Procedimiento para la generación de proteínas y usos del mismo.

Un método para generar una proteína Rubisco que tiene una propiedad funcional mejorada seleccionada del grupo que consiste en:

mejora de la eficiencia cinética de Rubisco, aumento de la especificidad de Rubisco para el dióxido de carbono con respecto a oxígeno, especificidad alterada de la Rubisco para uno o más sustratos, especificidad alterada de Rubisco para uno o más productos y un intervalo de temperatura eficaz alterado para la catálisis de Rubisco, comprendiendo dicho método:

(a) identificar al menos un Residuo de aminoácido Diana en una primera proteína Rubisco, en donde dicho Residuo de aminoácido Diana está asociado a dicha propiedad funcional, en donde los Residuos de aminoácido Diana de la proteína de Rubisco son residuos de la primera envoltura que se coordinan directamente con el centro de reacción o residuos de la segunda envoltura que se coordinan directamente con uno o más residuos de la primera envoltura, y dichos residuos de la primera envoltura de Rubisco se seleccionan del grupo que consiste en: Glu60, ASN123, LYS175, LYS177, KCX201, Asp203, GLU204 e HIS294, en donde la numeración de los residuos de Rubisco de espinaca, y KCX201 denota LYS201 carbamilada;

(b) comparar al menos una segunda proteína Rubisco homóloga de la misma o diferente ramas filogenéticas que la primera proteína Rubisco con la primera proteína Rubisco e identificar al menos un Residuo de aminoácido Variante entre la primera proteína Rubisco y la segunda proteína Rubisco, en donde los residuos de la segunda proteína Rubisco utilizados para la comparación con la primera proteína Rubisco comprenden todos los residuos directamente coordinados con el sitio activo de una proteína Rubisco, interactuando todos los residuos con el centro reactivo del sustrato o especies de reacción intermedias de una proteína Rubisco, y otros residuos a una distancia aproximada de entre 3 y 28 Å de cualquier átomo de sustrato o especies de reacción intermedias del sitio activo de la proteína Rubisco o un subconjunto de tales residuos;

(c) seleccionar al menos un Residuo de aminoácido Candidato entre los Residuos de aminoácidos Variantes identificados en (b) basándose en la estimación de la proximidad espacial de los Residuos Variantes a los Residuos Diana y estimar y clasificar su capacidad para influir en la electrostática y la orientación de los Residuos Diana y modular la propiedad funcional de la proteína formada;

(d) generar al menos una proteína Mutante Rubisco Candidata in vitro en la que dicho al menos un Residuo de aminoácido Candidato de la segunda proteína Rubisco sustituye un residuo correspondiente en la primera proteína de Rubisco; y

(e) detectar dicha al menos una proteína Rubisco Mutante Candidata producida en (d) para identificar una proteína Rubisco que tiene una propiedad funcional mejorada.