Proteínas quiméricas del receptor de toxina mejoradas y proteínas quiméricas del receptor de toxina para el tratamiento y la prevención de anthrax.
Una proteína quimérica de receptor de toxina formada por:
un complejo inmunoglobulínico,
que a su vez está compuesto por al menos un fragmento de cadena pesada de la inmunoglobulina G (IgG) y
una proteína de morfogenia capilar 2 (CMG2) de la proteína de receptor de la toxina del carbunco, a la que le faltan los residuos de aminoácidos de SEC ID N.º: 102, unidos por enlaces covalentes con la cadena pesada de la IgG, o un fragmento de la misma.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2006/030325.
Solicitante: PLANET BIOTECHNOLOGY, INC.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 25571 CLAWITER ROAD HAYWARD, CA 94545 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: LARRICK, JAMES, W., YU,LLOYD M, WYCOFF,KEITH L.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C07K16/00 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales.
PDF original: ES-2426194_T3.pdf
![Proteínas quiméricas del receptor de toxina mejoradas y proteínas quiméricas del receptor de toxina para el tratamiento y la prevención de anthrax.](https://patentados.com/img/2013/10/1252887/proteinas-quimericas-receptor-toxina-mejoradas-proteinas-quimericas.jpg)
Fragmento de la descripción:
Proteínas quiméricas del receptor de toxina mejoradas y proteínas quiméricas del receptor de toxina para el tratamiento y la prevención de anthrax
La presente invención se refiere a proteínas quiméricas del receptor de toxina, las inmunoadhesinas, su producción a partir de plantas, y su uso en el tratamiento y la prevención de la toxicidad y las enfermedades causadas por agentes patógenos. 10
Los receptores solubles y las proteínas de unión, que actúan como señuelo para toxinas y agentes patógenos y que mitigan la infección y la patogénesis, abren las puertas a la esperanza en el tratamiento y la prevención de la toxicidad y de enfermedades causadas por agentes patógenos.
Un ejemplo de una condición tratable con un receptor señuelo es la infección por carbunco. Se han identificado dos receptores de membrana del PA (antígeno protector, un componente tóxico del carbunco) : el marcador endotelial 15 tumoral 8 (TEM8) y la proteína de morfogenia capilar 2 (CMG2) (30, 31) . Se ha mostrado que las formas solubles de dominios extracelulares de ambas proteínas inhiben la intoxicación de células con receptores endógenos de toxina. La forma soluble de TEM8 inhibió la acción de la toxina letal en un 50% a 80 nM (IC50 = 80 nM) (Bradley, K. A., Mogridge, J., Mourez, M, Collier, R. J. & Young, J. A. Identification of the cellular receptor for anthrax toxin. Nature 414, 225-9 (2001) ) . La proteína CMG2 mostró una afinidad con el PA de 170 pM, y un IC50 en el ensayo de 20 protección macrófaga de 3, 1 nM (67 ng/ml) , convirtiéndose así en un potente inhibidor potencial de la acción de la toxina del carbunco (Scobie, H. M., Rainey, G. J., Bradley, K. A. & Young, J. A. Human capillar y morphogenesis protein 2 functions as an anthrax toxin receptor. Proc Natl Acad Sci USA 100, 5170-4 (2003) ; Wigelsworth, D. J., Krantz, B. A., Christensen, K. A., Lacy, D. B., Juris, S. J. & Collier, R. J. Binding stoichiometr y and kinetics of the interaction of a human anthrax toxin receptor, CMG2, with protective antigen. J Biol Chem 279, 23349-56 (2004) ) . En 25 ensayos de cultivo celular, las formas solubles de CMG2 de dominios extracelulares neutralizaron el 50% de la actividad de la toxina letal en una proporción molar de 3:1 con el PA (Scobie et al. Proc Natl Acad Sci USA 100, 5170-4 (2003) ) . Sin embargo, la alta concentración de bacilos en sangre durante una infección activa sugiere que la concentración del PA puede ser bastante alta, y que se necesita una dosis alta de antitoxina para dar protección.
WO 03/064992 (PLANET) describe un complejo inmunoglobulínico quimérico de receptor de la toxina del carbunco 30 que comprende una porción de cadena pesada de inmunoglobulina y una porción de cadena ligera de inmunoglobulina.
Para minimizar la cantidad de proteína de receptor señuelo necesaria para asegurar la eficacia, sería conveniente incrementar la actividad específica o la potencia del receptor señuelo aún más. Por lo tanto, siguen siendo necesarios potentes señuelos con mayor actividad y mayor farmacocinética. 35
El receptor señuelo descrito en el presente documento tiene varios inconvenientes, como son laboriosas técnicas de producción y costes altos asociados a los métodos de producción. Además, estos receptores señuelo tienen una estabilidad limitada como multímeros en condiciones ambientales adversas en las que la molécula puede incluso inactivar los patógenos. Así pues, es necesario desarrollar tecnologías de señuelo con una mayor estabilidad para mejorar el rendimiento y que se pueda producir en volúmenes comercialmente viables a un coste razonable. 40
La invención aporta una proteína quimérica de receptor tal y como se indica en cualquiera de las peticiones de 1 a 9.
En realizaciones preferidas, las proteínas quiméricas de receptor de toxina se expresan en plantas, incluyendo plantas monocotiledóneas y dicotiledóneas como parte del genoma de las plantas. El tabaco es una de las plantas preferidas para ello. La expresión en plantas, en contraposición a la expresión en células de mamífero cultivadas, favorece una importante reducción del coste de producción de las proteínas quiméricas de receptor de toxina. 45
En una realización preferida, todas las proteínas utilizadas para crear la toxina quimérica son proteínas de receptor expresadas en células heterólogas obtenidas a partir de plantas, vertebrados o invertebrados, como células de mamíferos, células del folículo piloso o células de tejidos vegetales cultivados.
En este documento se describen inmunoadhesinas que contienen receptores quiméricos de toxina. En algunas realizaciones, la inmunoadhesina es un multímero que contiene al menos dos proteínas quiméricas de receptor de 50 toxina. En otras realizaciones, la inmunoadhesina incluye una proteína de receptor de toxina asociada a la cadena J. En otra realización, la composición de la inmunoadhesina unida a la cadena J se asocia a un componente secretor.
En una realización, la presente invención contempla una proteína quimérica de receptor de toxina que tiene una glicosilación específica de planta. Un gen que codifica un polipéptido que contiene en su secuencia de aminoácidos la señal de glicosilación asparagina-X-serina/treonina, en la que X puede ser cualquier resto de aminoácido, se 55 glicosila mediante oligosacáridos unidos al residuo asparagina de la secuencia cuando se expresa en una célula de planta. Ver Marshall, Ann. Rev Biochem., 41:673 (1972) y Marshall, Biochem. Soc. Symp., 40:17 (1974) para una revisión general de la secuencia de polipéptidos que funcionan como señales de glicosilación. Estas señales son reconocidas por células tanto de mamífero como de planta. Al final de su maduración, las proteínas expresadas en plantas o en células vegetales tienen un modelo de glicosilación diferente al de las proteínas expresadas en otros 60
tipos de células entre las que se incluyen células de mamíferos e insectos. Estudios detallados que caracterizan la 5 glicosilación específica de plantas y su comparación con la glicosilación en otros tipos celulares se han realizado, por ejemplo, en los estudios descritos por Cabanes-Macheteau et al., Glicobiología 9 (4) :365-372 (1999) , y por Altmann, Glicoconjugación J. 14:643-646 (1997) . Estos y otros grupos han demostrado que la glicosilación específica de plantas genera glicanos que tienen xilosa unida por enlaces ß (1, 2) a la manosa, pero la xilosa no está unida por enlaces ß (1, 2) a la manosa como resultado de la glicosilación en células de mamífero e insecto. La 10 glicosilación específica de plantas da como resultado una fucosa unida por enlaces α (1, 3) al GlcNAc proximal, mientras que la glicosilación en células de mamífero da como resultado una fucosa unida por enlaces α (1, 6) al GlcNAc proximal. Adicionalmente, la glicosilación específica de plantas no da como resultado la adición de un ácido siálico al extremo de la proteína de glicano, mientras que en la glicosilación en células de mamífero se añade ácido siálico. 15
En otra realización, las composiciones anteriores son además asociadas con material de planta. El material de planta presente puede ser paredes celulares vegetales, orgánulos vegetales, citoplasmas vegetales, células vegetales intactas, semillas vegetales, plantas viables y similares. Los materiales vegetales o macromoléculas vegetales particulares que pueden estar presentes incluyen ribulosa bisfosfato carboxilasa, complejo ligero de cultivo, pigmentos, metabolitos secundarios o clorofila y sus fragmentos. Las composiciones de la presente 20 invención pueden tener una concentración de proteína quimérica de receptor de toxina de entre 0, 001% y 99, 9% en masa, excluyendo el agua. En otras realizaciones, la proteína quimérica de receptor de toxina está presente en concentraciones de entre 0, 01% y 99% en masa, excluyendo el agua. En otras realizaciones, las composiciones de la presente invención tienen material de planta o macromoléculas vegetales presentes a una concentración de 0, 01% a 99% en masa, excluyendo el agua. 25
En otra realización, la invención proporciona métodos para reducir el potencial de unión con un antígeno patógeno tal como se establece en la reivindicación 12. La invención contempla un receptor quimérico de toxina definido para su uso como medicamento en pacientes o animales.
La invención incluye además una proteína quimérica de receptor de toxina para su uso anteriormente indicado en la prevención o el tratamiento de la infección por carbunco, o los efectos de la toxina del carbunco. 30
En otro aspecto, la invención aporta compuestos farmacéuticos que incluyen las proteínas quiméricas de... [Seguir leyendo]
Reivindicaciones:
Una proteína quimérica de receptor de toxina formada por:
un complejo inmunoglobulínico, que a su vez está compuesto por al menos un fragmento de cadena pesada de la inmunoglobulina G (IgG) y
una proteína de morfogenia capilar 2 (CMG2) de la proteína de receptor de la toxina del carbunco, a la que le faltan los residuos de aminoácidos de SEC ID N.º: 102, unidos por enlaces covalentes con la cadena pesada de la IgG, o 10 un fragmento de la misma.
Una proteína quimérica de receptor de toxina, como indicado en la reivindicación 1, en forma de dímero con otro receptor quimérico de toxina de la reivindicación 1.
Una proteína quimérica de receptor de proteína, de las reivindicaciones 1 o 2, cuyo complejo inmunoglobulínico está formado, además, por un fragmento de una cadena ligera de inmunoglobulina, 15 preferiblemente una cadena kappa o lambda.
Una proteína quimérica de receptor de toxina, de las reivindicaciones 1 a 3, cuya cadena pesada de IgG, o un fragmento de la misma, y a cuya CMG2 de la proteína de receptor de la toxina del carbunco le faltan los residuos de aminoácidos de SEC ID N.º: 102, que están unidos por enlace covalente por medio de la unión (Gly3Ser) 3.
Una proteína quimérica de receptor de proteína, descrita en las reivindicaciones anteriores, cuyo dominio 20 Cγ1 de la cadena pesada de IgG se omite.
Una proteína quimérica de receptor de toxina, de las reivindicaciones 1 a 3, en donde el enlace covalente entre la CMG2 de la proteína de receptor de la toxina del carbunco y la cadena pesada de IgG es la bisagra de inmunoglobulina.
Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones anteriores, cuyo fragmento de 25 la cadena pesada de IgG solo contiene las regiones constantes 2 y 3 de la cadena pesada.
Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones anteriores, donde la cadena pesada de IgG y la proteína del receptor de la toxina del carbunco son proteínas humanas.
Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones anteriores, donde la proteína quimérica CMG-IgG tiene una secuencia de aminoácidos de SEC ID N.º: 114 30
Una composición formada por una CMG2 de una proteína quimérica de receptor de toxina, de cualquiera de la reivindicaciones de 1 a 9, y por material de planta.
Una composición, como la descrita en la reivindicación 10, cuyo material de planta sea seleccionado dentro del siguiente grupo: paredes de células de planta, orgánulos de plantas, citoplasma de plantas, células de planta intactas, semillas de plantas y plantas viables. 35
Un método para reducir la unión de un antígeno de carbunco a una célula hospedadora in vitro. El método consiste en: poner en contacto al antígeno de carbunco con la proteína quimérica de receptor de toxina de cualquiera de las reivindicaciones de 1 a 9, donde la proteína quimérica de receptor de toxina se une al antígeno de carbunco y se reduce la unión del antígeno de carbunco con la célula hospedadora.
Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones de 1 a 9, para utilizar como 40 medicamento sobre pacientes o animales.
Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones de 1 a 9, para utilizar en la prevención o en el tratamiento contra la infección por carbunco, o contra los efectos de la toxina del carbunco.
Un vector de expresión que codifica para la CMG2 de la proteína quimérica de receptor de toxina, según se describe en las reivindicaciones de 1 a 9. 45
Un método de producción de una proteína quimérica de receptor de toxina, de cualquiera de las reivindicaciones de 1 a 9, que esté formado por la introducción de un vector de expresión de la reivindicación 15 en una célula hospedadora; y la expresión del complejo inmunoglobulínico y de la CMG2 de la proteína del receptor de la toxina del carbunco para formar una proteína quimérica de receptor de toxina.
Un método, indicado en la reivindicación 16, donde el hospedador es una planta. 50
Una composición farmacéutica formada por una proteína quimérica de receptor de toxina, descrito en las reivindicaciones de 1 a 9, y un vehículo farmacéuticamente válido.
[SEC ID N.º: 8]
FIGURA 2B
FIGURA 3
Expresión de ICAM-1-SIgA en callos de tabaco transformados individualmente. Inmunoblots de geles de SDS-PAGE no reductora, cuyas muestras, que contienen diferentes callos de tabaco transformados (C) y extractos acuosos (Aq) , migran y prueban la presencia de ICAM humana (A) . Los marcadores de PM están indicados, y el patrón de referencia (R) fue una mezcla (~75 ng de cada) de ICAM humana (~75 kD) y SIgA humana (>>250 kD) . La solubilidad del planticuerpo nos asegura que la extracción se podría realizar fácilmente y la similitud de las señales nos lleva a creer en la reproducibilidad de la expresión. B. Inmunoblots de geles de SDS-PAGE no reductora que contienen varias fracciones del planticuerpo parcialmente purificado a partir de callos Rhi107-11. J = jugo, G = fracción G-100, SG = fracción G-100 esterilizada por filtración (el que se utiliza en ensayo ECP) y RS = una mezcla de patrones de referencia de SIgA humana (75 ng) y de ICAM-1 humana (75 ng) . Las transferencias se sondearon con anticuerpos frente a la ICAM humana (~ICAM) , la cadena pesada de la IgA humana (~α) , el componente secretor humano (~SC) y la cadena J humana (~J) . En segundo lugar, se usaron anticuerpos conjugados con enzimas según necesidad para etiquetar las bandas inmunopositivas con fosfatasa alcalina. La especificidad del inmunoblotting se comprueba por un fallo en la detección de bandas inmunopositivas en extractos de callos no expresables (no se muestra) . El PM esperado para una ICAM-1 dimerizada, sin glicosilación, es de 173.318; es probable que esta forma esté presente en la banda que migra justo por debajo de los marcadores de 250 kD, pues es inmunopositiva para el ICAM-1 y la cadena pesada. Esta banda también es inmunopositiva para el SC (PM total esperado de ~248 kD) pero no para la cadena J, algo inesperado, en cierto modo, teniendo en cuenta la vía canónica para la asociación de la SIgA, lo que implica dos tipos celulares (para mamíferos) y necesita de la presencia de cadena J antes de asociarse al SC. Una inmunoadhesina tetramérica, que contenga una sola molécula de cadena J y una sola molécula de SC, tiene un PM esperado de ~440 kD, previo a la glicosilación. Hay evidencias de varias especies con pesos moleculares muy por encima de los 200 kD, que son inmunopositivas según el método de las cuatro puntas.
FIGURA 4
FIGURA 7A
I. REGIÓN C-α-1 DE LA IG HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
>sp | P01376 | REGIÓN C CADENA ALFA-1 IG HUMANA ALC1 – Homo sapiens (Humano) .
[SEC ID N.º: 16]
SECUENCIA DE CODIFICACIÓN
[SEC ID N.º: 15]
GenBank
J00220
LOCUS HUMIGCC8 2533 bp ADN PRI 02-DIC-1998
DEFINICIÓN Región constante de la cadena pesada alfa-1 de la inmunoglobulina de homo sapiens (gen IGHA1) , SCD parcial.
N.º ACCESO J00220
VERSIÓN J00220.1 GI: 184743
PALABRAS CLAVE -
FUENTE humano ORGANISMO Homo sapiens FIGURA 7B
Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 2533)
AUTORES
Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.
TÍTULO
Structure of human immonoglobulin gamma genes: Implications for evolution of a gene family
REVISTA
Cell 29.
67. 679 (1982)
MEDLINE
COMENTARIO
Esta secuencia forma parte de una región multigénica que contiene los genes de la cadena pesada de inmunoglobulina gamma-3, gamma-1, pseudo-épsilon y alfa-1.
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..2533
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón: 9606”
/cromosoma = “14”
/mapa = “14q32.33”
/clon = “cosmid Ig13; Ig-gamma3-122”
/tipo_tejido = “placenta; hígado”
/germline
intrón
<1..141
/nota = “alfa-1 intrón J-C”
exón
142..447
/gen = “IGHA1”
gen
<142..>1638
/gen = “IGHA1”
SCD
unión a (<142..447, 662..1021, 1244..1638)
/gen = “IGHA1”
/comienzo_codón = 3
/producto = “región constante de la cadena pesada de la inmunoglobulina alfa-1”
/n_proteína = “AAC82528.1”
/db_xref = “GI = 184749”
intrón
448..661
/gen = “IGHA1”
/nota = “A”
axón
662..1021
/gen = “IGHA1”
intrón
1022..1243
/gen = “IGHA1”
/nota = “B”
exón
1244..>1638
/gen = “IGHA1”
CONTADOR BASE
490 a 866 c 753 g 424 t
ORIGEN
FIGURA 7C
[SEC ID N.º: 52]
II. REGIÓN C DE CADENA DE LA IG ALFA-2 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
>sp | P01877 | ALC2_REGIÓN C DE CADENA DE LA IG ALFA-2 HUMANA - Homo sapiens (Humano)
FIGURA 7D
[SEC ID N.º: 18]
SECUENCIA DE CODIFICACIÓN
[SEC ID N.º: 17]
GenBank
J700221
Ig humana de germline
LOCUS
HUMIGCD7 2516 bp ADN PRI 11-ABR-2001
DEFINICIÓN
Cadena H de Ig humana de germline Región: G E A B: alfa-2 A2m (l) Región constante de alelo extremo 3’.
N.º ACCESO
J00221
VERSIÓN
J00221.1 GI:184756
PALABRAS CLAVE
-
ORGANISMO
humano
FUENTE
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 2516)
AUTORES
Ellison.J. y Hood. L.
TÍTULO
Linkage and sequence homology of two human immunoglobulin gamma heavy chain constant region genes
REVISTA
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (6) , 1984-1988 (1982)
MEDLINE
PUBMED
REFERENCIA
(bases 737 a 1016)
AUTORES
Flanagan.J.G. y Rabbitts.T.H.
TÍTULO
Arrangement of human immunoglobulin heavy chain constant regiongenes implies evolutionar y duplication of a segment containing gamma, epsilon and alpha genes
REVISTA
Nature 300 (5894) .
70. 713 (1982)
MEDLINE
PUBMED
REFERENCIA
(bases 49 a 229; 425 a 514)
AUTORES
Hisajima, H., Nishida, Y., Nakai, S., Takahashi, N., Ueda, S. and
Honjo, T.
TÍTULO
Structure of the human immunoglobulin C epsilon 2 gene, a truncated pseudogene: implications for itsevolutionar y origin
REVISTA
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.80 (10) , 2995-2999 (1983)
MEDLINE
FIGURA 7E
PUBMED
REFERENCIA
(bases 1 a 2516)
AUTORES
Flanagan, J.G., Lefranc, M.P. y Rabbitts, T.H.
TÍTULO
Mechanisms of divergence and convergence of the human
immunoglobulin alpha 1 and alpha 2 constant region gene sequences
REVISTA
Cell 36 (3) .
66. 688 (1984)
MEDLINE
PUBMED
COMENTARIO
(3) también informa sobre el gen alfa-1 completo y parte del alelo alfa-2 A2m (2) (base.
73. 2516; véase Tabla de sitios) . La comparación de las tres secuencias sugiere que el alelo alfa-2 A2m (1) podría ser un híbrido del gen alfa-1 y del alelo alfa-2 A2m (2) . La región bisagra de los genes alfa está al principio del dominio CH2. La región bisagra alfa-1 tiene 13 aminoácidos más que la de alfa-2. Ambas regiones bisagra están formadas por repeticiones en tándem de una secuencia aproximada de 15 bps. La primera repetición se produce en el extremo 5’ del mARN del sitio de unión, y no es codificante. Los autores (3) sugieren que esta estructura repetitiva proporciona un mecanismo posible para el gran número de variaciones observadas en las regiones bisagra. Hay una inserción de 30 bp acopladas, deleción de 2 bp en alfa-2 en relación a alfa-1 (a partir de base 97) .
(1) también informa sobre los genes de región C épsilon-1 y épsilon-2 (pseudogén) . Los autores (1) determinaron la unión física entre épsilon-1 y alfa-2, y entre épsilon-2 y alfa-1. (2) también informa del dominio CH2 alfa y épsilon-2.
Esta entrada es parte de una región multigénica (región B) , que incluye los genes gamma-2, gamma-4, epsilon-1 y alfa-2. Véase segmento 1 para más comentarios.
Fuente de información completa;
ADN genómico humano, Ig10 cosmídico (1) , (3) ; Clon H-Ig-alfa-25 de ADN placentario (2) ; ADN genómico de TOU II-5 biblioteca clon lambda-TOU-alfa2 (para A2m (2) alelo) (3) .
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..2516
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón:9606”
/mapa = “14q32.33”
/germline
gen
<1..1621
/gen = “IgH”
/nota = “IGHA2”
intrón
<1..163
/gen = “IgH”
/nota = “alfa-2 intrón J-C”
SDC
unión ( <164..469.684 ..1004, 1227.. 1621)
/gen = “IgH”
/nota = “contiene región constante”
/comienzo_codón = 3
/producto = “inmunoglobulina de cadena pesada alfa-2”
/n.º_proteín a= “AAB59396.1”
/db_xref = “GI: 184761”
exón
164..469 “
/gen = “IgH”
/nota = “G00-119-333”
intrón
470..683
/gen = “IgH”
/nota = “alfa = 2 intrón A”
exón
684..1004
FIGURA 7F
intrón
/gen = “IgH”
1005..1226
/gen = “IgH”
/nota= “alfa-2 intrón B”
exón
1227..1621
/gen = “IgH”
variación
/gen = “IgH”
/nota = “t en A2m (1) ; a en A2m (2) .
variación
/gen = “IgH”
/nota = “g en A2m (1) ; a en A2m (2) .
variación
/gen = “IgH”
/nota = “c en A2m (1) ; t en A2m (2) ”.
variación
/gen = “IgH”
/nota = “c en A2m (1) ; g en A2m (2) ”.
variación
/gen = “IgH”
/nota = “t en A2m (1) ; a en A2m (2) .
variación
1573..1574
/gen = “IgH”
/nota = “tg en A2m (1) ; ca en A2m (2) ”.
variación
1602..1606
/gen = “IgH”
/nota = “tggac en A2m (1) ; cggat en A2m (2) ”.
variación
/nota = “c en A2m (1) ; t en A2m (2) ”.
variación
/nota = “a en A2m (1) ; c en A2m (2) ”.
variación
/nota = “c en A2m (1) ; g en A2m (2) ”.
CONTADOR BASE 488 a 861 c 754 g 413 t
ORIGEN
FIGURA 7G
[SEC ID N.º: 53]
III. REGIÓN C DE LA IG GAMMA-1 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
>sp | P01857 | GC1_REGIÓN C DE LA IG GAMMA-1HUMANA - Homo sapiens (Humano)
[SEC ID N.º: 20]
SECUENCIA DE CODIFICACIÓN
FIGURA 7H
[SEC ID N.º: 19]
GenBank
J700228
LOCUS
HUMIGCC4 2009 bp ADN PRI 02-DIC-1998
DEFINICIÓN
Región constante de la cadena pesada de la inmunoglobulina gamma-1 de homo sapiens (gen IGHG1) Scod. Parc.
N.º ACCESO
J00228
VERSIÓN
J00228.1 GI:184739
PALABRAS CLAVE
-
ORGANISMO
humano
FUENTE
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 2009)
AUTORES
Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.
TÍTULO
Structure of human immonoglobulin gamma genes: Implications for evolution of a gene family
REVISTA
Cell 29.
67. 679 (1982)
MEDLINE
COMENTARIO
Esta secuencia forma parte de una región multigénica que contiene los genes de la cadena pesada de inmunoglobulina gamma-3, gamma-1, pseudo-épsilon y alfa-1.
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..2009
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón: 9606”
/cromosoma = “14”
/mapa = “14q32.33”
/clon = “cósmido Ig13; Ig-gamma3-122”
/tipo_tejido = “placenta; hígado”
/germline
gen
<1..>1803
/gen = “IGHG1”
intrón
<1..209
/gen = “IGHG1”
SDC
unión (<210..503, 892..936, 1055..1384, 1481..1803)
/gen = “IGHG1”
/comienzo_codón = 3
/producto = “región constante de la cadena pesada de la inmunoglobulina gamma-1 “
/n_proteína = “AAC82527.1”
/db_xref = “GI: 184747”
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
FIGURA 7I
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
765…766
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
diferencia_misc
/gen = “IGHG1”
/sustituir = “ “
CONTADOR BASE 418 a 698 c 566 g 327 t
ORIGEN
[SEC ID N.º: 54]
IV. REGIÓN C DE LA IG GAMMA 2 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
>sp | P01859 | GC2_REGIÓN C DE LA IG GAMMA-2HUMANA - Homo sapiens (Humano)
FIGURA 7J
[SEC ID N.º: 22]
SECUENCIA DE CODIFICACIÓN
[SEC ID N.º: 21]
GenBank
J00230
Ig humana de germline
LOCUS
HUMIGCD1 2009 bp ADN PRI 11-ABR-2001
DEFINICIÓN
Cadena H de Ig humana de germline Región: G-E-A B: Región constante gamma-2 Extremo 3’.
N.º ACCESO
J00230 V00554
VERSIÓN
J00230.1 GI:184750
PALABRAS CLAVE
-
ORGANISMO
humano
FUENTE
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 2009)
AUTORES
Ellison.J. y Hood. L.
TÍTULO
Linkage and sequence homology of two human immunoglobulin gamma heavy chain constant region genes
REVISTA
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (6) , 1984-1988 (1982)
MEDLINE
PUBMED
REFERENCIA
(bases 896 a 1256; 1749 a 1937)
AUTORES
Krawinkel, H. y Rabbitts.T. H.
TÍTULO
Comparison of the hinge-coding segments in human immunoglobulin gamma heavy chain genes and the linkage of the gamma 2 and gamma 4
FIGURA 7K
subclass genes JOURNAL EMBO J. 1 (4) .
40. 407 (1982)
MEDLINE
84235992 PUBMED 6329676
REFERENCIA
(bases 475 a 1071; 1179 a 1330; 1461 a 1524)
AUTORES
Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.
TÍTULO
Structure of human immunoglobulin gamma genes: implications for evolution of a gene family JOURNAL Cell 29 (2) .
67. 679 (1982)
MEDLINE
83001943 PUBMED 6811139
COMENTARIO
El 2 Marzo de 2000 esta versión sustituye: 32759
(2) informa también secuencias de gamma-3, gamma-4 y un pseudogén gamma. La mayoría de esta secuencia es homóloga en un 95% con gamma-4. Los exones de la bisagra son homólogos solo en un 70%. Los autores estiman que gamma-2 y gamma-4 se separaron hace 6, 6 millones de años. Los autores de (1) creen que la transferencia mediada por dominio de intrones ha desempeñado un papel importante en la evolución de los genes humanos gamma. Asimismo, informan de las regiones bisagra de gamma-1, gamma-3, gamma-4 y un pseudogén de gamma. (1) se estima que la divergencia entre los genes humanos gamma se produjo entre 7, 7 y 4, 4 millones de años. Esta entrada es parte de una región multigénica que incluye los genes gamma-2, gamma-4, épsilon-1 y alfa-2. La ubicación relativa de los cuatro genes la determinaron Flanagan y Rabbitts (Nature 300.
70. 713 (1982) ) . Se refieren a este grupo de genes como región B. Los genes de la región A son gamma-3, gamma-1, pseudo-épsilon y alfa-1. Flanagan y Rabbits también determinaron las ubicaciones generales de las dos regiones. Situaron la región A entre las regiones JH/mu/delta y la región B. Fuente de información completa:
ADN de hígado fetal humano, biblioteca de T. Maniatis (3) y Lawn et al. (2) , (1) ; clones p-gamma-2RPA3 (2) , 5A (3) e Ig-gamma-2-15 (1) .
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores fuente 1..2009
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón: 9606” /mapa = “14q32.33”
/germline intrón <1..215
/gen = “IgH” gen <1..2009
/gen = “IgH” /nota = “IGHG2”
exón
216..509 /gen = “IgH”
/nota = “G00-119 -338” Región_C 216..508
/gen = “IgH”
/nota = “región constante de cadena pesada CH1 de inmunoglobulina”
SDC
unión (<216..509, 902..937, 1056..1382, 1480..1802)
/gen = “IgH” /comienzo_codón = 3
/producto = “cadena pesada de inmunoglobulina gamma-2”
/nº_proteína = “AAB59393.1”
/db_xref = “GI: 184758”
intrón
510..901 /gen = “IgH”
conflicto
537 /gen = “IgH”
/cita = (3) /sustituir = “ “
conflicto
550..551 /gen = “IgH”
/cita = (3) /sustituir = “ “
conflicto
570 /gen = “IgH”
/cita = (3) /sustituir = “ “
conflicto
777..778 /gen = “IgH”
/cita = (3) /sustituir = “ “
conflicto
791 /gen = “IgH”
/cita = (3) /sustituir = “ “
conflicto
864 /gen = “IgH”
/cita = (3) /sustituir = “ “
región_C
901..936 /gen = “IgH”
/nota = “bisagra de cadena pesada de inmunoglobulina”
exón
902..937 /gen = “IgH”
/nota = “G00-119 -338” intrón 938..1055
/gen = “IgH” región_C 1055.1381
FIGURA 7L
/gen = “IgH”
/nota = “región constante de cadena pesada CH2 de inmunoglobulina”
exón
1056..1382 /gen = “IgH”
/nota = “G00-119 -338” intrón 1383..1479
/gen = “IgH” región_C 1479..1799
/gen = “IgH”
/nota = “región constante de cadena pesada CH3 de inmunoglobulina”
exón
1480..1802 /gen = “IgH”
/nota = “G00-119 -338” conflicto 1493
/gen = “IgH” /cita = (3)
/sustituir = ““ conflicto 1802..1806
/gen = “IgH” /cita = (2)
/sustituir = ““ conflicto 1814..1815
/gen = “IgH” /cita = (2)
/sustituir = ““ conflicto 1825
/gen = “IgH” /cita = (2)
/sustituir = ““ conflicto 1890
/gen = “IgH” /cita = (2)
/sustituir = ““ señal poliA 1903..1908
/gen = “IgH” conflicto 1909..1918
/gen = “IgH” /cita = (3)
/sustituir = ““ conflicto 1929..1932
/gen = “IgH” /cita = (2)
/sustituir =“ “ CONTADOR BASE 410 a 700 c 568 g 331 t
ORIGEN
[SEC ID N.º: 55]
FIGURA 7M
V. REGIÓN C DE LA IG GAMMA-3 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
CAA27268 C gamma 3 (Homo sapiens)
[SEC ID N.º: 24]
FIGURA 7N
SECUENCIA DE CODIFICACIÓN
[SEC ID N.º: 23]
GenBank
X03604 gen gamma-3 de IgG humana IgG G3m (b) Región constante de cadena pesada de EZZ (individual II-4 de TOU) PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
LOCUS
HSIGGC3 2590 bp ADN PR.
2. NOV-1998
DEFINICIÓN
Gen gamma-3 de IgG humana IgG G3m (b) Región constante de cadena pesada de EZZ
(individual II-4 de TOU) .
N.º ACCESO
X03604 M12958
VERSIÓN
X03604.1 GI:33070
PALABRAS CLAVE
Región constante; gamma-inmunoglobulina; cadena pesada de Ig; inmunoglobulina.
ORGANISMO
humano
FUENTE
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 2590)
AUTORES
Huck, S., Fort, P., Crawford, D.H., Lefranc, M.P. and Lefranc, G.
TÍTULO
Sequence of a human immunoglobulin gamma 3 heavy chain constant region gene: comparison with the other human C gamma genes
REVISTA
Nucleic Acids Res. 14 (4) , 1779-1789 (1986)
MEDLINE
REFERENCIA
(bases 4 a 204; 2202 a 2236)
AUTORES
Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.
TÍTULO
Structure of human immunoglobulin gamma genes: implications for evolution of a gene family
REVISTA
Cell 29 (2) .
67. 679 (1982)
MEDLINE
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..2590
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón: 9606”
conflicto
/nota = “falta T en (2) ”.
/cita = (2)
conflicto
80..82
/nota = “CGC es GCG en (2) ”
FIGURA 7O
/cita = (2)
conflicto
/nota = “C es T en (2) ”
/cita = (2)
conflicto
/nota = “T es C en (2) ”.
/cita = (2)
SCD
unión (<215..509, 901..951, 1095..1239, 1283..1327, 1471..1515, 1634..1963, 2061..>2380)
/comienzo_codón = 1
/producto = “C gamma 3”
/nº_proteína = “CAA27268.1”
/db_xref = “GI: 577056”
intrón
510..900
/nota = “intrón I”
intrón
952..1094
/nota = “intrón II”
intrón
1140..1282
/nota = “intrón III”
intrón
1328..1470
/nota = “intrón IV”
intrón
1516..1633
/nota = “intrón V”
intrón
1964..2060
/nota = “intrón VI”
característica_misc
2484..2489
/nota = “pot. señal poliA”
CONTADOR BASE
541 a 925 c 703 g 421 t
ORIGEN
FIGURA 7P
[SEC ID N.º: 56]
VI. REGIÓN C DE LA IG GAMMA-4 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
>sp |P01861| GC4_REGIÓN C DE LA IG GAMMA-4 HUMANA – Homo sapiens (Humano) .
FIGURA 7Q
[SEC ID N.º: 26]
SECUENCIA DE CODIFICACIÓN
[SEC ID N.º: 25]
GenBank
K01316 Ig humana de germline
LOCUS
HUMIGCD2 2028 bp ADN PRI 11-ABR-2001
DEFINICIÓN
Cadena H de Ig humana de germline Región: G-E-A B: Región constante gamma-4, Extremo 3’
N.º ACCESO
K01316
VERSIÓN
K01316.1 GI: 184751
PALABRAS CLAVE
.
FUENTE
humano
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 2028)
AUTORES
Ellison, J., Buxbaum, J. y Hood, L.
TÍTULO
Nucleotide sequence of a human immunoglobulin C gamma 4 gene
REVISTA
DNA 1 (1) , 11-18 (1981)
MEDLINE
REFERENCIA
(bases 475 a 1069; 1180 a 1331, 1432 a 1655)
AUTORES
Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.
TÍTULO
Structure of human immunoglobulin gamma genes: implications for evolution of a gene family
REVISTA
Cell 29 (2) .
67. 679 (1982)
MEDLINE
PUBMED
REFERENCIA
(bases 894 a 1106)
AUTORES
Krawinkel, U. y Rabbitts, T. H.
TÍTULO
Comparison of the hinge-coding segments in human immunoglobulin gamma heavy chain genes and the linkage of the gamma 2 and gamma 4 subclass genes
REVISTA
EMBO J. 1 (4) .
40. 407 (1982)
MEDLINE
PUBMED
REFERENCIA
(bases 1 a 2028)
AUTORES
Ellison, J. y Hood, L.
TÍTULO
Linkage and sequence homology of two human immunoglobulin gamma heavy chain constant region genes
REVISTA
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (6) , 1984-1988 (1982)
MEDLINE
PUBMED
FIGURA 7R
COMENTARIO
(1) informa de que el gen C-gamma-4 humano es homólogo con los genes gamma-1, gamma-2a y gamma-2b de murino (sobre el 75%) . (3) también indica secuencias parciales para los pseudogenes gamma-2, gamma-3 y gamma. (2) muestra las regiones bisagra del gamma-1, gamma-2, gamma-3, y pseudo-gamma.
Esta entrada es parte de una región multigénica (región B) , que incluye los genes gamma-2, gamma-4, épsilon-1 y alfa-2. Véase segmento 1 para más comentarios.
Fuente de información completa:
ADN de hígado fetal humano, biblioteca de T. Maniatis (3) y Lawn et al. (1) , (2) ; clones 24B (1) , lambda-HG4.1 (3) e Ig-gamma-4-2 (2) .
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..2028
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/germline
gen
<1..2028
/gen = “IgH”
/nota = “IGHG4”
intrón
<1..215
/gen = “IgH”
/nota = “gamma-4 intrón J-C”
SCD
unión (<216..509, 900..935, 1054.. 1383, 1481..1803)
/gen = “IgH”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena pesada de inmunoglobulina gamma-4”
/nº_proteína = “AAB59394.1”
/db_xref = “GI: 184759”
exón
216..509
/gen = “IgH”
/nota = “G00-119-340”
intrón
510..899
/gen = “IgH”
exón
900..935
/gen = “IgH”
intrón
536..1053
/gen = “IgH”
exón
1054..1383
/gen = “IgH”
intrón
1384..1480
/gen = “IgH”
exón
1481..1803
/gen = “IgH”
CONTADOR BASE 421 a 709 c 567 g 331 t
ORIGEN
FIGURA 7S
[SEC ID N.º: 57]
VII. REGIÓN C DE LA IG DELTA HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
>sp |P01880| DTC_REGIÓN C DE LA IG DELTA HUMANA – Homo sapiens (Humano)
FIGURA 7T
[SEC ID N.º: 28]
GenBank
K02876 IgD humana de germline… (gi: 184766) PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
LOCUS
HUMIGCD2 300 bp ADN PRI 08-NOV-1994
DEFINICIÓN
Gen de la cadena de IdG humana de germline, región C, región bisagra primera.
N.º ACCESO
K02876
VERSIÓN
K02876.1 GI: 184766
PALABRAS CLAVE
Región C; germline; exón bisagra; cadena pesada de inmunoglobulina; inmunoglobulina delta.
FUENTE
ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) ) .
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 300)
AUTORES
White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.
TÍTULO
Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain
REVISTA
Science 228 (4700) .
73. 737 (1985)
MEDLINE
COMENTARIO
Véase segmento 1
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..300
/organismo= “Homo sapiens”
/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”
/db_xref= “taxón: 9606”
/mapa=“14q32.33”
/tipo_célula= “linfocito”
/germline
intrón
<1..151
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 1
exón
101..202
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “región bisagra-1; G00-120 -084”
/número = 2
intrón
203..>300
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 2
gen
unión (K02875. 1:1..495, 1..300, K02877.1: 1..300,
K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100,
K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)
/gen = “IGHD”
SCD
unión (K02875.1:101..403, 101..202, K02877.1:101..172, K02878.1:101..424, K02879.1:101..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “enlace de membrana”
/comienzo_codón= 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52771.1”
/db_xref = “GI: 495872”
/db_xref = “GDB G00-120 -084”
FIGURA 7U
[SEC ID N.º: 28]
SCD
unión (K02875.1:101..403, 101..202, K02877.1:101..172, K02878.1:101..424, K02879.1:101..424, K02880.1:25..53)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “forma secretada”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52770.1”
/db_xref = “GI: 495871”
/db_xref = “GDB G00-120 -084”
CONTADOR BASE 59 a 133 c 52 g 56 t
ORIGEN sobre 300 bp tras el segmento; 118 bp aguas arriba del sitio Stul.
[SEC ID N.º: 27]
K02877 Ig humana de germline...[gi: 184767] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
LOCUS
HUMIGCH03 300 bp ADN PRI 08-NOV-1994
DEFINICIÓN
Gen de la región C de la cadena de Ig delta-H de germline humana, segunda región bisagra (linfocito LLC) .
N.º ACCESO
K02877
VERSIÓN
K02877.1 GI: 184767
PALABRAS CLAVE
Región C; germline; exón bisagra; cadena pesada de inmunoglobulina; inmunoglobulina delta.
ORGANISMO FUENTE
ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica [LLC]) .
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 300)
AUTORES
White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.
TÍTULO
Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain
REVISTA
Science 228 (4700) .
73. 737 (1985)
MEDLINE
COMENTARIO
Véase segmento 1
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..300
/organismo = “Homo sapiens”
/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/tipo_célula = “linfocito”
/germline
intrón
<1..100
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 2
exón
101..172
/gen = “IGHD”
/nota = “región bisagra-2; G00-120 -084; putativo”
/número = 3
FIGURA 7V
intrón
103..>300
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 3
gen
unión (K02875. 1:1..495, K02876.1: 1..300, 1..300,
K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100,
K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)
/gen = “IGHD”
SCD
unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, 101..172, K02878.1:101..424, K02879.1:101..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “enlace de membrana”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/nº_proteína = “AAA52771.1”
/db_xref = “GI: 495872”
/db_xref = “GDB G00-120 -084”
SCD
unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, 101..172, K02878.1:101..424, K02879.1:101..424, K02880.1:25..53)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “forma secretada”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/nº_proteína = “AAA52770.1”
/db_xref = “GI: 495871”
/db_xref = “GDB G00-120 -084”
CONTADOR BASE 102 a 52 c 70 g 76 t
ORIGEN Sobre 1, 85 kb tras segmento 2.
[SEC ID N.º: 29]
FIGURA 7W
K02878 IgD humana de germline… [gi: 184768] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
LOCUS
HUMIGCH04 500 bp ADN PRI 08-NOV-1994
DEFINICIÓN
Genes de la cadena de IgD de Germline humana, Región C, Dominio C delta-2
N.º ACCESO
K02878
VERSIÓN
K02878.1 GI: 184768
PALABRAS CLAVE
Región C; germline, cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.
FUENTE
ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica [LLC])
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 500)
AUTORES
White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.
TÍTULO
Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain
REVISTA
Science 228 (4700) .
73. 737 (1985)
MEDLINE
COMENTARIO
Véase segmento 1.
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..500
/organismo = “Homo sapiens”
/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/tipo_célula = “linfocito”
/germline
intrón
<1..100
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 3
exón
101..424
/gen = “IGHD”
/nota = “dominio constante delta-2; G00-120 -084”
/número = 4
intrón
425..>500
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 4
intrón
425..>500
/gen = “IGHD”
/nota = “IgD-s intrón D”
gen
unión (K02875. 1:1..495, K02876.1: 1..300,
K02877.1:1..300, 1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100,
K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)
/gen = “IGHD”
SCD
unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, K02877.1:101…172, 101..424, K02879.1:101..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “enlace de membrana”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52771.1”
/db_xref = “GI: 495872”
/db_xref = “GDB G00-120 -084”
FIGURA 7X
SCD
unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, K02877.1:101…172, 101..424, K02879.1:101..424, K02880.1:25..53)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “forma secretada”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/nº_proteína = “AAA52770.1”
/db_xref = “GI: 495871”
/db_xref = “GDB G00-120 -084”
CONTADOR BASE 93 a 171 c 157 g 79 t
ORIGEN sobre 450 bp tras el segmento 3; 131 bp aguas arriba del sitio Accl.
[SEC ID N.º: 30]
K02879 Ig humana de germline...[gi: 184769] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
LOCUS
HUMIGCH05 500 bp ADN PRI 08-NOV-1994
DEFINICIÓN
Gen de la región C de la cadena de Ig delta-H de germline humana, dominio C delta-3 (linfocito LLC) .
N.º ACCESO
K02879
VERSIÓN
K02879.1 GI: 184769
PALABRAS CLAVE
región C; germline, cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.
FUENTE
ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 500)
AUTORES
White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.
TÍTULO
Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain
REVISTA
Science 228 (4700) .
73. 737 (1985)
MEDLINE
COMENTARIO
Véase segmento 1
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..500
/organismo = “Homo sapiens”
/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/tipo_célula = “linfocito”
/germline
intrón
<1..100
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 4
exón
101..424
/gen = “IGHD”
/nota = “dominio C delta-3; G00-120 -084; putativo”
/número = 5
FIGURA 7Y
intrón
425..>500
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 5
gen
unión (K02875. 1:1..495, K02876.1: 1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, 1..500, K02880.1:1..100, K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)
/gen = “IGHD”
SCD
unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, K02877.1:101…172, K02878.1:101..424, 101..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “enlace de membrana”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52771.1”
/db_xref = “GI: 495872”
/db_xref = “GDB G00-120 -084”
SCD
unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, K02877.1:101…172, K02878.1:101..424, 101..424, K02880.1:25..53)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “forma secretada”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52770.1”
/db_xref = “GI: 495871”
/db_xref = “GDB G00-120 -084”
CONTADOR BASE 85 a 188 c 145 g 82 t
ORIGEN sobre 150 bp tras el segmento 4; 118 bp aguas arriba del sitio HindIII.
FIGURA 7Z
[SEC ID N.º: 33]
K01311. IgD humana de germline...[gi: 184716] PubMed, Proteína, Taxonomía, OMIM
LOCUS
HUMIGCB9 106 bp ADN PRI 12-ABR-2001
DEFINICIÓN
Región de la cadena J de IgD delta de germline humana: C-delta CH1
N.º ACCESO
K01311
VERSIÓN
K01311.1 GI: 184716
PALABRAS CLAVE
región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.
FUENTE
humano
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 106)
AUTORES
Rabbitts, T.H., Forster, A. y Milstein, C.P.
TÍTULO
Human immunoglobulin heavy chain genes: evolutionar y comparisons of C mu, C delta, and C gamma genes and associated switch sequences
REVISTA
Nucleic Acids Res. 9 (18) , 4509-4524 (1981)
MEDLINE
PUBMED
COMENTARIO
La secuencia de aminoácidos deducida se compara en (1) para la unión cadena J/C delta-1 de la proteína ER1 humana. El gen delta aparece sólo en 5 kb desde la región mu. Los autores (1) no pudieron detectar ninguna secuencia de conmutación adyacente al gen delta y afirman que esto implica que no tienen lugar una conmutación mu/delta mediante un proceso de conmutación de clase. Especulan que toda la región VH- (C-mu) - (C-delta) se transcribe a una molécula precursora nuclear que se rompe más tarde.
Esto es parte de una región multigénica que contiene la región J, región de conmutación, genes C-mu-secretado, C-mu-membrana y C-delta.
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..106
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/tipo_célula = “linfocito”
/tipo_tejido = “placenta”
/tipo_tejido = “hígado”
/fase_desarrollo = “feto”
/germline /tejido_lib = “lawn et al.”
gen
<1..106
/gen = “IGHD”
intrón
<1..26
/gen = “IGHD”
/nota = “intrón delta J-C; G00-120 -084”
SCD
<27..>106
/gen = “IGHD”
/nota = “región C - dominio CH1”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/nº_proteína = “AAB59423.1”
/db_xref = “GI: 184735”
/traducción = “PTKAPDVFPIISGCRHPKDNSPVVLA”
CONTADOR BASE 24 a 38 c 24 g 20 t
ORIGEN
[SEC ID N.º: 58]
K02880. IgD humana de germline… (gi: 184770) PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
FIGURA 7AA
LOCUS
HUMIGH06 100 bp ADN PRI 08-NOV-1994
DEFINICIÓN
Genes de la cadena de IgD de germline humana, región C, terminal secretado.
N.º ACCESO
K02880
VERSIÓN
K02880.1 GI: 184770
PALABRAS CLAVE
región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.
FUENTE
ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 100)
AUTORES
White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.
TÍTULO
Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain
REVISTA
Science 228 (4700) .
73. 737 (1985)
MEDLINE
COMENTARIO
Véase segmento 1
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..100
/organismo = “Homo sapiens”
/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/tipo_célula = “linfocito”
/germline
intrón
<1..>100
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 5
intrón
<1..24
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 5
exón
25..>53
/gen = “IGHD”
/nota = “dominio terminal secretado; G00-120 -084”
/número = 6
gen
unión (K02875.1:1..495, K02876.1:1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, 1..100, K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)
/gen = “IGHD”
SCD
unión (K02875.1:1..403, K02876.1:1..202, K02877.1:1..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, 25..53)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “forma secretada”
/comienzo_codón= 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52770.1”
/db_xref = “GI: 495871”
/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”
CONTADOR BASE 24 a 33 c 22 g 21 t
ORIGEN Sobre 1, 8 kb tras segmento 5
[SEC ID N.º: 36]
FIGURA 7BB
K02881. IgD humana de Germline…[gi: 184771] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
LOCUS
HUMIGH07 200 bp ADN PRI 08-NOV-1994
DEFINICIÓN
Genes de la cadena de IgD de germline humana, región C, primer dominio de membrana terminal
N.º ACCESO
K02881
VERSIÓN
K02881.1 GI: 184771
PALABRAS CLAVE
región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.
FUENTE
ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 200)
AUTORES
White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.
TÍTULO
Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain
REVISTA
Science 228 (4700) .
73. 737 (1985)
MEDLINE
COMENTARIO
Véase segmento 1
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..200
/organismo = “Homo sapiens”
/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/tipo_célula = “linfocito”
/germline
intrón
<1..24
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 5
exón
25..182
/gen = “IGHD”
/nota = “primer dominio de membrana terminal; G00-120-084, putativo”
/número = 6
intrón
183..>200
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 6
gen
unión (K02875.1:1..495, K02876.1:1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100, 1..200, K02882.1:1..52)
/gen = “IGHD”
SCD
unión (K02875.1:1..403, K02876.1:1..202, K02877.1:1..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, 25..182.1:44..52)
/parcial
/gen = “IGHD”
/Nota = “enlace de membrana”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/nº_proteína = “AAA52771.1”
/db_xref = “GI: 495872”
/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”
CONTADOR BASE 37 a 72 c 49 g 42 t
FIGURA 7 CC
ORIGEN Sobre 800 bp tras segmento 6.
[SEC ID N.º: 38]
K02882. IgD humana de germline…[gi: 184772] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
LOCUS
HUMIGH08 100 bp ADN PRI 08-NOV-1994
DEFINICIÓN
Genes de la cadena de IgD de germline humana, región C, segundo dominio de membrana terminal
N.º ACCESO
K02882
VERSIÓN
K02882.1 GI: 184772
PALABRAS CLAVE
región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.
FUENTE
ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 100)
AUTORES
White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.
TÍTULO
Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain
REVISTA
Science 228 (4700) .
73. 737 (1985)
MEDLINE
COMENTARIO
Véase segmento 1
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..100
/organismo = “Homo sapiens”
/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/tipo_célula = “linfocito”
/germline
intrón
<1..43
/gen = “IGHD”
/nota = “IgD-Mb”
/número = 6
exón
44..>52
/gen = “IGHD”
/nota = “enlace de membrana (segundo dominio de membrana terminal) ; G00-120-084, putativo”
/número = 7
gen
unión (K02875.1:1..495, K02876.1:1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100, 1..200, K02881.1:1..52)
/gen = “IGHD”
SCD
unión (K02875.1:1..403, K02876.1:1..202, K02877.1:1..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, K02881.1:25..182.1:44..52)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “enlace de membrana”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52771.1”
/db_xref = “GI: 495872”
/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”
FIGURA 7DD
CONTADOR BASE 22 a 30 c 30 g 18 t
ORIGEN Sobre 1, 3 kb tras segmento 7.
[SEC ID N.º: 40]
K02875. IgD humana de germline…[gi: 184765] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut
LOCUS
HUMIGCH01 495 bp ADN PRI 08-NOV-1994
DEFINICIÓN
Genes de la cadena de IgD de germline humana, región C, dominio C delta-1
N.º ACCESO
K02875
VERSIÓN
K02875.1 GI: 184765
PALABRAS CLAVE
región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.
FUENTE
ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 495)
AUTORES
White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.
TÍTULO
Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain
REVISTA
Science 228 (4700) .
73. 737 (1985)
MEDLINE
COMENTARIO
La secuencia en formato legible por ordenador y el borrador de entrada (1) fueron gentilmente cedidos por M. B. Blanco, 06-AGO-1985.
Los extremos de los exones C-delta y delta-s se localizaron comparando las secuencias traducidas con las secuencias conocidas AA (1) .
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..495
/organismo = “Homo sapiens”
/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
/tipo_célula = “linfocito”
/germline
gen
unión (1..495, K02876.1:1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100, 1..200, K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)
/gen = “IGHD”
intrón
<1..100
/gen = “IGHD”
/nota = “intrón J-C; G00-120 -084”
SCD
unión (101..403, K02876.1:1..202, K02877.1:101..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, K02880.1:25..53)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “forma secretada”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52770.1”
/db_xref = “GI: 495871”
/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”
exón
101..403
/gen = “IGHD”
/nota = “dominio constante delta-1; G00-120 -084; putativo”
FIGURA 7EE
/número = 1
SCD
unión (101..403, K02876.1:1..202, K02877.1:101..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)
/parcial
/gen = “IGHD”
/nota = “enlace de membrana”
/comienzo_codón = 3
/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”
/n.º_proteína = “AAA52771.1”
/db_xref = “GI: 495872”
/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”
intrón
404..>495
/gen = “IGHD”
/nota = “G00-120-084”
/número = 1
CONTADOR BASE 114 a 179 c 120 g 82 t
ORIGEN 182 bp aguas arriba del sitio SphI; cromosoma 14p32.3.
[SEC ID N.º: 42]
VIII. REGIÓN C DE CADENA DE LA IG ÉPSILON HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
>sp |P01880| DTC_REGIÓN C DE CADENA DE LA IG ÉPSILON HUMANA – Homo sapiens (Humano)
FIGURA 7FF
[SEC ID N.º: 49]
SECUENCIA DE CODIFICACIÓN
[SEC ID N.º: 44]
GenBank
L00022 Ig humana activa
LOCUS
HUMIGHAE2 1920 bp ADN PR.
2. DIC-1994
DEFINICIÓN
Genes de la cadena pesada épsilon-1 de Ig activa humana, región constante
N.º ACCESO
L00022 J00227 V00555
VERSIÓN
L00022.1 GI: 185035
PALABRAS CLAVE
región C; inmunoglobulina épsilon; cadena pesada de inmunoglobulina; gen procesado.
FUENTE
Línea celular de mieloma humano 266B1 ADN y cADN a mARN, clones H-Ig-épsilon-11, lambda-épsilon-1.2, pJJ71, pGET2 y K85/A12 (véase comentario) .
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 1920)
AUTORES
Flanagan, J.G. y Rabbitts, T.H.
TÍTULO
The sequence of a human immunoglobulin epsilon heavy chain constant region gene, and evidence for three non-allelic genes
REVISTA
EMBO J. 1 (5) .
65. 660 (1982)
FIGURA 7GG
MEDLINE
REFERENCIA
(bases 528 a 736; 1044 a 1138)
AUTORES
Nishida, Y., Miki, T., Hisajima, H. y Honjo, T.
TÍTULO
Cloning of human immunoglobulin epsilon chain genes: evidence for multiple C epsilon genes
REVISTA
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (12) , 3833-3837 (1982)
MEDLINE
REFERENCIA
(bases 1 a 1920)
AUTORES
Kenten, J.H., Molgaard, H.V., Houghton, M., Derbyshire, R.B., Viney, J., Bell, L.O. y Gould, H.J.
TÍTULO
Cloning and sequence determination of the gene for the human immunoglobulin epsilon chain expressed in a myeloma cell line
REVISTA
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (21) , 6661-6665 (1982)
MEDLINE
REFERENCIA
(bases 98 a 1884)
AUTORES
Seno, M., Kurokava, T., Ono, Y., Onda, H., Sasada, R., Igarashi, K., Kikuchi, M., Sugino, Y., Nishida, Y. y Honjo, T.
TÍTULO
Molecular cloning and nucleotide sequencing of human immunoglobulin epsilon chain cDNA
REVISTA
Nucleic Acids Res. 11 (3) .
71. 726 (1983)
MEDLINE
REFERENCIA
(bases 691 a 807; 1571 a 1818; 1860 a 1885)
AUTORES
Liu, F. T., Albrandt, K. A., Br y , C. G. y Ishizaka, T.
TÍTULO
Expression of a biologically active fragment of human IgE epsilon chain in Escherichia coli
REVISTA
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81 (17) , 5369-5373 (1984)
MEDLINE
COMENTARIO
(2) y (1) indican el aislamiento de otros dos genes épsilon, épsilon-2 y épsilon-3. Los autores (2) reivindican que épsilon-3 es un pseudogén. Max, et al. (Cell 29.
69. 699 (1982) ) lo comparan en (4) con la secuencia de la región C y encuentran 3 diferencias con respecto a los nucleótidos. La secuencia de aminoácidos que se deduce en (4) difiere en cierta medida con la secuencia de la región C publicada. (5) expresión producida de la IgE en E. coli mediante la inserción dentro del vector de expresión pUC7.
Fuente de información completa:
Línea celular de mieloma humano 266B1 ADN (2) , (1) , (5) y cADN a mARN (3) , (4) , clones H-Ig-épsilon-11 (2) , lambda-épsilon-1.2 (1) , pJJ71 (3) , pGET2 (4) y K85/A12 (5) .
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..1920
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón: 9606”
/mapa = “14q32.33”
prim_transcripc.
<1..1886
/nota = “épsilon-1 mRNA”
intrón
<1..97
/gen = “IGHE”
/nota = “épsilon-1 intrón J-C”
exón
98..406
/gen = “IGHE”
/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio CH1) ; G00-119 -335”
intrón
407..613
/gen = “IGHE”
/nota = “épsilon-1 intrón A”
exón
614..934
/gen = “IGHE”
/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio CH2) ”
conflicto
/gen = “IGHE”
/cita = (3)
/sustituir = “ “
intrón
935-1020
/gen = “IGHE”
/nota = “épsilon-1 intrón B”
exón
1021..1344
FIGURA 7HH
/gen = “IGHE”
/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio CH3) ”
conflicto
/gen = “IGHE”
/cita = (3)
/sustituir = “ “
conflicto
/gen = “IGHE”
/cita = (3)
/sustituir = “ “
intrón
1345..1427
/gen = “IGHE”
/nota = “épsilon-1 intrón C”
exón
1428..>1759
/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio CH4) ”
conflicto
1444..1445
/gen = “IGHE”
/cita = (3)
/sustituir = “ “
conflicto
/gen = “IGHE”
/cita = (3)
/sustituir = “ “
conflicto
/cita = (3)
/sustituir = “ “
gen
unión (L00021.1:57..495, 1..1758)
/gen = “IGHE”
SCD
unión (L00021.1:57..495, 98..406, 614..934, 1021..1344, 1428..1759)
/parcial
/gen = “IGHE”
/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio V-D-J) ”
/comienzo_codón = 1
/n.º_proteína = “AAB59424.1”
/db_xref = “GI: 386807”
/db_xref = “GDB G00-119 -335”
[SEC ID N.º: 60]
CONTADOR BASE 387 a 658 c 576 g 299 t
ORIGEN tras unos 3 kb; 1 bp aguas arriba del sitio BamHI.
FIGURA 7II
[SEC ID N.º: 59]
IX. REGIÓN C DE CADENA DE LA IG MU HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)
SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
>sp |P01871| MUC_REGIÓN C DE CADENA DE LA IG MU HUMANA – Homo sapiens (Humano)
[SEC ID N.º: 47]
SECUENCIA DE CODIFICACIÓN
FIGURA 7JJ
[SEC ID N.º: 46]
GenBank
X17115. mARN humano de IgH
LOCUS
HSIGM201 2213 bp mARN PRI 03-ABR-1995
DEFINICIÓN
Secuencia completa de mARN de cadena pesada de IgM humana
N.º ACCESO
X17115
VERSIÓN
X17115.1 GI: 33450
PALABRAS CLAVE
cadena pesada de Ig; gen de IgM; cadena pesada de IgM; proteína transmembrana.
FUENTE
humano
ORGANISMO
Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;
Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.
REFERENCIA
(bases 1 a 2213)
AUTORES
Friendlander, R. M.
TÍTULO
Direct Submission
REVISTA
Submitted (03-NOV-1989) Friedlander R. M., Harvard Medical School, Howard Hughes Medical Institute, Department of Genetics, 25
Shattuck St, Boston, MA 02115, USA
REFERENCIA
(bases 1 a 2213)
AUTORES
Friedlander, R. M., Nussenzweig, M. C. y Leder, P.
TÍTULO
Complete nucleotide sequence of the membrane form of the human IgM heavy chain
REVISTA
Nucleic Acids Res. 18 (14) , 4278 (1990)
MEDLINE
REFERENCIA
(bases 1 a 2213)
AUTORES
Kristensen, T., Loper, R. y Pr y dz, H.
TÍTULO
An estimate of the sequencing error frequency in the DNA sequence databases
REVISTA
DNA Seq. 2 (6) .
34. 346 (1992)
MEDLINE
OBSERVACIÓN
Errata: I (fe de erratas publicada en DNA Seq 1993 ; 3 (5) : 337) )
COMENTARIO
Para la secuencia genómica véase <K01306>, <X14939> y <X14940>. El autor menciona varios conflictos con estas secuencias. Datos revisados amablemente (30-MAY-1990) por Friedlander R. M.
CARACTERÍSTICAS
Situación/Calificadores
fuente
1..2213
/organismo = “Homo sapiens”
/db_xref = “taxón: 9606”
FIGURA 7KK
/clon = “201-203”
/línea_celular = “linfoma 201”
/tipo_célula = “B”
/tipo_tejido = “linfoide”
característica_misc
1..39
/nota = “secuencia del VECTOR putativo Bluescript SKP+”
/cita = (3)
SCD
73..1956
/nota = “precursor (AA -15 a 612) ”
/comienzo_codón = 1
/nº_proteína = “CAA34971.1”
/db_xref = “GI: 33451”
/db_xref = “SWISS-PROT: P01871”
/db_xref = “SWISS-PROT: P20769”
[SEC ID N.º: 52]
péptidos_señal
73..117
péptidos_mat
118..1953
/producto = “cadena pesada de IgM (AA 1 a 612) .
sitio_poliA
/nota = “sitio_poliA”
CONTADOR BASE 462 a 708 c 629 g 414 t
ORIGEN
FIGURA 7LL
[SEC ID N.º: 61]
FIGURA 8A
FIGURA 8A (Cont.)
FIGURA 8A (Cont.)
FIGURA 8A (Cont.)
FIGURA 8A (Cont.)
[SEC ID N.º: 9]
[SEC ID N.º: 10]
FIGURA 8B
PÉPTIDO SEÑAL DE LEGÚMINA DE ALUBIA
[SEC ID N.º: 11]
FIGURA 8C
NUCLEÓTIDOS Y SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS DE PROTEÍNA
REGIÓN DE CODIFICACIÓN DE pSHuJ
FIGURA 8D
NUCLEÓTIDOS Y SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS DE PROTEÍNA
REGIÓN DE CODIFICACIÓN DE pSHuSC
FIGURA 8D (Cont.)
[SEC ID N.º: 12]
FIGURA 8E
pBMSP-1
FIGURA 8E (Cont.)
[SEC ID N.º: 13]
FIGURA 8E (Cont.)
FIGURA 8F
pBMSP-lspJSC
FIGURA 8F (Cont.)
FIGURA 8F (Cont.)
FIGURA 8F (Cont.)
FIGURA 8F (Cont.)
FIGURA 8F (Cont.)
[SEC ID N.º: 14]
FIGURA 9
LISTA DE SECUENCIAS
<110> PLANET BIOTECHNOLOGY, INCORPORATED
Larrick, James William
Wycoff, Keith Lynn
<120> NOVEL IMMUNOADHESION FOR THE PREVENTION OF RHINOVIRUS INFECTION
<130> 030905.0003.WO
<140> Pendiente de asignación <141> 2001-04-27
<150> 60/200, 298
<151> 2000-04-27
<160> 8
<170> FastSEO para Windows versión 4.0
<210> 1
<211> 1596
<212> ADN
<213> Homo Sapiens
<220>
<221> CDS
<222> (1) … (1596)
<223> ICAM-1
FIGURA 9 (Cont.)
FIGURA 9 (Cont.)
[La secuencia de ADN tiene el SEC ID N.º: 1]
[La secuencia de proteína tiene el SEC ID N.º: 2]
FIGURA 9 (Cont.)
FIGURA 9 (Cont.)
[SEC ID N.º: 2]
<210>
<211>
<212>
ADN
<213>
Homo sapiens
<400>
FIGURA 9 (Cont.)
[SEC ID N.º: 3]
<210>
<211>
<212>
PRT
<213>
Homo sapiens
<400>
Ser Glu Lys Asp Glu Leu 1 5
[SEC ID N.º: 4]
<210>
<211>
<212>
PRT
<213>
Homo sapiens
<400>
Arg Ser Glu Lys Asp Glu Leu 1 5
[SEC ID N.º: 5]
<210>
<211>
<212>
ADN
<213>
Homo sapiens
<400>
[SEC ID N.º: 6]
<210>
<211>
<212>
ADN
<213>
Homo sapiens
<400>
[SEC ID N.º: 7]
FIGURA 9 (Cont.)
<210>
<211>
<212>
PRT
<213>
Homo sapiens
<220>
<221>
SCD
<222>
(1) … (448)
<223>
Dominios extracelulares de ICAM-1
<220>
<221>
SCD
<222>
(453) … (799)
<223>
IgA2m (2) humana
<400>
FIGURA 9 (Cont.)
[SEC ID N.º: 8]
Figura 10:
FIGURA 10 (cont.)
FIGURA 10 (cont.)
FIGURA 10 (cont.)
Figura 11. pGPTV-kan-ocs-ATR-IgA2:
FIGURA 11 (cont.)
FIGURA 11 (cont.)
FIGURA 11 (cont.)
FIGURA 11 (cont.)
FIGURA 11 (cont.)
FIGURA 11 (cont.)
FIGURA 11 (cont.)
Figura 12. pGPTV-hpt-ocs-35SJ/SC
FIGURA 12 (cont.)
FIGURA 12 (cont.)
FIGURA 12 (cont.)
FIGURA 12 (cont.)
FIGURA 12 (cont.)
FIGURA 12 (cont.)
FIGURA 12 (cont.)
FIGURA 12 (cont.)
Figura 13
Figura 14
Figura 15
Figura 16
Minutos
Figura 17
concentración proteica [µg/ml]
Figura 18
Figura 19
No reducida Reducida M
Figura 20
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