reivindicaciones 1 a 16, que se caracteriza en que el cierre del anillo en el paso b) se realiza a una temperatura en el rango de 15°C a 35°C.

18. El proceso de la reivindicación 1, que se caracteriza en que el disolvente orgánico, inmiscible en agua es tolueno.

19. El proceso de la reivindicación 18, que se caracteriza en que el producto diana está cristalizado a partir de una mezcla de tolueno, isopropanol y heptano.


 

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