Métodos y combinaciones de sondas para detectar melanoma.

Un método para detectar la presencia de células de melanoma en una muestra biológica de un paciente,

el método comprendiendo:

a) poner en contacto la muestra con una combinación de dos, tres o cuatro sondas, en el que la combinación tiene una diferencia del valor ideal (DFI) de 0,29 o menos, en el que el DFI se calcula como [(1-sensibilidad)2 + (1-especificidad)2]1/2,

en el que la combinación de dos sondas comprende una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25 y una sonda enumeradora de cromosoma 10,

en el que la combinación de tres sondas se selecciona del grupo de:

(i) una sonda que se dirige a las subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6q23 y una sonda enumeradora de cromosoma 6;

(ii) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 1q31 y una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 17q25;

(iii) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 11q13 y una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 17q25;

(iv) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 17q25 y una sonda enumeradora de cromosoma 10;

(v) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 7q34 y una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 17q25;

(vi) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 20q13 y una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 17q25;

(vii) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 20q13 y una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 11q13;

(viii) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 20q13 y una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6q23;

(ix) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 7q34 y una sonda enumeradora de cromosoma 10; y

(x) una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 6p25, una sonda que se dirige a la subregión de cromosoma 20q13 y una sonda enumeradora de cromosoma 10,

y en el que la combinación de cuatro sondas comprende una sonda que se dirige e la subregión de cromosoma 6p25;

b) incubar cada sonda de la combinación con la muestra bajo condiciones en las que cada sonda enlaza selectivamente con una secuencia de polinucleótidos en su cromosoma o región cromosómica diana para formar un complejo de hibridación estable; y

c) detectar el patrón de hibridación de la combinación de sondas, en el que un patrón de hibridación que muestra al menos una ganancia o pérdida o desequilibrio en una región cromosómica dirigida por las sondas es indicativo de melanoma.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2006/034251.

Solicitante: THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA.

Inventor/es: MORRISON,Larry,E, BASTIAN,BORIS, JEWELL,SUSAN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2644045_T3.pdf

 

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