Expresión constitutiva de ligandos coestimuladores en linfocitos T transferidos de forma adoptiva.
Un linfocito T que comprende un receptor que se une a un antígeno y a ligandos coestimuladores exógenos 4-1BBL y CD80.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2008/004251.
Solicitante: Memorial Sloan Kettering Cancer Center.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 1275 York Avenue New York, NY 10021 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: SADELAIN,MICHEL, STEPHAN,MATTHIAS.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- A61K39/00 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA. › A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE. › A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53).
PDF original: ES-2398760_T3.pdf
Fragmento de la descripción:
Expresión constitutiva de ligandos coestimuladores en linfocitos T transferidos de forma adoptiva Referencia cruzada a solicitud relacionada Cada una de las solicitudes y patentes citadas en este texto, así como cada documento o referencia citado en cada una de las solicitudes y patentes (incluyendo durante la prosecución de cada patente expedida; “documentos citados en la solicitud”) , y cada una de las solicitudes o patentes de PCT y extranjeras correspondientes a y/o que reivindican el beneficio de prioridad de cualquiera de estas solicitudes y patentes, y cada uno de los documentos citados o referidos en cada uno de los documentos citados en la solicitud, pueden emplearse en la práctica de la invención.
Antecedentes de la invención El cáncer de próstata es el cáncer más frecuente en hombres en los Estados Unidos y es la causa de casi 31.000 muertes cada año. Cuando se diagnostica pronto, el cáncer puede tratarse eficazmente por cirugía o radiación. La enfermedad residual postquirúrgica requiere radiación y/o terapia hormonal, que puede evitar la progresión tumoral y metástasis. En la actualidad, no existe tratamiento curativo para cáncer de próstata metastásico refractario para hormonas. La inmunoterapia es una terapia dirigida que en principio posibilita el tratamiento de tales cánceres. Siguen existiendo obstáculos para inducir la inmunidad tumoral, lo que requiere la expansión de linfocitos T citotóxicos a números suficientes para mediar en el rechazo de tumores. Entre los mecanismos que limitan la sensibilización de linfocitos T eficaz y el rechazo de tumores está la ausencia inherente de ligandos coestimuladores en muchos tumores malignos.
Sumario de la invención La presente divulgación generalmente proporciona células inmunosensibles, incluyendo linfocitos T y linfocitos Citolíticos Naturales (NK) , que expresan al menos uno de un receptor que reconoce antígenos y un ligando coestimulador y procedimientos de uso de los mismos para el tratamiento de neoplasia, enfermedad infecciosa y otras patologías.
La invención generalmente proporciona un linfocito T que comprende un receptor que se une a un antígeno y ligandos coestimuladores exógenos 4-1BBL y CD80.
En otro aspecto, la invención proporciona un linfocito T específico de virus que expresa un vector (por ejemplo, un vector de expresión) que codifica un polipéptido seleccionado de uno cualquiera o más de CD80 y 4-1BBL. En una realización, el linfocito T específico de virus reconoce un virus seleccionado de uno cualquier o más de citomegalovirus (CMV) , Virus de Epstein Barr (VEB) , Virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH) y antígenos de virus de la gripe.
En otro aspecto más, la invención proporciona un linfocito T específico de antígeno tumoral que expresa un vector que codifica un polipéptido seleccionado del grupo que consiste en CD80 y 4-1BBL. En una realización, la célula expresa CD80 y 4-1BBL. En otra realización, el vector es un vector retroviral (por ejemplo, gamma-retroviral o lentiviral) ; también puede ser no viral.
En otro aspecto más, la divulgación proporciona un procedimiento para modular una respuesta inmunitaria en un sujeto, comprendiendo el procedimiento administrar una cantidad eficaz de una célula inmunosensible de cualquier aspecto previo. En una realización, el procedimiento aumenta o reduce una respuesta inmunitaria. En otra realización, el procedimiento aumenta la autotolerancia o aumenta la tolerancia a un trasplante de órgano.
En otro aspecto más, la divulgación proporciona un procedimiento para tratar o prevenir una neoplasia en un sujeto, comprendiendo el procedimiento administrar una cantidad eficaz de una célula inmunosensible que comprende un receptor que se une a un antígeno tumoral y un vector que codifica un ligando coestimulador. En una realización, la neoplasia se selecciona de uno cualquier o más de cáncer de próstata, cáncer de colon, cáncer de mama y glioblastoma. En otra realización, el antígeno tumoral es antígeno de membrana específico de próstata, CD19, NY-ESO-1, WT-1, hTERT o mesotelina.
En otro aspecto, la divulgación proporciona un procedimiento para imponer tolerancia en un sujeto, comprendiendo el procedimiento administrar una cantidad eficaz de una célula inmunosensible que comprende un receptor que se une a un antígeno y un vector que codifica un ligando coestimulador. En una realización, el procedimiento previene o reduce una enfermedad autoinmune o una enfermedad asociada con trasplante alogénico.
En otro aspecto más, la divulgación proporciona un procedimiento para tratar o prevenir una infección por patógenos en un sujeto, comprendiendo el procedimiento administrar una cantidad eficaz de una célula inmunosensible que comprende un receptor que se une a un antígeno viral y un vector que codifica un ligando coestimulador. En una realización, el patógeno es un virus, una bacteria, un hongo, un protozoo o un parásito. En otra realización, el virus se selecciona de uno cualquiera o más de citomegalovirus (CMV) , Virus de Epstein Barr (VEB) , Virus de la
Inmunodeficiencia Humana (VIH) y virus de la gripe. En otra realización más, la célula es un linfocito T, un linfocito Citolítico Natural (NK) o un linfocito T citotóxico (CTL) .
En otro aspecto más, la divulgación proporciona un procedimiento para producir una célula inmunosensible específica de antígeno, comprendiendo el procedimiento introducir en la célula inmunosensible una secuencia de ácido nucleico que codifique un receptor de antígeno quimérico, en el que el receptor de antígeno quimérico comprende un dominio de unión a antígeno acoplado a un dominio de señalización intracelular que activa una célula inmunosensible. En una realización, la célula inmunosensible es un linfocito T, CTL o linfocito NK. En otra realización, el dominio de unión a antígeno es un dominio de unión a antígeno tumoral. En otra realización más, el antígeno tumoral es antígeno de membrana específico de próstata (PSMA) . En otra realización más, el dominio de señalización intracelular activa un linfocito T, linfocito CTL o linfocito NK. En otra realización más, el dominio de señalización intracelular es el dominio de señalización de cadena ξ.
En otro aspecto, la divulgación proporciona un procedimiento para tratar una neoplasia en un sujeto que lo necesite, comprendiendo el procedimiento administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente eficaz de un linfocito T que comprende un antígeno tumoral y un complejo presentador de antígenos que comprende al menos dos ligandos coestimuladores, en el que al menos uno de los dos ligandos coestimuladores se seleccionan de uno cualquiera o más de un ligando de factor de necrosis tumoral (TNF) y un ligando de la superfamilia de inmunoglobulina (Ig) y combinaciones de los mismos, tratando de este modo cáncer en el sujeto.
En otro aspecto, la divulgación proporciona un procedimiento para tratar una neoplasia en un sujeto, comprendiendo el procedimiento administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente eficaz de un linfocito Citolítico Natural (NK) que comprende un antígeno tumoral y un complejo presentador de antígenos que comprende al menos dos ligandos coestimuladores, en el que al menos uno de los dos ligandos coestimuladores se selecciona de uno cualquiera o más de un ligando de factor de necrosis tumoral (TNF) y un ligando de la superfamilia de inmunoglobulina (Ig) y combinaciones de los mismos, tratando de este modo cáncer en el sujeto. En una realización, el ligando de TNF se selecciona de uno cualquiera o más de 4-1BBL, OX40L, CD70, CD30L y LIGHT. En otra realización, el ligando de la superfamilia de Ig se selecciona de CD80 y CD86. En otra realización más, la célula expresa al menos dos ligandos coestimuladores, en los que uno es un ligando de TNF (por ejemplo, 4-1BBL) y el otro es un ligando de la superfamilia de Ig (por ejemplo, CD80) .
En otro aspecto, la divulgación proporciona un procedimiento para tratar una enfermedad infecciosa en un sujeto que lo necesite, comprendiendo el procedimiento administrar a un sujeto una cantidad terapéuticamente eficaz de un linfocito T que comprende un receptor específico para un antígeno viral y un complejo presentador de antígenos que comprende al menos dos ligandos coestimuladores, en el que al menos uno de los dos ligandos coestimuladores se selecciona de uno cualquiera o más de un ligando de factor de necrosis tumoral (TNF) y un ligando de la superfamilia de inmunoglobulina (Ig) y combinaciones de los mismos, tratando de este modo la enfermedad infecciosa en el sujeto.
En otro aspecto más, la divulgación proporciona un procedimiento para tratar una enfermedad infecciosa en un sujeto, que comprende... [Seguir leyendo]
Reivindicaciones:
1. Un linfocito T que comprende un receptor que se une a un antígeno y a ligandos coestimuladores exógenos 41BBL y CD80.
2. El linfocito T de la reivindicación 1, en el que el ligando coestimulador se expresa de forma constitutiva o inducible.
3. El linfocito T de la reivindicación 1, en el que la célula se selecciona del grupo que consiste en un linfocito Citolítico Natural (NK) , un linfocito T citotóxico (CTL) y un linfocito T regulador, y en el que el antígeno es un antígeno tumoral o de patógeno.
4. El linfocito T de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en el que el antígeno se selecciona del grupo que consiste en antígeno de membrana específico de próstata (PSMA) , antígeno carcinoembrionario (CEA) , IL13R alfa, her-2, CD19, NY-ESO-1, HIV-1 Gag, Lewis Y, Mart-1, gp100, tirosinasa, WT-1, hTERT y mesotelina.
5. El linfocito T de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-4, expresando el linfocito T un receptor de antígeno recombinante o endógeno que es Pzl o P28z.
6. El linfocito T de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-5, comprendiendo además el linfocito T un ligando coestimulador exógeno seleccionado del grupo que consiste en OX40L, CD70, LIGHT, CD30L y CD86.
7. El linfocito T de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que un receptor de antígeno endógeno o recombinante oun complejo presentador de antígenos se expresa de forma constitutiva en la superficie del linfocito T.
8. El linfocito T de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-7, en el que el ligando coestimulador 41BBL o el ligando coestimulador CD80 se expresa de forma constitutiva en la superficie del linfocito T.
9. El linfocito T de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-8, en el que el ligando coestimulador 41BBL o el ligando coestimulador CD80 se expresa en un vector retroviral.
10. Un linfocito T específico de virus o un linfocito T específico de antígeno tumoral que comprende un vector de expresión que codifica un polipéptido de 4-1BBL y un polipéptido de CD80.
11. El linfocito T específico de virus de la reivindicación 10, en el que el linfocito T reconoce un virus seleccionado del grupo que consiste en citomegalovirus (CMV) , virus de Epstein Barr (VEB) , virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) y antígenos del virus de la gripe.
12. El linfocito T específico de virus o el linfocito T específico de antígeno tumoral de la reivindicación 10, en el que el vector de expresión codifica además un polipéptido seleccionado del grupo que consiste en OX40L, CD70 y CD30L.
13. El linfocito T específico de virus o el linfocito T específico de antígeno tumoral de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 10-12, en el que el vector de expresión es un vector retroviral.
14. Un kit para el tratamiento de una neoplasia, una infección por patógeno, un trastorno autoinmune o un trasplante alogénico, en el que el kit comprende i) un linfocito T de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-9 o ii) un linfocito T específico de virus o un linfocito T específico de antígeno tumoral de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 10-13 y comprendiendo el kit además instrucciones para su uso.
LOCUS NP_005182 288 aa lineal PR.
2. FEB-2008
DEFINICIÓN Precursor de antígeno CD80 [Homo sapiens]
REFERENCIA NP_005182
VERSIÓN NP_005182.1 GI:4885123
FUENTE DB REFSEQ: referencia NM_005191.3
FUENTE Homo sapiens (ser humano)
ORGANISMO Homo sapiens
Eukar y ota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCIA 1 (restos 1 a 288)
AUTORES Nolan, A., Weiden.M., Kelly, A., Hoshino, Y., Hoshino, S., Mehta.N. y
Gold, J.A.
TÍTULO CD40 and CD80/86 act synergistically to regulate inflammation and
mortality in polymicrobial sepsis
PUBLICACIÓN Am. J. Respir. Crit. Care Med. 177 (3) .
30. 308 (2008)
PUBMED 17989345
OBSERVACIÓN GeneRIF: la expresión de CD80 se reguló positivamente en los monocitos
en circulación en sujetos sépticos el día 1
REFERENCIA 2 (restos 1 a 288)
AUTORES Stephan, M.T., Ponomarev, V., Brentjens, R.J., Chang, A.H.,
Dobrenkov, K.V., Heller, G. y Sadelain, M.
TÍTULO T cell-encoded CD80 and 4-1BBL induce auto- and transcostimulation,
resulting in potent tumor rejection
PUBLICACIÓN Nat. Med. 13 (12) , 1440-1449 (2007)
PUBMED 18026115.
OBSERVACIÓN GeneRIF: CD80 y 4-1BBL inducen auto y transcoestimulación en células
tumorales
REFERENCIA 3 (restos 1 a 288)
AUTORES Habib-Agahi, M., Phan, T.T. y Searle, P.F.
TÍTULO Co-stimulation with 4-1BB ligand allows extended T-cell proliferation,
synergizes with CD80/CD86 and can reactivate anergic T cells
PUBLICACIÓN Int. Immunol. 19 (12) , 1383-1394 (2007)
PUBMED 17977894
OBSERVACIÓN GeneRIF: Los linfocitos T que se habían vuelto no sensibles a anti-CD3
podrían reactivarse para proliferar cuando se coestimulan con 4-1BBL,
solo o combinado con CD80-CD86
REFERENCIA 4 (restos 1 a 288)
AUTORES Kakoulidou, M., Giscombe.R., Zhao.X., Lefvert, A.K. y Wang, X.
TÍTULO Human Soluble CD80 is generated by alternative solicing, and
recombinant soluble CD80 binds to CD28 and CD152 influencing T-cell
activation
PUBLICACIÓN Scand. J. Immunol. 66 (5) .
52. 537 (2007)
PUBMED 17953528
OBSERVACIÓN GeneRIF: sCD80 en suero humano añade un nuevo miembro a la familia de receptores solubles, lo que implica una red de factores coestimuladores solubles con relevancia funcional
REFERENCIA 5 (restos 1 a 288)
AUTORES Dopheide, J.F., Sester, U., Schlitt, A., Horstick, G., Rupprecht, H.J., Munzel.T. y Blankenberg, S.
TÍTULO Monocyte-derived dendritic cells of patients with coronar y arter y disease show an increased expression of costimulator y molecules CD40, CD80 and CD86 in vitro
PUBLICACIÓN Coron. Arter y Dis. 18 (7) .
52. 531 (2007)
PUBMED 17925605
OBSERVACIÓN GeneRIF: CD40, CD80 y CD86 se regula positivamente en células dendríticas derivadas de monocitos cultivados de pacientes con enfermedad de las arterias coronarias
REFERENCIA 6 (restos 1 a 288)
AUTORES Weiskirchen, R., Pino, J.D., Macalma.T., Bister, K. y Beckerle, M.C.
TÍTULO The cysteine-rich protein family of highly related LIM domain proteins
PUBLICACIÓN J. Biol. Chem. 270 (48) , 28946-28954 (1995)
PUBMED 7499425
REFERENCIA 7 (restos 1 a 288)
AUTORES Freeman, G.J., Disteche, C.M. , Gribben, J.G., Adler, D.A., Freedman, A.S., Douger y , J. y Nadler, L.M.
TÍTULO The gene for B7, a costimulator y signal for T-cell activation, maps to chromosomal region 3ql3.3-3q21
PUBLICACIÓN Blood 79 (2) .
48. 494 (1992)
PUBMED 1370389
REFERENCIA 8 (restos 1 a 288)
AUTORES Selvakumar, A. , Mohanraj, B.K., Eddy, R.L., Shows, T.B., White, P.C. y Dupont, B.
TÍTULO Genomic organization and chromosomal location of the human gene encoding the B-lymphocyte activation antigen B7
PUBLICACIÓN Immunogenetics 36 (3) .
17. 181 (1992)
PUBMED 1377173
REFERENCIA 9 (restos 1 a 288)
AUTORES Freeman, G.J. , Gray, G.S., Gimmi, C.D., Lombard, D.B., Zhou, L.J., White, M., Fingeroth, J.D., Gribben, J.G. y Nadler, L.M.
TÍTULO Structure, expression, and T cell costimulator y activity of the murine homologue of the human B lymphocyte activation antigen B7
PUBLICACIÓN J. Exp. Med. 174 (3) .
62. 631 (1991)
PUBMED 1714935
REFERENCIA 10 (restos 1 a 288)
AUTORES Freeman, G.J., Freedman, A.S., Segil, J.M., Lee, G., Whitman, J.F. y Nadler.L.M.
TÍTULO B7, a new member of the Ig superfamily with unique expression on activated and neoplastic B cells
PUBLICACIÓN J. Immunol. 143 (8) , 2714-2722 (1989)
PUBMED 2794510
COMENTARIO REFSEQ VALIDADO: Este registro ha experimentado validación o revisión preliminar. La secuencia de referencia derivó de BP225173.1, BC042665.1 y AC073352.22. Sumario: El antígeno de activación de linfocitos B B7-1 (denominado anteriormente B7) proporciona señales reguladoras para linfocitos T como consecuencia de unión con los ligandos CD28 (MIM 186760) y CTLA4 (MIM 123890) de linfocitos T [proporcionado por OMIM].
Nota de Publicación: Este registro de RefSeq incluye un subconjunto de las publicaciones que están disponibles para este gen. Por favor, véase el registro de Entrez Gene para acceder a publicaciones adicionales
ELEMENTOS Localización/Calificadores
source 1..288 /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxón:9606" /chromosome=" 3" /map="3ql3.3-q21"
Protein 1..288 /product="Precursor de antígeno CD80" /note="variante de molécula coestimuladora IgV-CD80; antígeno CD80 (ligando de antígeno CD28 1, antígeno B7-1) ; factor coestimulador CD80; antígeno de activación de linfocitos B B7"
sig_peptide 1..34 /calculated_mol_wt=3754 35..288
mat_peptide /product="antígeno CD80" /calculated_mol_wt=29312
Region 37. .139 /region_name="IG" /note="Inmunoglobulina; smart00409" /db_xref="CDD:47718"
Region 37..135 /region_name="conjunto V" /note="Dominio de conjunto V de inmunoglobulina. Este dominio se encuentra en anticuerpos así como en proteína neural P0 y CTL4 entre otras; pfam07686" /db_xref="CDD:87333"
Region 143..227 /region_name="conjunto C2_2" /note= "Dominio de inmunoglobulina de conjunto de C2 de tipo CD80. Estos dominios pertenecen a la superfamilia de inmunoglobulina; pfam08205" /db_xref="CDD:71639"
CDS 1..288 /gene="CD80" /coded_by="NM_005191.3:396. .1262" /db_xref="CCDS:CCDS2989.1" /db_xref="GenelD:941" /db_xref="HGNC:1700" /db_xref="HPRD:00202" /db_xref="MIM:112203"
DEFINICIÓN Miembro de la superfamilia del ligando de factor de necrosis tumoral 9 (ligando de 4-1BB) (4-1BBL) .
REFERENCIA P41273
VERSIÓN P41273.1 GI:728739
FUENTE DB swissprot: locus TNFL9_HUMAN, referencia P41273; clase: convencional. referencias extra:Q2M3S2 creado: 1 de febrero de 1995. secuencia actualizada: 1 de febrero de 1995. anotación actualizada: 4 de diciembre de 2007. xrefs: U03398.1, AAA53134.1, BC104805.1, AAI04806.1, BC104807.1, AAI04808.1, 138427 xrefs (bases de datos no de secuencia) : RefSeq:NP_003802.1, UniGene:Hs.l524, DIP:DIP:3020N, Ensembl:ENSG00000125657, GeneID:8744, KEGG:hsa: 8744, H-InvDB:HIX0040144, HGNC:11939, MIM:606182, PharmGKB:PA36629, ArrayExpress:P41273, CleanEx:HS_TNFSF9, GermOnline:ENSG00000125657, GO:0005102, GO:0006915, GO:0008283, GO:0007267, GO:0007165, InterPr Pfam:PF00229, SMART:SM00207, PROSITE:PS00251, PROSITE:PS50049
PALABRAS CLAVE Citocina; membrana; polimorfismo; anclaje de señal; transmembrana
FUENTE Homo sapiens (ser humano)
ORGANISMO Homo sapiens Eukar y ota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCIA 1 (restos 1 a 254)
AUTORES Alderson.M.R., Smith, C.A., Tough, T.W., Davis-Smith, T., Armitage.R.J., Falk, B., Roux.E., Baker, E., Sutherland, G.R., Din.W.S. y Goodwin, R.G.
TÍTULO Molecular and biological characterization of human 4-1BB and its ligand
PUBLICACIÓN Eur. J. Immunol. 24 (9) , 2219-2227 (1994)
PUBMED 8088337
OBSERVACIÓN SECUENCIA DE NUCLEÓTIDOS [ARNM].
REFERENCIA 2 (restos 1 a 254)
AUTORES Gerhard, D.S., Wagner, L., Feingold, E.A., Shenmen.C.M., Grouse, L.H., Schuler, G., Klein, S.L., Old, S., Rasooly, R., Good, P., Guyer, M. , Peck, A.M., Derge, J.G., Lipman, D., Collins, F.S., Jang, W., Sherr y , S., Feolo, M., Misquitta, L., Lee.E., Rotmistrovsky, K., Greenhut, S.F., Schaefer, C.F., Buetow, K., Bonner, T.I., Haussler, D., Kent, J., Kiekhaus, M., Furey, T., Brent, M. , Prange, C, Schreiber, K. ,
Shapiro, N., Bhat, N.K., Hopkins, R.F., Hsie, F., Driscoll, T.,
Soares, M.B., Casavant, T.L., Scheetz, T.E., Brown-stein, M.J.,
Usdin, T.B., Toshiyuki, S., Carninci, P., Piao, Y., Dudekula, D.B.,
Ko, M.S., Kawakami, K-, Suzuki, Y., Sugano, S., Gruber, C.E.,
Smith, M.R., Simmons/B., Moore, T., Waterman, R., Johnson, S.L.,
Ruan, Y., Wei.C.L., Mathavan, S., Gunaratne.P.H., Wu, J.,
Garcia, A.M., Hulyk, S.W., Fuh, E., Yuan, Y., Sneed.A., Kowis.C,
Hodgson, A., Muzny, D.M., McPherson, J., Gibbs, R.A., Fahey, J.,
Helton, E., Ketteman, M., Madan, A., Rodrigues, S., Sanchez, A.,
Whiting, M., Madari, A., Young, A.C., Wetherby.K.D., Granite, S.J.,
Kwong, P.N., Brinkley, C.P., Pearson, R.L., Bouffard.G.G.,
Blakesly, R.W., Green, E.D., Dickson, M.C., Rodriguez, A.C.,
Grimwood, J., Schmutz, J., Myers, R.M., Butterfield, Y.S.,
Griffith, M., Griffith, O.L., Krzywinski, M.I., Liao, N., Morin, R.,
Palmquist.D., Petrescu, A.S., Skalska, U., Smailus, D.E., Stott, J.M.,
Schnerch, A., Schein, J.E., Jones, S.J., Holt, R.A., Baross.A.,
Marra, M.A., Clifton, S., Makowski, K.A., Bosak.S. y Malek, J.
CONSRTM MGC Project Team
TÍTULO The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA
project: the Mammalian Gene Collection (MGC)
PUBLICACIÓN Genome Res. 14 (10B) , 2121-2127 (2004)
PUBMED 15489334
OBSERVACIÓN SECUENCIA DE NUCLEÓTIDOS [ARNM A GRAN ESCALA].
TEJIDO = Pulmón
Errata:[Genome Res. Jun 2006;16 (6) :804. Morrin, Ryan [corregido a
Morin, Ryan]]
COMENTARIO En o antes de 16 de febrero de 2007 esta versión de secuencia
reemplazó
gi:121941506, gi:7512264.
[FUNCIÓN] Citocina que se une a TNFRSF9. Induce la proliferación
de linfocitos T en sangre periférica activados. Puede tener un
papel en la muerte celular inducida por activación (AICD) . Puede
desempeñar un papel en interacciones afines entre linfocitos T y
linfocitos B/macrófagos.
[SUBUNIDAD] Homotrímero (Potencial) .
[LOCALIZACIÓN SUBCELULAR) Membrana; proteína de membrana de tipo
II de pase único
[ESPECIFICIDAD TISULAR] Expresado en cerebro, placenta, pulmón,
músculo esquelético y riñón.
[SIMILITUD] Pertenece a la familia de factor de necrosis tumoral.
ELEMENTOS Localización/Calificadores
source 1..254
/organism="Homo sapiens"
/db_xref="taxón:9606"
gene 1..254
/gene="TNFSF9"
Protein 1..254
/gene="TNFSF9"
/product="miembro de la superfamilia de ligando de factor de
necrosis tumoral 9"
Region 1..254
/gene="TNFSF9"
/region_name="Cadena madura"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
/note="Miembro de la superfamilia de ligando de factor necrosis
tumoral 9".
/FTId=PRO_0000185501."
Region 1. .28
/gene="TNFSF9"
/region_name="Dominio topológico"
/inference = "pruebas no experimentales, no se registraron
detalles adicionales"
/note = "Citoplásmico (Potencial) ."
Region 17
/gene="TNFSF9"
/region_name="Variante"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="P -> A (in dbSNP:rs442511) . /FTId=VAR_011928."
Region 29..49
/gene="TNFSF9"
/regi on_name="Región transmembrana"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Anclaje de señal para proteína de membrana de tipo II
(Potencial) ."
Region 35..41
/gene="TNFSF9"
/region_name="Región con preferencia composicional"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Poli-Leu."
Region 50..254
/gene="TNFSF9"
/region_name="Dominio topológico"
/inference= "pruebas no experimentales, no se registraron
detalles adicionales"
/note="Extracelular (Potencial) ."
Region 91. .238
/gene="TNFSF9"
/region_name="TNF"
/note="Factor de necrosis tumoral; los miembros de la
superfamilia de TNF incluyen las citocinas: TNF (TNF-alfa) , LT
(linfotoxina-alfa, TNF-beta) , ligando de CD40, Apo2L (TRAIL) ,
ligando de Fas y ligando de osteoprotegerina (OPG) ; cdO0184"
/db_xref="CDD:29146"
Site order (94, 142, 144, 199, 204, 234, 238)
/gene="TNFSF9"
/site_type="otro"
/note="interfaz de trímero"
/db_xref="CDD:29146"
Site order (110..111, 116, 162, 169, 176)
/gene="TNFSF9"
/site_type="otro"
/note="sitios de unión a receptor"
/db_xref="CDD:29146"
ORIGEN •
LOCUS BAB18304 67 aa lineal PRI 19-OCT-2004
DEFINICIÓN ligando de OX40 [Homo sapiens].
REFERENCIA BAB18304
VERSIÓN BAB18304.1 GI:11275538
FUENTE DB referencia AB042988.2
FUENTE Homo sapiens (ser humano)
ORGANISMO Homo sapiens
Eukar y ota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCIA 1
AUTORES Hikami, K., Tsuchiya, N. y Tokunaga, K.
TÍTULO New variations in human 0X40 ligand (CD134L) gene
PUBLICACIÓN Genes Immun. 1 (8) .
52. 522 (2000)
PUBMED 11197696
REFERENCIA 2 (restos 1 a 67)
AUTORES Hikami.K., Tsuchiya, N. y Tokunaga.K.
TÍTULO Presentación directa
PUBLICACIÓN Presentado (19 de mayo de 2000) Koki Hikami, Universidad de Tokio,
Departamento de Genética Humana; 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokio
113-0033, Japón (E-mail:kokihikami@mail.goo.ne.jp,
Tel:81-3-5841-3693, Fax:81-3-5802-8619)
ELEMENTOS Localización/Calificadores
source 1..67
/organism="Homo sapiens"
/db.xref="taxón:9606"
/chromosome="1"
/map="lq25"
Protein 1..67
/product="ligando de OX40"
CDS 1..67
/gene="OX40L"
/coded_by="join (AB042988.2:55..207, AB042988.2:462..>510) "
LOCUS NP_001243 193 aa lineal PRI ll-FEB-2008
DEFINICIÓN superfamilia del ligando de factor de necrosis tumoral, miembro 7 [Homo
sapiens].
REFERENCIA NP_001243
VERSIÓN NP_001243.1 GI:4507605
FUENTE DB REFSEQ: referencia NM_001252.3
FUENTE Homo sapiens (ser humano)
ORGANISMO Homo sapiens
Eukar y ota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCIA 1 (restos 1 a 193)
AUTORES Yang, Z.Z., Novak, A.J., Ziesmer, S.C., Witzig, T.E. y Ansell, S.M.
TÍTULO CD70+ non-Hodgkin lymphoma B cells induce Foxp3 expression and
regulator y function in intratumoral CD4+CD25 T cells
PUBLICACIÓN Blood 110 (7) , 2537-2544 (2007)
PUBMED 17615291
OBSERVACIÓN GeneRIF: revela un nuevo papel para linfocitos B de linfoma no de
Hodgkin en el desearrollo de linfocitos T reguladores intratumorales
REFERENCIA 2 (restos 1 a 193)
AUTORES van Oosterwijk, M.F., Juwana, H., Arens, R., Tesselaar.K., van
Oers, M.H., Eldering, E. y van Lier, R.A.
TÍTULO CD27-CD70 interactions sensitise naive CD4+ T cells for
IL-12-induced Thl cell development
PUBLICACIÓN Int. Immunol. 19 (6) .
71. 718 (2007)
PUBMED 17548342
OBSERVACIÓN GeneRIF: Las interacciones CD27-CD70 pueden promover la formación de
linfocitos Th1 permitiendo que los linfocitos T vírgenes respondan a
señales de diferenciación y promoviendo la supervivencia de linfocitos T
efectores activados.
REFERENCIA 3 (restos 1 a 193)
AUTORES Diegmann, J., Junker, K., Loncarevic, I.F., Michel, S., Schimmel, B. y von
Eggeling, F.
TÍTULO Immune escape for renal cell carcinoma: CD70 mediates apoptosis in
lymphocytes
PUBLICACIÓN Neoplasia 8 (11) .
93. 938 (2006)
PUBMED 17132225
OBSERVACIÓN GeneRIF: La apoptosis mediada por exposición al CD70 secretado por
células tumorales puede contribuir a la incapacidad de pacientes con
carcinoma de células renales para desarrollar una respuesta antitumoral
mediada por linfocitos eficaz
REFERENCIA 4 (restos 1 a 193)
AUTORES Adam, P.J., Terrett, J.A., Steers, G., Stockwin, L., Loader, J.A.,
Fletcher, G.C., Lu, L.S., Leach, B.I., Mason, S., Stamps, A.C.,
Boyd, R.S., Pezzella, F., Gatter, K.C. y Harris, A.L.
TÍTULO CD70 (TNFSF7) is expressed at high prevalence in renal cell
carcinomas and is rapidly internalised on antibody binding
PUBLICACIÓN Br. J. Cancer 95 (3) .
29. 306 (2006)
PUBMED 16892042
OBSERVACIÓN GeneRIF: El análisis inmunocitoquímico demostró que la unión de un
anticuerpo anti-CD70 con CD70 (TNFSF7) , expresado de forma endógena
en la superficie de líneas celulares A498 .
78. O dio como resultado
la rápida internalización del complejo anticuerpo-receptor.
REFERENCIA 5 (restos 1 a 193)
AUTORES Huang, J., Kerstann, K.W., Ahmadzadeh, M., Li, Y.F., El-Gamil, M.,
Rosenberg, S.A. y Robbins.P.F.
TÍTULO Modulation by IL-2 of CD70 and CD27 expression on CD8+ T cells:
importance for the therapeutic effectiveness of cell transfer
immunotherapy
PUBLICACIÓN J. Immunol. 176 (12) , 7726-7735 (2006)
PUBMED 16751420
OBSERVACIÓN GeneRIF: Interacción de CD70 con CD27 desempeña un papel directo en
la activación de linfocitos T mediada por IL-2.
REFERENCIA 6 (restos 1 a 193)
AUTORES Kobata, T., Jacquot, S., Kozlowski, S., Agematsu, K., Schlossman, S.F.
y Morimoto, C.
TÍTULO CD27-CD70 interactions regulate B-cell activation by T cells
PUBLICACIÓN Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92 (24) , 11249-11253 (1995)
PUBMED 7479974
REFERENCIA 7 (restos 1 a 193)
AUTORES Brown, G.R., Meek, K., Nishioka, Y. y Thiele.D.L.
TÍTULO CD27-CD27 ligand/CD70 interactions enhance alloantigen-induced
proliferation and cytolytic activity in CD8+ T lymphocytes
PUBLICACIÓN J. Immunol. 154 (8) , 3686-3695 (1995)
PUBMED 7706711
REFERENCIA 8 (restos 1 a 193)
AUTORES Hintzen, R.Q., Lens, S.M., Koopman, G., Pals.S.T., Spits, H. y van
Lier, R.A.
TÍTULO CD70 represents the human ligand for CD27
PUBLICACIÓN Int. Immunol. 6 (3) .
47. 480 (1994)
PUBMED 8186199
REFERENCIA 9 (restos 1 a 193)
AUTORES Hintzen, R.Q., Lens, S.M., Beckmann, M.P., Goodwin, R.G., Lynch, D. y
van Lier, R.A.
TÍTULO Characterization of the human CD27 ligand, a novel member of the
TNF gene family
PUBLICACIÓN J. Immunol. 152 (4) , 1762-1773 (1994)
PUBMED 8120385
REFERENCIA 10 (restos 1 a 193)
AUTORES Bowman, M.R., Crimmins, M.A. , Yetz-Aldape, J., Kriz, R., Kelleher, K.
y Herrmann, S.
TÍTULO The cloning of CD70 and its identification as the ligand for CD27
PUBLICACIÓN J. Immunol. 152 (4) , 1756-1761 (1994)
PUBMED 8120384
COMENTARIO REFSEQ REVISADO: Este registro se ha revisado por el personal de
NCBI. La secuencia de referencia derivó de AC008760.7.
Sumario: La proteína codificada por este gen es una citocina que
pertenece a la familia del ligando de factor de necrosis tumoral
(TNF) . Esta citocina es un ligando para TNFRSF27/CD27. Es un
antígeno de superficie en linfocitos T y B activados, pero no en
reposo. Induce proliferación de linfocitos T coestimulados, potencia
la generación de linfocitos T citolíticos y contribuye a la
activación de linfocitos T.
También se ha indicado que esta citocina desempeña un papel en la
regulación de la activación de linfocitos B, función citotóxica de
linfocitos citolíticos naturales y síntesis de inmunoglobulina.
Nota de publicación: Este registro de RefSeq incluye un subconjunto
de las publicaciones que están disponibles para este gen. Por favor,
véase el registro de Entrez Gene para acceder a publicaciones
adicionales.
ELEMENTOS Localización/Calificadores
source 1. .193
/orgahism="Homo sapiens"
/db_xref="taxón:9606"
/chromosome="19"
/map="19pl3"
Protein 1..193
/product="superfamilia de ligando de factor de necrosis
tumoral, miembro 7"
/note="antígeno CD70; ligando de CD27; antígeno de superficie
CD70; antígeno Ki-24; superfamilia de factor de necrosis
tumoral (ligando) , miembro 7"
/calculated_mol_wt=2 0987
Region 58..189
/region_name="TNF"
/note="Factor de Necrosis Tumoral; los miembros de la
superfamilia de TNF incluyen las citocinas: TNF (TNF-alfa) , LT
(linfotoxina-alfa, TNF-beta) , ligando CD40, Apo2L (TRAIL) ,
ligando de Fas y ligando de osteoprotegerina (OPG) ; cd00184"
/db_xref="CDD:29146"
Site order (61, 105, 107, 154, 159, 185, 189)
/site_type="otro"
/note="interfaz de trímero"
/db_xref="CDD:29146"
Site order (76..77, 84, 119, 126, 129)
/site_type="otro"
/note="sitios de unión a receptor"
/db_xref="CDD:29146"
CDS 1..193
/gene="CD70"
/coded_by="NM_001252.3:151..732"
/db_xref="CCDS:CCDS12170.1"
/db_xref="GenelD:970"
/db_xref="HGNC:11937"
/db_xref="HPRD:18515"
/db_xref=nMIM:602840"
LOCUS NP_742011 204 aa lineal PRI 16-MAR-2008
DEFINICIÓN Superfamilia de ligando de factor de necrosis tumoral, miembro 14
isoforma 2 [Homo sapiens].
REFERENCIA NP_742011
VERSIÓN NP_742011.1 GI:25952147
FUENTE DB REFSEQ: referencia NM_172014.1
FUENTE Homo sapiens (ser humano)
ORGANISMO Homo sapiens
Eukar y ota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCIA 1 (restos 1 a 204)
AUTORES Pawlak, K., Pawlak, D. y Mysliwiec, M.
TÍTULO LIGHT—a new member of the TNF superfamily in the plasma, dialysate
and urine of uremic patients; the impact of residual diuresis and
presence of viral hepatitis
PUBLICACIÓN Clin. Biochem. 40 (16-17) , 1240-1244 (2007)
PUBMED 17826757
OBSERVACIÓN GeneRIF: Los niveles de LIGHT en plasma parecen ser similares en
pacientes con hemodiálisis (HD) y sujetos sanos y no se vieron
afectados por el sexo, edad, el periodo medio de historial de HD,
etiología de la enfermedad, tipo de medicación y tipo de membrana de
diálisis en uso.
REFERENCIA 2 (restos 1 a 204)
AUTORES Celik.S., Langer, H., Stellos, K., May.A.E., Shankar, V., Kurz, K.,
Katus.H.A., Gawaz, M.P. y Dengler.T.J.
TÍTULO Platelet-associated LIGHT (TNFSF14) mediates adhesion of platelets
to human vascular endothelium
PUBLICACIÓN Thromb. Haemost. 98 (4) .
79. 805 (2007)
PUBMED 17938804
OBSERVACIÓN GeneRIF: LIGHT asociado a plaquetas está implicado en la adhesión de
plaquetas a endotelio mientras que LIGHT soluble induce un estado
proinflamatorio en células endoteliales vasculares
REFERENCIA 3 (restos 1 a 204)
AUTORES Loeffler, M., Le'Negrate.G., Krajewska, M. y Reed, J.C.
TÍTULO Attenuated Salmonella engineered to produce human cytokine LIGHT
inhibit tumor growth
PUBLICACIÓN Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104 (31) , 12879-12883 (2007)
PUBMED 17652173
OBSERVACIÓN GeneRIF: la Salmonella typhimurium atenuada que expresaba LIGHT inhibió el crecimiento de tumores primarios, así como la diseminación de metástasis pulmonares, en diversos modelos tumorales de ratón empleando líneas celulares de carcinoma murino en ratones inmunocompetentes
REFERENCIA 4 (restos 1 a 204)
AUTORES Nadiminty, N., Chun, J.Y., Hu, Y., Dutt, S., Lin.X. y Gao, A.C.
TÍTULO LIGHT, a member of the TNF superfamily, activates Stat3 mediated by NIK pathway
PUBLICACIÓN Biochem. Biophys. Res. Commun. 359 (2) .
37. 384 (2007)
PUBMED 17543278
OBSERVACIÓN GeneRIF: además de activar NF-kappaB/p52, LIGHT también activa Stat3 a través de la ruta de NIK
REFERENCIA 5 (restos 1 a 204)
AUTORES Gill, R.M., Coleman, N.M. y Hunt, J.S.
TÍTULO Differential cellular expression of LIGHT and its receptors in early gestation human placentas
PUBLICACIÓN J. Reprod. Immunol. 74 (1-2) , 1-6 (2007)
PUBMED 17010447
OBSERVACIÓN GeneRIF: el sistema LIGHT puede regular los estadios temprano a medio de desarrollo placentario mediante expresión programada temporalmente específica de células del ligando y sus receptores, y también puede ayudar a conservar el privilegio inmune placentario.
REFERENCIA 6 (restos 1 a 204)
AUTORES Yu.K.Y., Kwon.B., Ni, J., Zhai, Y., Ebner.R. y Kwon.B.S.
TÍTULO A newly identified member of tumor necrosis factor receptor superfamily (TR6) suppresses LIGHT-mediated apoptosis
PUBLICACIÓN J. Biol. Chem. 274 (20) , 13733-13736 (1999)
PUBMED 10318773
REFERENCIA 7 (restos 1 a 204)
AUTORES Harrop, J.A., McDonnell, P.C., Brigham-Burke, M., Lyn, S.D., Minton, J., Tan, K.B., Dede, K., Spampanato, J., Silverman, C., Hensley.P., DiPrinzio, R., Emer y , J.G., Deen, K., Eichman.C, Chabot-Fletcher.M., Truneh, A. y Young, P.R.
TÍTULO Herpesvirus entr y mediator ligand (HVEM-L) , a novel ligand for HVEM/TR2, stimulates proliferation of T cells and inhibits HT29 cell growth
PUBLICACIÓN J. Biol. Chem. 273 (42) , 27548-27556 (1998)
PUBMED 9765287
REFERENCIA 8 (restos 1 a 204)
AUTORES Zhai, Y., Guo, R., Hsu, T.L., Yu, G.L., Ni, J., Kwon, B.S., Jiang, G.W., Lu, J., Tan, J., Ugustus, M., Carter, K. , Rojas, L., Zhu, F., Lincoln, C, Endress, G., Xing, L., Wang, S., Oh, K.O., Gentz, R., Ruben, S., Lippman, M.E., Hsieh, S.L. y Yang, D.
TÍTULO LIGHT, a novel ligand for lymphotoxin beta receptor and TR2/HVEM induces apoptosis and suppresses in vivo tumor formation via gene transfer
PUBLICACIÓN J. Clin. Invest. 102 (6) , 1142-1151 (1998)
PUBMED 9739048
REFERENCIA 9 (restos 1 a 204)
AUTORES Marsters, S.A., Sheridan, J.P., Pitti, R.M., Brush, J., Goddard.A. y Ashkenazi, A.
TÍTULO Identification of a ligand for the death-domain-containing receptor Apo3
PUBLICACIÓN Curr. Biol. 8 (9) .
52. 528 (1998)
PUBMED 9560343
REFERENCIA 10 (restos 1 a 204)
AUTORES Mauri, D.N., Ebner.R., Montgomer y , R.I., Kochel, K.D., Cheung, T.C., Yu.G.L., Ruben, S., Murphy, M., Eisenberg, R.J., Cohen, G.H., Spear, P.G. y Ware, C.F.
TÍTULO LIGHT, a new member of the TNF superfamily, and lymphotoxin alpha are ligands for herpesvirus entr y mediator
PUBLICACIÓN Immunity 8 (1) .
2. 30 (1998)
PUBMED 9462508
COMENTARIO REFSEQ REVISADO: Este registro se ha revisado por el personal de NCBI. La
secuencia de referencia derivó de AY028261.1 y AF064090.1.
Sumario: La proteína codificada por este gen es un miembro de la familia
de ligando de factor de necrosis tumoral (TNF) . Esta proteína es un
ligando para TNFRSF14, que es un miembro de la superfamilia del receptor
del factor de necrosis tumoral, y que también se conoce como un mediador
de entrada de herpesvirus (HVEM) . Esta proteína puede actuar como un
factor coestimulador para la activación de células linfoides y como un
elemento disuasorio de infección por herpesviurs. Se ha demostrado que
esta proteína estimula proliferación de linfocitos T, y desencadena
apoptosis de diversas células tumorales. También se ha indicado que esta
proteína evita la apoptosis mediada por factor de necrosis tumoral alfa en
hepatocito primario. Se han presentado dos variantes de transcrito de
corte y empalme alternativo que codifican isoformas distintas.
Variante de transcrito: Esta variante (2) carece de un segmento de
codificación en fase en comparación con la variante 1, dando como
resultado una isoforma (2) que carece de una región interna, en
comparación con la isoforma 1.
Nota de Publicación: Este registro de RefSeq incluye un subconjunto de las
publicaciones que están disponibles para este gen. Por favor, véase el
registro de Entrez Gene para acceder a publicaciones adicionales.
ELEMENTOS Localización/Calificadores
source 1..204
/organism="Homo sapiens"
/db_xref="taxón:9606"
/chromosome="19"
/map="19pl3.3"
Protein 1..204
/product="superfamilia del ligando del factor de necrosis
tumoral, miembro 14 isoforma 2"
/note="LIGHT transmembrana delta; miembro de superfamilia de
factor de necrosis tumoral LIGHT; mediador de entrada de
herpevirus A; tipo receptor de factor de necrosis tumoral 2;
ligando para mediador de entrada de herpesvirus"
/calculated_mol_wt=22265
Region 58..202
/region_name="TNF"
/note="Factor de necrosis tumoral; los miembros de la
superfamilia de TNF incluyen las citocinas: TNF (TNF-alfa) , LT
(linfotoxina-alfa, TNF-beta) , ligando de CD40, Apo2L (TRAIL) ,
ligando de Fas y ligando de osteoprotegerina (OPG) ; cd00184"
/db_xref="CDD:29146"
Site order (61, 106, 108, 166, 171, 198, 202)
/site_type="otro"
/note="interfaz de trímero"
/db_xref="CDD:29146"
Site order (79..80, 85, 127, 134, 139)
/site_type="otro"
/note="sitios de unión a receptor"
/db_xref="CDD:29146"
CDS 1..204
/gene="TNFSF14"
/coded_by="NM_172014.1:383..997"
/note= "la isoforma 2 se codifica por la variante de transcrito
2"
/db_xref="GeneID:8740"
/db_xref="HGNC:1193 0"
/db_xref="MIM:604520"
ORIGEN
LOCUS AAB97877 234 aa lineal PR.
2. ENE-1998
DEFINICIÓN Proteina CD30L [Homo sapiens].
REFERENCIA AAB97877
VERSIÓN AAB97877.1 GI:2815515
FUENTE DB locus HSCD30L1 referencia AF006381.1
locus HSCD30L2 referencia AF006382.1
locus HSCD30L3 referencia AF006383.1
locus HSCD30L4 referencia AF006384.1
PALABRAS CLAVE .
FUENTE Homo sapiens (ser humano)
ORGANISMO Homo sapiens
Eukar y ota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini,
Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCIA 1 (restos 1 a 234)
AUTORES Croager.E.J. y Abraham, L.J.
TÍTULO Characterisation of the human CD30 ligand gene structure
PUBLICACIÓN Biochim. Biophys. Acta 1353 (3) .
23. 235 (1997)
PUBMED 9349718
REFERENCIA 2 (restos 1 a 234)
AUTORES Croager.E.J. y Abraham, L.J.
TÍTULO Prsentación Directa
PUBLICACIÓN Presentado (02-JUN-1997) Biochemistr y , University of Western
Australia, Entrance 2, Hackett Drive, Nedlands, Western Australia
6907, Australia
COMENTARIO Procedimiento: traducción conceptual.
ELEMENTOS Localización/Calificadores
source 1. .234
/organism="Homo sapiens"
/db_xref="taxón:9606"n
/chromosome="9"
/map="9q33"
Protein 1 234
/product="proteína CD30L"
Region 104..220
/region_name="TNF"
/note="Factor de Necrosis tumoral; los miembros de la superfamilia de
/db_xref="CDD:29146"
Site order (107, 140, 142, 190, 195)
/site_type="otro"
/note="interfaz de trímero"
/db_xref=-CDD:29146"
Site order (116..117, 157, 164, 169)
/site_type="otro"
/note="sitio de unión a receptor"
/db_xref="CDD:29146"
CDS 1..234
/gene="CD30L"
/coded_by="join (AF006381.1:1599..1793, AF006382.1:188..230,
AF006383.1:534..605, AF006384.1:347. .741) "
DEFINICIÓN Precursor de antígeno de activación de linfocitos T CD86 (antígeno B7.2 de activación) (contrarreceptor de CTLA-4 B7.2) (B70) (FUN-1) (BU63) .
REFERENCIA P42081 VERSIÓN P42081.1 GI:1168851 FUENTE DB swissprot: locus CD86_HUMAN, referencia P42081;
clase: convencional. referencias extra:AONOPO, Q13655, Q6FHB1, Q6GTS4, Q7M4L5 creado: 1 de noviembre de 1995. secuencia actualizada: 1 de noviembre de 1995. anotación actualizada: 15 de enero de 2008. xrefs: U04343.1, AAB03814.1, L25259.1, AAA58389.1, CR541844.1, CAG46642.1, EF064748.1, ABK41931.1, BC040261.1, AAH40261.1, U17722.1, AAA86473.1, U17717.1, U17718.1, U17719.1, U17721.1, A48754, JC7605, 1I85, 1NCN xrefs (base de datos no de secuencia) : UniGener: Hs.171182, PDBsum:lI85, PDBsum:lNCN, IntAct:P42081, Ensembl:ENSG00000114013, KEGG:hsa:942, H-InvDB:HIX0024331, HGNC:1705, HPA:CAB004319, MIM:601020, PharmGKB:PA26243, LinkHub:P42081, ArrayExpress:P42081, CleanEx:HS_CD86, GermOnline:ENSG00000114013, GO:0016021, GO:0005886, GO:0015026, GO:0005515, GO:0016563, GO:0007267, GO:0008284, GO:0045086, GO:0045404, GO:0043017, GO:0045630, GO:0045941, InterPro:IPR015651, InterPro:IPR007110, InterPro:IPR013783, InterPro:IPR003006, InterPro:IPR013106, InterPro:IPR003596, Gene3D:G3DSA:2.60.40.10, PANTHER:PTHR13712:SF45, Pfam:PF07686, SMART:SM00406, PROSITE:PS50835, PROSITE:PS00290
PALABRAS CLAVE Estructura en 3D; corte y empalme alternativo; glicoproteína; interacción huésped-virus; dominio de inmunoglobulina; membrana; polimorfismo; receptor; señal; transmembrana; conjugación de Ubl.
FUENTE Homo sapiens (ser humano)
ORGANISMO Homo sapiens Eukar y ota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCIA 1 (restos 1 a 329) AUTORES Azuma, M., Ito, D., Yagita, H., Okumura, K., Phillips, J.H., Lanier, L.L.
y Somoza, C. TÍTULO B70 antigen is a second ligand for CTLA-4 and CD28 PUBLICACIÓN Nature 366 (6450) .
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TÍTULO Presentación directa
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TÍTULO Presentación directa
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CONSRTM MGC Project Team
TÍTULO The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)
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T cell proliferation, cytokine production, and generation of CTL PUBLICACIÓN J. Immunol. 154 (1) .
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activated B lymphocytes is the CD86 differentiation antigen PUBLICACIÓN Blood 84 (5) , 1402-1407 (1994) PUBMED 7520767 OBSERVACIÓN IDENTIFICACIÓN COMO CD86. REFERENCIA 10 (restos 1 a 329) AUTORES Goto.E., Ishido, S., Sato.Y., Ohgimoto, S., Ohgimoto.K.,
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herpesvirus proteins MIR1 and MIR2 and has similar activity PUBLICACIÓN J. Biol. Chem. 278 (17) , 14657-14668 (2003) PUBMED 12582153 OBSERVACIÓN UBIQUITINACIÓN E INTERACCIÓN CON MARCH8. COMENTARIO En o antes de 27 de febrero de 2007 esta versión de secuencia remplazó
gi:74721835, gi:74757610, gi:627415, gi:25392201. [FUNCIÓN] Receptor implicado en la señal coestimuladora esencial para proliferación de linfocitos T y producción de interleucina 2, mediante unión de CD28 o CTLA-4. Puede desempeñar un papel crítico en los acontecimientos tempranos de la activación de linfocitos T y coestimulación de linfocitos T vírgenes, tales como decidir entre inmunidad y anergia que se realiza por linfocitos T en un periodo de 24 horas después de la activación. La isoforma 2 interfiere con la formación de grupos de CD86 y actúa de este modo como un regulador negativo de la activación de linfocitos T. [SUBUNIDAD] Interacciona con MARCH8. Interacciona con la proteína MIR2 de herpesvirus humano 8 (Probable) . [LOCALIZACIÓN SUBCELULAR] Membrana; proteína de membrana de tipo I de paso único. [PRODUCTOS ALTERNATIVOS] Acontecimiento=corte y empalme alternativo; isoformas nombradas=3; nombre=l; IsoId=P42081-l; secuencia=presentada; nombre=2; IsoId=P42081-3; secuencia=VSP_023124; nombre=3; sinónimos=CD86 deltaEC; IsoId=P42081-2; secuencia=VSP_009125. [ESPECIFICIDAD TISULAR] Expresado por linfocitos B activados y monocitos. [PTM] Poliubiquitinizado; que se promueve por MARCH8 y da como resultado endocitosis y degradación lisosomal.
[SIMILITUD] Contiene un dominio de tipo C2 similar a Ig (de tipo inmunoglobulina) [SIMILITUD] Contiene un dominio de tipo V similiar a Ig (de tipo inmunoglobulina) [RECURSO WEB] Nombre=Wikipedia; Nota=entrada CD86; URL='http://en.wikipedia.org/wiki/CD86'.
ELEMENTOS Localización/Calificadores
source 1..329 /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxón:9606"
gene 1..329 /gene="CD86" /note="sinónimo: CD28LG2"
Protein 1. .329 /gene="CD86" /product="precursor de antígeno de activación de linfocitos T CD86 "
Region 1..23 /gene="CD86" /region_name="Señal" /inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles adicionales" /note="Potencial."
Region 1..6 /gene="CD86" /region_name="Variante de corte y empalme" /experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles adicionales" /note="Ausente (en isoforma 2) . /FTId=VSP_023124."
Region 22..234 /gene="CD86" /region_name="Variante de corte y empalme" /experiment=" pruebas experimentales, no se registraron detalles adicionales" /note="Ausente (en isoforma 3) . /FTId=VSP_009125."
Region 24..329 /gene="CD86" /region_name="Cadena madura" /experiment=" pruebas experimentales, no se registraron detalles adicionales " /note="Antígeno de activación de linfocitos T CD86". /FTId=PRO_0000014550."
Region 24..247 /gene="CD86" /region_name="Dominio topológico" /inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles adicionales" /note="Extracelular (Potencial) ."
Region 27. .31 /gene="CD86" /region_name="Región de cadena beta" /experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles adicionales"
Region 27 /gene="CD86" /region_name="Conflicto" /experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles adicionales" /note="K -> E (en Ref. 7; AAA86473) ."
Region 33..131 /gene="CD86"
/region_name="Dominio"
/experiment= "pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Tipo V similar a Ig"
Site 33
/gene="CD86"
/site_type="glicosilación"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Ligado a N (GlcNAc...) (Potencial) ."
Region 35..110
/gene="CD86"
/region_name="IGv"
/note="inmunoglobulina de tipo V; smart00406"
/db_xref="CDD:47715"
Region 36..38
/gene="CD86"
/region_name="Región de cadena beta"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
Bond bond (40, 110)
/gene="CD86"
/bond_type="disulfuro"
/inference="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Potencial."
Site 47
/gene="CD86"
/site_type="glicosilación"
/inference="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="ligado a N (GlcNAc...) (Potencial) ."
Region 54..58
/gene="CD86"
/region_name="región de cadena beta"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
Region 64. .69
/gene="CD86"
/region_name="Región de cadena beta"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
Region 80..84
/gene="CD86"
/region_name="Vuelta con enlace de hidrógeno"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
Region 85..88
/genescD86"
/region_name="Región de cadena beta"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
Region 90..92
/genescD86"
/region_name="Vuelta con enlace de hidrógeno"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
Region 95..97
/gene="CD86"
/region_name="Región de cadena beta"
/experiment= "pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
Region 106..113
/gene="CD86"
/region_name="Región de cadena beta"
/experiment=pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales
Region 122. .133
/gene="CD86"
/region_name="Región de cadena beta"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales
Site 135
/gene="CD86"
/site_type="glicosilación"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles
adicionales
/note="Ligado a N (GlcNAc...) (Potencial) ."
Site 146
/gene="CD86"
/site_type="glicosilación"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles
adicionales
/note="Ligado a N (GlcNAc...) (Potencial) ."
Region 150..225
/gene="CD86"
/region_name="Dominio"
/experiment=pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Tipo C2 similar a Ig."
Site 154
/gene="CD86"
/site_type="glicosilación"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Ligado a N (GlcNAc...) (Potencial) ."
Bond bond (157, 218)
/gene="CD86"
/bond_type="disulfuro"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Potencial."
Region 170
/gene="CD86"
/region_name="Variante"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="S -> N (en dbSNP:rs9282642) . /FTId=VAR_021916. "
Site 177
/genes="D86"
/site_type="glicosilación"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Ligado a N (GlcNAc...) (Potencial) ."
Site 192
/gene="CD86"
/site_type="glicosilación"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles
adicionales"
/note="Ligado a N (GlcNAc...) (Potencial) ."
Site 213
/gene=nCD86"
/site_type="glicosilación" /inference="pruebas no experimentales, no se registraron
detalles adicionales"
/note="Ligado a N (GlcNAc...) (Potencial) ."
Region 248..268
/gene="CD86" /region_name="Región transmembrana"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles adicionales"
/note="Potencial."
Reqion 269..329
/gene="CD86" /region_name="Dominio topológico"
/inference="pruebas no experimentales, no se registraron detalles adicionales"
/note="Citoplásmico (Potential) ."
Reqion 310
/gene="CD86" /region_name="Variante"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron
detalles adicionales"
/note="A -> T (en dbSNP:rsll29055) . /FTId=VAR_014650."
Region 323
/gene="CD86" /region_name="Variante"
/experiment="pruebas experimentales, no se registraron detalles adicionales"
/note="D -> N (en dbSNP:rs9282648) . /FTId=VAR_021917."
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