Sistema para detectar células anómalas empleando un análisis multidimensional.

Un sistema de diagnóstico que comprende un medio para llevar a cabo un método de caracterización de un conjunto de ensayo de células biológicas,

que comprende:

a) cartografiar cada célula en el conjunto de ensayo de células biológicas a un punto correspondiente en un espacio n-dimensional, en el que n 5 ≥ 3 empleando un protocolo definido en el que al menos algunas de las n-dimensiones son datos de intensidad fluorescente de las células, y los puntos correspondientes forman un conjunto de ensayo de puntos;

b) comparar el conjunto de ensayo de puntos con un conjunto definido de agrupaciones de células biológicas normales, es decir, un conjunto definido de agrupaciones normales, en el espacio n-dimensional, en el que cada agrupación en el conjunto definido de agrupaciones normales se corresponde con un nivel de maduración dentro de un linaje celular, y en el que, para el conjunto de agrupaciones normales, se define una línea centroide de referencia y un radio, y la línea centroide de referencia y el radio forman diversas conformaciones de agrupaciones, en el que la línea centroide de referencia para el conjunto de agrupaciones se basa en un conjunto de puntos de referencia, y en el que el radio es una función de una posición en la línea centroide de referencia, en el que la línea centroide de referencia y el radio se ajustan de una manera iterativa empleando al menos un análisis estadístico y la entrada de un usuario, en el que el ajuste incluye determinar una distancia desde un punto centroide identificado de cada agrupación y un punto más cercano en la línea centroide de referencia;

c) determinar, para cada punto del conjunto de ensayo de puntos, basándose en la línea centroide de referencia y el radio determinados, si se encuentra fuera del conjunto definido de agrupaciones normales basándose en la comparación; y

d) caracterizar el conjunto de ensayo de células biológicas basándose al menos en parte en una determinación de una cantidad de células anómalas en el conjunto de ensayo de células biológicas basándose en la determinación de la etapa c).

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2006/005778.

Solicitante: Hematologics, Inc.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 3161 Elliott Avenue, Suite 200 Seattle, WA 98121 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: LOKEN, MICHAEL R., JOSHI,SANJAYA N.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G06F19/20 SECCION G — FISICA.G06 COMPUTO; CALCULO; CONTEO.G06F TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS (computadores en los que una parte del cálculo se efectúa hidráulica o neumáticamente G06D, ópticamente G06E; sistemas de computadores basados en modelos de cálculo específicos G06N). › G06F 19/00 Métodos o equipos para computación digital o procesamiento de datos, especialmente adaptados para aplicaciones específicas (G06F 17/00  tiene preferencia; sistema o métodos de procesamiento de datos especialmente adaptados para propósitos administrativos, comerciales, financieros, de gestión, supervisión o predicción G06Q). › para hibridación o expresión génica, p.ej. microarrays, secuenciación por hibridación, normalización, perfiles, modelos de corrección de ruido, estimación de la ratio de expresión, diseño de sondas u optimización de sondas.
  • G06F19/24 G06F 19/00 […] › para aprendizaje automático, minería de datos o bioestadística, p.ej. identificación de patrones, descubrimiento de conocimiento, extracción de reglas, correlación, agrupamiento o clasificación.
  • G06F19/26 G06F 19/00 […] › para visualización de datos, p.ej. generación de gráficos, presentación de mapas o redes u otras representaciones visuales.

PDF original: ES-2609412_T3.pdf

 

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