METODO DE ALTO RENDIMIENTO PARA CLASIFICAR FUNCIONALMENTE PROTEINAS IDENTIFICADAS USANDO UN ENFOQUE GENOMICO.

Método para la determinación de al menos una función biológica de una proteína diana,

comprendiendo dicho método: (a) seleccionar una multiplicidad de moléculas diferentes por su capacidad para modificar la estabilidad de dicha proteína diana, en el que la modificación de la curva de desplegamiento de dicha proteína diana por una molécula indica que la molécula se une a dicha proteína diana, comprendiendo dicha etapa de selección: (a1) poner en contacto dicha proteína diana con una o más de dicha multiplicidad de moléculas diferentes en cada uno de una multiplicidad de recipientes; (a2) tratar dicha proteína diana en cada uno de dicha multiplicidad de recipientes para hacer que la proteína se despliegue; (a3) medir en cada uno de dichos recipientes un cambio físico asociado con el desplegamiento de dicha proteína diana; (a4) generar una curva de desplegamiento para dicha proteína diana para cada uno de dichos recipientes; (a5) comparar cada una de dichas curvas de desplegamiento en la etapa (a4) con la curva de desplegamiento obtenida para dicha proteína en ausencia de cualquiera de dicha multiplicidad de moléculas diferentes; y (a6) determinar si cualquiera de dicha multiplicidad de moléculas diferentes modifica la estabilidad de dicha proteína, en el que una modificación en la estabilidad está indicada por un desplazamiento en la curva de desplegamiento; y (b) en el que una modificación en la estabilidad está indicada en la etapa (a6), determinando al menos una función biológica de dicha proteína diana mediante: (b1) la generación de una primera lista de moléculas que modifican la curva de desplegamiento de dicha proteína diana; y (b2) la comparación de dicha primera lista de moléculas con al menos una segunda lista de moléculas, en la que las moléculas en dicha segunda lista se sabe que modifican la curva de desplegamiento de un grupo de proteínas que comparten función biológica; y (b3) la determinación de si alguna molécula en dicha primera lista está incluida en dicha segunda lista, determinando así al menos una función biológica de la proteína diana.

Tipo: Resumen de patente/invención.

Solicitante: 3-DIMENSIONAL PHARMACEUTICALS, INC..

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: EAGLEVIEW CORPORATE CENTER, SUITE 104, 665 STOCKTON DRIVE,EXTON, PA 19341.

Inventor/es: PANTOLIANO, MICHAEL, W., SALEMME, FRANCIS, R., CARVER, THEODORE, E., JR.

Fecha de Publicación: 1 de Mayo de 2007.

Fecha Solicitud PCT: 12 de Noviembre de 1998.

Fecha Concesión Europea: 9 de Agosto de 2006.

Clasificación Internacional de Patentes:

A61K38/00 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA. › A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE. › A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00).
C07K1/00 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › Procedimientos generales de preparación de péptidos.

Clasificación PCT:

A61K38/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00).
C07K1/00 C07K […] › Procedimientos generales de preparación de péptidos.
G01N33/68 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › en los que intervienen proteínas, péptidos o aminoácidos.

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Eslovenia, Finlandia, Rumania, Chipre, Oficina Europea de Patentes, Lituania, Letonia, Ex República Yugoslava de Macedonia, Albania.

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