Métodos para la secuenciación estandarizada de ácidos nucleicos y usos de los mismos.

Un método para reducir el sobremuestreo de dianas de ácidos nucleicos naturales sobrerrepresentadas y el error de muestreo estocástico asociado con la secuenciación profunda,

que comprende:

i) preparar una mezcla que comprende un número conocido de moléculas de ácido nucleico de control interno de amplificación (IAC) competitivo correspondientes a cada diana de ácido nucleico natural; y

ii) mezclar la mezcla de IAC competitivos de la etapa i) con una muestra que contiene una diana de ácido nucleico natural antes de la preparación de una biblioteca para secuenciación, o antes de la secuenciación si no se requiere la preparación de la biblioteca;

en el que cada diana de ácido nucleico natural es similar a su respectivo IAC competitivo, con la excepción de uno o más cambios en la secuencia de ácido nucleico que son identificables con la secuenciación, y

en el que dichos cambios pueden incluir una o más deleciones, adiciones o alteraciones en el ordenamiento o la composición de los nucleótidos usados;

iii) evaluar la proporción de eventos de secuenciación entre la diana de ácido nucleico natural y su respectivo IAC competitivo, junto con el número conocido de moléculas de ácido nucleico de IAC competitivo introducidas en la muestra antes de la preparación de la biblioteca; y

iv) determinar cuantificablemente la cantidad original de cada diana de ácido nucleico natural en la muestra original antes de la preparación de la biblioteca y la secuenciación.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2013/071656.

Solicitante: THE UNIVERSITY OF TOLEDO.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 2801 Bancroft St., Ms 218 Toledo, OH 43606 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: WILLEY,JAMES C, BLOMQUIST,THOMAS, CRAWFORD,ERIN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • C40B20/04 C […] › C40 TECNOLOGIA COMBINATORIA.C40B QUIMICA COMBINATORIA; BIBLIOTECAS, p. ej. QUIMIOTECAS, BIBLIOTECAS IN SILICO. › C40B 20/00 Procedimientos especialmente adaptados para la identificación de miembros de una biblioteca. › Identificación de miembros de una biblioteca por medio de una etiqueta ("tag"), de un marcador ("label") o de otro identificador leíble o detectable, p.ej. procedimientos de decodificación.

PDF original: ES-2675618_T3.pdf

 

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