REGULACION DE UNA QUINASA, 'QUINASA REGULADA EN EPOC' (QUINASA RC).

Un polinucleótido aislado que codifica un polipéptido de la Quinasa RC,

una serina/treonina quinasa, con una expresión incrementada en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica seleccionado del grupo que consiste en:

(a) un polinucléotido que codifica un polipéptido de la Quinasa RC, cuyo polipéptido comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en:

(i) una secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en 75% a la secuencia de aminoácidos mostrada en el SEQ ID NO: 7, 8, 9, 10, 11, o 12; y

(ii) una secuencia de aminoácidos como la descrita en el SEQ ID NO: 7, 8, 9, 10, 11, o 12,

(b) un polinucleótido que comprende la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, o 6; y

(c) un polinucleótido que comprende una secuencia de nucleótidos que se aparta de las secuencias de polinucleótidos especificadas en los apartados a) a b) debido a la degeneración del código genético

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2004/006474.

Solicitante: AXIKIN PHARMACEUTICALS, INC.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 10835 ROAD TO THE CURE, SUITE 200,SAN DIEGO, CA 92121.

Inventor/es: BACON, KEVIN, WATANABE, SHINICHI, KONDO, SHINICHI, ENCINAS,JEFFREY,464-1-1401 TOROYAMA-CHO.

Fecha de Publicación: .

Fecha Concesión Europea: 9 de Junio de 2010.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N9/02 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN (biocidas, productos que repelen o atraen a los animales nocivos, o reguladores del crecimiento de los vegetales, que contienen microorganismos virus, hongos microscópicos, enzimas, productos de fermentación o sustancias obtenidas por o extraídas de microorganismos o sustancias animales A01N 63/00; preparaciones de uso médico A61K; fertilizantes C05F ); PROPAGACION,CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 9/00 Enzimas, p. ej. ligasas (6.; Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas. › Oxidorreductasas (1.), p. ej. luciferasa.

Clasificación PCT:

  • A61K38/43 SECCION A — NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA.A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE.A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L;   composiciones a base de jabón C11D). › A61K 38/00 Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00). › Enzimas; Proenzimas; Sus derivados.
  • C12N9/02 C12N 9/00 […] › Oxidorreductasas (1.), p. ej. luciferasa.

Clasificación antigua:

  • A61K38/43 A61K 38/00 […] › Enzimas; Proenzimas; Sus derivados.
  • C12N9/02 C12N 9/00 […] › Oxidorreductasas (1.), p. ej. luciferasa.

Fragmento de la descripción:

Regulación de una quinasa, "Quinasa regulada en EPOC" (Quinasa RC).

Campo técnico de la invención

La invención hace referencia al área de la regulación de la actividad quinasa. Más concretamente, la invención hace referencia a la regulación de una quinasa humana novedosa, Quinasa Regulada en la EPOC (Quinasa RC). La invención describe que el gen de la Quinasa RC es expresado en exceso en pacientes con EPOC y es útil como marcador diagnóstico y diana para su tratamiento. Se describen los métodos para predecir, diagnosticar y pronosticar así como para prevenir y tratar la EPOC mediante el uso de la Quinasa RC. También se describen los métodos para predecir, diagnosticar y pronosticar así como prevenir y tratar otras dolencias en las cuales la Quinasa RC está desregulada o en las cuales la modulación o la intensificación de la actividad de la Quinasa RC pueden modificar el progreso de la enfermedad. La modulación de la actividad de la Quinasa RC puede afectar a diferentes enfermedades tales como, EPOC, asma, cáncer, enfermedad de Alzheimer, enfermedades inflamatorias, y enfermedades cardiovasculares.

Antecedentes de la invención

La señalización intracelular regula una variedad de funciones biológicas importantes. Un método común utilizado por las células para conducir las señales es la fosforilación de proteínas. Con el fin de transmitir señales, las enzimas activadas denominadas proteína quinasas anclan grupos fosfato a moléculas aguas abajo de una cascada de señalización y de ese modo, dependiendo del tipo de molécula, regulan su actividad enzimática, su localización subcelular, su interacción con otras moléculas, su forma, o su vida media. Una familia importante de proteína quinasas implicadas en este tipo de transmisión de la señal son las proteína quinasas activadas por mitógenos (MAPK) (Widmann, C. et al., Physiol. Rev. 79(1):143-80, 1999). Debido a que las MAPK son a su vez reguladas por la fosforilación, a menudo son miembros de sistemas de liberación de fósforo complejos dentro de las células que implican a otras quinasas. Por ejemplo, una MAPK puede ser fosforilada por quinasas MAPK (MKK), que a su vez pueden ser fosforiladas por quinasas de quinasas MAPK (MKKK). Semejante sistema de liberación de fósforo puede servir para amplificar una señal, determinar la especificidad de una señal, y permitir la regulación en diferentes puntos de la cascada de señalización. Se ha descubierto que las MAPK, MKK y MKKK juegan papeles en una gran variedad de actividades celulares, incluyendo la expresión génica, la mitosis, la proliferación, el movimiento celular, el metabolismo y la muerte celular programada. Debido a las funciones importantes de las enzimas de la familia de las proteína quinasas tales como MAPK, MKK y MKKK, existe la necesidad en la técnica de identificar nuevas quinasas de la ruta de MAPK y métodos de regulación de estas nuevas quinasas para efectos terapéuticos.

En el documento WO 2002/33099 se describe un polinucleótido que codifica una quinasa PKIN-6 con una expresión disminuida en la EPOC, donde el polinucleótido tiene un cierto grado de identidad de secuencia comparado con los polinucleótidos de la presente invención. En el documento WO 2003/018786 se describe un polinucleótido que codifica una serina-treonina quinasa adecuada para el tratamiento de la EPOC, donde el polinucleótido no tiene un grado relevante de identidad de secuencia comparado con los polinucleótidos de la presente invención.

Compendio de la invención

Un objeto de la invención es proporcionar reactivos y métodos de regulación de la quinasa RC humana. Estos y otros objetos de la invención son proporcionados por una o más de las realizaciones descritas más abajo.

Una realización de la invención es un polinucleótido aislado que codifica un polipéptido de la Quinasa RC, serina/treonina quinasa, con una expresión aumentada en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica seleccionado del grupo que consiste en

a) un polinucleótido que codifica un polipéptido de la Quinasa RC que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en:

secuencias de aminoácidos que son idénticas al menos en 75% a

la secuencia de aminoácidos mostrada en el SEQ ID NO: 7, 8, 9, 10, 11 o 12; y

la secuencia de aminoácidos mostrada en el SEQ ID NO: 7, 8, 9, 10, 11 o 12.

b) un polinucleótido que comprende la secuencia del SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, o 6; y

c) un polinucleótido que comprende una secuencia de nucleótidos que se aparta de las secuencias de polinucleótidos especificadas en los apartados a) a b) debido a la degeneración del código genético.

Otra realización de la invención es un polipéptido de la Quinasa RC esencialmente purificado codificado por uno de los polinucleótidos anteriores.

Los polipéptidos de Quinasa RC de la presente invención son adecuados para composiciones preventivas, predictivas, diagnósticas, prognósticas y terapéuticas novedosas y para usos en la EPOC. Puesto que los niveles de expresión de la Quinasa RC aumentan en la enfermedad, su producto génico es una diana particularmente útil para los métodos de tratamiento así como para métodos diagnósticos y de supervisión clínica.

Asimismo se describen en la presente memoria composiciones preventivas, predictivas, diagnósticas, prognósticas y terapéuticas novedosas y sus usos para la EPOC basadas en derivados, fragmentos, análogos y homólogos del gen de la Quinasa RC.

La presente invención hace referencia adicionalmente a métodos para detectar la desregulación de la Quinasa RC en la EPOC a nivel de ADN y ARN.

La presente invención hace referencia adicionalmente a un método in vitro para la predicción, diagnosis o prognosis de enfermedades respiratorias o EPOC mediante la detección de un gen de Quinasa RC o un ácido nucleico genómico de Quinasa RC que está alterado en la EPOC.

En una realización se puede detectar la expresión del gen de la Quinasa RC con matrices.

En una realización adicional, la expresión del gen puede ser detectada cono técnicas de lectura de fluorescencia directas basadas en cuentas tales como las proporcionadas por Luminex Corporation (Documento US 6.268.222).

La invención hace referencia a un método de escrutinio para agentes que disminuyen la actividad de un polipéptido de la Quinasa RC o un polipéptido de la Quinasa RC esencialmente purificado codificado por un polinucleótido como se ha descrito más arriba, que comprende las etapas de (a): poner en contacto un compuesto de ensayo con un polipéptido codificado por cualquier polinucleótido como se ha descrito más arriba; y (b) detectar la unión del compuesto de ensayo al polipéptido, donde el compuesto de ensayo que se une al polipéptido se identifica como un agente terapéutico potencial para disminuir la actividad de dicho polipéptido.

La invención también hace referencia a un método de escrutinio para agentes que regulan la actividad de un polipéptido de la Quinasa RC, que comprende las etapas de: (a) poner en contacto un compuesto de ensayo con un polipéptido de la Quinasa RC codificado por cualquier polinucleótido como se ha descrito más arriba; y (b) detectar la actividad de fosforilación del polipéptido de la Quinasa RC, donde el compuesto de ensayo que aumenta la actividad del polipéptido se identifica como un agente terapéutico potencial para incrementar la actividad del polipéptido de la Quinasa RC, y donde el compuesto de ensayo que disminuye la actividad del polipéptido se identifica como un agente terapéutico potencial para disminuir la actividad del polipéptido de la Quinasa RC.

La invención también hace referencia a un método de escrutinio para agentes que regulan la actividad de una Quinasa RC, que comprende las etapas de: (a) poner en contacto un compuesto de ensayo con un polipéptido de la Quinasa RC codificado por cualquier polinucleótido como se ha descrito más arriba y MKK4; y (b) detectar la fosforilación por el polipéptido de la Quinasa RC de MKK4, donde el compuesto de ensayo que aumenta la fosforilación por el péptido de la Quinasa RC de MKK4 se identifica como un agente terapéutico potencial para incrementar la actividad del polipéptido de la Quinasa RC, y donde el compuesto de ensayo que disminuye la fosforilación por el polipéptido de la Quinasa RC de MKK4 se identifica como...

 


Reivindicaciones:

1. Un polinucleótido aislado que codifica un polipéptido de la Quinasa RC, una serina/treonina quinasa, con una expresión incrementada en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica seleccionado del grupo que consiste en:

(a) un polinucléotido que codifica un polipéptido de la Quinasa RC, cuyo polipéptido comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en:

(i) una secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en 75% a la secuencia de aminoácidos mostrada en el SEQ ID NO: 7, 8, 9, 10, 11, o 12; y

(ii) una secuencia de aminoácidos como la descrita en el SEQ ID NO: 7, 8, 9, 10, 11, o 12,

(b) un polinucleótido que comprende la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, o 6; y

(c) un polinucleótido que comprende una secuencia de nucleótidos que se aparta de las secuencias de polinucleótidos especificadas en los apartados a) a b) debido a la degeneración del código genético.

2. Un vector de expresión que contiene cualquiera de los polinucleótidos de la reivindicación 1.

3. Una célula anfitriona que contiene el vector de expresión de la reivindicación 2.

4. Un polipéptido de la Quinasa RC sustancialmente purificado codificado por un polinucleótido de la reivindicación 1.

5. Un método para producir un polipéptido de la Quinasa RC de la reivindicación 4, donde el método comprende las siguientes etapas:

(a) cultivar la célula anfitriona de la reivindicación 3 en condiciones adecuadas para la expresión del polipéptido; y

(b) recuperar el polipéptido del cultivo de la célula anfitriona.

6. Un método para la detección de un polinucleótido que codifica un polipéptido de la Quinasa RC de acuerdo con la reivindicación 4 en una muestra biológica que comprende las siguientes etapas:

(a) hibridar cualquier polinucleótido de la reivindicación 1 con un material ácido nucleico de una muestra biológica, formando de ese modo un complejo de hibridación; y

(b) detectar dicho complejo de hibridación.

7. El método de la reivindicación 6, donde antes de la hibridación, el material ácido nucleico de la muestra biológica es amplificado.

8. Un método para la detección de un polinucleótido de la reivindicación 1 o un polipéptido de la Quinasa RC de la reivindicación 4 que comprende poner en contacto una muestra biológica con un reactivo que interacciona específicamente con el polinucleótido o el polipéptido, donde el reactivo es una ribozima, un oligonucleótido antisentido o un anticuerpo.

9. Un kit diagnóstico para llevar a cabo el método de una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 8.

10. Un método de escrutinio para agentes que disminuyen la actividad de un polipéptido de la Quinasa RC de acuerdo con la reivindicación 4, que comprende las etapas de:

(a) poner en contacto un compuesto de ensayo con un polipéptido codificado por cualquier polinucleótido de la reivindicación 1; y

(b) detectar la unión del compuesto de ensayo al polinucleótido, donde un compuesto de ensayo que se une al polipéptido se identifica como un agente terapéutico potencial para disminuir la actividad de dicho polipéptido.

11. Un método de escrutinio para agentes que regulan la actividad de un polipéptido de la Quinasa RC, que comprende las etapas de:

(a) poner en contacto un compuesto de ensayo con un polipéptido de la Quinasa RC codificado por cualquier polinucleótido de la reivindicación 1; y

(b) detectar la actividad de fosforilación del polipéptido de la Quinasa RC, donde un compuesto de ensayo que incrementa la actividad del polipéptido se identifica como un agente terapéutico potencial para incrementar la actividad del polipéptido de la Quinasa RC, y donde un compuesto de ensayo que disminuye la actividad del polipéptido se identifica como un agente terapéutico potencial para disminuir la actividad del polipéptido de la Quinasa RC.

12. Un método de escrutinio para agentes que regulan la actividad de una Quinasa RC, que comprende las etapas de:

(a) poner en contacto un compuesto de ensayo con un polipéptido de la Quinasa RC codificado por cualquier polinucleótido de la reivindicación 1 y MKK4; y

(b) detectar fosforilación del polipéptido de la Quinasa RC, donde un compuesto de ensayo que incrementa la fosforilación por el polipéptido de la Quinasa RC de MKK4 se identifica como un agente terapéutico potencial para incrementar la actividad del polipéptido de la Quinasa RC, y donde un compuesto de ensayo que disminuye la fosforilación por el polipéptido de la Quinasa RC de MKK4 se identifica como un agente terapéutico potencial para disminuir la actividad del polipéptido de la Quinasa RC.

13. Un método de escrutinio de agentes que disminuyen la actividad de un polipéptido de la Quinasa RC, que comprende poner en contacto un compuesto de ensayo con cualquier polinucleótido de la reivindicación 1 y detectar la unión del compuesto de ensayo al polinucleótido, donde un compuesto de ensayo que se une al polinucleótido se identifica como un agente terapéutico potencial para disminuir la actividad del polipéptido de la Quinasa de RC.

14. Un método de reducción de la actividad de la Quinasa RC, que comprende poner en contacto una célula en el exterior de un organismo humano o animal con un reactivo que se une específicamente a cualquier polinucleótido de la reivindicación 1 o cualquier polipéptido de la Quinasa de RC de la reivindicación 4, donde el reactivo es una ribozima, un oligonucleótido antisentido o un anticuerpo, donde la actividad de la Quinasa RC es reducida.

15. Un método in vitro para la predicción, la diagnosis o la prognosis de enfermedades respiratorias que comprende detectar al menos un marcador seleccionado del grupo que consiste en:

(a) un polinucleótido de la reivindicación 1; y

(b) un polipéptido de Quinasa RC de la reivindicación 4.

16. El método de la reivindicación 15, donde la enfermedad es una enfermedad pulmonar obstructiva crónica, cáncer, o una enfermedad respiratoria en la cual la señalización celular es defectuosa.

17. El método de la reivindicación 15 o 16, donde el método de detección comprende el uso de PCR, matrices o cuentas.

18. Un método in vitro para la predicción, diagnosis o prognosis de la EPOC que comprende detectar al menos un marcador seleccionado del grupo que consiste en:

(a) un polinucleótido de la reivindicación 1; y

(b) un polipéptido de Quinasa RC de la reivindicación 4.

19. El método de la reivindicación 18, donde se detecta el nivel de expresión del marcador.

20. Una matriz que comprende una pluralidad de polinucleótidos o análogos de polinucleótidos que codifican un polipéptido de la Quinasa RC, una serina/treonina quinasa, con una expresión incrementada en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica, donde cada uno de los polinucleótidos se selecciona del grupo que consiste en:

(a) un polinucleótido que codifica un polipéptido de la Quinasa RC, cuyo polipéptido comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en:

(i) una secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en 75% a la secuencia de aminoácidos mostrada en el SEQ ID NO: 7, 8, 9, 10, 11, o 12; y

(ii) una secuencia de aminoácidos como se representa en el SEQ ID NO: 7, 8, 9, 10, 11, o 12;

(b) un polinucleótido que comprende la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, o 6; y

(c) un polinucleótido que comprende una secuencia de nucleótidos que se aparta de la secuencia de nucleótidos especificada en los apartados (a) a (b) debido a la degeneración del código genético.

21. El uso de un método de escrutinio, comprendiendo dicho método las etapas de

(a) poner en contacto un compuesto de ensayo con un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en 90% a la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 7, y

(b) detectar la unión de dicho compuesto de ensayo a un polipéptido del apartado (a), para la identificación de compuestos útiles en el tratamiento de la EPOC.

22. El uso de un método de escrutinio, comprendiendo dicho método las etapas de

(a) poner en contacto un compuesto de ensayo con un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en 90% a la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 7, y

(b) detectar la actividad de un polipéptido del apartado (a), para la identificación de compuestos útiles en el tratamiento de la EPOC.


 

Patentes similares o relacionadas:

Composiciones y métodos para preparar (s)-norcoclaurina y (s)-norlaudanosolina e intermedios de síntesis de las mismas, del 23 de Octubre de 2019, de Willow Biosciences Inc: Un método de preparación de (S)-norcoclaurina o (S)-norlaudanosolina que comprende: (a) proporcionar al menos un precursor de la vía de la […]

DsbA y DsbC ultrapurificadas y procedimientos de preparación y uso de las mismas, del 16 de Octubre de 2019, de F. HOFFMANN-LA ROCHE AG: Un procedimiento para purificar un polipéptido de disulfuro oxidorreductasa A (DsbA) de un lisado celular que comprende el polipéptido de DsbA, comprendiendo el procedimiento […]

Producción de ácidos grasos y derivados de los mismos, del 2 de Octubre de 2019, de Genomatica, Inc: Una célula de E. coli recombinante que comprende una o más secuencias de ácido nucleico exógeno que codifican al menos una enzima de una ruta biosintética de alcohol […]

Catalizador y uso del mismo, del 2 de Octubre de 2019, de JOHNSON MATTHEY PUBLIC LIMITED COMPANY: Uso de un catalizador en un metodo para reducir un sustrato, comprendiendo el metodo poner en contacto un sustrato con un catalizador, opcionalmente en presencia de un cosustrato, […]

Célula de levadura que consume acetato, del 25 de Septiembre de 2019, de DSM IP ASSETS B.V.: Una célula de levadura que está modificada genéticamente, que comprende: a) una alteración de una o más aldehído deshidrogenadas (E.C:1.2.1.4) nativas de la […]

Drimenol sintasas y procedimiento de producción de drimenol, del 11 de Septiembre de 2019, de FIRMENICH SA: Un procedimiento para producir drimenol que comprende: i) poner en contacto difosfato de farnesilo (FPP) con un polipéptido que tiene actividad […]

Procedimiento de producción enzimática de alcohol isoamílico, del 11 de Septiembre de 2019, de Global Bioenergies: Un procedimiento de producción de alcohol isoamílico (3-metilbutan-1-ol) que comprende la conversión enzimática de 3-metilbutiril-CoA en alcohol isoamílico, […]

Polipéptido citocromo P450 novedoso con actividad enzimática aumentada, del 10 de Septiembre de 2019, de SANOFI: Una monooxigenasa del citocromo P450 aislada que comprende o consiste en una secuencia de aminoácidos al menos el 80% idéntica a la SEQ ID NO: 1, en la que dicha […]

Utilizamos cookies para mejorar nuestros servicios y mostrarle publicidad relevante. Si continua navegando, consideramos que acepta su uso. Puede obtener más información aquí. .