Análisis digital de secuencia de la metilación de ADN.
Un procedimiento de selección de un subconjunto definido de loci CpG en un ácido nucleico marcador para su uso en un ensayo de detección de ácido nucleico que detecta la metilación coordinada de un subconjunto definido de loci CpG,
en el que la metilación coordinada del subconjunto definido de loci CpG es indicativo de adenoma o cáncer, comprendiendo el procedimiento:
a) la determinación del estado de metilación de una pluralidad de loci CpG en cada una de una pluralidad de copias individuales de un ácido nucleico marcador de una pluralidad de muestras normales;
b) la determinación del estado de metilación de dicha pluralidad de loci CpG en cada una de una pluralidad de copias individuales de dicho ácido nucleico marcador de una pluralidad de muestras de adenoma o una pluralidad de muestras de cáncer; en el que la pluralidad de copias individuales de dicho ácido nucleico marcador analizado en cada una de dichas muestras normales y dichas muestras de adenoma o cáncer comprende al menos 1.000;
c) la determinación de las relaciones de metilación de cada locus en dicha pluralidad de dichos loci CpG en dicho ácido nucleico marcador; en el que la determinación de dichas relaciones de metilación comprende la determinación de la relación entre la media de metilación en cada uno de dicha pluralidad de loci CpG en dichas muestras normales respecto a la media de metilación de cada locus CpG correspondiente en dicha pluralidad de loci CpG en dichas muestras de adenoma o cáncer;
d) la selección de un conjunto definido de loci CpG en dicho ácido nucleico marcador, en el que dicho conjunto definido de loci CpG comprende una pluralidad de loci CpG que tienen relaciones de metilación ventajosas que se correlacionan con adenoma o cáncer; y
e) la selección de un subconjunto definido de loci CpG de dicho conjunto definido, en el que dicho subconjunto definido de loci CpG comprende al menos tres loci CpG, y en el que dicho subconjunto definido se selecciona de manera que el porcentaje de copias individuales en dicho ácido nucleico marcador de dicha pluralidad de muestras normales que están metiladas en todos los dichos al menos tres loci CpG en dicho subconjunto definido es menor que el porcentaje de copias individuales de dicho ácido nucleico marcador de dicha pluralidad de muestras de adenoma o dichas muestras de cáncer que están metiladas en todos los dichos al menos tres loci CpG en dicho subconjunto definido.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2012/023646.
Solicitante: Exact Sciences Development Company, LLC.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 441 Charmany Drive Madison, Wisconsin 53719 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: LIDGARD, GRAHAM, P., TAYLOR,WILLIAM R, ZOU,HONGZHI, AHLQUIST,DAVID A.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/6827 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › para detección de mutaciones o polimorfismos.
- C12Q1/6858 C12Q 1/00 […] › Amplificación específica de alelo.
- C12Q1/6886 C12Q 1/00 […] › para el cáncer (ensayos inmunológicos para el cáncer G01N 33/574).
PDF original: ES-2686309_T3.pdf
Patentes similares o relacionadas:
Distintivos de expresión génica predictivos de la respuesta de un sujeto a un inhibidor multicinasa y métodos de uso de los mismos, del 29 de Julio de 2020, de Crown Bioscience, Inc. (Taicang): Un método de determinación de la sensibilidad de un sujeto a un inhibidor multicinasa que comprende medir el perfil de expresión de un […]
Métodos y sistemas para detectar variantes genéticas, del 15 de Julio de 2020, de Guardant Health, Inc: Un método para determinar una medida cuantitativa indicativa de una serie de moléculas de ácido desoxirribonucleico (ADN) de cadena doble individuales en una muestra, […]
Biosondas y métodos de uso de las mismas, del 15 de Julio de 2020, de THE GOVERNING COUNCIL OF THE UNIVERSITY OF TORONTO: Una primera biosonda inmovilizada sobre una superficie, comprendiendo la primera biosonda: una secuencia de ANP capaz de hibridarse con un nucleótido […]
Marcadores de metilación de ADN no sesgados que definen un defecto de campo amplio en tejidos de próstata histológicamente normales asociados al cáncer de próstata: nuevos biomarcadores para hombres con cáncer de próstata, del 15 de Julio de 2020, de WISCONSIN ALUMNI RESEARCH FOUNDATION: Un método para diagnosticar cáncer de próstata en un sujeto humano que comprende cuantificar la metilación en el ADN genómico obtenido del sujeto humano en al menos una región […]
Predicción de pronóstico para el melanoma de cáncer, del 8 de Julio de 2020, de Pacific Edge Limited: Un método para determinar el pronóstico de melanoma en un paciente con melanoma en estadio IIIB o en estadio IIIC, que comprende las etapas de: (i) determinar el […]
MÉTODO DE DETECCIÓN TEMPRANA DE CÁNCER GASTRICO POR DETERMINACIÓN DE IncRNA KCNQ1OT1, del 18 de Junio de 2020, de PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE: Método de detección no invasiva de cáncer gástrico basada en la detección de un nuevo marcador molecular en sangre. Particularmente, a través de la detección en sangre periférica […]
Diferentes niveles en muestras de células sanguíneas de marcadores de EMT para el diagnóstico de cáncer, en particular del cáncer colorrectal (CRC) y de páncreas (PC), del 10 de Junio de 2020, de HUMANITAS MIRASOLE S.P.A.: Un método para determinar si un sujeto está afectado por un cáncer que comprende la etapa de evaluar una muestra de sangre de dicho sujeto para la […]
Método de deducción de un valor de positividad de biomarcador en porcentaje para células seleccionadas presentes en un campo de visión, del 10 de Junio de 2020, de NOVARTIS AG: Método de deducción de un valor para el % de positividad de biomarcador (PBP) para todas las células u, opcionalmente, uno o más subconjuntos de las […]