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(11/03/2020) Un método para detectar cáncer de próstata y/o para distinguir entre o dentro de trastornos proliferativos de células de próstata en un sujeto, que comprende: a) poner en contacto el ADN genómico derivado de una muestra biológica que se ha obtenido del sujeto, o un fragmento del mismo, con un reactivo o una pluralidad de reactivos para distinguir entre secuencias de dinucleótidos CpG metiladas y no metiladas dentro de al menos una secuencia diana del ADN genómico, o fragmento del mismo, en donde la secuencia diana comprende o hibrida en condiciones restrictivas con al menos 16 nucleótidos contiguos de la secuencia de acuerdo con la SEQ ID NO: 31 o un complemento de la misma, comprendiendo dichos nucleótidos contiguos al menos una secuencia de dinucleótidos CpG; y b) determinar,…

(16/10/2019) Un método para análisis de metilación, comprende a) tratar ADN genómico con uno o más reactivos para convertir bases de citosina no metiladas a sulfonato de uracilo o a otra base que tenga un comportamiento de unión diferente de citosina, mientras que la citosina metilada permanece sin cambio; b) amplificar el ADN tratado por medio de i) al menos un oligonucleótido que comprende o que consiste en una secuencia seleccionada de un grupo que consiste en SEQ ID NO: 6, 48, 62-64 y sus variantes, SEQ ID NO: 6, 44-48 y sus variantes, SEQ ID NO: 1, 12-15 y sus variantes, o SEQ ID NO: 92, en donde dicho al menos un oligonucleótido es adecuado…

(20/03/2019) Un método para detectar la presencia o ausencia de ADN diana hipermetilado en una muestra que comprende ADN genómico, en donde dicho ADN genómico está al menos parcialmente fragmentado, que comprende las etapas: (a) convertir, en el ADN, la citosina no metilada en la posición en uracilo u otra base que no hibrida con guanina; (b) amplificar una región del ADN diana convertido mediante el uso de oligonucleótidos cebadores no específicos de metilación y al menos un bloqueador específico de metilación que bloquea la amplificación de una manera específica de metilación, en donde dicha región es menor que 100 pares de bases (pb) de longitud y comprende al menos 3 sitios CpG del ADN genómico no…

(04/10/2017) Procedimiento para (i) determinar el pronóstico de un sujeto con cáncer de colon o colorrectal después de cirugía o resección que remueve el tumor primario y antes de un tratamiento después de la cirugía o resección del tumor primario, (ii) determinar la necesidad de tratamiento médico adicional para un sujeto con cáncer de colon o colorrectal después del tratamiento que remueve el tumor primario y antes de un tratamiento luego de cirugía o resección de tumor y antes de un tratamiento luego de cirugía o resección, (iii) seleccionar un sujeto con cáncer de colon o colorrectal para tratamiento de cáncer adicional después del tratamiento que remueve el tumor primario y antes de un tratamiento luego de cirugía o resección, o (iv) determinar, después del tratamiento que remueve…

(19/08/2015) Un método para identificar al menos una muestra biológica en el campo del análisis de la metilación, que comprende las etapas (a) y (b) en el orden indicado: (a) proporcionar un conjunto de muestras de al menos dos muestras biológicas, en donde al menos una muestra comprende el ADN genómico diferencialmente metilado al menos en una posición; (b) aplicar al menos un identificador para cada muestra, en donde al menos un identificador aplicado no interfiera con el análisis posterior; y en donde al menos un identificador aplicado es un ácido nucleico que no forma una estructura secundaria estable y comprende al menos un sitio de unión de oligonúcleotidos libre de citosina, o libre de citosina y libre de guanina; que pone en contacto el ADN de cada muestra con el bisulfito; (c) someter cada muestra a una reacción de…

(05/08/2015) Un método para detectar cáncer de colon en un sujeto que comprende: i) poner en contacto el ADN genómico aislado de plasma sanguíneo, suero sanguíneo, sangre entera, células sanguíneas aisladas, células aisladas de la sangre obtenida del sujeto con al menos un reactivo, o serie de reactivos que distingue entre dinucleótidos CpG metilados y no metilados dentro de al menos una región objetivo del ADN genómico, en donde dicha región objetivo comprende, o se hibrida en condiciones rigurosas con al menos 16 nucleótidos contiguos del gen o la secuencia de ALX4; y ii) detectar el cáncer de colon en un sujeto con base en el estado de metilación de al menos una secuencia del dinucleótido…

(29/07/2015) Método para la conversión de una base citosina en un ácido nucleico a una base uracilo, que comprende las etapas de: a) incubar el ácido nucleico en presencia de iones sulfito de manera que el ácido nucleico se desamina, b) unir el ácido nucleico desaminado a una fase sólida, c) lavar opcionalmente el ácido nucleico desaminado unido a la fase sólida, d) incubar el ácido nucleico unido a la fase sólida desaminado bajo condiciones alcalinas de manera que el ácido nucleico desaminado se desulfona, e) lavar opcionalmente el ácido nucleico unido a la fase sólida desaminado y desulfonado, y f) eluir opcionalmente el ácido nucleico desaminado y desulfonado a partir de la fase sólida.

(22/07/2015) Un método para la detección de carcinoma colorrectal en un sujeto, que comprende determinar el nivel de expresión de RASSF2 en una muestra biológica seleccionada del grupo que consiste en plasma sanguíneo, suero sanguíneo, sangre completa, y células sanguíneas, aislada de dicho sujeto, en donde dicho nivel de expresión se determina por medio de la detección de la presencia o ausencia de metilación de CpG dentro de dicho gen, en donde la presencia de metilación indica la presencia de carcinoma colorrectal.

(06/05/2015) Un método para el análisis de la metilación de un ácido nucleico bicatenario, que comprende convertir dicho ácido nucleico de forma tal que la 5-metilcitosina permanece sin cambio, mientras que la citosina no metilada se convierte a uracilo o a otra base que se distingue de la citosina en su comportamiento de apareamiento de base, dicha reacción lleva a dos hebras de ácidos nucleicos convertidas diferentes que ya no son complementarias entre sí, analizar ambas hebras de ácidos nucleicos convertidas en una reacción de detección para la presencia o ausencia de metilación de CpG en la misma posición, en donde a) se analiza la presencia de metilación en una o más posiciones…

(25/03/2015) Un método para detectar un trastorno proliferativo celular de la próstata en un sujeto que comprende determinar los niveles de expresión de RASSF2 en una muestra biológica aislada de dicho sujeto, y seleccionada del grupo que consiste en eyaculación, orina, pasma sanguíneo, suero sanguíneo, sangre completa, células sanguíneas aisladas, donde la expresión disminuida de y/o metilación de CpG en el gen RASSF22 es indicativa de la presencia de dicho trastorno.

(04/03/2015) Un método para evitar la reducción del contenido total de C del ADN genómico durante el tratamiento con uno o más reactivos que convierten las bases de citosina no metiladas a uracilo o a otra base que se detecta diferente a la citosina en términos de propiedades de hibridación que comprende: (a) tratar el dicho ADN genómico, o un fragmento del mismo, con una enzima o serie de enzimas que adicionan un grupo metilo a una citosina fuera de la secuencia de dinucleótidos CpG de el dicho ADN genómico, o un fragmento del mismo y (b) tratar dicho ADN genómico de la etapa (a) o un fragmento de este con uno o más reactivos para convertir las bases de citosina no metiladas a uracilo o a otra base que se detecta diferente a la citosina en términos de…

(11/02/2015) Un método para proporcionar un pronóstico de un sujeto con un trastorno proliferativo de células de la próstata, que comprende las etapas de: a) determinar el estado de expresión del gen PITX2 en una muestra biológica obtenida de dicho sujeto; y b) determinar el pronóstico de dicho sujeto basado en dicha expresión, en donde la subexpresión es indicativo de un pronóstico negativo, en donde la expresión se determina mediante la medición del nivel de ARNm.

(14/01/2015) Procedimiento para la conversión de una base de citosina, en un ácido nucleico, a una base de uracilo, que comprende las etapas de a) incubar una solución que comprende el ácido nucleico, durante un período de tiempo de 1, 5 a 3, 5 horas, a una temperatura comprendida dentro de unos márgenes comprendidos entre 70 y 90°C, en donde, la concentración de bisulfito, en la solución, es de un valor comprendido dentro de unos márgenes situados entre 3 M y 6, 25 M, y en donde, el valor pH de la solución, es de un valor comprendido dentro de unos márgenes situados entre 5, 0 y 6, 0, en donde, el ácido nucleico, se desamina, y b) incubar la solución que comprende el ácido nucleico desaminado, bajo condiciones alcalinas, a cuyo efecto, el ácido nucleido desaminado, se desulfona.

(31/12/2014) Un método para detectar y/o clasificar el carcinoma colorrectal en un sujeto que comprende determinar la presencia o ausencia de metilación CpG de FOXL2 en una muestra biológica aislada de dicho sujeto en donde la hipermetilación CpG de FOXL2 es indicativa de la presencia o clase de dicho carcinoma colorrectal.

(13/08/2014) Un método para proveer fragmentos de ADN derivados de una muestra archivada, que comprende: obtener una muestra archivada que comprende ADN y parafina y opcionalmente un agente de fijación; (a) someter la muestra archivada directamente a una etapa de lisis con una proteasa, en donde la parafina es licuada por calentamiento para proveer una cantidad de ADN tratado con proteasa accesible; (b) inactivar la proteasa mediante calor, adición de un inhibidor de proteasa, o ambos; y (c) tratar el ADN con un reactivo de bisulfito sin una etapa previa de extracción de ADN.

(14/05/2014) Método para detectar el cáncer de pulmón, mama o vejiga en un sujeto que comprende determinar el nivel de metilación del gen SHOX2 en una muestra biológica aislada de dicho sujeto en el que la hipermetilación resulta indicativa de la presencia de dicho cáncer.

(14/05/2014) Método para proporcionar un pronóstico de un sujeto con cáncer de próstata, que comprende las etapas siguientes: a) en una muestra biológica obtenida de dicho sujeto, b) determinar el estado de metilación del gen PITX2 en dicha muestra, y c) determinar a partir del mismo el pronóstico de dicho sujeto, en el que opcionalmente por lo menos una variable pronóstica adicional se incluye en la valoración al determinar dicho pronóstico, y en el que la hipermetilación es indicativa de un pronóstico negativo, y d) opcionalmente, determinar un tratamiento adecuado para dicho sujeto.