Evaluación de la susceptibilidad a antibióticos utilizando sondas para arn prerribosómico.

Un método para determinar si una muestra de bacterias es susceptible a un agente antibiótico,

comprendiendo el método los pasos de:

(a) (a) poner en contacto un espécimen obtenido a partir de la muestra con una sonda o un par de sondas de oligonucleótidos en ausencia del agente, en donde la sonda o el par de sondas hibrida específicamente a una secuencia diana sobre la longitud completa de la secuencia diana, en donde la secuencia diana comprende 25-35 nucleótidos contiguos de ARN ribosómico (rARN) bacteriano que abarca un sitio de empalme entre una cola de ARN prerribosómico (prARN) y ARN ribosómico maduro (mrARN)

(b) (b) poner en contacto un espécimen obtenido a partir de la muestra con la sonda o par de sondas en presencia del agente antibiótico;

(c) (c) detectar las cantidades relativas de hibridación de la sonda a la secuencia diana en los especímenes de (a) y (b);

(d) (d) identificar la muestra como susceptible al tratamiento con antibiótico si la cantidad de hibridación de la sonda a la secuencia diana en el paso (b) se reduce al menos un 80% con relación a la cantidad de hibridación de la sonda a la secuencia diana en el paso (a).

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2013/039574.

Solicitante: THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1111 FRANKLIN STREET OAKLAND, CA 94607-5200 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: HAAKE,DAVID, HALFORD,COLIN, BABBITT,JANE T, CHURCHILL,BERNARD M.

Fecha de Publicación: 20 de Diciembre de 2017.

Clasificación Internacional de Patentes:

C12N1/20 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 1/00 Microorganismos, p.ej. protozoos; Composiciones que los contienen (preparaciones de uso médico que contienen material de protozoos, bacterias o virus A61K 35/66, de algas A61K 36/02, de hongos A61K 36/06; preparación de composiciones de uso médico que contienen antígenos o anticuerpos bacterianos, p. ej. vacunas bacterianas, A61K 39/00 ); Procesos de cultivo o conservación de microorganismos, o de composiciones que los contienen; Procesos de preparación o aislamiento de una composición que contiene un microorganismo; Sus medios de cultivo. › Bacterias; Sus medios de cultivo.
C12N15/11 C12N […] › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Fragmentos de ADN o de ARN; sus formas modificadas (ADN o ARN no empleado en tecnología de recombinación C07H 21/00).
C12Q1/02 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen microorganismos vivos.
C12Q1/68 C12Q 1/00 […] › en los que intervienen ácidos nucleicos.
C12R1/19 C12 […] › C12R SISTEMA DE INDEXACION ASOCIADO A LAS SUBCLASES C12C - C12Q, RELATIVO A LOS MICROORGANISMOS. › C12R 1/00 Microorganismos. › Escherichia coli.
C12R1/385 C12R 1/00 […] › Pseudomonas aeruginosa.
C12R1/45 C12R 1/00 […] › Staphylococcus epidermidis.
C12R1/49 C12R 1/00 […] › Streptomyces aureus.
G01N33/573 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › para enzimas o isoenzimas.

PDF original: ES-2663955_T3.pdf

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