PROTEINA SOD1 TRUNCADA Y METODO DE DETECCION DE CELULAS TUMORALES.

Proteína SOD1 truncada y método de detección de células tumorales.

Proteína truncada derivada de la proteína superóxido dismutasa 1 (SOD1). La proteína SOD1 truncada tiene una masa molecular relativa (Mr) de entre 13,5 y 14,5 KDa. Asimismo, un método para detectar la proteína SOD1 truncada y para detectar células tumorales con un índice de proliferación (IP) menor de 0.8 teniendo en cuenta la relación entre el tiempo de proliferación de las células de la muestra respecto del tiempo de proliferación de células tumorales de referencia

Tipo: Patente de Invención. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: P200803728.

Solicitante: UNIVERSIDAD DE ZARAGOZA..

Nacionalidad solicitante: España.

Provincia: ZARAGOZA.

Inventor/es: ALAVA MARTINEZ DE CONTRASTA, MARIA ANGELES, IÑARREA LASHERAS,PEDRO, AGUILO ANENTO,JUAN IGNACIO, ITURRALDE NAVARRO,MARIA.

Fecha de Solicitud: 29 de Diciembre de 2008.

Fecha de Publicación: .

Fecha de Concesión: 31 de Mayo de 2011.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N9/02M

Clasificación PCT:

  • C12N9/02 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 9/00 Enzimas, p. ej. ligasas (6.); Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas. › Oxidorreductasas (1.), p. ej. luciferasa.
  • C12Q1/26 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que interviene una oxidorreductasa.
  • G01N33/574 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › para el cáncer.

PDF original: ES-2342252_A1.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Proteína SOD1 truncada y método de detección de células tumorales.

La presente invención se refiere a una proteína truncada derivada de la proteína superóxido dismutasa 1 (SOD1). La proteína SOD1 truncada tiene una masa molecular relativa (Mr) de entre 13,5 y 14,5 KDa. Asimismo, la presente invención también se refiere a un método para detectar la proteína SOD1 truncada y para detectar células tumorales con un índice de proliferación (IP) menor de 0.8 teniendo en cuenta la relación entre el tiempo de proliferación de las células de la muestra respecto del tiempo de proliferación de células tumorales de referencia.

Estado de la técnica anterior

Las enzimas "superóxido dismutasa" (SOD) constituyen una familia de metaloproteínas pertenecientes al grupo de antioxidantes celulares que tienen como función principal la eliminación de aniones superóxido generados en la célula como consecuencia de su metabolismo o como resultado de tratamientos celulares externos. La principal proteína SOD es la Cu,Zn-SOD o SOD1, tradicionalmente ubicada en el citosol, aunque recientemente se ha descrito su presencia en el espacio mitocondrial intermembranal, en el que parece desempeñar un papel importante en la depuración de los aniones superóxidos generados en la función respiratoria (Iñarrea et al. (2007). Biochem. J. 405: 173-9).

Las especies reactivas de oxígeno (ROS) se han considerado como moléculas citotóxicas perjudiciales durante décadas. Además, los ROS se han convertido en agentes capaces de promover la iniciación de tumores y su posterior progresión. La mayor parte de las células cancerosas parecen tener aumentados sus niveles de ROS en lo que respecta a las células normales. Se ha documentado que los procesos de metástasis están favorecidos en ausencia de Cu, ZnSOD (Tanaka et al (1997). Int J Cáncer 73(2): 187-192).

Previamente se ha descrito que la ausencia de SOD1 causa la esclerosis lateral amiotrófica (ELA) (Hiranoa et al. (2000). Biochemical and Biophysical Research Communications 276(1) 52-56) así como un aumento en la incidencia de procesos neoplásicos (Elchuri et al. (2005). Oncogene 24(3):367-380). Por otra parte, se ha descrito que las mutaciones o truncamientos en el gen SOD1 causan el 25% de los casos de ELA (Ghanashyam et al. (2005). Neurobiology of disease 21(1): 194-205). También se han relacionado niveles altos de SOD1 en suero con un aumento en el riesgo de padecer cáncer de estómago, tanto en etapas tempranas como avanzadas (Lin et al. (2002). Japanese journal of cáncer research 93(10): 1071-1075).

Reciben el nombre de linfoma un grupo de tipos de cáncer que comienzan en el sistema linfático. Se calcula que por cada 100.000 habitantes un 7,7 por ciento de hombres y un 5,2 por ciento de mujeres sufren linfoma, y se estima que la incidencia del linfoma aumenta entre un 3 y un 4% cada año. Los linfomas son una enfermedad clínicamente heterogénea, existiendo más de 35 tipos de linfomas que se dividen en dos categorías principales: linfoma de Hodgkin y todos los demás linfomas, denominados linfomas no Hodgkin.

A pesar de la incidencia del linfoma en los países industrializados, la etiología de la mayoría de los linfomas es desconocida, pudiendo existir diferentes rutas moleculares afectadas. En este sentido, se ha relacionado una menor expresión de SOD1 durante el proceso de diferenciación de células leucémicas (Hiroyuki Saito et al. (1989). FEBS Letters 249(2): 253-256).

En la actualidad, la mayoría de los tratamientos empleados son aproximaciones no específicas a cada tipo de linfoma o alteración molecular, sino tratamientos generales basados en la quimioterapia o la radioterapia. Hasta la fecha actual no se han descrito proteínas o biomarcadores que permitan discriminar entre diferentes actividades proliferativas de células tumorales.

Explicación de la invención

La presente invención se refiere a una proteína derivada de la proteína SOD1 de células T leucémicas de humanos, que presenta un truncamiento que consiste en la reducción de la masa molecular relativa (Mr) de entre 1,5 y 2,5 KDa respecto de la SOD1 completa. La proteína SOD1 truncada tiene una (Mr) de entre 13,5 y 14,5 KDa. La proteína truncada se localiza en células tumorales que tienen un tiempo de proliferación menor que las células tumorales de referencia. Estas células tumorales de referencia expresan una proteína SOD1 que tiene una Mr de 16 KDa. Asimismo, la presente invención también se refiere a un método para detectar la proteína SOD1 truncada y para detectar células tumorales con un índice de proliferación (IP) menor de 0.8 teniendo en cuenta la relación entre el tiempo de proliferación de las células de la muestra respecto del tiempo de proliferación de células tumorales de referencia (ver más adelante). El método de detección es reproducible, con alta sensibilidad, especificidad y sencillez.

Se entiende como tiempo de proliferación el tiempo necesario para la duplicación del número de células. Las células tumorales de referencia expresan una proteína SOD1 con Mr de 16 KDa y se seleccionan dependiendo del tipo de células tumorales que se deseen detectar. Así pues, si se desean detectar células tumorales leucémicas, las células tumorales de referencia han de ser células tumorales leucémicas del mismo tipo.

Según la IUBMB (International Union of Biochemistry and Molecular Biology), la enzima superoxido dismutasa, SOD (EC 15.1.1), es una oxidoreductasa (EC 1), que tiene como aceptor al ión superoxido O2• - (EC 1.15). El nombre sistemático de la proteína es el de superoxido oxidoreductasa. La SOD cataliza la reacción: 2 O2• - + 2 H+ = O2 + H2O2.

Los nombres de la superoxido dismutasa aceptados son: superoxido dismutasa, cobre-zinc superoxido dismutasa, Cu-Zn superoxido dismutasa, ferrisuperóxido dismutasa, superoxido dismutasa I, superoxido dismutasa II, SOD, Cu,Zn-SOD, Mn-SOD, Fe-SOD, SODF, SODS, SOD-1, SOD-2, SOD-3, SOD-4, hemocupreina, eritrocupreina, citocupreina, cupreina o hepatocupreina.

En humanos existen tres formas de superoxido dismutasa; SOD1 se encuentra en el citoplasma, SOD2 en las mitocondrias y SOD3 en el líquido extracelular. La primera es un dímero (consiste en dos subunidades), mientras que las otras son tetrámeros (cuatro subunidades). SOD1 y SOD3 contienen cobre y zinc, mientras que SOD2 tiene manganeso en su centro reactivo. El gen que codifica para la proteína SOD1 se encuentra localizado en el cromosoma 21 (21q22.1).

La enzima SOD1 también se conoce como superoxido dismutasa I, cobre-zinc superoxido dismutasa o Cu,Zn-SOD. La proteína SOD1 es un homodímero de masa molecular relativa (Mr) 32,5 kDa (se detectan las dos subunidades en una misma banda de alrededor de 16 KDa). Las dos subunidades están unidas por interacciones hidrofóbicas y electrostáticas. Los ligandos de cobre y zinc son cadenas laterales de histidina.

La proteína SOD1 de Homo sapiens tiene 154 aminoácidos, su número de acceso (Accesión number) es CAG46542 (para la secuencia aminoacídica). El número de acceso en el EMBL (European Molecular Biology Laboratory) es CR541742.1 (para su secuencia nucleotídica).

En la presente invención se detecta la proteína SOD1 en células Jurkat, una leucemia humana tipo T, y se compara con la proteína SOD1 en linfocitos de sangre periférica (PBL) obtenidos de un individuo sano. Además, se estudia la correspondiente expresión de isoformas de SOD1 en dos sublíneas celulares (Jhp y Jws), que se han seleccionado a partir de las células Jurkat parentales (células de referencia), mediante el cultivo continuado a altas densidades celulares (Jhp) y en un medio modificado carente de suero fetal bovino (SFB) (Jws). Estas sublíneas presentan un fenotipo tumoral con un IP menor de 0.8 (ver más adelante).

La detección de la proteína de la presente invención, asociada a una mayor capacidad de proliferación (respecto de células de referencia) y mayor resistencia a la apoptosis inducida por drogas, podría ser de interés en el futuro diagnóstico y tratamiento de este tipo de patologías de características tumorales más agresivas. Mediante la detección de proteínas de la presente invención en células tumorales se pueden identificar células tumorales con alta capacidad de proliferación que dan lugar a patologías tumorales... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Proteína que consiste en una isoforma de la proteína SOD1 con una masa molecular relativa (Mr) de entre 13,5 y 14,5 KDa.

2. Método de detección de la proteína según la reivindicación 1 que comprende:

a. Obtener una muestra biológica aislada,

b. obtener el extracto celular de la muestra biológica del apartado (a) y separar las proteínas en un medio de soporte capaz de retenerlas,

c. añadir anticuerpos anti-SOD1 (Ac1) unidos a un compuesto marcador, al soporte del apartado (b) y

d. detectar la proteína según la reivindicación 1 mediante la adición de un sustrato indicador cromogénico, fluorogénico y/o quimioluminiscente al producto obtenido en el apartado (c).

3. Método de detección de células tumorales con un índice de proliferación (IP) menor de 0.8, que incluye los apartados (a)-(d) según la reivindicación 2, y que además comprende:

e. comparar la Mr de la proteína del apartado (d) con la Mr de una proteína SOD1 de referencia y

f. asignar la diferencia de Mr del apartado (e) a la presencia de células tumorales con un IP menor de 0.8.

4. Método según cualquiera de las reivindicaciones 2 ó 3 donde las células de la muestra son células leucémicas.

5. Método según la reivindicación 4 donde las células leucémicas pertenecen a las sublíneas Jhp o Jws.

6. Método según cualquiera de las reivindicaciones 2 a 5 donde se añaden anticuerpos anti-Ac1 (Ac2) unidos a un compuesto marcador, a los anticuerpos Ac1 sin marcar del apartado (c).

7. Método según cualquiera de las reivindicaciones 2 a 6 donde además se incluye un paso de cultivo de las células presentes en la muestra biológica, previo a la obtención del extracto celular del apartado (b).

8. Uso de la proteína según la reivindicación 1 como biomarcador de células tumorales.

9. Uso de la proteína según la reivindicación 8, para la monitorización de la respuesta a un tratamiento de células tumorales con un IP de las células de la muestra respecto de células tumorales de referencia, menor de 0.8.


 

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