Métodos para predecir el riesgo de metástasis en melanoma cutáneo.

Un método para predecir el riesgo de metástasis, supervivencia general,

o ambos, en un paciente con un tumor de melanoma cutáneo primario, el método comprende:

(a) medir los niveles de expresión génica de al menos ocho genes seleccionados del grupo que consiste en BAP1_varA, BAP1_varB, MGP, SPP1, CXCL14, CLCA2, S100A8, BTG1, SAP130, ARG1, KRT6B, GJA, ID2, EIF1B, S100A9, CRABP2, KRT14, ROBO1, RBM23, TACSTD2, DSC1, SPRR1B, TRIM29, AQP3, TYRP1, PPL, LTA4H, y CST6, en una muestra del tumor de melanoma cutáneo primario,

en donde los al menos ocho genes son:

(i) KRT6B, GJA1, AQP3, TRIM29, TYRP1, RBM23, MGP y EIF1B;

(ii) SAP130, ARG1, KRT6B, EIF1B, S100A9, KRT14, ROBO1, RBM23, TRIM29, AQP3, TYRP1 y CST6;

(iii) GJA1, PPL, ROBO1, MGP, TRIM29, AQP3, RBM23, TACSTD2, TYRP1, KRT6B, EIF1B y DSC1;

(iv) CRABP2, TYRP1, PPL, EIF1B, SPRR1B, DSC1, GJA1, AQP3, MGP, RBM23, CLCA2 y TRIM29;

(v) RBM23, TACSTD2, CRABP2, PPL, GJA1, SPP1, CXCL14, EIF1B, AQP3, MGP, LTA4H y KRT6B;

(vi) S100A8, TACSTD2, BAP1_varA, KRT6B, EIF1B, TRIM29, TYRP1, CST6, PPL, RBM23, AQP3, GJA1, SPRR1B y ARG1;

(vii) CST6, KRT6B, LTA4H, CLCA2, CRABP2, TRIM29, CXCL14, PPL, ARG1, RBM23, GJA1, AQP3, TYRP1, SPP1, DSC1, TACSTD2, EIF1B, y BAP1_varA;

(viii) EIF1B, S100A9, CRABP2, KRT14, ROBO1, RBM23, TRIM29, AQP3, TYRP1, PPL, LTA4H, y CST6;

(ix) BTG1, SAP130, ARG1, GJA1, EIF1B, CRABP2, ROBO1, RBM23, TACSTD2, DSC1, SPRR1B, AQP3, PPL, CST6; o

(x) BAP1_varA, BAP1_varB, MGP, SPP1, CXCL14, CLCA2, S100A8, BTG1, SAP130, ARG1, KRT6B, GJA, ID2, EIF1B, S100A9, CRABP2, KRT14, ROBO1, RBM23, TACSTD2, DSC1, SPRR1B, TRIM29, AQP3, TYRP1, PPL, LTA4H, y CST6;

en donde medir los niveles de expresión génica de los al menos ocho genes comprende la medición de un nivel de fluorescencia mediante un sistema de detección de secuencias después de una RT-PCR de los al menos ocho genes;

(b) determinar una firma del perfil de expresión génica del paciente que comprende los niveles de expresión génica de los al menos ocho genes;

(c) comparar la firma del perfil de expresión génica del paciente con un perfil de expresión génica de un conjunto de entrenamiento predictivo; y

(d) proporcionar una indicación como un riesgo de metástasis, supervivencia general o ambos para el tumor de melanoma cutáneo primario cuando el perfil de expresión génica del paciente indica que los niveles de expresión de al menos los ocho genes están alterados de una manera predictiva en comparación con el perfil de expresión génica del conjunto de entrenamiento predictivo.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/019326.

Solicitante: Castle Biosciences Inc.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 2014 San Miguel Drive Friendswood, TX 77546 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: COOK,ROBERT WILLIS, MAETZOLD,DEREK, OESCHLAGER,KRISTEN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/6886

PDF original: ES-2690584_T3.pdf

 

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