Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores.

Método para cuantificar reproductivamente la expresión de biomarcadores en una muestra de tejido montada en una diapositiva que comprende:



(a) obtención de una muestra de tejido montada en una diapositiva, que se ha manchado para permitir la localización de al menos un compartimento celular y al menos un biomarcador;

(b) obtención de una o más imágenes formadas por píxeles de la muestra de tejido manchada utilizando un sistema óptico estandarizado, y análisis de una o más imágenes formadas por píxeles para obtener uno o más conjuntos de datos;

(c) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos del ruido;

(d) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos atribuible a cada uno de dicho al menos un compartimento celular;

(e) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos atribuible a dicho al menos un biomarcador para cada uno de dicho al menos un compartimento celular;

(f) cuantificación de la cantidad de biomarcador expresado en cada uno de dicho al menos un compartimento celular para llegar a una puntuación estandarizada, que es un producto de una puntuación bruta, un factor de fuente luminosa, un factor de trayectoria óptica, y opcionalmente un factor de cubo de calibración, por lo cual el sistema óptico estandarizado está dispuesto para ajuste automático de tiempo de exposición para proporcionar un rango dinámico optimizado de datos capturados en los píxeles de la imagen,

y donde un tiempo de exposición nuevo se calcula como:**Fórmula**

donde**Fórmula**

donde E es el nuevo tiempo de exposición, E' es el tiempo de exposición actualmente establecido. A es un nivel de agresión, SL es el límite de saturación, CCDx y CCDy representan las dimensiones de píxel de la imagen capturada, y P es el recuento de píxeles a intensidad máxima.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2009/056996.

Solicitante: NOVARTIS AG.

Nacionalidad solicitante: Suiza.

Dirección: LICHTSTRASSE 35 4056 BASEL SUIZA.

Inventor/es: PINARD,Robert, GUSTAVSON,Mark, BOURKE,Brian, REILLY,Dylan,M, TEDESCHI,Gregory,R, CHRISTIANSEN,JASON, ZERKOWSKI,MACIEJ P, WILLIAMS,CHRISTINE, WANG,DONGXIAO.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G06T7/00 FISICA.G06 CALCULO; CONTEO.G06T TRATAMIENTO O GENERACIÓN DE DATOS DE IMAGEN, EN GENERAL.Análisis de imagen.

PDF original: ES-2573945_T3.pdf

 

Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores.

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