Alargamiento Iterado Programable: Un método para elaborar genes sintéticos y ADN combinatorio y librerías de proteína.

Un método para fabricar por lo menos semiautomáticamente un polinucleótido con errores mínimos o reducidos a través de un proceso de eliminación de error iterativo,

el método comprende las etapas de:

a. analizar y dividir una secuencia de polinucleótido objetivo in silico en secuencias de ADN de cadena sencilla propensas a errores suficientemente cortas para ser sintetizadas por una síntesis de oligonucleótidos convencional, en el que dicho análisis comprende adicionalmente la construcción de cada secuencia de ADN de cadena sencilla corta por separado;

b. combinar de forma recursiva las secuencias de ADN de cadena sencilla propensas a errores in vitro para formar secuencias de ADN de cadena sencilla alargadas propensas a errores, el proceso recursivo comprende las etapas de fosforilar una de las dos hebras de entrada de hebra sencilla, hibridar las hebras, alargar las hebras para producir un ADN de hebra doble alargado y digerir la hebra fosforilada del ADN de doble hebra mediante una exonucleasa para producir una salida de ADN de una hebra alargada;

c. clonar y secuenciar la salida de ADN de hebra sencilla alargada para identificar errores en el mismo, en el que si se identifica un polinucleótido objetivo libre de error, este forma la salida y finaliza el proceso; o en donde si se identifica una salida propensa a errores, se identifica un grupo de regiones libre de errores más grande de ADN de una hebra alargada y se utilizan como entradas más precisas para repetir la combinación recursiva para producir un ADN de una hebra alargado sin errores o con pocos errores que la iteración anterior; y

d. repetir el proceso hasta que se forma una molécula objetivo libre de errores.

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E12167464.

Solicitante: YEDA RESEARCH AND DEVELOPMENT COMPANY LIMITED.

Nacionalidad solicitante: Israel.

Dirección: THE WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE P.O. BOX 95 76100 REHOVOT ISRAEL.

Inventor/es: SHAPIRO,EHUD Y, LINSHIZ,GREGORY, BEN-YEHEZKEL,TUVAL, KAPLAN,SHAI, ADAR,RIVKA, GRONAU,ILAN, TUVI,SIVAN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N15/10 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN (biocidas, productos que repelen o atraen a los animales nocivos, o reguladores del crecimiento de los vegetales, que contienen microorganismos virus, hongos microscópicos, enzimas, productos de fermentación o sustancias obtenidas por o extraídas de microorganismos o sustancias animales A01N 63/00; preparaciones de uso médico A61K; fertilizantes C05F ); PROPAGACION,CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).
  • G06F19/00 SECCION G — FISICA.G06 COMPUTO; CALCULO; CONTEO.G06F TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS (computadores en los que una parte del cálculo se efectúa hidráulica o neumáticamente G06D, ópticamente G06E; sistemas de computadores basados en modelos de cálculo específicos G06N). › Métodos o equipos para computación digital o procesamiento de datos, especialmente adaptados para aplicaciones específicas (G06F 17/00  tiene preferencia; sistema o métodos de procesamiento de datos especialmente adaptados para propósitos administrativos, comerciales, financieros, de gestión, supervisión o predicción G06Q).

PDF original: ES-2551577_T3.pdf

 

Ilustración 1 de Alargamiento Iterado Programable: Un método para elaborar genes sintéticos y ADN combinatorio y librerías de proteína.
Ilustración 2 de Alargamiento Iterado Programable: Un método para elaborar genes sintéticos y ADN combinatorio y librerías de proteína.
Ilustración 3 de Alargamiento Iterado Programable: Un método para elaborar genes sintéticos y ADN combinatorio y librerías de proteína.
Ilustración 4 de Alargamiento Iterado Programable: Un método para elaborar genes sintéticos y ADN combinatorio y librerías de proteína.
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Alargamiento Iterado Programable: Un método para elaborar genes sintéticos y ADN combinatorio y librerías de proteína.

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