Procedimiento para la generación de proteínas y usos del mismo.

Un método para generar una proteína Rubisco que tiene una propiedad funcional mejorada seleccionada del grupo que consiste en:

mejora de la eficiencia cinética de Rubisco, aumento de la especificidad de Rubisco para el dióxido de carbono con respecto a oxígeno, especificidad alterada de la Rubisco para uno o más sustratos, especificidad alterada de Rubisco para uno o más productos y un intervalo de temperatura eficaz alterado para la catálisis de Rubisco, comprendiendo dicho método:

(a) identificar al menos un Residuo de aminoácido Diana en una primera proteína Rubisco, en donde dicho Residuo de aminoácido Diana está asociado a dicha propiedad funcional, en donde los Residuos de aminoácido Diana de la proteína de Rubisco son residuos de la primera envoltura que se coordinan directamente con el centro de reacción o residuos de la segunda envoltura que se coordinan directamente con uno o más residuos de la primera envoltura, y dichos residuos de la primera envoltura de Rubisco se seleccionan del grupo que consiste en: Glu60, ASN123, LYS175, LYS177, KCX201, Asp203, GLU204 e HIS294, en donde la numeración de los residuos de Rubisco de espinaca, y KCX201 denota LYS201 carbamilada;

(b) comparar al menos una segunda proteína Rubisco homóloga de la misma o diferente ramas filogenéticas que la primera proteína Rubisco con la primera proteína Rubisco e identificar al menos un Residuo de aminoácido Variante entre la primera proteína Rubisco y la segunda proteína Rubisco, en donde los residuos de la segunda proteína Rubisco utilizados para la comparación con la primera proteína Rubisco comprenden todos los residuos directamente coordinados con el sitio activo de una proteína Rubisco, interactuando todos los residuos con el centro reactivo del sustrato o especies de reacción intermedias de una proteína Rubisco, y otros residuos a una distancia aproximada de entre 3 y 28 Å de cualquier átomo de sustrato o especies de reacción intermedias del sitio activo de la proteína Rubisco o un subconjunto de tales residuos;

(c) seleccionar al menos un Residuo de aminoácido Candidato entre los Residuos de aminoácidos Variantes identificados en (b) basándose en la estimación de la proximidad espacial de los Residuos Variantes a los Residuos Diana y estimar y clasificar su capacidad para influir en la electrostática y la orientación de los Residuos Diana y modular la propiedad funcional de la proteína formada;

(d) generar al menos una proteína Mutante Rubisco Candidata in vitro en la que dicho al menos un Residuo de aminoácido Candidato de la segunda proteína Rubisco sustituye un residuo correspondiente en la primera proteína de Rubisco; y

(e) detectar dicha al menos una proteína Rubisco Mutante Candidata producida en (d) para identificar una proteína Rubisco que tiene una propiedad funcional mejorada.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/AU2007/001542.

Solicitante: THE AUSTRALIAN NATIONAL UNIVERSITY.

Inventor/es: GREADY,JILL E, KANNAPPAN,BABU.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07H21/04 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07H AZUCARES; SUS DERIVADOS; NUCLEOSIDOS; NUCLEOTIDOS; ACIDOS NUCLEICOS (derivados de ácidos aldónicos o sacáricos C07C, C07D; ácidos aldónicos, ácidos sacáricos C07C 59/105, C07C 59/285; cianohidrinas C07C 255/16; glicales C07D; compuestos de constitución indeterminada C07G; polisacáridos, sus derivados C08B; ADN o ARN concerniente a la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos o su aislamiento, preparación o purificación C12N 15/00; industria del azúcar C13). › C07H 21/00 Compuestos que contienen al menos dos unidades mononucleótido que tienen cada una grupos fosfato o polifosfato distintos unidos a los radicales sacárido de los grupos nucleósido, p. ej. ácidos nucleicos. › con desoxirribosilo como radical sacárido.
  • C07K1/00 C07 […] › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02;   proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › Procedimientos generales de preparación de péptidos.
  • C07K14/415 C07K […] › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de vegetales.
  • C12N15/29 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN (biocidas, productos que repelen o atraen a los animales nocivos, o reguladores del crecimiento de los vegetales, que contienen microorganismos virus, hongos microscópicos, enzimas, productos de fermentación o sustancias obtenidas por o extraídas de microorganismos o sustancias animales A01N 63/00; preparaciones de uso médico A61K; fertilizantes C05F ); PROPAGACION,CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Genes que codifican proteínas vegetales, p. ej. taumatina.
  • C12N15/64 C12N 15/00 […] › Métodos generales para la preparación del vector, para su introducción en la célula o para la selección del huésped que contiene el vector.

PDF original: ES-2640747_T3.pdf

 

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