GENES EXPRESADOS DIFERENCIALMENTE EN CANCER PANCREATICO Y DISPLASIA.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US99/14036.
Solicitante: CHIRON CORPORATION.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 4560 HORTON STREET,EMERYVILLE, CALIFORNIA 9460.
Inventor/es: KENNEDY,GIULIA,C.
Fecha de Publicación: .
Fecha Concesión Europea: 7 de Abril de 2010.
Clasificación Internacional de Patentes:
- C07K14/47 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
Clasificación PCT:
- C07K14/47 C07K 14/00 […] › de mamíferos.
- C07K16/18 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra materiales animales o humanos.
- C12N15/11 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Fragmentos de ADN o de ARN; sus formas modificadas (ADN o ARN no empleado en tecnología de recombinación C07H 21/00).
- C12N15/12 C12N 15/00 […] › Genes que codifican proteínas animales.
- C12N9/00 C12N […] › Enzimas, p. ej. ligasas (6.); Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas.
- C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
- G01N33/53 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
Clasificación antigua:
- C07K14/47 C07K 14/00 […] › de mamíferos.
- C07K16/18 C07K 16/00 […] › contra materiales animales o humanos.
- C12N15/11 C12N 15/00 […] › Fragmentos de ADN o de ARN; sus formas modificadas (ADN o ARN no empleado en tecnología de recombinación C07H 21/00).
- C12N15/12 C12N 15/00 […] › Genes que codifican proteínas animales.
- C12N9/00 C12N […] › Enzimas, p. ej. ligasas (6.); Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas.
- C12Q1/68 C12Q 1/00 […] › en los que intervienen ácidos nucleicos.
- G01N33/53 G01N 33/00 […] › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
Fragmento de la descripción:
Genes expresados diferencialmente en cáncer pancreático y displasia.
Área técnica de la invención
La invención se refiere al área del diagnóstico y tratamiento del cáncer y la displasia pancreática. Más específicamente, se refiere a polinucleótidos que se regulan de manera diferencial en el cáncer y la displasia pancreática.
Antecedentes de la invención
El cáncer pancreático es la quinta causa principal de muerte por cáncer en los Estados Unidos. Según la Sociedad Americana del Cáncer, aproximadamente 28.000 personas morirán de cáncer pancreático en los Estados Unidos en 1998. En ciertas familias se puede transmitir un riesgo elevado de desarrollo de cáncer pancreático, sin el incremento correspondiente de riesgo de desarrollo de otros cánceres. El cáncer pancreático está provocado muy probablemente por una acumulación de mutaciones en genes específicos que provocan el cáncer. El cáncer pancreático es muy agresivo, y los agentes quimioterápicos que pueden ser activos contra otras neoplasias malignas no actúan de manera eficaz cuando se usan para el cáncer pancreático.
La mayoría de las células del páncreas están en las glándulas exocrinas, que producen las enzimas pancreáticas, y en los conductos que transportan las enzimas pancreáticas a las vías biliares y al intestino delgado. Los cánceres de las células exocrinas del páncreas son normalmente adenocarcinomas. Los adenocarcinomas pancreáticos comienzan normalmente en los conductos del páncreas, pero a veces se pueden desarrollar a partir de las células acinares. Alrededor del 95% de los cánceres de páncreas son adenocarcinomas. Los cánceres menos comunes del páncreas exocrino incluyen los carcinomas adenoescamosos, carcinomas de células escamosas, y carcinomas de células gigantes.
El documento WO 86/02081 se refiere a proteínas reguladoras de manera diferencial en el cáncer, y a su uso para el diagnóstico del cáncer.
Debido a que el cáncer pancreático es un cáncer agresivo con una mortalidad muy elevada, existe la necesidad en la técnica de genes que se estimulen o se inhiban en la progresión de los tumores. Tales genes son útiles para fines terapéuticos y para el diagnóstico del cáncer pancreático, así como de otros cánceres.
Sumario de la invención
La presente invención se refiere a polinucleótidos subgenómicos aislados que comprenden al menos 25 nucleótidos contiguos seleccionados del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1-11 y 14.
La presente invención se refiere además a polinucleótidos subgenómicos aislados que comprenden al menos 25 nucleótidos contiguos seleccionados del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2 y 5.
En un aspecto adicional, la presente invención se refiere a polipéptidos aislados, en los que dichos polipéptidos comprenden al menos 12 aminoácidos contiguos de un polipéptido natural codificado por un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1-11 y 13-15.
Según otro aspecto adicional, la invención se refiere a polipéptidos aislados, en los que dichos polipéptidos comprenden al menos 12 aminoácidos contiguos de un polipéptido natural codificado por un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15.
La presente invención proporciona además preparaciones de anticuerpos que se unen de manera específica a estos polipéptidos.
Según una realización adicional, se proporciona una sonda nucleotídica aislada que consiste en una secuencia seleccionada del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1-11 y 13-15.
En otro aspecto, la presente invención proporciona métodos in vitro de diagnóstico del cáncer pancreático, que comprenden las etapas de: determinar la cantidad de un polipéptido expresado a partir de un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15 en una muestra de tejido de un ser humano que se sospecha que es cancerosa, y en un tejido humano que es normal; y comparar las cantidades determinadas; en los que un tejido humano del probando que contiene más polipéptido que el tejido normal se identifica como canceroso.
Otros métodos in vitro de diagnóstico del cáncer pancreático según la presente invención comprenden las etapas de: determinar la cantidad de un polipéptido expresado a partir de un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15 y la cantidad de un polipéptido expresado a partir de un polinucleótido que tiene una secuencia seleccionada del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1, 3-4, 6-11, y 13-14 en una muestra de tejido humano que se sospecha que contiene cáncer, y en un tejido humano que es normal; y comparar las cantidades determinadas; en los que una muestra de tejido humano que contiene más polipéptido expresado a partir de un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15 en comparación con el tejido normal y que contiene sustancialmente la misma cantidad de un polipéptido expresado a partir de un polinucleótido que tiene una secuencia seleccionada del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1, 3-4, 6-11, y 13-14, en comparación con el tejido normal, se identifica como cancerosa.
Otros métodos in vitro adicionales de diagnóstico del cáncer pancreático según la invención comprenden las etapas de: determinar la cantidad de moléculas de mARN en una muestra de tejido de un ser humano que se sospecha que es cancerosa, y en un tejido humano que es normal, en los que dichas moléculas de mARN son complementarias a un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15 o su complemento; y comparar las cantidades determinadas de las moléculas de mARN; en los que una muestra de tejido humano que contiene más moléculas de mARN que el tejido normal se identifica como cancerosa.
De manera alternativa, la invención proporciona métodos in vitro de diagnóstico del cáncer pancreático que comprenden las etapas de: determinar la cantidad de un primer grupo de moléculas de mARN en una muestra de tejido humano que se sospecha que es cancerosa, y en un tejido humano que es normal, en los que dichas moléculas de mARN son complementarias a la cadena no codificante de una secuencia polinucleotídica bicatenaria, en los que dicha secuencia polinucleotídica bicatenaria se selecciona del grupo de polinucleótidos mostrados en SEQ ID Nºs: 1, 3-4, 6-11, y 13-14; y determinar la cantidad de un segundo grupo de moléculas de mARN en una muestra de tejido humano que se sospecha que es cancerosa y en un tejido humano que es normal, en los que dichas moléculas de mARN son complementarias a la cadena no codificante de una secuencia bicatenaria, en los que dicha secuencia polinucleotídica bicatenaria se selecciona del grupo de polinucleótidos mostrados en SEQ ID Nºs: 2, 5, y 15; y comparar las cantidades determinadas; en los que un tejido humano del probando que contiene más del segundo grupo de moléculas de mARN que el tejido normal, y que contiene sustancialmente la misma cantidad del primer grupo de moléculas de mARN; en comparación con el tejido normal, se identifica como canceroso.
En otro aspecto, la invención proporciona composiciones terapéuticas útiles para disminuir la cantidad de traducción de una molécula de mARN en una célula, que comprenden un polinucleótido inverso complementario a la cadena codificante de un polinucleótido bicatenario, en las que dicho polinucleótido bicatenario se selecciona del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15, en las que dicho polinucleótido inverso se une a una molécula de mARN; y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
Las composiciones terapéuticas útiles para reducir la expresión de un polipéptido según la invención pueden comprender además un anticuerpo que se une de manera específica a un polipéptido natural expresado a partir de un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15; y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
Finalmente, la invención proporciona composiciones...
Reivindicaciones:
1. Un polinucleótido subgenómico aislado que comprende al menos 25 nucleótidos contiguos seleccionados del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1-11 y 14.
2. Un polinucleótido subgenómico aislado que comprende al menos 25 nucleótidos contiguos seleccionados del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2 y 5.
3. Un polipéptido aislado, en el que dicho polipéptido comprende al menos 12 aminoácidos contiguos de un polipéptido natural codificado por un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1-11 y 13-15.
4. Un polipéptido aislado, en el que dicho polipéptido comprende al menos 12 aminoácidos contiguos de un polipéptido natural codificado por un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15.
5. Una preparación de anticuerpo que se une específicamente a un polipéptido de la reivindicación 3.
6. Una preparación de anticuerpo que se une específicamente a un polipéptido de la reivindicación 4.
7. Una sonda nucleotídica aislada que consiste en una secuencia seleccionada del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1-11 y 13-15.
8. Un método in vitro de diagnóstico del cáncer pancreático que comprende las etapas de: determinar la cantidad de un polipéptido expresado a partir de un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15 en una muestra de tejido de un ser humano que se sospecha que es cancerosa, y en un tejido humano que es normal; y
comparar las cantidades determinadas; en el que un tejido humano del probando que contiene más polipéptido que el tejido normal se identifica como canceroso.
9. Un método in vitro de diagnóstico del cáncer pancreático que comprende las etapas de: determinar la cantidad de un polipéptido expresado a partir de un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15 y la cantidad de un polipéptido expresado a partir de un polinucleótido que tiene una secuencia seleccionada del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1, 3-4, 6-11, y 13-14 en una muestra de tejido humano que se sospecha que contiene cáncer, y en un tejido humano que es normal; y
comparar las cantidades determinadas; en el que una muestra de tejido humano que contiene más polipéptido expresado a partir de un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15 en comparación con el tejido normal y que contiene sustancialmente la misma cantidad de un polipéptido expresado a partir de un polinucleótido que tiene una secuencia seleccionada del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas mostradas en SEQ ID Nºs: 1, 3-4, 6-11, y 13-14, en comparación con el tejido normal, se identifica como canceroso.
10. Un método in vitro de diagnóstico del cáncer pancreático que comprende las etapas de: determinar la cantidad de moléculas de mARN en una muestra de tejido de un ser humano que se sospecha que es cancerosa y en un tejido humano que es normal, en el que dichas moléculas de mARN son complementarias a un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15 o su complemento; y
comparar las cantidades determinadas de las moléculas de mARN; en el que una muestra de tejido humano que contiene más moléculas de mARN que el tejido normal se identifica como canceroso.
11. Un método in vitro de diagnóstico del cáncer pancreático que comprende las etapas de: determinar la cantidad de un primer grupo de moléculas de mARN en una muestra de tejido humano que se sospecha que es cancerosa y en un tejido humano que es normal, en el que dichas moléculas de mARN son complementarias a la cadena no codificante de una secuencia polinucleotídica bicatenaria, en el que dicha secuencia polinucleotídica bicatenaria se selecciona del grupo de polinucleótidos mostrados en SEQ ID Nºs: 1, 3-4, 6-11, y 13-14; y
determinar la cantidad de un segundo grupo de moléculas de mARN en una muestra de tejido humano que se sospecha que es cancerosa y en un tejido humano que es normal, en el que dichas moléculas de mARN son complementarias a la cadena no codificante de una secuencia bicatenaria, en el que dicha secuencia polinucleotídica bicatenaria se selecciona del grupo de polinucleótidos mostrados en SEQ ID Nºs: 2, 5, y 15; y
comparar las cantidades determinadas; en el que un tejido humano del probando que contiene más del segundo grupo de moléculas de mARN que el tejido normal, y que contiene sustancialmente la misma cantidad del primer grupo de moléculas de mARN; en comparación con el tejido normal, se identifica como canceroso.
12. Una composición terapéutica útil para disminuir la cantidad de traducción de una molécula de mARN en una célula, que comprende:
un polinucleótido inverso complementario a la cadena codificante de un polinucleótido bicatenario, en el que dicho polinucleótido bicatenario se selecciona del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15, en el que dicho polinucleótido inverso se une a una molécula de mARN; y
un vehículo farmacéuticamente aceptable.
13. Una composición terapéutica útil para reducir la expresión de un polipéptido que comprende:
un anticuerpo que se une de manera específica a un polipéptido natural expresado a partir de un polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15; y
un vehículo farmacéuticamente aceptable.
14. Una composición terapéutica útil para reducir la traducción de una molécula de mARN que comprende:
una ribozima que se une a una molécula de mARN, en el que una porción de dicha ribozima es complementaria a la cadena codificante de un polinucleótido bicatenario;
en el que dicho polinucleótido se selecciona del grupo que consiste en las secuencias polinucleotídicas de SEQ ID Nºs: 2, 5 y 15;
y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
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