Códigos de barras de secuencia combinatoria para selección de alto rendimiento.

Método para identificar el origen de muestra de ADN de muestra ligado a un adaptador y/o amplificado comprendiendo las etapas de:



a) proporcionar un primer y un segundo identificador de secuencias de nucleótidos, donde cada identificador de secuencia de nucleótidos es una secuencia de nucleótidos de al menos un nucleótido;

b) proporcionar adaptadores y/o cebadores de amplificación, donde al menos un primer adaptador o cebador de amplificación comprende el primer identificador de secuencia de nucleótidos y un segundo adaptador o cebador de amplificación comprende el segundo identificador de secuencia de nucleótidos, y donde opcionalmente se proporcionan otros adaptadores o cebadores de amplificación que comprenden otro identificador de secuencias de nucleótidos;

c) proporcionar una pluralidad de ADNs de muestra;

d) realizar reacciones de ligamiento y/o de amplificación en los ADNs de muestra utilizando los adaptadores y/o cebadores de amplificación, para proporcionar modelos de ADN amplificado y/o ligado a un adaptador preparados para secuenciación de alto rendimiento, donde un modelo monocatenario preparado de ADN comprende, además de una secuencia capturada y/o amplificada a partir del ADN de muestra, una combinación única del primer y el segundo identificador de secuencia de nucleótidos y un primer y un segundo sitio de unión al cebador de secuenciación, y donde el primer sitio de unión al cebador de secuenciación está localizado 3' del primer identificador de secuencia de nucleótidos y el segundo sitio de unión al cebador de secuenciación está localizado 3' del segundo identificador de secuencia de nucleótidos;

e) determinar al menos la secuencia del primer y el segundo identificador de secuencia de nucleótidos, donde la primera secuencia de identificador de secuencias de nucleótidos se determina en una primera reacción de secuenciación de alto rendimiento utilizando un primer cebador de secuenciación que hibrida con el primer sitio de unión de cebador de secuenciación y la segunda secuencia de identificador de secuencia de nucleótidos se determina en una segunda reacción de secuenciación de alto rendimiento utilizando un segundo cebador de secuenciación que hibrida con el segundo sitio de unión de cebador de secuenciación y

f) determinar, basándose en la combinación única del primer y segundo identificador de secuencia de nucleótidos, el origen de muestra de los ADNs de muestra amplificados y/o ligados a un adaptador.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/NL2011/050411.

Solicitante: KEYGENE N.V..

Nacionalidad solicitante: Países Bajos.

Dirección: P.O. BOX 216 6700 AE WAGENINGEN PAISES BAJOS.

Inventor/es: VAN EIJK,MICHAEL,JOSEPHUS,THERESIA, VAN DER POEL,Henricus,Johannes,Adam.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/6855 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › Adaptadores de ligadura.
  • C12Q1/6869 C12Q 1/00 […] › Métodos de secuenciación.

PDF original: ES-2697974_T3.pdf

 

Patentes similares o relacionadas:

Secuenciado pirofosforolítico usando nanoporos, del 15 de Julio de 2020, de ILLUMINA CAMBRIDGE LIMITED: Un método para determinar la secuencia de un ácido nucleico diana, que comprende (a) proporcionar un ácido nucleico diana; (b) poner en […]

Métodos y sistemas para detectar variantes genéticas, del 15 de Julio de 2020, de Guardant Health, Inc: Un método para determinar una medida cuantitativa indicativa de una serie de moléculas de ácido desoxirribonucleico (ADN) de cadena doble individuales en una muestra, […]

Métodos y sistemas para analizar datos de imagen, del 3 de Junio de 2020, de ILLUMINA, INC: Un método que comprende: (a) realizar una pluralidad de ciclos de una secuenciación por reacción de síntesis, de tal forma que, en cada ciclo, se genera una […]

Métodos de secuenciación, del 3 de Junio de 2020, de DNAE GROUP HOLDINGS LIMITED: Un método para secuenciar una cadena de polinucleótidos mediante secuenciación por síntesis, comprendiendo el método las etapas de: a) proporcionar […]

Imagen de 'Análisis de polinucleótidos basado en nanoporos con marcadores…'Análisis de polinucleótidos basado en nanoporos con marcadores fluorescentes que se inactivan mutuamente, del 29 de Abril de 2020, de Quantapore Inc: Un método para determinar una secuencia de nucleótidos de al menos un polinucleótido, comprendiendo el método las etapas de: translocar al menos un polinucleótido […]

Etiquetado múltiple de fragmentos largos de ADN, del 22 de Abril de 2020, de Complete Genomics, Inc: Un método para preparar ADN genómico para el análisis de secuencias, por reacción homogénea sin el uso de compartimentación física tal como nanogotas, comprendiendo el método: […]

Secuenciación de ácidos nucleicos usando marcas, del 8 de Abril de 2020, de Roche Sequencing Solutions, Inc: Un procedimiento para secuenciar una muestra de ácido nucleico con la ayuda de un nanoporo en una membrana contigua a un electrodo sensor, comprendiendo el procedimiento: […]

Método para evaluar un inmunorrepertorio, del 1 de Abril de 2020, de iRepertoire, Inc: Un método implementado por ordenador para analizar informaciones de secuencia semicuantitativas para identificar y caracterizar el inmunoperfil de un ser humano o animal […]

Utilizamos cookies para mejorar nuestros servicios y mostrarle publicidad relevante. Si continua navegando, consideramos que acepta su uso. Puede obtener más información aquí. .