HIBRIDACION POR FLUORESCENCIA COMPARATIVA A MICROSERIES DE OLIGONUCLEOTIDOS.
Un método para comparar el número de copias de secuencias de ácidos nucleicos en dos o más colecciones de moléculas de ácido nucleico,
método que comprende: (a) preparar una primera colección representativa y una segunda colección representativa de secuencias de ácidos nucleicos marcadas, a partir de una primera fuente de ácidos nucleicos y de una segunda fuente de ácidos nucleicos, respectivamente, (i) poniendo en contacto la primera y la segunda fuente con cebadores de PCR que comprenden secuencias presentes en los ácidos nucleicos fuente, y adaptadores que comprenden secuencias que no están presentes en los ácidos nucleicos fuente, produciendo de este modo un juego de ácidos nucleicos amplificados que comprenden secuencias diana; y (ii)poner en contacto el juego de ácidos nucleicos amplificados, producidos en la etapa (i), con cebadores que hibridan de forma específica con los adaptadores, produciendo de este modo, por amplificación de PCR, una primera y una segunda colección de secuencias de ácidos nucleicos marcadas de complejidad reducida, en comparación con la primera fuente de ácidos nucleicos y la segunda fuente de ácidos nucleicos; en donde la primera y segunda colecciones de secuencias de ácidos nucleicos marcadas son distinguibles entre sí; y (b) poner en contacto la primera y la segunda colecciones con una pluralidad de elementos diana que comprenden oligonucleótidos diana unidos a una superficie sólida; en donde la primera colección de secuencias de ácidos nucleicos marcadas comprende una secuencia que hibrida específicamente con un oligonucleótido diana; y en donde la segunda colección de secuencias de ácidos nucleicos marcadas comprende una secuencia que hibrida específicamente con el oligonucleótido diana; y (c) comparar el número de copias, determinando la cantidad de hibridación específica de la primera y segunda colecciones de secuencias de ácidos nucleicos marcadas con los elementos diana.
Tipo: Resumen de patente/invención.
Solicitante: THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 12TH FLOOR, 1111 FRANKLIN STREET,OAKLAND, CALIFORNIA 94607-5200.
Inventor/es: GRAY, JOE, W., PINKEL, DAN, ALBERTSON, DONNA, G., COLLINS, COLIN, C., BALDOCCHI, RUSSELL, A.
Fecha de Publicación: .
Fecha Solicitud PCT: 28 de Abril de 2000.
Fecha Concesión Europea: 9 de Febrero de 2005.
Clasificación Internacional de Patentes:
- C07H21/02 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07H AZUCARES; SUS DERIVADOS; NUCLEOSIDOS; NUCLEOTIDOS; ACIDOS NUCLEICOS (derivados de ácidos aldónicos o sacáricos C07C, C07D; ácidos aldónicos, ácidos sacáricos C07C 59/105, C07C 59/285; cianohidrinas C07C 255/16; glicales C07D; compuestos de constitución indeterminada C07G; polisacáridos, sus derivados C08B; ADN o ARN concerniente a la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos o su aislamiento, preparación o purificación C12N 15/00; industria del azúcar C13). › C07H 21/00 Compuestos que contienen al menos dos unidades mononucleótido que tienen cada una grupos fosfato o polifosfato distintos unidos a los radicales sacárido de los grupos nucleósido, p. ej. ácidos nucleicos. › con ribosilo como radical sacárido.
- C07H21/04 C07H 21/00 […] › con desoxirribosilo como radical sacárido.
- C12P19/34 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12P PROCESOS DE FERMENTACION O PROCESOS QUE UTILIZAN ENZIMAS PARA LA SINTESIS DE UN COMPUESTO QUIMICO DADO O DE UNA COMPOSICION DADA, O PARA LA SEPARACION DE ISOMEROS OPTICOS A PARTIR DE UNA MEZCLA RACEMICA. › C12P 19/00 Preparación de compuestos que contienen radicales sacárido (ácido cetoaldónico C12P 7/58). › Polinucleótidos, p. ej. ácidos nucleicos, oligorribonucleótidos.
- C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Finlandia, Chipre, Oficina Europea de Patentes.
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