Acido nucleico y proteina correspondiente denominada 158P1D7 util para el tratamiento y la detección del cancer de vejiga y otros canceres.

Una proteína para uso en el tratamiento de cáncer de vejiga, en la que la proteína provoca una respuesta inmunecontra una célula de cáncer de vejiga que expresa una proteína,

en la que la proteína comprende una secuenciaidéntica a la secuencia de aminoácidos de SEC ID Nº 657, en la que el medicamento se proporciona al sistemainmune del mamífero y por medio de lo cual se provoca con el que tiene lugar la respuesta inmune contra dichacélula de cáncer de vejiga que expresa la proteína.

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E07101693.

Solicitante: AGENSYS, INC..

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1701 COLORADO AVENUE SANTA MONICA, CA 90404 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: JAKOBOVITS, AYA, CHALLITA-EID, PIA, M., HUBERT, RENE, S., RAITANO, ARTHUR, B., AFAR, DANIEL, E., H., FARIS, MARY, LEVIN,ELANA.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • A61K38/00 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA.A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE.A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00).
  • A61K39/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53).
  • C07K14/47 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
  • C12N15/12 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Genes que codifican proteínas animales.
  • C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

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Fragmento de la descripción:

Ácido Nucleico y Proteína Correspondiente Denominada 158P1D7 útil para el Tratamiento y la Detección del Cáncer de Vejiga y otros Cánceres

Campo de la Invención

La invención descrita en este documento se refiere a una secuencia de ácido nucleico nueva y a su proteína codificada, designada como 158P1D7, y a procedimientos de diagnóstico y terapéuticos y composiciones útiles en el tratamiento de diversos cánceres que expresan 158P1D7.

Antecedentes de la invención El cáncer es la segunda causa principal de muerte humana después de la enfermedad coronaria. En todo el mundo, millones de personas mueren de cáncer cada año. Sólo en Estados Unidos, según la Sociedad Americana del Cáncer, el cáncer provoca la muerte de más de medio millón de personas anualmente, con más de 1, 2 millones de nuevos casos diagnosticados al año. Si bien las muertes por cardiopatía han ido disminuyendo notablemente, en general las que se deben al cáncer están aumentando. A principios del próximo siglo se prevé que el cáncer sea la causa de muerte más importante.

De todos los nuevos casos de cáncer en Estados Unidos, el cáncer de vejiga representa aproximadamente un 5 por ciento en los hombres (quinto neoplasma más común) y el 3 por ciento en las mujeres (octavo neoplasma más común) . La incidencia va aumentando lentamente, a la vez que envejece la población. En 1998, se estimaron 54.500 casos, 39.500 en hombres y 15.000 en mujeres. La incidencia según la edad en Estados Unidos es del 32 cada 100.000 para los hombres y del 8 cada 100.000 en las mujeres. La proporción histórica varón/mujer de 3:1 puede estar disminuyendo debido a los hábitos de fumar en las mujeres. Se estimaron 11.000 muertes de cáncer de vejiga en 1998 (7.800 en hombres y 3.900 en mujeres) . La incidencia del cáncer de vejiga y la mortalidad aumentan en gran medida con la edad y representarán un problema creciente a medida que la población vaya envejeciendo.

Los cánceres de vejiga comprenden un grupo heterogéneo de enfermedades. Los principales determinantes del control de la enfermedad y la supervivencia son la histología y la amplitud de la enfermedad. Los códigos principales para estos factores incluyen la clasificación de la patología, la Clasificación Internacional de Enfermedades-Oncología (ICDO) y la clasificación por etapas de la amplitud de la enfermedad, la clasificación TNM (Tabla XXI) . Para una discusión general sobre los cánceres de vejiga y otros cánceres urogenitales, véase por ejemplo, Volgelzang y col., Eds. Comprehensive Textbook of Genitourinar y Oncology, (Williams & Wilkins, Baltimore 1996) , en particular páginas 295-556.

Se ha informado de tres tipos principales de tumores en la vejiga. El tipo más común de cáncer de vejiga es el carcinoma de célula transicional (TCC) ; esto explica aproximadamente el 90% de todos los cánceres de vejiga. La segunda forma de cáncer de vejiga es el carcinoma de célula escamosa, que explica aproximadamente el 8% de todos los cánceres de vejiga en los cuales la esquistosomiasis no es endémica, y aproximadamente el 75% de los carcinomas de vejiga en los cuales la esquistosomiasis es endémica. Los carcinomas de célula escamosa tienden a invadir las capas más profundas de la vejiga. El tercer tipo de cáncer de vejiga es el adenocarcinoma, que explica el 1%-2% de los cánceres de vejiga; éstas son las principales formas invasivas del cáncer.

Normalmente el cáncer de vejiga se detecta y diagnostica por citoscopia y citología urinaria. Sin embargo, estos procedimientos presentan poca sensibilidad. Procedimientos de detección relativamente más fiables actualmente utilizados en clínica incluyen la prueba del antígeno tumoral vesical (BTA) stat, el ensayo de la proteína NMP22, la expresión de la telomerasa y el ensayo en orina de ácido hialurónico e hialuronidasa (HA-HAasa) . La ventaja de utilizar estos marcadores en el diagnóstico del cáncer de vejiga es su relativa alta sensibilidad en las etapas tumorales tempranas en comparación con la citología estándar.

Por ejemplo, la prueba BTA stat tiene una sensibilidad del 60-80% y una especificidad del 50-70% para el cáncer de vejiga, mientras que la prueba de orina de HA-HAasa presenta una sensibilidad del 90-92% y una especificidad del 80-84% para el cáncer de vejiga (J Urol 2001 165:1067) . En general, la sensibilidad para los tumores en etapa T era del 81% para la proteína de la matriz nuclear (NMP22) , del 70% para la telomerasa, del 32% para el antígeno tumoral vesical (BTA) y del 26% para la citología (J Urol 2001 166:470; J Urol 1999, 161:810) . Aunque el ensayo de repetición telomérica que mide la actividad de la telomerasa sea relativamente sensible, la inestabilidad de la telomerasa en orina hace que este procedimiento de detección sea poco fiable actualmente.

La mayoría de los cánceres de vejiga reaparecen en la vejiga. Generalmente, el cáncer de vejiga se trata mediante una combinación de resección transuretral de la vejiga (TUR) y quimioterapia o inmunoterapia intravesical. La naturaleza multifocal y recurrente del cáncer de vejiga señala las limitaciones de la TUR. La mayoría de los cánceres invasivos de músculo no se curan por TUR sólo. La cistectomía radical y la diversión urinaria es el medio más eficaz para eliminar el cáncer, pero tiene un impacto innegable sobre la función urinaria y sexual.

El bacilo de Calmette-Guerin (BCG) intravesical es un agente inmunoterapéutico común y eficaz utilizado en el tratamiento del cáncer de vejiga. El BCG se utiliza también como agente profiláctico para impedir la reaparición del

cáncer de vejiga. Sin embargo, el 30% de los pacientes no responden a la terapia con BCG y siguen desarrollando la enfermedad invasiva y metastática (Catalona y col., J Urol 1987, 137:220-224) . Con frecuencia se observan efectos secundarios relacionados con el BCG, tales como cistitis inducidas por el medicamento, riesgo de infección bacteriana y hematuria, entre otros. Se han utilizado otras inmunoterapias alternativas para el tratamiento del cáncer de vejiga, por ejemplo KLH (Flamm y col. Urologe 1994; 33:138-143) , interferones (Bazarbashi y col., J Surg Oncol. 2000; 74:181-4) y células dendríticas cargadas con el péptido MAGE-3 (Nishiyama y col., Clin Cancer Res 2001; 7:23-31) . Todos estos enfoques siguen siendo experimentales (Zlotta y col., Eur Urol 2000; 37 Suppl 3:10-15) . Sigue existiendo una necesidad notable de modalidades de diagnóstico y tratamiento que sean provechosas para los pacientes de cáncer de vejiga. Además, desde un punto de vista mundial, varios cánceres destacan como asesinos principales. En particular, los carcinomas de pulmón, próstata, mama, colon, páncreas y ovario son las principales causas de muerte por cáncer. Estos y virtualmente todos los demás carcinomas comparten una característica letal común. Con muy pocas excepciones, la enfermedad metastática procedente de un carcinoma es fatal. Además, incluso en aquellos pacientes con cáncer que sobreviven inicialmente a sus cánceres primarios, sus vidas quedan alteradas drásticamente. Muchos pacientes de cáncer experimentan una fuerte ansiedad reforzada por ser conscientes de la posibilidad de reaparición o fallo del tratamiento. Muchos pacientes de cáncer experimentan una debilidad física después del tratamiento. Además, muchos pacientes de cáncer sufren una reaparición del cáncer.

El cáncer de próstata es el cuarto cáncer predominante en los hombres en todo el mundo. En América del Norte y Europa del Norte, es con diferencia el cáncer más común en los varones y es la segunda causa principal de muerte por cáncer en los hombres. Sólo en Estados Unidos más de 30.000 hombres mueren anualmente de esta enfermedad, sólo superada por el cáncer de pulmón. A pesar de la magnitud de estas cifras, sigue sin existir tratamiento eficaz alguno para el cáncer metastático de próstata. La prostatectomía quirúrgica, la terapia de radiación, la terapia de ablación hormonal, la castración quirúrgica y la quimioterapia siguen siendo las principales modalidades de tratamiento. Desafortunadamente, estos tratamientos son ineficaces para muchos y a menudo se asocian con consecuencias no deseables.

En cuanto al diagnóstico, la falta de un marcador tumoral prostático que pueda detectar con precisión tumores en la etapa temprana localizados sigue siendo una limitación notable en el diagnóstico y tratamiento de esta enfermedad. Aunque el ensayo del antígeno específico de la próstata (PSA) en suero haya sido una herramienta muy útil, su especificidad y utilidad general, sin embargo, en gemeral se consideran como carentes en varios aspectos importantes. Aunque los marcadores previamente identificados tales como PSA,... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Una proteína para uso en el tratamiento de cáncer de vejiga, en la que la proteína provoca una respuesta inmune contra una célula de cáncer de vejiga que expresa una proteína, en la que la proteína comprende una secuencia idéntica a la secuencia de aminoácidos de SEC ID Nº 657, en la que el medicamento se proporciona al sistema inmune del mamífero y por medio de lo cual se provoca con el que tiene lugar la respuesta inmune contra dicha célula de cáncer de vejiga que expresa la proteína.

2. La proteína para su uso en el tratamiento de cáncer de vejiga de acuerdo con la reivindicación 1, en la que el medicamento expone el sistema inmune del mamífero a la proteína.

3. La proteína para su uso en el tratamiento de cáncer de vejiga de acuerdo con la reivindicación 2, en el que la

respuesta inmune comprende la célula que presenta el antígeno que presenta un antígeno derivado de la secuencia de aminoácidos idéntica a la secuencia de SEC ID Nº: 657 para generar una respuesta inmune humoral.

4. La proteína para su uso en el tratamiento de cáncer de vejiga de acuerdo con la reivindicación 2, en la que la respuesta inmune comprende la célula que presenta antígeno que presenta un antígeno derivado de la secuencia de aminoácidos que es idéntica a la secuencia de SEC ID Nº: 657 para generar una respuesta inmune mediada por la célula.

5. Una composición inmunogénica para su uso en el tratamiento de cáncer de vejiga provocando respuesta inmune contra una célula de cáncer de vejiga que comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable y una proteína o ácido nucleico que codifica la proteína, en la que la proteína comprende la secuencia de aminoácidos de SEC ID Nº: 657 y se expresa por dicha célula de cáncer de vejiga, en la que la respuesta inmune es efectiva para inhibir el

crecimiento de células cancerígenas.

Figura 1. Secuencia 15BP1D7 SSH (SEQ ID NO:655)

Figura 2. Clon de cDNA 15BP1D7 TurboScript3PX Y marco de lectura abierto (ORF)

Figura 3. Secuencia de aminoacidos 15BP1D7

Figura 4. Homologia BLAST de aminoacidos de 15BP1D7 con la proteina hipotetica FLJ22774

Identidades = 798/798 (100%)

Figura 5a: Alineación de 15BP1D7 con FLJ22774 humana, CLON KAIA1575. [Homo sapiens]

Identidades = 405/415 (97%) , Positivas = 405/415 (97%)

Figura 5b: Alineación de la proteina 15BP1D7 con una proteina humana similar a IGFALS

Identidades = 316/864 (36%) , Positivas = 459/864 (52%)

Figura 7. Expresión de 15BP1D7 en Tejidos Sanos

Corazón1. 1. Bazo Cerebro2. 2. Timo Placenta3. 3. Próstata Pulmón4. 4. Testículo Hígado5. 5. Ovario Músculo Esquelético 6. 6. Intestino Delgado Riñón7. 7. Colon Páncreas8. 8. Leucocitos Figura BA. Expresión de 15BP1D7 en Especimenes de Pacientes de Cancer de Vejiga

Figura BB. Expresión de 15BP1D7 en Especimenes de Pacientes de Cancer de Vejiga

Figura 11. Perfil de hidrofilia de 15BP1D7 (Hopp T.P., Woods K.R., 19B1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 7B:3B24-3B2B)

Figura 12. Perfil de hidropatia de 15BP1D7 (KYte J., Doolittle R. F., 19B2, J. Mol. Biol. 157:105-132)

Figura 14. Perfil de Flexibilidad Media de 15BP1D7 (Bhaskaran R., PonnuswamY P. K., 19BB. Int. J. Pept. Protein Res. 32:242-255)


 

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