COMPOSICIONES UTILIZABLES PARA REGULAR LA ACTIVIDAD DE LA PARQUINA.
Polipéptido que interactúa con la parquina que presenta en toda su longitud una identidad de al menos 95% con la secuencia SEQ ID Nº: 2
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/FR01/00461.
Solicitante: AVENTIS PHARMA S.A.
INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM).
Nacionalidad solicitante: Francia.
Dirección: 20, AVENUE RAYMOND ARON,92160 ANTONY.
Inventor/es: FOURNIER, ALAIN, BRICE,ALEXIS, PRADIER,LAURENT, KOUTNIKOVA,HANA, PRADES,CATHERINE, ARNOULD-REGUIGNE,ISABELLE, ROSIER-MONTUS,MARIE-FRANCOISE, CORTI,OLGA.
Fecha de Publicación: .
Fecha Concesión Europea: 28 de Abril de 2010.
Clasificación Internacional de Patentes:
- C07K14/47 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
Clasificación PCT:
- A61K38/17 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA. › A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE. › A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › A61K 38/00 Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00). › que provienen de animales; que provienen de humanos.
- C07K14/47 C07K 14/00 […] › de mamíferos.
- C07K16/18 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra materiales animales o humanos.
- C12N15/12 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Genes que codifican proteínas animales.
- C12N5/10 C12N […] › C12N 5/00 Células no diferenciadas humanas, animales o vegetales, p. ej. líneas celulares; Tejidos; Su cultivo o conservación; Medios de cultivo para este fin (reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00). › Células modificadas por introducción de material genético extraño, p. ej. células transformadas por virus.
- G01N33/50 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Análisis químico de material biológico, p. ej. de sangre o de orina; Ensayos mediante métodos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas con grupos coordinadores; Ensayos inmunológicos (procedimientos de medida o ensayos diferentes de los procedimientos inmunológicos en los que intervienen enzimas o microorganismos, composiciones o papeles reactivos a este efecto, procedimientos para preparar estas composiciones, procedimientos de control sensibles a las condiciones del medio en los procedimientos microbiológicos o enzimáticos C12Q).
Clasificación antigua:
- A61K38/17 A61K 38/00 […] › que provienen de animales; que provienen de humanos.
- A61K39/395 A61K […] › A61K 39/00 Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53). › Anticuerpos (aglutininas A61K 38/36 ); Inmunoglobulinas; Inmunosuero, p. ej. suero antilinfocitario.
- A61K48/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen material genético que se introduce en las células del cuerpo vivo para tratar enfermedades genéticas; Terapia génica.
- A61P25/28 A61 […] › A61P ACTIVIDAD TERAPEUTICA ESPECIFICA DE COMPUESTOS QUIMICOS O DE PREPARACIONES MEDICINALES. › A61P 25/00 Medicamentos para el tratamiento de trastornos del sistema nervioso. › de los problemas neurodegenerativos del sistema nervioso central, p. ej. noótropos, activadores del conocimiento, medicamentos para el tratamiento del Alzheimer o de otras formas de demencia.
- C07K14/47 C07K 14/00 […] › de mamíferos.
- C07K16/18 C07K 16/00 […] › contra materiales animales o humanos.
- C12N15/12 C12N 15/00 […] › Genes que codifican proteínas animales.
- C12N15/63 C12N 15/00 […] › Introducción de material genético extraño utilizando vectores; Vectores; Utilización de huéspedes para ello; Regulación de la expresión.
- G01N33/53 G01N 33/00 […] › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
Fragmento de la descripción:
Composiciones utilizables para regular la actividad de la parquina.
La presente invención se refiere a composiciones y métodos utilizables para regular la actividad de la parquina. Se refiere principalmente a una nueva proteína, denominada PAP1, pareja de la parquina, así como a los péptidos o polipéptidos derivados u homólogos de esta proteína. Se refiere principalmente a compuestos capaces de modular al menos parcialmente la actividad de la parquina, principalmente de interferir con la interacción entre la parquina y la PAP1. La presente invención se puede usar en los campos terapéuticos, de diagnóstico o para la constitución de dianas farmacológicas que permitan el desarrollo de nuevos medicamentos.
El gen de la parquina muta en algunas formas familiares (juveniles autosómicas recesivas) de la enfermedad de Parkinson (Kitada et al., 1998). La enfermedad de Parkinson (Lewy, 1912) es una de las enfermedades neurodegenerativas más comunes que afecta a más de 15 de la población mayor de 55 años. Los pacientes afectados de esta enfermedad tienen trastornos neurológicos agrupados con el término de síndrome parquinsoniano, caracterizado por rigidez, bradiquinesia y temblores Estos síntomas son consecuencia de una degeneración de las neuronas dopaminérgicas de la sustancia negra del cerebro.
La mayor parte de casos con enfermedad de Parkinson no tienen una historia familiar. Sin embargo, existen casos familiares de los que algunos corresponden a una forma monogénica de la enfermedad. Hasta el momento, solo se han identificado tres genes diferentes en algunas formas hereditarias raras. La primera forma corresponde a una forma autosómica dominante cuyo gen responsable codifica para la alfa sinucleina (Polymeropoulos et al., 1997). Esta proteína es un constituyente en la que abundan inclusiones intracitoplasmáticas, denominadas cuerpos de Lewy, que sirven como marcador de la enfermedad de Parkinson (Lewy, 1912). La segunda forma, igualmente autosómica dominante, está unida a una mutación en un gen que codifica para una hidrolasa denominada ubiquitina carboxiterminal hidrolasa L1 (Leroy et al., 1998). Se supone que esta enzima hidroliza los polímeros o los conjugados de las ubiquitinas en monómeros de ubiquitina. La tercera forma se distingue de las precedentes por una transmisión autosómica recesiva y un inicio a menudo antes de los 40 años, así como por una ausencia de cuerpos de Lewy. Estas enfermedades responden más favorablemente a la levodopa, un precursor de la dopamina usado como tratamiento de la enfermedad de Parkinson. El gen implicado en esta forma codifica para una nueva proteína denominada parquina (Kitada et al., 1998).
El gen de la parquina está constituido por 12 exones que cubren una región genómica de más de 500.000 pares de bases sobre el cromosoma 6 (6q25.2-q27). Hasta el momento se conocen dos tipos importantes de mutaciones de este gen en el origen de la enfermedad, bien deleciones de tamaño variable en la región que cubre los exones 2 a 9 o bien mutaciones puntuales que producen la aparición prematura de un codon de terminación o el cambio de un aminoácido (Kitada et al., 1998; Abbas et al., 1999; Lucking et al., 1998; Hattori et al., 1998). La naturaleza de estas mutaciones y el modo de transmisión autosómica recesiva sugieren una pérdida de función de la parquina que lleva a la enfermedad de Parkinson.
Este gen se expresa en un gran número de tejidos y principalmente en la sustancia negra. Existes varios tránscritos que corresponden a este gen y que provienen de empalmes alternativos diferentes (Kitada et al., 1998; Sunada et al., 1998). En el cerebro se encuentran dos tipos de ARN mensajero de los que uno está desprovisto de la parte correspondiente al exón 5. En los leucocitos se han identificado ARN mensajeros de la parquina que no contienen la región que codifica para los exones 3, 4 y 5. El más largo de los ARN mensajeros de la parquina, presente en el cerebro, contiene 2960 bases y codifica para una proteína de 465 aminoácidos.
Esta proteína tiene una pequeña homología en su parte N-terminal con la ubiquitina. Su extremo C-terminal contiene dos restos "ring finger" separados por un dominio IBR (por sus iniciales en inglés: "In Between Ring") que corresponde con un región rica en cisteina que puede unirse a metales como los dominios "dedos de zinc" (Morett, 1999). Se ha demostrado por inmunocitoquímica que la parquina está localizada en el citoplasma del aparato de Golgi de las neuronas de la sustancia negra que contienen melanina (Shimura et al., 1999). Además, esta proteína está presente en algunos cuerpos de Lewy de los enfermos de Parkinson. La función celular de la parquina aún no ha sido demostrada, pero podría tener un papel de transportador de las vesículas sinápticas, en la maduración o degradación de las proteínas y en el control del crecimiento, de la diferenciación o del desarrollo celular. En las formas autosómicas recesivas juveniles, la parquina está ausente confirmando así que la pérdida de esta función es responsable de la enfermedad.
La elucidación del papel exacto de la proteína parquina en el proceso de degeneración de las neuronas dopaminérgicas constituye por tanto un reto importante para la comprensión y el enfoque terapéutico de la enfermedad de Parkinson y, más generalmente, de las enfermedades del sistema nervioso central.
La presente invención se refiere a la identificación de una pareja de la parquina que interacciona con esta proteína en condiciones fisiológicas. Esta pareja representa una nueva diana farmacológica para la fabricación o la investigación de compuestos capaces de modular la actividad de la parquina, principalmente su actividad sobre la degeneración de las neuronas dopaminérgicas y/o el desarrollo de patologías nerviosas. Esa proteína, los anticuerpos, los ácidos nucleicos correspondientes así como las sondas o cebos específicos, son también utilizables para la detección o dosificación de las proteínas en muestras biológicas, en particular muestras de tejido nervioso. Estas proteínas o ácidos nucleicos son también utilizables en métodos terapéuticos para modular la actividad de la parquina, así como cualquier compuesto según la invención capaz de modular la interacción entre la parquina y los polipéptidos de la invención.
La presente invención resulta más particularmente de la demostración por la Solicitante de una nueva proteína humana, denominada PAP1 (por sus iniciales en inglés: Parkine Associated Protein 1) o LY111 que interacciona con la parquina. La proteína PAP1 (secuencias SEQ ID Nº: 1 ó 2) presenta cierta homología con las sinaptotagminas y es capaz de interactuar más particularmente con la región central de la parquina (representada por las secuencias SEQ ID Nº: 3 ó 4). La proteína PAP1 ha sido igualmente clonada, secuenciada y caracterizada a partir de diferentes tejidos de origen humano, principalmente del pulmón (SEQ ID Nº: 12, 13) y del cerebro (SEQ ID Nº: 42, 43), así como de formas cortas que corresponden a variantes de empalme (SEQ ID Nº: 14, 15, 44, 45).
La presente invención resulta igualmente de la identificación y de la caracterización de regiones particulares de la proteína PAP1, implicadas en la modulación de la función de la parquina. La demostración de la existencia de esa proteína y de regiones implicadas en su función permite en particular preparar nuevos compuestos y/o composiciones utilizables como agentes farmacéuticos y desarrollar métodos industriales de selección de tales compuestos.
Un primer objetivo de la invención se refiere a un polipéptido que interacciona con la proteína que presenta en toda su longitud una identidad de al menos 95% con la secuencia SEQ ID Nº: 2.
Otro aspecto de la invención se refiere a un ácido nucleico que codifica para la proteína PAP1, sus fragmentos, derivados u homólogos, así como cualquier vector que comprenda dicho ácido nucleico, cualquier célula recombinante que contenga dicho ácido nucleico o vector y cualquier mamífero no humano que comprenda en sus células dicho ácido nucleico.
La invención se refiere también a anticuerpos capaces de unir la proteína PAP1, sus fragmentos, derivados y homólogos, principalmente anticuerpos policlonales o monoclonales, más preferentemente anticuerpos capaces de unir la proteína PAP1 y de inhibir al menos parcialmente su interacción con la parquina.
Otro aspecto de la invención se refiere a sondas o iniciadores nucleotídicos, específicos...
Reivindicaciones:
1. Polipéptido que interactúa con la parquina que presenta en toda su longitud una identidad de al menos 95% con la secuencia SEQ ID Nº: 2.
2. Polipéptido que presenta una de las secuencias SEQ ID Nº: 13 y SEQ ID Nº: 43.
3. Polipéptido que presenta una de las secuencias SEQ ID Nº: 15 y SEQ ID Nº: 45.
4. Ácido nucleico que codifica para un polipéptido según una de las reivindicaciones 1 a 3.
5. Ácido nucleico según la reivindicación 4, caracterizado porque presenta una identidad de al menos 95% con la secuencia SEQ ID Nº: 1.
6. Ácido nucleico según la reivindicación 4, caracterizado porque presente una de las secuencias SEQ ID Nº: 12 y SEQ ID Nº: 42.
7. Ácido nucleico según la reivindicación 4 que presenta una de las secuencias SEQ ID Nº: 14 y SEQ ID Nº: 44.
8. Vector que comprende un ácido nucleico según una de las reivindicaciones 4 a 7.
9. Virus recombinante defectivo que comprende un ácido nucleico según una de las reivindicaciones 4 a 7.
10. Composición farmacéutica que comprende al menos un polipéptido según una de las reivindicaciones 1 a 3.
11. Composición farmacéutica que comprende al menos un ácido nucleico según una de las reivindicaciones 4 a 7 o un vector según una de las reivindicaciones 8 ó 9.
12. Composición según una de las reivindicaciones 10 u 11 destinada al tratamiento de patologías neurodegenerativas.
13. Procedimiento para la selección o la caracterización de moléculas destinadas al tratamiento de patologías neurodegenerativas que comprende una etapa de selección de moléculas capaces de unir la secuencia SEQ ID Nº: 2, o un fragmento de ella.
14. Procedimiento para la selección o la caracterización de moléculas destinadas al tratamiento de patologías neurodegenerativas que comprende una etapa de selección de moléculas capaces de unir una secuencia elegida entre las secuencias SEQ ID Nº: 13, SEC ID Nº: 15, SEC ID Nº: 43 y SEC ID Nº: 45, o un fragmento de ellas.
15. Procedimiento de producción de un polipéptido según una de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende el cultivo de una célula que contiene un ácido nucleico según una de las reivindicaciones 4 a 7 o un vector según la reivindicación 8 ó 9, en condiciones de expresión de dicho ácido nucleico, y la recuperación del compuesto peptídico producto.
16. Célula que contiene un ácido nucleico según una de las reivindicaciones 4 a 7 o un vector según la reivindicación 8 ó 9.
17. Mamífero no humano que comprende, en sus células, un ácido nucleico según una de las reivindicaciones 4 a 7.
18. Anticuerpos, fragmentos o derivados de anticuerpo dirigidos contra un polipéptido según una de las reivindicaciones 1 a 3.
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