Proteínas quiméricas del receptor de toxina mejoradas y proteínas quiméricas del receptor de toxina para el tratamiento y la prevención de anthrax.

Una proteína quimérica de receptor de toxina formada por:

un complejo inmunoglobulínico,

que a su vez está compuesto por al menos un fragmento de cadena pesada de la inmunoglobulina G (IgG) y

una proteína de morfogenia capilar 2 (CMG2) de la proteína de receptor de la toxina del carbunco, a la que le faltan los residuos de aminoácidos de SEC ID N.º: 102, unidos por enlaces covalentes con la cadena pesada de la IgG, o un fragmento de la misma.

Proteínas quiméricas del receptor de toxina mejoradas y proteínas quiméricas del receptor de toxina para el tratamiento y la prevención de anthrax

La presente invención se refiere a proteínas quiméricas del receptor de toxina, las inmunoadhesinas, su producción a partir de plantas, y su uso en el tratamiento y la prevención de la toxicidad y las enfermedades causadas por agentes patógenos. 10

Los receptores solubles y las proteínas de unión, que actúan como señuelo para toxinas y agentes patógenos y que mitigan la infección y la patogénesis, abren las puertas a la esperanza en el tratamiento y la prevención de la toxicidad y de enfermedades causadas por agentes patógenos.

Un ejemplo de una condición tratable con un receptor señuelo es la infección por carbunco. Se han identificado dos receptores de membrana del PA (antígeno protector, un componente tóxico del carbunco) : el marcador endotelial 15 tumoral 8 (TEM8) y la proteína de morfogenia capilar 2 (CMG2) (30, 31) . Se ha mostrado que las formas solubles de dominios extracelulares de ambas proteínas inhiben la intoxicación de células con receptores endógenos de toxina. La forma soluble de TEM8 inhibió la acción de la toxina letal en un 50% a 80 nM (IC50 = 80 nM) (Bradley, K. A., Mogridge, J., Mourez, M, Collier, R. J. & Young, J. A. Identification of the cellular receptor for anthrax toxin. Nature 414, 225-9 (2001) ) . La proteína CMG2 mostró una afinidad con el PA de 170 pM, y un IC50 en el ensayo de 20 protección macrófaga de 3, 1 nM (67 ng/ml) , convirtiéndose así en un potente inhibidor potencial de la acción de la toxina del carbunco (Scobie, H. M., Rainey, G. J., Bradley, K. A. & Young, J. A. Human capillar y morphogenesis protein 2 functions as an anthrax toxin receptor. Proc Natl Acad Sci USA 100, 5170-4 (2003) ; Wigelsworth, D. J., Krantz, B. A., Christensen, K. A., Lacy, D. B., Juris, S. J. & Collier, R. J. Binding stoichiometr y and kinetics of the interaction of a human anthrax toxin receptor, CMG2, with protective antigen. J Biol Chem 279, 23349-56 (2004) ) . En 25 ensayos de cultivo celular, las formas solubles de CMG2 de dominios extracelulares neutralizaron el 50% de la actividad de la toxina letal en una proporción molar de 3:1 con el PA (Scobie et al. Proc Natl Acad Sci USA 100, 5170-4 (2003) ) . Sin embargo, la alta concentración de bacilos en sangre durante una infección activa sugiere que la concentración del PA puede ser bastante alta, y que se necesita una dosis alta de antitoxina para dar protección.

WO 03/064992 (PLANET) describe un complejo inmunoglobulínico quimérico de receptor de la toxina del carbunco 30 que comprende una porción de cadena pesada de inmunoglobulina y una porción de cadena ligera de inmunoglobulina.

Para minimizar la cantidad de proteína de receptor señuelo necesaria para asegurar la eficacia, sería conveniente incrementar la actividad específica o la potencia del receptor señuelo aún más. Por lo tanto, siguen siendo necesarios potentes señuelos con mayor actividad y mayor farmacocinética. 35

El receptor señuelo descrito en el presente documento tiene varios inconvenientes, como son laboriosas técnicas de producción y costes altos asociados a los métodos de producción. Además, estos receptores señuelo tienen una estabilidad limitada como multímeros en condiciones ambientales adversas en las que la molécula puede incluso inactivar los patógenos. Así pues, es necesario desarrollar tecnologías de señuelo con una mayor estabilidad para mejorar el rendimiento y que se pueda producir en volúmenes comercialmente viables a un coste razonable. 40

La invención aporta una proteína quimérica de receptor tal y como se indica en cualquiera de las peticiones de 1 a 9.

En realizaciones preferidas, las proteínas quiméricas de receptor de toxina se expresan en plantas, incluyendo plantas monocotiledóneas y dicotiledóneas como parte del genoma de las plantas. El tabaco es una de las plantas preferidas para ello. La expresión en plantas, en contraposición a la expresión en células de mamífero cultivadas, favorece una importante reducción del coste de producción de las proteínas quiméricas de receptor de toxina. 45

En una realización preferida, todas las proteínas utilizadas para crear la toxina quimérica son proteínas de receptor expresadas en células heterólogas obtenidas a partir de plantas, vertebrados o invertebrados, como células de mamíferos, células del folículo piloso o células de tejidos vegetales cultivados.

En este documento se describen inmunoadhesinas que contienen receptores quiméricos de toxina. En algunas realizaciones, la inmunoadhesina es un multímero que contiene al menos dos proteínas quiméricas de receptor de 50 toxina. En otras realizaciones, la inmunoadhesina incluye una proteína de receptor de toxina asociada a la cadena J. En otra realización, la composición de la inmunoadhesina unida a la cadena J se asocia a un componente secretor.

En una realización, la presente invención contempla una proteína quimérica de receptor de toxina que tiene una glicosilación específica de planta. Un gen que codifica un polipéptido que contiene en su secuencia de aminoácidos la señal de glicosilación asparagina-X-serina/treonina, en la que X puede ser cualquier resto de aminoácido, se 55 glicosila mediante oligosacáridos unidos al residuo asparagina de la secuencia cuando se expresa en una célula de planta. Ver Marshall, Ann. Rev Biochem., 41:673 (1972) y Marshall, Biochem. Soc. Symp., 40:17 (1974) para una revisión general de la secuencia de polipéptidos que funcionan como señales de glicosilación. Estas señales son reconocidas por células tanto de mamífero como de planta. Al final de su maduración, las proteínas expresadas en plantas o en células vegetales tienen un modelo de glicosilación diferente al de las proteínas expresadas en otros 60

tipos de células entre las que se incluyen células de mamíferos e insectos. Estudios detallados que caracterizan la 5 glicosilación específica de plantas y su comparación con la glicosilación en otros tipos celulares se han realizado, por ejemplo, en los estudios descritos por Cabanes-Macheteau et al., Glicobiología 9 (4) :365-372 (1999) , y por Altmann, Glicoconjugación J. 14:643-646 (1997) . Estos y otros grupos han demostrado que la glicosilación específica de plantas genera glicanos que tienen xilosa unida por enlaces ß (1, 2) a la manosa, pero la xilosa no está unida por enlaces ß (1, 2) a la manosa como resultado de la glicosilación en células de mamífero e insecto. La 10 glicosilación específica de plantas da como resultado una fucosa unida por enlaces α (1, 3) al GlcNAc proximal, mientras que la glicosilación en células de mamífero da como resultado una fucosa unida por enlaces α (1, 6) al GlcNAc proximal. Adicionalmente, la glicosilación específica de plantas no da como resultado la adición de un ácido siálico al extremo de la proteína de glicano, mientras que en la glicosilación en células de mamífero se añade ácido siálico. 15

En otra realización, las composiciones anteriores son además asociadas con material de planta. El material de planta presente puede ser paredes celulares vegetales, orgánulos vegetales, citoplasmas vegetales, células vegetales intactas, semillas vegetales, plantas viables y similares. Los materiales vegetales o macromoléculas vegetales particulares que pueden estar presentes incluyen ribulosa bisfosfato carboxilasa, complejo ligero de cultivo, pigmentos, metabolitos secundarios o clorofila y sus fragmentos. Las composiciones de la presente 20 invención pueden tener una concentración de proteína quimérica de receptor de toxina de entre 0, 001% y 99, 9% en masa, excluyendo el agua. En otras realizaciones, la proteína quimérica de receptor de toxina está presente en concentraciones de entre 0, 01% y 99% en masa, excluyendo el agua. En otras realizaciones, las composiciones de la presente invención tienen material de planta o macromoléculas vegetales presentes a una concentración de 0, 01% a 99% en masa, excluyendo el agua. 25

En otra realización, la invención proporciona métodos para reducir el potencial de unión con un antígeno patógeno tal como se establece en la reivindicación 12. La invención contempla un receptor quimérico de toxina definido para su uso como medicamento en pacientes o animales.

La invención incluye además una proteína quimérica de receptor de toxina para su uso anteriormente indicado en la prevención o el tratamiento de la infección por carbunco, o los efectos de la toxina del carbunco. 30

En otro aspecto, la invención aporta compuestos farmacéuticos que incluyen las proteínas quiméricas de... [Seguir leyendo]

Una proteína quimérica de receptor de toxina formada por:

un complejo inmunoglobulínico, que a su vez está compuesto por al menos un fragmento de cadena pesada de la inmunoglobulina G (IgG) y

una proteína de morfogenia capilar 2 (CMG2) de la proteína de receptor de la toxina del carbunco, a la que le faltan los residuos de aminoácidos de SEC ID N.º: 102, unidos por enlaces covalentes con la cadena pesada de la IgG, o 10 un fragmento de la misma.

Una proteína quimérica de receptor de toxina, como indicado en la reivindicación 1, en forma de dímero con otro receptor quimérico de toxina de la reivindicación 1.

Una proteína quimérica de receptor de proteína, de las reivindicaciones 1 o 2, cuyo complejo inmunoglobulínico está formado, además, por un fragmento de una cadena ligera de inmunoglobulina, 15 preferiblemente una cadena kappa o lambda.

Una proteína quimérica de receptor de toxina, de las reivindicaciones 1 a 3, cuya cadena pesada de IgG, o un fragmento de la misma, y a cuya CMG2 de la proteína de receptor de la toxina del carbunco le faltan los residuos de aminoácidos de SEC ID N.º: 102, que están unidos por enlace covalente por medio de la unión (Gly3Ser) 3.

Una proteína quimérica de receptor de proteína, descrita en las reivindicaciones anteriores, cuyo dominio 20 Cγ1 de la cadena pesada de IgG se omite.

Una proteína quimérica de receptor de toxina, de las reivindicaciones 1 a 3, en donde el enlace covalente entre la CMG2 de la proteína de receptor de la toxina del carbunco y la cadena pesada de IgG es la bisagra de inmunoglobulina.

Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones anteriores, cuyo fragmento de 25 la cadena pesada de IgG solo contiene las regiones constantes 2 y 3 de la cadena pesada.

Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones anteriores, donde la cadena pesada de IgG y la proteína del receptor de la toxina del carbunco son proteínas humanas.

Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones anteriores, donde la proteína quimérica CMG-IgG tiene una secuencia de aminoácidos de SEC ID N.º: 114 30

Una composición formada por una CMG2 de una proteína quimérica de receptor de toxina, de cualquiera de la reivindicaciones de 1 a 9, y por material de planta.

Una composición, como la descrita en la reivindicación 10, cuyo material de planta sea seleccionado dentro del siguiente grupo: paredes de células de planta, orgánulos de plantas, citoplasma de plantas, células de planta intactas, semillas de plantas y plantas viables. 35

Un método para reducir la unión de un antígeno de carbunco a una célula hospedadora in vitro. El método consiste en: poner en contacto al antígeno de carbunco con la proteína quimérica de receptor de toxina de cualquiera de las reivindicaciones de 1 a 9, donde la proteína quimérica de receptor de toxina se une al antígeno de carbunco y se reduce la unión del antígeno de carbunco con la célula hospedadora.

Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones de 1 a 9, para utilizar como 40 medicamento sobre pacientes o animales.

Una proteína quimérica de receptor de toxina, descrita en las reivindicaciones de 1 a 9, para utilizar en la prevención o en el tratamiento contra la infección por carbunco, o contra los efectos de la toxina del carbunco.

Un vector de expresión que codifica para la CMG2 de la proteína quimérica de receptor de toxina, según se describe en las reivindicaciones de 1 a 9. 45

Un método de producción de una proteína quimérica de receptor de toxina, de cualquiera de las reivindicaciones de 1 a 9, que esté formado por la introducción de un vector de expresión de la reivindicación 15 en una célula hospedadora; y la expresión del complejo inmunoglobulínico y de la CMG2 de la proteína del receptor de la toxina del carbunco para formar una proteína quimérica de receptor de toxina.

Un método, indicado en la reivindicación 16, donde el hospedador es una planta. 50

Una composición farmacéutica formada por una proteína quimérica de receptor de toxina, descrito en las reivindicaciones de 1 a 9, y un vehículo farmacéuticamente válido.

[SEC ID N.º: 8]

FIGURA 2B

FIGURA 3

Expresión de ICAM-1-SIgA en callos de tabaco transformados individualmente. Inmunoblots de geles de SDS-PAGE no reductora, cuyas muestras, que contienen diferentes callos de tabaco transformados (C) y extractos acuosos (Aq) , migran y prueban la presencia de ICAM humana (A) . Los marcadores de PM están indicados, y el patrón de referencia (R) fue una mezcla (~75 ng de cada) de ICAM humana (~75 kD) y SIgA humana (>>250 kD) . La solubilidad del planticuerpo nos asegura que la extracción se podría realizar fácilmente y la similitud de las señales nos lleva a creer en la reproducibilidad de la expresión. B. Inmunoblots de geles de SDS-PAGE no reductora que contienen varias fracciones del planticuerpo parcialmente purificado a partir de callos Rhi107-11. J = jugo, G = fracción G-100, SG = fracción G-100 esterilizada por filtración (el que se utiliza en ensayo ECP) y RS = una mezcla de patrones de referencia de SIgA humana (75 ng) y de ICAM-1 humana (75 ng) . Las transferencias se sondearon con anticuerpos frente a la ICAM humana (~ICAM) , la cadena pesada de la IgA humana (~α) , el componente secretor humano (~SC) y la cadena J humana (~J) . En segundo lugar, se usaron anticuerpos conjugados con enzimas según necesidad para etiquetar las bandas inmunopositivas con fosfatasa alcalina. La especificidad del inmunoblotting se comprueba por un fallo en la detección de bandas inmunopositivas en extractos de callos no expresables (no se muestra) . El PM esperado para una ICAM-1 dimerizada, sin glicosilación, es de 173.318; es probable que esta forma esté presente en la banda que migra justo por debajo de los marcadores de 250 kD, pues es inmunopositiva para el ICAM-1 y la cadena pesada. Esta banda también es inmunopositiva para el SC (PM total esperado de ~248 kD) pero no para la cadena J, algo inesperado, en cierto modo, teniendo en cuenta la vía canónica para la asociación de la SIgA, lo que implica dos tipos celulares (para mamíferos) y necesita de la presencia de cadena J antes de asociarse al SC. Una inmunoadhesina tetramérica, que contenga una sola molécula de cadena J y una sola molécula de SC, tiene un PM esperado de ~440 kD, previo a la glicosilación. Hay evidencias de varias especies con pesos moleculares muy por encima de los 200 kD, que son inmunopositivas según el método de las cuatro puntas.

FIGURA 4

FIGURA 7A

I. REGIÓN C-α-1 DE LA IG HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

>sp | P01376 | REGIÓN C CADENA ALFA-1 IG HUMANA ALC1 – Homo sapiens (Humano) .

[SEC ID N.º: 16]

SECUENCIA DE CODIFICACIÓN

[SEC ID N.º: 15]

GenBank

J00220

LOCUS HUMIGCC8 2533 bp ADN PRI 02-DIC-1998

DEFINICIÓN Región constante de la cadena pesada alfa-1 de la inmunoglobulina de homo sapiens (gen IGHA1) , SCD parcial.

N.º ACCESO J00220

VERSIÓN J00220.1 GI: 184743

PALABRAS CLAVE -

FUENTE humano ORGANISMO Homo sapiens FIGURA 7B

Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 2533)

AUTORES

Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.

TÍTULO

Structure of human immonoglobulin gamma genes: Implications for evolution of a gene family

REVISTA

Cell 29.

67. 679 (1982)

MEDLINE

COMENTARIO

Esta secuencia forma parte de una región multigénica que contiene los genes de la cadena pesada de inmunoglobulina gamma-3, gamma-1, pseudo-épsilon y alfa-1.

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..2533

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón: 9606”

/cromosoma = “14”

/mapa = “14q32.33”

/clon = “cosmid Ig13; Ig-gamma3-122”

/tipo_tejido = “placenta; hígado”

/germline

intrón

<1..141

/nota = “alfa-1 intrón J-C”

exón

142..447

/gen = “IGHA1”

gen

<142..>1638

/gen = “IGHA1”

SCD

unión a (<142..447, 662..1021, 1244..1638)

/gen = “IGHA1”

/comienzo_codón = 3

/producto = “región constante de la cadena pesada de la inmunoglobulina alfa-1”

/n_proteína = “AAC82528.1”

/db_xref = “GI = 184749”

intrón

448..661

/gen = “IGHA1”

/nota = “A”

axón

662..1021

/gen = “IGHA1”

intrón

1022..1243

/gen = “IGHA1”

/nota = “B”

exón

1244..>1638

/gen = “IGHA1”

CONTADOR BASE

490 a 866 c 753 g 424 t

ORIGEN

FIGURA 7C

[SEC ID N.º: 52]

II. REGIÓN C DE CADENA DE LA IG ALFA-2 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

>sp | P01877 | ALC2_REGIÓN C DE CADENA DE LA IG ALFA-2 HUMANA - Homo sapiens (Humano)

FIGURA 7D

[SEC ID N.º: 18]

SECUENCIA DE CODIFICACIÓN

[SEC ID N.º: 17]

GenBank

J700221

Ig humana de germline

LOCUS

HUMIGCD7 2516 bp ADN PRI 11-ABR-2001

DEFINICIÓN

Cadena H de Ig humana de germline Región: G E A B: alfa-2 A2m (l) Región constante de alelo extremo 3’.

N.º ACCESO

J00221

VERSIÓN

J00221.1 GI:184756

PALABRAS CLAVE

-

ORGANISMO

humano

FUENTE

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 2516)

AUTORES

Ellison.J. y Hood. L.

TÍTULO

Linkage and sequence homology of two human immunoglobulin gamma heavy chain constant region genes

REVISTA

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (6) , 1984-1988 (1982)

MEDLINE

PUBMED

REFERENCIA

(bases 737 a 1016)

AUTORES

Flanagan.J.G. y Rabbitts.T.H.

TÍTULO

Arrangement of human immunoglobulin heavy chain constant regiongenes implies evolutionar y duplication of a segment containing gamma, epsilon and alpha genes

REVISTA

Nature 300 (5894) .

70. 713 (1982)

MEDLINE

PUBMED

REFERENCIA

(bases 49 a 229; 425 a 514)

AUTORES

Hisajima, H., Nishida, Y., Nakai, S., Takahashi, N., Ueda, S. and

Honjo, T.

TÍTULO

Structure of the human immunoglobulin C epsilon 2 gene, a truncated pseudogene: implications for itsevolutionar y origin

REVISTA

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.80 (10) , 2995-2999 (1983)

MEDLINE

FIGURA 7E

PUBMED

REFERENCIA

(bases 1 a 2516)

AUTORES

Flanagan, J.G., Lefranc, M.P. y Rabbitts, T.H.

TÍTULO

Mechanisms of divergence and convergence of the human

immunoglobulin alpha 1 and alpha 2 constant region gene sequences

REVISTA

Cell 36 (3) .

66. 688 (1984)

MEDLINE

PUBMED

COMENTARIO

(3) también informa sobre el gen alfa-1 completo y parte del alelo alfa-2 A2m (2) (base.

73. 2516; véase Tabla de sitios) . La comparación de las tres secuencias sugiere que el alelo alfa-2 A2m (1) podría ser un híbrido del gen alfa-1 y del alelo alfa-2 A2m (2) . La región bisagra de los genes alfa está al principio del dominio CH2. La región bisagra alfa-1 tiene 13 aminoácidos más que la de alfa-2. Ambas regiones bisagra están formadas por repeticiones en tándem de una secuencia aproximada de 15 bps. La primera repetición se produce en el extremo 5’ del mARN del sitio de unión, y no es codificante. Los autores (3) sugieren que esta estructura repetitiva proporciona un mecanismo posible para el gran número de variaciones observadas en las regiones bisagra. Hay una inserción de 30 bp acopladas, deleción de 2 bp en alfa-2 en relación a alfa-1 (a partir de base 97) .

(1) también informa sobre los genes de región C épsilon-1 y épsilon-2 (pseudogén) . Los autores (1) determinaron la unión física entre épsilon-1 y alfa-2, y entre épsilon-2 y alfa-1. (2) también informa del dominio CH2 alfa y épsilon-2.

Esta entrada es parte de una región multigénica (región B) , que incluye los genes gamma-2, gamma-4, epsilon-1 y alfa-2. Véase segmento 1 para más comentarios.

Fuente de información completa;

ADN genómico humano, Ig10 cosmídico (1) , (3) ; Clon H-Ig-alfa-25 de ADN placentario (2) ; ADN genómico de TOU II-5 biblioteca clon lambda-TOU-alfa2 (para A2m (2) alelo) (3) .

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..2516

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón:9606”

/mapa = “14q32.33”

/germline

gen

<1..1621

/gen = “IgH”

/nota = “IGHA2”

intrón

<1..163

/gen = “IgH”

/nota = “alfa-2 intrón J-C”

SDC

unión ( <164..469.684 ..1004, 1227.. 1621)

/gen = “IgH”

/nota = “contiene región constante”

/comienzo_codón = 3

/producto = “inmunoglobulina de cadena pesada alfa-2”

/n.º_proteín a= “AAB59396.1”

/db_xref = “GI: 184761”

exón

164..469 “

/gen = “IgH”

/nota = “G00-119-333”

intrón

470..683

/gen = “IgH”

/nota = “alfa = 2 intrón A”

exón

684..1004

FIGURA 7F

intrón

/gen = “IgH”

1005..1226

/gen = “IgH”

/nota= “alfa-2 intrón B”

exón

1227..1621

/gen = “IgH”

variación

/gen = “IgH”

/nota = “t en A2m (1) ; a en A2m (2) .

variación

/gen = “IgH”

/nota = “g en A2m (1) ; a en A2m (2) .

variación

/gen = “IgH”

/nota = “c en A2m (1) ; t en A2m (2) ”.

variación

/gen = “IgH”

/nota = “c en A2m (1) ; g en A2m (2) ”.

variación

/gen = “IgH”

/nota = “t en A2m (1) ; a en A2m (2) .

variación

1573..1574

/gen = “IgH”

/nota = “tg en A2m (1) ; ca en A2m (2) ”.

variación

1602..1606

/gen = “IgH”

/nota = “tggac en A2m (1) ; cggat en A2m (2) ”.

variación

/nota = “c en A2m (1) ; t en A2m (2) ”.

variación

/nota = “a en A2m (1) ; c en A2m (2) ”.

variación

/nota = “c en A2m (1) ; g en A2m (2) ”.

CONTADOR BASE 488 a 861 c 754 g 413 t

ORIGEN

FIGURA 7G

[SEC ID N.º: 53]

III. REGIÓN C DE LA IG GAMMA-1 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

>sp | P01857 | GC1_REGIÓN C DE LA IG GAMMA-1HUMANA - Homo sapiens (Humano)

[SEC ID N.º: 20]

SECUENCIA DE CODIFICACIÓN

FIGURA 7H

[SEC ID N.º: 19]

GenBank

J700228

LOCUS

HUMIGCC4 2009 bp ADN PRI 02-DIC-1998

DEFINICIÓN

Región constante de la cadena pesada de la inmunoglobulina gamma-1 de homo sapiens (gen IGHG1) Scod. Parc.

N.º ACCESO

J00228

VERSIÓN

J00228.1 GI:184739

PALABRAS CLAVE

-

ORGANISMO

humano

FUENTE

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 2009)

AUTORES

Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.

TÍTULO

Structure of human immonoglobulin gamma genes: Implications for evolution of a gene family

REVISTA

Cell 29.

67. 679 (1982)

MEDLINE

COMENTARIO

Esta secuencia forma parte de una región multigénica que contiene los genes de la cadena pesada de inmunoglobulina gamma-3, gamma-1, pseudo-épsilon y alfa-1.

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..2009

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón: 9606”

/cromosoma = “14”

/mapa = “14q32.33”

/clon = “cósmido Ig13; Ig-gamma3-122”

/tipo_tejido = “placenta; hígado”

/germline

gen

<1..>1803

/gen = “IGHG1”

intrón

<1..209

/gen = “IGHG1”

SDC

unión (<210..503, 892..936, 1055..1384, 1481..1803)

/gen = “IGHG1”

/comienzo_codón = 3

/producto = “región constante de la cadena pesada de la inmunoglobulina gamma-1 “

/n_proteína = “AAC82527.1”

/db_xref = “GI: 184747”

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

FIGURA 7I

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

765…766

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

diferencia_misc

/gen = “IGHG1”

/sustituir = “ “

CONTADOR BASE 418 a 698 c 566 g 327 t

ORIGEN

[SEC ID N.º: 54]

IV. REGIÓN C DE LA IG GAMMA 2 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

>sp | P01859 | GC2_REGIÓN C DE LA IG GAMMA-2HUMANA - Homo sapiens (Humano)

FIGURA 7J

[SEC ID N.º: 22]

SECUENCIA DE CODIFICACIÓN

[SEC ID N.º: 21]

GenBank

J00230

Ig humana de germline

LOCUS

HUMIGCD1 2009 bp ADN PRI 11-ABR-2001

DEFINICIÓN

Cadena H de Ig humana de germline Región: G-E-A B: Región constante gamma-2 Extremo 3’.

N.º ACCESO

J00230 V00554

VERSIÓN

J00230.1 GI:184750

PALABRAS CLAVE

-

ORGANISMO

humano

FUENTE

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 2009)

AUTORES

Ellison.J. y Hood. L.

TÍTULO

Linkage and sequence homology of two human immunoglobulin gamma heavy chain constant region genes

REVISTA

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (6) , 1984-1988 (1982)

MEDLINE

PUBMED

REFERENCIA

(bases 896 a 1256; 1749 a 1937)

AUTORES

Krawinkel, H. y Rabbitts.T. H.

TÍTULO

Comparison of the hinge-coding segments in human immunoglobulin gamma heavy chain genes and the linkage of the gamma 2 and gamma 4

FIGURA 7K

subclass genes JOURNAL EMBO J. 1 (4) .

40. 407 (1982)

MEDLINE

84235992 PUBMED 6329676

REFERENCIA

(bases 475 a 1071; 1179 a 1330; 1461 a 1524)

AUTORES

Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.

TÍTULO

Structure of human immunoglobulin gamma genes: implications for evolution of a gene family JOURNAL Cell 29 (2) .

67. 679 (1982)

MEDLINE

83001943 PUBMED 6811139

COMENTARIO

El 2 Marzo de 2000 esta versión sustituye: 32759

(2) informa también secuencias de gamma-3, gamma-4 y un pseudogén gamma. La mayoría de esta secuencia es homóloga en un 95% con gamma-4. Los exones de la bisagra son homólogos solo en un 70%. Los autores estiman que gamma-2 y gamma-4 se separaron hace 6, 6 millones de años. Los autores de (1) creen que la transferencia mediada por dominio de intrones ha desempeñado un papel importante en la evolución de los genes humanos gamma. Asimismo, informan de las regiones bisagra de gamma-1, gamma-3, gamma-4 y un pseudogén de gamma. (1) se estima que la divergencia entre los genes humanos gamma se produjo entre 7, 7 y 4, 4 millones de años. Esta entrada es parte de una región multigénica que incluye los genes gamma-2, gamma-4, épsilon-1 y alfa-2. La ubicación relativa de los cuatro genes la determinaron Flanagan y Rabbitts (Nature 300.

70. 713 (1982) ) . Se refieren a este grupo de genes como región B. Los genes de la región A son gamma-3, gamma-1, pseudo-épsilon y alfa-1. Flanagan y Rabbits también determinaron las ubicaciones generales de las dos regiones. Situaron la región A entre las regiones JH/mu/delta y la región B. Fuente de información completa:

ADN de hígado fetal humano, biblioteca de T. Maniatis (3) y Lawn et al. (2) , (1) ; clones p-gamma-2RPA3 (2) , 5A (3) e Ig-gamma-2-15 (1) .

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores fuente 1..2009

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón: 9606” /mapa = “14q32.33”

/germline intrón <1..215

/gen = “IgH” gen <1..2009

/gen = “IgH” /nota = “IGHG2”

exón

216..509 /gen = “IgH”

/nota = “G00-119 -338” Región_C 216..508

/gen = “IgH”

/nota = “región constante de cadena pesada CH1 de inmunoglobulina”

SDC

unión (<216..509, 902..937, 1056..1382, 1480..1802)

/gen = “IgH” /comienzo_codón = 3

/producto = “cadena pesada de inmunoglobulina gamma-2”

/nº_proteína = “AAB59393.1”

/db_xref = “GI: 184758”

intrón

510..901 /gen = “IgH”

conflicto

537 /gen = “IgH”

/cita = (3) /sustituir = “ “

conflicto

550..551 /gen = “IgH”

/cita = (3) /sustituir = “ “

conflicto

570 /gen = “IgH”

/cita = (3) /sustituir = “ “

conflicto

777..778 /gen = “IgH”

/cita = (3) /sustituir = “ “

conflicto

791 /gen = “IgH”

/cita = (3) /sustituir = “ “

conflicto

864 /gen = “IgH”

/cita = (3) /sustituir = “ “

región_C

901..936 /gen = “IgH”

/nota = “bisagra de cadena pesada de inmunoglobulina”

exón

902..937 /gen = “IgH”

/nota = “G00-119 -338” intrón 938..1055

/gen = “IgH” región_C 1055.1381

FIGURA 7L

/gen = “IgH”

/nota = “región constante de cadena pesada CH2 de inmunoglobulina”

exón

1056..1382 /gen = “IgH”

/nota = “G00-119 -338” intrón 1383..1479

/gen = “IgH” región_C 1479..1799

/gen = “IgH”

/nota = “región constante de cadena pesada CH3 de inmunoglobulina”

exón

1480..1802 /gen = “IgH”

/nota = “G00-119 -338” conflicto 1493

/gen = “IgH” /cita = (3)

/sustituir = ““ conflicto 1802..1806

/gen = “IgH” /cita = (2)

/sustituir = ““ conflicto 1814..1815

/gen = “IgH” /cita = (2)

/sustituir = ““ conflicto 1825

/gen = “IgH” /cita = (2)

/sustituir = ““ conflicto 1890

/gen = “IgH” /cita = (2)

/sustituir = ““ señal poliA 1903..1908

/gen = “IgH” conflicto 1909..1918

/gen = “IgH” /cita = (3)

/sustituir = ““ conflicto 1929..1932

/gen = “IgH” /cita = (2)

/sustituir =“ “ CONTADOR BASE 410 a 700 c 568 g 331 t

ORIGEN

[SEC ID N.º: 55]

FIGURA 7M

V. REGIÓN C DE LA IG GAMMA-3 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

CAA27268 C gamma 3 (Homo sapiens)

[SEC ID N.º: 24]

FIGURA 7N

SECUENCIA DE CODIFICACIÓN

[SEC ID N.º: 23]

GenBank

X03604 gen gamma-3 de IgG humana IgG G3m (b) Región constante de cadena pesada de EZZ (individual II-4 de TOU) PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

LOCUS

HSIGGC3 2590 bp ADN PR.

2. NOV-1998

DEFINICIÓN

Gen gamma-3 de IgG humana IgG G3m (b) Región constante de cadena pesada de EZZ

(individual II-4 de TOU) .

N.º ACCESO

X03604 M12958

VERSIÓN

X03604.1 GI:33070

PALABRAS CLAVE

Región constante; gamma-inmunoglobulina; cadena pesada de Ig; inmunoglobulina.

ORGANISMO

humano

FUENTE

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 2590)

AUTORES

Huck, S., Fort, P., Crawford, D.H., Lefranc, M.P. and Lefranc, G.

TÍTULO

Sequence of a human immunoglobulin gamma 3 heavy chain constant region gene: comparison with the other human C gamma genes

REVISTA

Nucleic Acids Res. 14 (4) , 1779-1789 (1986)

MEDLINE

REFERENCIA

(bases 4 a 204; 2202 a 2236)

AUTORES

Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.

TÍTULO

Structure of human immunoglobulin gamma genes: implications for evolution of a gene family

REVISTA

Cell 29 (2) .

67. 679 (1982)

MEDLINE

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..2590

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón: 9606”

conflicto

/nota = “falta T en (2) ”.

/cita = (2)

conflicto

80..82

/nota = “CGC es GCG en (2) ”

FIGURA 7O

/cita = (2)

conflicto

/nota = “C es T en (2) ”

/cita = (2)

conflicto

/nota = “T es C en (2) ”.

/cita = (2)

SCD

unión (<215..509, 901..951, 1095..1239, 1283..1327, 1471..1515, 1634..1963, 2061..>2380)

/comienzo_codón = 1

/producto = “C gamma 3”

/nº_proteína = “CAA27268.1”

/db_xref = “GI: 577056”

intrón

510..900

/nota = “intrón I”

intrón

952..1094

/nota = “intrón II”

intrón

1140..1282

/nota = “intrón III”

intrón

1328..1470

/nota = “intrón IV”

intrón

1516..1633

/nota = “intrón V”

intrón

1964..2060

/nota = “intrón VI”

característica_misc

2484..2489

/nota = “pot. señal poliA”

CONTADOR BASE

541 a 925 c 703 g 421 t

ORIGEN

FIGURA 7P

[SEC ID N.º: 56]

VI. REGIÓN C DE LA IG GAMMA-4 HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

>sp |P01861| GC4_REGIÓN C DE LA IG GAMMA-4 HUMANA – Homo sapiens (Humano) .

FIGURA 7Q

[SEC ID N.º: 26]

SECUENCIA DE CODIFICACIÓN

[SEC ID N.º: 25]

GenBank

K01316 Ig humana de germline

LOCUS

HUMIGCD2 2028 bp ADN PRI 11-ABR-2001

DEFINICIÓN

Cadena H de Ig humana de germline Región: G-E-A B: Región constante gamma-4, Extremo 3’

N.º ACCESO

K01316

VERSIÓN

K01316.1 GI: 184751

PALABRAS CLAVE

.

FUENTE

humano

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 2028)

AUTORES

Ellison, J., Buxbaum, J. y Hood, L.

TÍTULO

Nucleotide sequence of a human immunoglobulin C gamma 4 gene

REVISTA

DNA 1 (1) , 11-18 (1981)

MEDLINE

REFERENCIA

(bases 475 a 1069; 1180 a 1331, 1432 a 1655)

AUTORES

Takahashi, N. , Ueda, S. , Obata, M. , Nikaido, T. , Nakai, S. y Honjo, T.

TÍTULO

Structure of human immunoglobulin gamma genes: implications for evolution of a gene family

REVISTA

Cell 29 (2) .

67. 679 (1982)

MEDLINE

PUBMED

REFERENCIA

(bases 894 a 1106)

AUTORES

Krawinkel, U. y Rabbitts, T. H.

TÍTULO

Comparison of the hinge-coding segments in human immunoglobulin gamma heavy chain genes and the linkage of the gamma 2 and gamma 4 subclass genes

REVISTA

EMBO J. 1 (4) .

40. 407 (1982)

MEDLINE

PUBMED

REFERENCIA

(bases 1 a 2028)

AUTORES

Ellison, J. y Hood, L.

TÍTULO

Linkage and sequence homology of two human immunoglobulin gamma heavy chain constant region genes

REVISTA

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (6) , 1984-1988 (1982)

MEDLINE

PUBMED

FIGURA 7R

COMENTARIO

(1) informa de que el gen C-gamma-4 humano es homólogo con los genes gamma-1, gamma-2a y gamma-2b de murino (sobre el 75%) . (3) también indica secuencias parciales para los pseudogenes gamma-2, gamma-3 y gamma. (2) muestra las regiones bisagra del gamma-1, gamma-2, gamma-3, y pseudo-gamma.

Esta entrada es parte de una región multigénica (región B) , que incluye los genes gamma-2, gamma-4, épsilon-1 y alfa-2. Véase segmento 1 para más comentarios.

Fuente de información completa:

ADN de hígado fetal humano, biblioteca de T. Maniatis (3) y Lawn et al. (1) , (2) ; clones 24B (1) , lambda-HG4.1 (3) e Ig-gamma-4-2 (2) .

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..2028

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/germline

gen

<1..2028

/gen = “IgH”

/nota = “IGHG4”

intrón

<1..215

/gen = “IgH”

/nota = “gamma-4 intrón J-C”

SCD

unión (<216..509, 900..935, 1054.. 1383, 1481..1803)

/gen = “IgH”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena pesada de inmunoglobulina gamma-4”

/nº_proteína = “AAB59394.1”

/db_xref = “GI: 184759”

exón

216..509

/gen = “IgH”

/nota = “G00-119-340”

intrón

510..899

/gen = “IgH”

exón

900..935

/gen = “IgH”

intrón

536..1053

/gen = “IgH”

exón

1054..1383

/gen = “IgH”

intrón

1384..1480

/gen = “IgH”

exón

1481..1803

/gen = “IgH”

CONTADOR BASE 421 a 709 c 567 g 331 t

ORIGEN

FIGURA 7S

[SEC ID N.º: 57]

VII. REGIÓN C DE LA IG DELTA HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

>sp |P01880| DTC_REGIÓN C DE LA IG DELTA HUMANA – Homo sapiens (Humano)

FIGURA 7T

[SEC ID N.º: 28]

GenBank

K02876 IgD humana de germline… (gi: 184766) PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

LOCUS

HUMIGCD2 300 bp ADN PRI 08-NOV-1994

DEFINICIÓN

Gen de la cadena de IdG humana de germline, región C, región bisagra primera.

N.º ACCESO

K02876

VERSIÓN

K02876.1 GI: 184766

PALABRAS CLAVE

Región C; germline; exón bisagra; cadena pesada de inmunoglobulina; inmunoglobulina delta.

FUENTE

ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) ) .

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 300)

AUTORES

White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.

TÍTULO

Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain

REVISTA

Science 228 (4700) .

73. 737 (1985)

MEDLINE

COMENTARIO

Véase segmento 1

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..300

/organismo= “Homo sapiens”

/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”

/db_xref= “taxón: 9606”

/mapa=“14q32.33”

/tipo_célula= “linfocito”

/germline

intrón

<1..151

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 1

exón

101..202

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “región bisagra-1; G00-120 -084”

/número = 2

intrón

203..>300

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 2

gen

unión (K02875. 1:1..495, 1..300, K02877.1: 1..300,

K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100,

K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)

/gen = “IGHD”

SCD

unión (K02875.1:101..403, 101..202, K02877.1:101..172, K02878.1:101..424, K02879.1:101..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “enlace de membrana”

/comienzo_codón= 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52771.1”

/db_xref = “GI: 495872”

/db_xref = “GDB G00-120 -084”

FIGURA 7U

[SEC ID N.º: 28]

SCD

unión (K02875.1:101..403, 101..202, K02877.1:101..172, K02878.1:101..424, K02879.1:101..424, K02880.1:25..53)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “forma secretada”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52770.1”

/db_xref = “GI: 495871”

/db_xref = “GDB G00-120 -084”

CONTADOR BASE 59 a 133 c 52 g 56 t

ORIGEN sobre 300 bp tras el segmento; 118 bp aguas arriba del sitio Stul.

[SEC ID N.º: 27]

K02877 Ig humana de germline...[gi: 184767] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

LOCUS

HUMIGCH03 300 bp ADN PRI 08-NOV-1994

DEFINICIÓN

Gen de la región C de la cadena de Ig delta-H de germline humana, segunda región bisagra (linfocito LLC) .

N.º ACCESO

K02877

VERSIÓN

K02877.1 GI: 184767

PALABRAS CLAVE

Región C; germline; exón bisagra; cadena pesada de inmunoglobulina; inmunoglobulina delta.

ORGANISMO FUENTE

ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica [LLC]) .

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 300)

AUTORES

White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.

TÍTULO

Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain

REVISTA

Science 228 (4700) .

73. 737 (1985)

MEDLINE

COMENTARIO

Véase segmento 1

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..300

/organismo = “Homo sapiens”

/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/tipo_célula = “linfocito”

/germline

intrón

<1..100

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 2

exón

101..172

/gen = “IGHD”

/nota = “región bisagra-2; G00-120 -084; putativo”

/número = 3

FIGURA 7V

intrón

103..>300

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 3

gen

unión (K02875. 1:1..495, K02876.1: 1..300, 1..300,

K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100,

K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)

/gen = “IGHD”

SCD

unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, 101..172, K02878.1:101..424, K02879.1:101..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “enlace de membrana”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/nº_proteína = “AAA52771.1”

/db_xref = “GI: 495872”

/db_xref = “GDB G00-120 -084”

SCD

unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, 101..172, K02878.1:101..424, K02879.1:101..424, K02880.1:25..53)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “forma secretada”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/nº_proteína = “AAA52770.1”

/db_xref = “GI: 495871”

/db_xref = “GDB G00-120 -084”

CONTADOR BASE 102 a 52 c 70 g 76 t

ORIGEN Sobre 1, 85 kb tras segmento 2.

[SEC ID N.º: 29]

FIGURA 7W

K02878 IgD humana de germline… [gi: 184768] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

LOCUS

HUMIGCH04 500 bp ADN PRI 08-NOV-1994

DEFINICIÓN

Genes de la cadena de IgD de Germline humana, Región C, Dominio C delta-2

N.º ACCESO

K02878

VERSIÓN

K02878.1 GI: 184768

PALABRAS CLAVE

Región C; germline, cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.

FUENTE

ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica [LLC])

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 500)

AUTORES

White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.

TÍTULO

Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain

REVISTA

Science 228 (4700) .

73. 737 (1985)

MEDLINE

COMENTARIO

Véase segmento 1.

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..500

/organismo = “Homo sapiens”

/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/tipo_célula = “linfocito”

/germline

intrón

<1..100

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 3

exón

101..424

/gen = “IGHD”

/nota = “dominio constante delta-2; G00-120 -084”

/número = 4

intrón

425..>500

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 4

intrón

425..>500

/gen = “IGHD”

/nota = “IgD-s intrón D”

gen

unión (K02875. 1:1..495, K02876.1: 1..300,

K02877.1:1..300, 1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100,

K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)

/gen = “IGHD”

SCD

unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, K02877.1:101…172, 101..424, K02879.1:101..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “enlace de membrana”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52771.1”

/db_xref = “GI: 495872”

/db_xref = “GDB G00-120 -084”

FIGURA 7X

SCD

unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, K02877.1:101…172, 101..424, K02879.1:101..424, K02880.1:25..53)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “forma secretada”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/nº_proteína = “AAA52770.1”

/db_xref = “GI: 495871”

/db_xref = “GDB G00-120 -084”

CONTADOR BASE 93 a 171 c 157 g 79 t

ORIGEN sobre 450 bp tras el segmento 3; 131 bp aguas arriba del sitio Accl.

[SEC ID N.º: 30]

K02879 Ig humana de germline...[gi: 184769] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

LOCUS

HUMIGCH05 500 bp ADN PRI 08-NOV-1994

DEFINICIÓN

Gen de la región C de la cadena de Ig delta-H de germline humana, dominio C delta-3 (linfocito LLC) .

N.º ACCESO

K02879

VERSIÓN

K02879.1 GI: 184769

PALABRAS CLAVE

región C; germline, cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.

FUENTE

ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 500)

AUTORES

White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.

TÍTULO

Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain

REVISTA

Science 228 (4700) .

73. 737 (1985)

MEDLINE

COMENTARIO

Véase segmento 1

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..500

/organismo = “Homo sapiens”

/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/tipo_célula = “linfocito”

/germline

intrón

<1..100

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 4

exón

101..424

/gen = “IGHD”

/nota = “dominio C delta-3; G00-120 -084; putativo”

/número = 5

FIGURA 7Y

intrón

425..>500

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 5

gen

unión (K02875. 1:1..495, K02876.1: 1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, 1..500, K02880.1:1..100, K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)

/gen = “IGHD”

SCD

unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, K02877.1:101…172, K02878.1:101..424, 101..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “enlace de membrana”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52771.1”

/db_xref = “GI: 495872”

/db_xref = “GDB G00-120 -084”

SCD

unión (K02875.1:101..403, K02876.1:101..202, K02877.1:101…172, K02878.1:101..424, 101..424, K02880.1:25..53)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “forma secretada”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52770.1”

/db_xref = “GI: 495871”

/db_xref = “GDB G00-120 -084”

CONTADOR BASE 85 a 188 c 145 g 82 t

ORIGEN sobre 150 bp tras el segmento 4; 118 bp aguas arriba del sitio HindIII.

FIGURA 7Z

[SEC ID N.º: 33]

K01311. IgD humana de germline...[gi: 184716] PubMed, Proteína, Taxonomía, OMIM

LOCUS

HUMIGCB9 106 bp ADN PRI 12-ABR-2001

DEFINICIÓN

Región de la cadena J de IgD delta de germline humana: C-delta CH1

N.º ACCESO

K01311

VERSIÓN

K01311.1 GI: 184716

PALABRAS CLAVE

región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.

FUENTE

humano

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 106)

AUTORES

Rabbitts, T.H., Forster, A. y Milstein, C.P.

TÍTULO

Human immunoglobulin heavy chain genes: evolutionar y comparisons of C mu, C delta, and C gamma genes and associated switch sequences

REVISTA

Nucleic Acids Res. 9 (18) , 4509-4524 (1981)

MEDLINE

PUBMED

COMENTARIO

La secuencia de aminoácidos deducida se compara en (1) para la unión cadena J/C delta-1 de la proteína ER1 humana. El gen delta aparece sólo en 5 kb desde la región mu. Los autores (1) no pudieron detectar ninguna secuencia de conmutación adyacente al gen delta y afirman que esto implica que no tienen lugar una conmutación mu/delta mediante un proceso de conmutación de clase. Especulan que toda la región VH- (C-mu) - (C-delta) se transcribe a una molécula precursora nuclear que se rompe más tarde.

Esto es parte de una región multigénica que contiene la región J, región de conmutación, genes C-mu-secretado, C-mu-membrana y C-delta.

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..106

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/tipo_célula = “linfocito”

/tipo_tejido = “placenta”

/tipo_tejido = “hígado”

/fase_desarrollo = “feto”

/germline /tejido_lib = “lawn et al.”

gen

<1..106

/gen = “IGHD”

intrón

<1..26

/gen = “IGHD”

/nota = “intrón delta J-C; G00-120 -084”

SCD

<27..>106

/gen = “IGHD”

/nota = “región C - dominio CH1”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/nº_proteína = “AAB59423.1”

/db_xref = “GI: 184735”

/traducción = “PTKAPDVFPIISGCRHPKDNSPVVLA”

CONTADOR BASE 24 a 38 c 24 g 20 t

ORIGEN

[SEC ID N.º: 58]

K02880. IgD humana de germline… (gi: 184770) PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

FIGURA 7AA

LOCUS

HUMIGH06 100 bp ADN PRI 08-NOV-1994

DEFINICIÓN

Genes de la cadena de IgD de germline humana, región C, terminal secretado.

N.º ACCESO

K02880

VERSIÓN

K02880.1 GI: 184770

PALABRAS CLAVE

región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.

FUENTE

ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 100)

AUTORES

White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.

TÍTULO

Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain

REVISTA

Science 228 (4700) .

73. 737 (1985)

MEDLINE

COMENTARIO

Véase segmento 1

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..100

/organismo = “Homo sapiens”

/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/tipo_célula = “linfocito”

/germline

intrón

<1..>100

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 5

intrón

<1..24

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 5

exón

25..>53

/gen = “IGHD”

/nota = “dominio terminal secretado; G00-120 -084”

/número = 6

gen

unión (K02875.1:1..495, K02876.1:1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, 1..100, K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)

/gen = “IGHD”

SCD

unión (K02875.1:1..403, K02876.1:1..202, K02877.1:1..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, 25..53)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “forma secretada”

/comienzo_codón= 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52770.1”

/db_xref = “GI: 495871”

/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”

CONTADOR BASE 24 a 33 c 22 g 21 t

ORIGEN Sobre 1, 8 kb tras segmento 5

[SEC ID N.º: 36]

FIGURA 7BB

K02881. IgD humana de Germline…[gi: 184771] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

LOCUS

HUMIGH07 200 bp ADN PRI 08-NOV-1994

DEFINICIÓN

Genes de la cadena de IgD de germline humana, región C, primer dominio de membrana terminal

N.º ACCESO

K02881

VERSIÓN

K02881.1 GI: 184771

PALABRAS CLAVE

región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.

FUENTE

ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 200)

AUTORES

White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.

TÍTULO

Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain

REVISTA

Science 228 (4700) .

73. 737 (1985)

MEDLINE

COMENTARIO

Véase segmento 1

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..200

/organismo = “Homo sapiens”

/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/tipo_célula = “linfocito”

/germline

intrón

<1..24

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 5

exón

25..182

/gen = “IGHD”

/nota = “primer dominio de membrana terminal; G00-120-084, putativo”

/número = 6

intrón

183..>200

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 6

gen

unión (K02875.1:1..495, K02876.1:1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100, 1..200, K02882.1:1..52)

/gen = “IGHD”

SCD

unión (K02875.1:1..403, K02876.1:1..202, K02877.1:1..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, 25..182.1:44..52)

/parcial

/gen = “IGHD”

/Nota = “enlace de membrana”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/nº_proteína = “AAA52771.1”

/db_xref = “GI: 495872”

/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”

CONTADOR BASE 37 a 72 c 49 g 42 t

FIGURA 7 CC

ORIGEN Sobre 800 bp tras segmento 6.

[SEC ID N.º: 38]

K02882. IgD humana de germline…[gi: 184772] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

LOCUS

HUMIGH08 100 bp ADN PRI 08-NOV-1994

DEFINICIÓN

Genes de la cadena de IgD de germline humana, región C, segundo dominio de membrana terminal

N.º ACCESO

K02882

VERSIÓN

K02882.1 GI: 184772

PALABRAS CLAVE

región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.

FUENTE

ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 100)

AUTORES

White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.

TÍTULO

Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain

REVISTA

Science 228 (4700) .

73. 737 (1985)

MEDLINE

COMENTARIO

Véase segmento 1

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..100

/organismo = “Homo sapiens”

/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/tipo_célula = “linfocito”

/germline

intrón

<1..43

/gen = “IGHD”

/nota = “IgD-Mb”

/número = 6

exón

44..>52

/gen = “IGHD”

/nota = “enlace de membrana (segundo dominio de membrana terminal) ; G00-120-084, putativo”

/número = 7

gen

unión (K02875.1:1..495, K02876.1:1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100, 1..200, K02881.1:1..52)

/gen = “IGHD”

SCD

unión (K02875.1:1..403, K02876.1:1..202, K02877.1:1..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, K02881.1:25..182.1:44..52)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “enlace de membrana”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52771.1”

/db_xref = “GI: 495872”

/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”

FIGURA 7DD

CONTADOR BASE 22 a 30 c 30 g 18 t

ORIGEN Sobre 1, 3 kb tras segmento 7.

[SEC ID N.º: 40]

K02875. IgD humana de germline…[gi: 184765] PubMed, Proteína, Secuencias Relacionadas, Taxonomía, OMIM, LinkOut

LOCUS

HUMIGCH01 495 bp ADN PRI 08-NOV-1994

DEFINICIÓN

Genes de la cadena de IgD de germline humana, región C, dominio C delta-1

N.º ACCESO

K02875

VERSIÓN

K02875.1 GI: 184765

PALABRAS CLAVE

región C; germline; cadena pesada de inmunoglobulina; cadena delta de inmunoglobulina.

FUENTE

ADN de Homo sapiens (paciente individual aislado con leucemia linfocítica crónica (LLC) )

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 495)

AUTORES

White, M.B., Shen, A.L., Word, C.J., Tucker, P.W. y Blattner, F.R.

TÍTULO

Human immunoglobulin D: genomic sequence of the delta heavy chain

REVISTA

Science 228 (4700) .

73. 737 (1985)

MEDLINE

COMENTARIO

La secuencia en formato legible por ordenador y el borrador de entrada (1) fueron gentilmente cedidos por M. B. Blanco, 06-AGO-1985.

Los extremos de los exones C-delta y delta-s se localizaron comparando las secuencias traducidas con las secuencias conocidas AA (1) .

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..495

/organismo = “Homo sapiens”

/aislamiento = “Paciente con leucemia linfocítica crónica (LLC) ”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

/tipo_célula = “linfocito”

/germline

gen

unión (1..495, K02876.1:1..300, K02877.1:1..300, K02878.1:1..500, K02879.1:1..500, K02880.1:1..100, 1..200, K02881.1:1..200, K02882.1:1..52)

/gen = “IGHD”

intrón

<1..100

/gen = “IGHD”

/nota = “intrón J-C; G00-120 -084”

SCD

unión (101..403, K02876.1:1..202, K02877.1:101..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, K02880.1:25..53)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “forma secretada”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52770.1”

/db_xref = “GI: 495871”

/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”

exón

101..403

/gen = “IGHD”

/nota = “dominio constante delta-1; G00-120 -084; putativo”

FIGURA 7EE

/número = 1

SCD

unión (101..403, K02876.1:1..202, K02877.1:101..172, K02878.1:1..424, K02879.1:1..424, K02881.1:25..182, K02882.1:44..52)

/parcial

/gen = “IGHD”

/nota = “enlace de membrana”

/comienzo_codón = 3

/producto = “cadena delta de inmunoglobulina”

/n.º_proteína = “AAA52771.1”

/db_xref = “GI: 495872”

/db_xref = “ GDB: G00-120 -084”

intrón

404..>495

/gen = “IGHD”

/nota = “G00-120-084”

/número = 1

CONTADOR BASE 114 a 179 c 120 g 82 t

ORIGEN 182 bp aguas arriba del sitio SphI; cromosoma 14p32.3.

[SEC ID N.º: 42]

VIII. REGIÓN C DE CADENA DE LA IG ÉPSILON HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

>sp |P01880| DTC_REGIÓN C DE CADENA DE LA IG ÉPSILON HUMANA – Homo sapiens (Humano)

FIGURA 7FF

[SEC ID N.º: 49]

SECUENCIA DE CODIFICACIÓN

[SEC ID N.º: 44]

GenBank

L00022 Ig humana activa

LOCUS

HUMIGHAE2 1920 bp ADN PR.

2. DIC-1994

DEFINICIÓN

Genes de la cadena pesada épsilon-1 de Ig activa humana, región constante

N.º ACCESO

L00022 J00227 V00555

VERSIÓN

L00022.1 GI: 185035

PALABRAS CLAVE

región C; inmunoglobulina épsilon; cadena pesada de inmunoglobulina; gen procesado.

FUENTE

Línea celular de mieloma humano 266B1 ADN y cADN a mARN, clones H-Ig-épsilon-11, lambda-épsilon-1.2, pJJ71, pGET2 y K85/A12 (véase comentario) .

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 1920)

AUTORES

Flanagan, J.G. y Rabbitts, T.H.

TÍTULO

The sequence of a human immunoglobulin epsilon heavy chain constant region gene, and evidence for three non-allelic genes

REVISTA

EMBO J. 1 (5) .

65. 660 (1982)

FIGURA 7GG

MEDLINE

REFERENCIA

(bases 528 a 736; 1044 a 1138)

AUTORES

Nishida, Y., Miki, T., Hisajima, H. y Honjo, T.

TÍTULO

Cloning of human immunoglobulin epsilon chain genes: evidence for multiple C epsilon genes

REVISTA

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (12) , 3833-3837 (1982)

MEDLINE

REFERENCIA

(bases 1 a 1920)

AUTORES

Kenten, J.H., Molgaard, H.V., Houghton, M., Derbyshire, R.B., Viney, J., Bell, L.O. y Gould, H.J.

TÍTULO

Cloning and sequence determination of the gene for the human immunoglobulin epsilon chain expressed in a myeloma cell line

REVISTA

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (21) , 6661-6665 (1982)

MEDLINE

REFERENCIA

(bases 98 a 1884)

AUTORES

Seno, M., Kurokava, T., Ono, Y., Onda, H., Sasada, R., Igarashi, K., Kikuchi, M., Sugino, Y., Nishida, Y. y Honjo, T.

TÍTULO

Molecular cloning and nucleotide sequencing of human immunoglobulin epsilon chain cDNA

REVISTA

Nucleic Acids Res. 11 (3) .

71. 726 (1983)

MEDLINE

REFERENCIA

(bases 691 a 807; 1571 a 1818; 1860 a 1885)

AUTORES

Liu, F. T., Albrandt, K. A., Br y , C. G. y Ishizaka, T.

TÍTULO

Expression of a biologically active fragment of human IgE epsilon chain in Escherichia coli

REVISTA

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81 (17) , 5369-5373 (1984)

MEDLINE

COMENTARIO

(2) y (1) indican el aislamiento de otros dos genes épsilon, épsilon-2 y épsilon-3. Los autores (2) reivindican que épsilon-3 es un pseudogén. Max, et al. (Cell 29.

69. 699 (1982) ) lo comparan en (4) con la secuencia de la región C y encuentran 3 diferencias con respecto a los nucleótidos. La secuencia de aminoácidos que se deduce en (4) difiere en cierta medida con la secuencia de la región C publicada. (5) expresión producida de la IgE en E. coli mediante la inserción dentro del vector de expresión pUC7.

Fuente de información completa:

Línea celular de mieloma humano 266B1 ADN (2) , (1) , (5) y cADN a mARN (3) , (4) , clones H-Ig-épsilon-11 (2) , lambda-épsilon-1.2 (1) , pJJ71 (3) , pGET2 (4) y K85/A12 (5) .

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..1920

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón: 9606”

/mapa = “14q32.33”

prim_transcripc.

<1..1886

/nota = “épsilon-1 mRNA”

intrón

<1..97

/gen = “IGHE”

/nota = “épsilon-1 intrón J-C”

exón

98..406

/gen = “IGHE”

/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio CH1) ; G00-119 -335”

intrón

407..613

/gen = “IGHE”

/nota = “épsilon-1 intrón A”

exón

614..934

/gen = “IGHE”

/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio CH2) ”

conflicto

/gen = “IGHE”

/cita = (3)

/sustituir = “ “

intrón

935-1020

/gen = “IGHE”

/nota = “épsilon-1 intrón B”

exón

1021..1344

FIGURA 7HH

/gen = “IGHE”

/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio CH3) ”

conflicto

/gen = “IGHE”

/cita = (3)

/sustituir = “ “

conflicto

/gen = “IGHE”

/cita = (3)

/sustituir = “ “

intrón

1345..1427

/gen = “IGHE”

/nota = “épsilon-1 intrón C”

exón

1428..>1759

/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio CH4) ”

conflicto

1444..1445

/gen = “IGHE”

/cita = (3)

/sustituir = “ “

conflicto

/gen = “IGHE”

/cita = (3)

/sustituir = “ “

conflicto

/cita = (3)

/sustituir = “ “

gen

unión (L00021.1:57..495, 1..1758)

/gen = “IGHE”

SCD

unión (L00021.1:57..495, 98..406, 614..934, 1021..1344, 1428..1759)

/parcial

/gen = “IGHE”

/nota = “Cadena pesada de Ig épsilon-1 (dominio V-D-J) ”

/comienzo_codón = 1

/n.º_proteína = “AAB59424.1”

/db_xref = “GI: 386807”

/db_xref = “GDB G00-119 -335”

[SEC ID N.º: 60]

CONTADOR BASE 387 a 658 c 576 g 299 t

ORIGEN tras unos 3 kb; 1 bp aguas arriba del sitio BamHI.

FIGURA 7II

[SEC ID N.º: 59]

IX. REGIÓN C DE CADENA DE LA IG MU HUMANA - HOMO SAPIENS (HUMANO)

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

>sp |P01871| MUC_REGIÓN C DE CADENA DE LA IG MU HUMANA – Homo sapiens (Humano)

[SEC ID N.º: 47]

SECUENCIA DE CODIFICACIÓN

FIGURA 7JJ

[SEC ID N.º: 46]

GenBank

X17115. mARN humano de IgH

LOCUS

HSIGM201 2213 bp mARN PRI 03-ABR-1995

DEFINICIÓN

Secuencia completa de mARN de cadena pesada de IgM humana

N.º ACCESO

X17115

VERSIÓN

X17115.1 GI: 33450

PALABRAS CLAVE

cadena pesada de Ig; gen de IgM; cadena pesada de IgM; proteína transmembrana.

FUENTE

humano

ORGANISMO

Homo sapiens Eucariotas; Metazoos; Cordados; Craneados; Vertebrados; Teleósteos;

Mamíferos; Euterios; Primates; Catarrinos; Homínidos; Homos.

REFERENCIA

(bases 1 a 2213)

AUTORES

Friendlander, R. M.

TÍTULO

Direct Submission

REVISTA

Submitted (03-NOV-1989) Friedlander R. M., Harvard Medical School, Howard Hughes Medical Institute, Department of Genetics, 25

Shattuck St, Boston, MA 02115, USA

REFERENCIA

(bases 1 a 2213)

AUTORES

Friedlander, R. M., Nussenzweig, M. C. y Leder, P.

TÍTULO

Complete nucleotide sequence of the membrane form of the human IgM heavy chain

REVISTA

Nucleic Acids Res. 18 (14) , 4278 (1990)

MEDLINE

REFERENCIA

(bases 1 a 2213)

AUTORES

Kristensen, T., Loper, R. y Pr y dz, H.

TÍTULO

An estimate of the sequencing error frequency in the DNA sequence databases

REVISTA

DNA Seq. 2 (6) .

34. 346 (1992)

MEDLINE

OBSERVACIÓN

Errata: I (fe de erratas publicada en DNA Seq 1993 ; 3 (5) : 337) )

COMENTARIO

Para la secuencia genómica véase <K01306>, <X14939> y <X14940>. El autor menciona varios conflictos con estas secuencias. Datos revisados amablemente (30-MAY-1990) por Friedlander R. M.

CARACTERÍSTICAS

Situación/Calificadores

fuente

1..2213

/organismo = “Homo sapiens”

/db_xref = “taxón: 9606”

FIGURA 7KK

/clon = “201-203”

/línea_celular = “linfoma 201”

/tipo_célula = “B”

/tipo_tejido = “linfoide”

característica_misc

1..39

/nota = “secuencia del VECTOR putativo Bluescript SKP+”

/cita = (3)

SCD

73..1956

/nota = “precursor (AA -15 a 612) ”

/comienzo_codón = 1

/nº_proteína = “CAA34971.1”

/db_xref = “GI: 33451”

/db_xref = “SWISS-PROT: P01871”

/db_xref = “SWISS-PROT: P20769”

[SEC ID N.º: 52]

péptidos_señal

73..117

péptidos_mat

118..1953

/producto = “cadena pesada de IgM (AA 1 a 612) .

sitio_poliA

/nota = “sitio_poliA”

CONTADOR BASE 462 a 708 c 629 g 414 t

ORIGEN

FIGURA 7LL

[SEC ID N.º: 61]

FIGURA 8A

FIGURA 8A (Cont.)

FIGURA 8A (Cont.)

FIGURA 8A (Cont.)

FIGURA 8A (Cont.)

[SEC ID N.º: 9]

[SEC ID N.º: 10]

FIGURA 8B

PÉPTIDO SEÑAL DE LEGÚMINA DE ALUBIA

[SEC ID N.º: 11]

FIGURA 8C

NUCLEÓTIDOS Y SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS DE PROTEÍNA

REGIÓN DE CODIFICACIÓN DE pSHuJ

FIGURA 8D

NUCLEÓTIDOS Y SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS DE PROTEÍNA

REGIÓN DE CODIFICACIÓN DE pSHuSC

FIGURA 8D (Cont.)

[SEC ID N.º: 12]

FIGURA 8E

pBMSP-1

FIGURA 8E (Cont.)

[SEC ID N.º: 13]

FIGURA 8E (Cont.)

FIGURA 8F

pBMSP-lspJSC

FIGURA 8F (Cont.)

FIGURA 8F (Cont.)

FIGURA 8F (Cont.)

FIGURA 8F (Cont.)

FIGURA 8F (Cont.)

[SEC ID N.º: 14]

FIGURA 9

LISTA DE SECUENCIAS

<110> PLANET BIOTECHNOLOGY, INCORPORATED

Larrick, James William

Wycoff, Keith Lynn

<120> NOVEL IMMUNOADHESION FOR THE PREVENTION OF RHINOVIRUS INFECTION

<130> 030905.0003.WO

<140> Pendiente de asignación <141> 2001-04-27

<150> 60/200, 298

<151> 2000-04-27

<160> 8

<170> FastSEO para Windows versión 4.0

<210> 1

<211> 1596

<212> ADN

<213> Homo Sapiens

<220>

<221> CDS

<222> (1) … (1596)

<223> ICAM-1

FIGURA 9 (Cont.)

FIGURA 9 (Cont.)

[La secuencia de ADN tiene el SEC ID N.º: 1]

[La secuencia de proteína tiene el SEC ID N.º: 2]

FIGURA 9 (Cont.)

FIGURA 9 (Cont.)

[SEC ID N.º: 2]

<210>

<211>

<212>

ADN

<213>

Homo sapiens

<400>

FIGURA 9 (Cont.)

[SEC ID N.º: 3]

<210>

<211>

<212>

PRT

<213>

Homo sapiens

<400>

Ser Glu Lys Asp Glu Leu 1 5

[SEC ID N.º: 4]

<210>

<211>

<212>

PRT

<213>

Homo sapiens

<400>

Arg Ser Glu Lys Asp Glu Leu 1 5

[SEC ID N.º: 5]

<210>

<211>

<212>

ADN

<213>

Homo sapiens

<400>

[SEC ID N.º: 6]

<210>

<211>

<212>

ADN

<213>

Homo sapiens

<400>

[SEC ID N.º: 7]

FIGURA 9 (Cont.)

<210>

<211>

<212>

PRT

<213>

Homo sapiens

<220>

<221>

SCD

<222>

(1) … (448)

<223>

Dominios extracelulares de ICAM-1

<220>

<221>

SCD

<222>

(453) … (799)

<223>

IgA2m (2) humana

<400>

FIGURA 9 (Cont.)

[SEC ID N.º: 8]

Figura 10:

FIGURA 10 (cont.)

FIGURA 10 (cont.)

FIGURA 10 (cont.)

Figura 11. pGPTV-kan-ocs-ATR-IgA2:

FIGURA 11 (cont.)

FIGURA 11 (cont.)

FIGURA 11 (cont.)

FIGURA 11 (cont.)

FIGURA 11 (cont.)

FIGURA 11 (cont.)

FIGURA 11 (cont.)

Figura 12. pGPTV-hpt-ocs-35SJ/SC

FIGURA 12 (cont.)

FIGURA 12 (cont.)

FIGURA 12 (cont.)

FIGURA 12 (cont.)

FIGURA 12 (cont.)

FIGURA 12 (cont.)

FIGURA 12 (cont.)

FIGURA 12 (cont.)

Figura 13

Figura 14

Figura 15

Figura 16

Minutos

Figura 17

concentración proteica [µg/ml]

Figura 18

Figura 19

No reducida Reducida M

Figura 20