Identificación de microorganismos por espectrometría y clasificación estructurada.

Procedimiento de identificación por espectrometría de microorganismos desconocidos entre un conjunto de especies de referencia,

que comprende:

• una primera etapa de aprendizaje supervisado de un modelo de clasificación de las especies de referencia, que comprende:

- para cada especie, la adquisición de un conjunto de espectros de aprendizaje de microorganismos identificados que pertenecen a dicha especie;

- la transformación de cada espectro de aprendizaje adquirido en un conjunto de datos de aprendizaje según un formato predeterminado para su utilización mediante un algoritmo de tipo máquina de vector de soporte de clase múltiple; y

- la determinación del modelo de clasificación de las especies de referencia en función de los conjuntos de datos de aprendizaje mediante dicho algoritmo de tipo máquina de vector de soporte de clase múltiple,

* una segunda etapa de predicción de un microorganismo desconocido a identificar que comprende:

- la adquisición de un espectro de microorganismo desconocido; y

- la aplicación de un modelo de predicción en función de dicho espectro y del modelo de clasificación a fin de inferir al menos un tipo de microorganismo al que el microorganismo desconocido pertenece,

caracterizado:

• por que la transformación de cada espectro de aprendizaje adquirido comprende:

- la transformación del espectro en un vector de datos representativo de una estructura del espectro de aprendizaje;

- la producción del conjunto de datos según el formato predeterminado realizando el producto tensorial del vector de datos por un vector predeterminado que representa de manera biunívoca la posición de la especie de referencia del microorganismo en una representación jerárquica en forma de árbol de las especies de referencia en términos de evolución y/o de fenotipo clínico;

• y por que el modelo de clasificación es un modelo de clasificación de clases que corresponde a unos nodos del árbol de la representación jerárquica, consistiendo el algoritmo de tipo máquina de vector de soporte de clase múltiples en determinar unos parámetros del modelo de clasificación resolviendo un único problema de optimización de un criterio expresado en función de los parámetros del modelo de clasificación bajo restricciones de márgenes que comprenden unas funciones denominadas de "pérdida" que cuantifica una proximidad entre los nodos del árbol.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2013/056889.

Solicitante: BIOMERIEUX.

Nacionalidad solicitante: Francia.

Dirección: 69280 Marcy l'Etoile FRANCIA.

Inventor/es: MAHE,PIERRE, VEYRIERAS,JEAN-BAPTISTE, VERVIER,KEVIN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G01N33/50 SECCION G — FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Análisis químico de material biológico, p. ej. de sangre, de orina; Investigación o análisis por métodos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas con grupos coordinadores; Investigación o análisis inmunológico (procedimientos de medida, de investigación o análisis diferentes de los procedimientos inmunológicos en los que intervienen enzimas o microorganismos, composiciones o papeles reactivos a este efecto; procedimientos para preparar estas composiciones, procedimientos de control sensibles a las condiciones del medio en los procedimientos microbiológicos o enzimáticos C12Q).
  • G06F19/24 G […] › G06 COMPUTO; CALCULO; CONTEO.G06F TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS (computadores en los que una parte del cálculo se efectúa hidráulica o neumáticamente G06D, ópticamente G06E; sistemas de computadores basados en modelos de cálculo específicos G06N). › G06F 19/00 Métodos o equipos para computación digital o procesamiento de datos, especialmente adaptados para aplicaciones específicas (G06F 17/00  tiene preferencia; sistema o métodos de procesamiento de datos especialmente adaptados para propósitos administrativos, comerciales, financieros, de gestión, supervisión o predicción G06Q). › para aprendizaje automático, minería de datos o bioestadística, p.ej. identificación de patrones, descubrimiento de conocimiento, extracción de reglas, correlación, agrupamiento o clasificación.
  • G06K9/00 G06 […] › G06K RECONOCIMIENTO DE DATOS; PRESENTACION DE DATOS; SOPORTES DE REGISTROS; MANIPULACION DE SOPORTES DE REGISTROS (impresión per se B41J, G01V). › Métodos o disposiciones para la lectura o el reconocimiento de caracteres impresos o escritos o el reconocimiento de formas, p. ej. de huellas dactilares (métodos y disposiciones para la lectura de grafos o para la conversión de patrones de parámetros mecánicos, p.e. la fuerza o la presencia, en señales eléctricas G06K 11/00; reconocimiento de la voz G10L 15/00).
  • G06K9/62 G06K […] › G06K 9/00 Métodos o disposiciones para la lectura o el reconocimiento de caracteres impresos o escritos o el reconocimiento de formas, p. ej. de huellas dactilares (métodos y disposiciones para la lectura de grafos o para la conversión de patrones de parámetros mecánicos, p.e. la fuerza o la presencia, en señales eléctricas G06K 11/00; reconocimiento de la voz G10L 15/00). › Métodos o disposiciones para el reconocimiento que utilizan medios electrónicos.
  • H01J49/16 SECCION H — ELECTRICIDAD.H01 ELEMENTOS ELECTRICOS BASICOS.H01J TUBOS DE DESCARGA ELECTRICA O LAMPARAS DE DESCARGA ELECTRICA (espinterómetros H01T; lámparas de arco, con electrodos consumibles H05B; aceleradores de partículas H05H). › H01J 49/00 Espectrómetros de partículas o tubos separadores de partículas. › que utilizan una ionización de superficie, p. ej. emisión termoiónica o fotoeléctrica.

PDF original: ES-2663257_T3.pdf

 

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