Método y kit para la cuantificación cromosómica molecular.

Un método para la cuantificación de cromosomas y genes en muestras tomadas de un humano,

en el diagnósticodel síndrome de Turner, caracterizado porque

a) se eligen al menos dos secuencias marcadoras que no son microsatélites o STR (por sus siglas eninglés, "Short Tadem Repeat"), en donde

- una secuencia marcadora es una secuencia que se conoce que está presente en el cromosoma X y

- otra secuencia marcadora es una secuencia que se conoce está que presente en un cromosomaautosómico,

b) la muestra se amplifica utilizando al menos dos cebadores, y en donde dichos, al menos dos, cebadoresson complementarios a las secuencias marcadoras que se conoce que están presentes en dichocromosoma X y dicho cromosoma autosómico,

c) cada una de dichas secuencias marcadoras que se conoce que están presentes en dicho cromosoma X ydicho cromosoma autosómico, tienen una parte de su secuencia homóloga a una parte de la otra, y lahomología entre dichas partes es de al menos un 90%, y en donde los al menos dos cebadores sonespecíficos para dicha parte en las secuencias marcadoras, y las secuencias marcadoras son de diferentelongitud, siendo la diferencia de longitud suficiente para distinguir la amplificación de productos durante ladetección,

d) se detectan fragmentos amplificados, y una relación de la amplificación de productos de las secuenciasmarcadoras presentes en el cromosoma autosómico y el cromosoma X, que es 2:1, es indicativa delsíndrome de Turner.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/SE2007/050276.

Solicitante: VYTAL DIAGNOSTICS AB.

Nacionalidad solicitante: Suecia.

Dirección: ALBANOVA UNIVERSITY CENTER 106 91 STOCKHOLM SUECIA.

Inventor/es: HAUZENBERGER,DAN, KLANGBY,ULF, HEDRUM,ANDERS.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2385867_T1.pdf

 

Método y kit para la cuantificación cromosómica molecular.

Reivindicaciones:

1. Un método para la cuantificación de cromosomas y genes en muestras tomadas de un humano, en el diagnóstico del síndrome de Turner, caracterizado porque a) se eligen al menos dos secuencias marcadoras que no son microsatélites o STR (por sus siglas en inglés, “Short Tadem Repeat”) , en donde

- una secuencia marcadora es una secuencia que se conoce que está presente en el cromosoma X y

- otra secuencia marcadora es una secuencia que se conoce está que presente en un cromosoma autosómico,

b) la muestra se amplifica utilizando al menos dos cebadores, y en donde dichos, al menos dos, cebadores son complementarios a las secuencias marcadoras que se conoce que están presentes en dicho cromosoma X y dicho cromosoma autosómico, c) cada una de dichas secuencias marcadoras que se conoce que están presentes en dicho cromosoma X y dicho cromosoma autosómico, tienen una parte de su secuencia homóloga a una parte de la otra, y la homología entre dichas partes es de al menos un 90%, y en donde los al menos dos cebadores son específicos para dicha parte en las secuencias marcadoras, y las secuencias marcadoras son de diferente longitud, siendo la diferencia de longitud suficiente para distinguir la amplificación de productos durante la detección, d) se detectan fragmentos amplificados, y una relación de la amplificación de productos de las secuencias marcadoras presentes en el cromosoma autosómico y el cromosoma X, que es 2:1, es indicativa del síndrome de Turner.

2. El método de acuerdo con la reivindicación 1, en donde las al menos dos secuencias marcadoras que se conoce que están presentes en el cromosoma X y en un cromosoma autosómico son el gen BRAF en el cromosoma 7 y el gen BRAF2 en el cromosoma X.

3. El método de acuerdo con la reivindicación 2, en donde las secuencias marcadoras se amplifican utilizando cebadores elegidos entre SEQ ID NO 1 – 17.

4. El método de acuerdo con la reivindicación 3, en donde las secuencias marcadoras se amplifican utilizando un par de cebadores elegidos entre ; SEQ ID NOs 1 y 2; SEQ ID NOs 1 y 3; SEQ ID NOs 1 y 4; SEQ ID NOs 1 y 5; SEQ ID NOs 1 y 9; SEQ ID NOs 1 y 11; SEQ ID NOs 1 y 14; SEQ ID NOs 1 y 15; SEQ ID NOs 1 y 17; SEQ ID NOs 6 y 7; SEQ ID NOs 6 y 8; SEQ ID NOs 6 y 14; SEQ ID NOs 10 y 7; SEQ ID NOs 12 y 7; SEQ ID NOs 13 y 3; SEQ ID NOs 13 y 11; SEQ I D NOs 16 y3; ySEQ I D NOs 16 y 7.

5. El método de acuerdo con la reivindicación 3, en donde las secuencias marcadoras se amplifican utilizando la pareja de cebadores SEQ ID NO. 1 y SEQ ID NO. 2.

6. El método de acuerdo con la reivindicación 2, en donde las siguientes secuencias marcadoras adicionales se utilizan: AMELX y AMELY, SRY, DXS1187, DXS981 y XHPRT.

7. Un kit diagnóstico que incluye al menos dos cebadores elegidos entre SEQ ID NO 1 – 17 para llevar a cabo el método de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 – 6.

 

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