HUMAN TSC403 GENE AND HUMAN ING1L GENE.
Polinucleótido que tiene una secuencia nucleotídica que codifica la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID nº:
1 o una secuencia complementaria a la misma
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/JP1999/000419.
Solicitante: OTSUKA PHARMACEUTICAL CO., LTD..
Nacionalidad solicitante: Japón.
Dirección: 9, KANDATSUKASA-CHO 2-CHOME CHIYODA-KU, TOKYO 101-0048 JAPON.
Inventor/es: HORIE, MASATO, NAGATA, MASAMI, OZAKI,KOUICHI, SHIMADA,YOSHIKAZU,TANAKAHAITSU 201.
Fecha de Publicación: .
Fecha Solicitud PCT: 2 de Febrero de 1999.
Fecha Concesión Europea: 1 de Septiembre de 2010.
Clasificación PCT:
- C07K14/47 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
- C07K16/18 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra materiales animales o humanos.
- C12N15/12 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Genes que codifican proteínas animales.
- C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
Clasificación antigua:
Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Finlandia, Chipre.
Fragmento de la descripción:
Gen TSC403 humano.
Campo técnico
La invención se refiere a un gen de uso como un índice en la profilaxis, diagnóstico y terapia de enfermedades humanas, y más particularmente a un nuevo gen humano específico del pulmón que es homólogo a lamp-1 y 2 humana [glucoproteína de membrana lisosómica; Saito, O. et al., J. Biol. Chem., 261, 5700-5711 (1992); Sawada, R. et al., J. Biol. Chem., 268, 12615-12681 (1993); Sawada, R. et al., J. Biol. Chem., 269, 1425-1431 (1994)] y que se sospecha que actúa como oncogén.
La invención se refiere además a un nuevo gen humano que es análogo a los genes de rata, ratón, levadura, nemátodo, y ser humano conocidos y otros genes, y, a través del análisis de ADNc, cartografiado cromosómico y análisis funcional de su ADNc, se puede utilizar en el diagnóstico génico y para el desarrollo de nuevos fármacos terapéuticos.
Además, la invención se refiere a nuevas proteínas codificadas por dichos genes, y a anticuerpos específicos para ellas.
Antecedentes de la técnica
La información genética en organismos se acumula en conjuntos (ADN) de cuatro tipos de bases, a saber, A, C, G y T, en el núcleo celular, y esta información genética se conserva para el mantenimiento del linaje y ontogénesis. En un ser humano, se afirma que el número de tales bases es aproximadamente tres mil millones (3 x 109), y se estima que esta población incluye 50-100 mil genes. La información genética está implicada en el mantenimiento de fenómenos vitales a través de la creación de proteínas reguladoras, proteínas estructurales, enzimas, etc., a lo largo del flujo de transcripción de ARNm de genes (ADN) y la traducción subsiguiente en proteínas.
Generalmente se sabe que cualquier anormalidad del flujo anterior a partir de un gen en su proteína del producto de la traducción conduce a un error del sistema de mantenimiento de la vida, incluso de la proliferación y diferenciación de células, y puede ser la causa de diversas enfermedades. Los resultados de análisis génicos hechos hasta la fecha sugieren que los genes de diversos receptores, tales como la insulina, LDL y otros receptores, y aquellos de enzimas metabólicas asociadas con el crecimiento y diferenciación de células, tales como proteasa, ATPasa, superóxido dismutasa, etc., se consideran que son herramientas útiles para el desarrollo de fármacos.
Sin embargo, el análisis de genes humanos y el estudio de sus funciones y relaciones con diversas enfermedades todavía están en la etapa incipiente, y todavía queda mucho por conocer. Por lo tanto, el análisis de nuevos genes, las exploraciones analíticas en las funciones y relaciones con las enfermedades de tales genes, y los estudios para el establecimiento de diagnóstico génico que explotan los genes así analizados, y los estudios de la aplicación farmacéutica sobre tales genes son sujetos de inmenso interés para esta industria.
Mientras tanto, el carcinoma del páncreas es uno de los tumores malignos del sistema digestivo con el peor pronóstico, detentando el cuarto y quinto puesto en la lista de causas para la muerte relacionada por cáncer en Japón y países Occidentales, respectivamente (Poston, J. G., et al., Gut., 32, 800-812 (1991)). El objetivo más importante en la investigación sobre el cáncer es identificar cambios en los genes en la fase temprana de la oncogénesis. La identificación de tales cambios debería de conducir al desarrollo de herramientas genéticas para el diagnóstico temprano y nuevas modalidades terapéuticas para el tratamiento eficaz de esta enfermedad mortal.
La elucidación de los papeles fisiológicos de tales genes y la información resultante son importantes para la explicación de los mecanismos de la génesis y el comienzo de enfermedades neoplásicas, y se han demandado no sólo en el campo de la investigación científica fundamental, sino también desde el punto de vista de la caracterización y tratamiento de tumores malignos en el campo farmacéutico.
Descripción de la invención
De este modo, asumiendo que se proporciona un nuevo gen humano, se podría elucidar sus niveles de expresión en diversas células, así como su estructura y funciones, y, a través del análisis de los productos de la expresión del gen, sería factible la clarificación de la patología, diagnóstico y terapia de las enfermedades asociadas con el gen, tales como enfermedades hereditarias y cánceres. El objetivo de la invención consiste en proporcionar tales genes humanos nuevos.
Teniendo en cuenta el objetivo anterior, se ha investigado intensamente como se describe a continuación. De este modo, para empezar, se han sintetizado ADNc a partir de los ARNm extraídos de diversos tejidos humanos, tales como cerebro fetal humano, vaso sanguíneo adulto y placenta, se los clonó en vectores para construir librerías, se cultivaron células de Escherichia coli transformadas con cada librería en medio agar, se recogieron colonias transformantes al azar y se transfirieron a placas de microtitulación para preparar y registrar clones de E. coli que contienen diversos genes humanos. Después, cada uno de estos clones se cultivó, el ADN se extrajo y se purificó, y, usando como molde el ADNc así obtenido, se llevó a cabo una reacción de amplificación con terminación de cadena específica para dichas 4 bases mediante el método terminador de desoxi, y, usando un secuenciador automático de ADN, se determinó la secuencia de alrededor de 400 nucleótidos desde el extremo 5' del gen humano en cada clon registrado. Basándose en la información de la secuencia nucleotídica así obtenida en genes humanos, se exploraron nuevos genes de la familia similares a los genes conocidos de bacterias, levaduras, nemátodos, murinos, humanos y otros animales y plantas. La tecnología anterior para el análisis de ADNc se describe con detalle en el informe de Fujiwara et al. [Fujiwara, Tsutomu, Saibo Kogaku (Cell Engineering), 14, 645-654 (1995)].
Como resultado, entre los clones de ADNc recogidos arbitrariamente de la librería de ADNc de cerebro fetal humano, se encontró un clon que alberga un nuevo gen que codifica una secuencia de aminoácidos que tiene una elevada homología con p33ING1, que se considera que es una proteína que suprime el cáncer [GenBank A. C. nº AF001954, Garkavetsev, et al., Nature, Genet., 14, 415-420 (1996); Garkavetsev, et al, Mol. Cell. Biol., 17, 2014-2019 (1997); reescrito -GenBank A. C. nº AF044076].
Adicionalmente, con el fin de proporcionar dicha información demandada por la industria, en particular un gen que codifica una nueva proteína que tiene homología con el gen lamp-1 y con el gen lamp-2, se realizó una intensa exploración en los genes derivados de diversos tejidos humanos, y se tuvo éxito en aislar y caracterizar un nuevo gen específico del pulmón que satisface el fin anterior. Esta invención se ha desarrollado basándose en el hallazgo anterior.
De este modo, en primer lugar, la invención proporciona un gen que contiene una secuencia nucleotídica que codifica la secuencia de aminoácidos de SEC ID nº: 1 (en lo sucesivo denominada como gen TSC403), en particular aquel gen que es un gen humano.
Además, la invención proporciona una nueva proteína codificada por dicho gen TSC403 (en lo sucesivo denominada como proteína TSC403), y un anticuerpo que tiene una afinidad de unión por dicha proteína.
Además, la invención proporciona un gen TSC403 que es uno cualquiera de los siguientes polinucleótidos (a) y (b), particularmente aquel gen que es un gen humano.
La invención proporciona además un gen TSC403 que tiene la secuencia nucleotídica de SEC ID nº: 3.
La invención proporciona además sondas y cebadores oligonucleotídicos como se definen en las reivindicaciones.
Adicionalmente, se describe un gen humano (en lo sucesivo denominado como gen ING1L humano) que contiene una secuencia nucleotídica que codifica la secuencia de aminoácidos...
Reivindicaciones:
1. Polinucleótido que tiene una secuencia nucleotídica que codifica la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID nº: 1 o una secuencia complementaria a la misma.
2. Polinucleótido seleccionado de entre los siguientes (a) y (b):
3. Polinucleótido según la reivindicación 2, que tiene la secuencia nucleotídica mostrada en SEC ID nº: 3.
4. Método para el diagnóstico de cáncer, que comprende detectar la expresión del polinucleótido según las reivindicaciones 1 y 2 usando una sonda que tiene una secuencia que consiste en por lo menos 15 nucleótidos consecutivos en la secuencia nucleotídica mostrada en SEC ID nº: 2 o un cebador que tiene una secuencia que consiste en por lo menos 15 nucleótidos consecutivos en la secuencia nucleotídica mostrada en SEC ID nº: 2.
5. Método de diagnóstico según la reivindicación 4, en el que el cáncer es un miembro seleccionado de entre cáncer de la glándula mamaria, cáncer de la trompa uterina, cáncer del esófago, cáncer del colon, cáncer del recto, cáncer de la glándula tiroides, cáncer de la glándula parótida, cáncer de la uretra, cáncer del ovario y cáncer de páncreas.
6. Oligonucleótidos, sondas y cebadores que comprenden una secuencia que consiste en por lo menos 15 nucleótidos consecutivos en la secuencia nucleotídica mostrada en SEC ID nº: 2 o SEC ID nº: 3, adecuados para uso en un método tal como se describe en las reivindicaciones 4 y 5.
7. Kit de diagnóstico para el cáncer, que comprende una sonda que tiene una secuencia que consiste en por lo menos 15 nucleótidos consecutivos en la secuencia nucleotídica mostrada en SEC ID nº: 2, o un cebador que tiene una secuencia que consiste en por lo menos 15 nucleótidos consecutivos en la secuencia nucleotídica mostrada en SEC ID nº: 2, como componente esencial.
8. Proteína que tiene una secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID nº: 1.
9. Anticuerpo que tiene una afinidad de unión específica por la proteína definida en la reivindicación 8.
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