Compuesto de fosforamidita y método para producir un oligo-ARN.
Un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general (1),
**Fórmula**
en donde:
Bx representa una nucleobase que puede tener un grupo protector;
R1 es un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (2),
en donde:
R11, R12 y R13 son iguales o diferentes y cada uno representa hidrógeno o alcoxi;
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógenoadyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico aminoopcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo denitrógeno adyacente; y
WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno y WG2 representa un grupo de extracción deelectrones.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/JP2005/015420.
Solicitante: NIPPON SHINYAKU CO., LTD..
Nacionalidad solicitante: Japón.
Dirección: 14, KISSHOIN NISHINOSHO MONGUCHICHO, MINAMI-KU KYOTO-SHI, KYOTO 601-8550 JAPON.
Inventor/es: OHGI, TADAAKI, ISHIYAMA,kouichi, MASUTOMI,YutakaRoom 2-1C Nippon Shinyaku.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C07C255/13 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07C COMPUESTOS ACICLICOS O CARBOCICLICOS (compuestos macromoleculares C08; producción de compuestos orgánicos por electrolisiso electroforesis C25B 3/00, C25B 7/00). › C07C 255/00 Nitrilos de ácidos carboxílicos (cianógeno o sus compuestos C01C 3/00). › que contienen grupos ciano y grupos hidroxi eterificados unidos a la estructura carbonada.
- C07H19/067 C07 […] › C07H AZUCARES; SUS DERIVADOS; NUCLEOSIDOS; NUCLEOTIDOS; ACIDOS NUCLEICOS (derivados de ácidos aldónicos o sacáricos C07C, C07D; ácidos aldónicos, ácidos sacáricos C07C 59/105, C07C 59/285; cianohidrinas C07C 255/16; glicales C07D; compuestos de constitución indeterminada C07G; polisacáridos, sus derivados C08B; ADN o ARN concerniente a la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos o su aislamiento, preparación o purificación C12N 15/00; industria del azúcar C13). › C07H 19/00 Compuestos que contienen un heterociclo que comparten un heteroátomo del ciclo con un radical sacárido; Nucleósidos; Mononucleótidos; Sus anhidro-derivados. › con un ribosilo como radical sacárido.
- C07H19/167 C07H 19/00 […] › con un ribosilo como radical sacárido.
- C07H21/02 C07H […] › C07H 21/00 Compuestos que contienen al menos dos unidades mononucleótido que tienen cada una grupos fosfato o polifosfato distintos unidos a los radicales sacárido de los grupos nucleósido, p. ej. ácidos nucleicos. › con ribosilo como radical sacárido.
PDF original: ES-2386709_T3.pdf
Fragmento de la descripción:
Compuesto de fosforamidita y método para producir un oligo-ARN.
Campo técnico
La presente invención se refiere a un novedoso compuesto de fosforamidita en el que se introduce un novedoso 5 grupo protector en el grupo 2'-hidroxilo y a un agente para introducir el grupo protector.
Antecedentes de la invención
Los ácidos oligorribonucleicos (oligo-ARN) son útiles como sondas de ARN para el análisis génico, materiales farmacéuticos de ARN (ARN antisentido, ribozimas, ARN para el control de la expresión génica mediada por ARNi) , enzimas artificiales y aptámeros. Un procedimiento de síntesis sólida para preparar oligo-ARN se estableció a fines
de la década de 1980. En el primer informe del procedimiento se usaron los compuestos de fosforamidita con tercbutildimetilsililo (TBDMS) o triisopropilsililo (TIPS) como un grupo protector 2'-hidroxilo (documento no patente 1) .
La síntesis química de los oligo-ARN presenta muchos más problemas que la síntesis química de los ácidos oligodesoxirribonucleicos (oligo-ADN) constituidos solamente por desoxirribonucleótidos.
Por ejemplo, el uso del grupo TBDMS como un grupo protector de 2’-hidroxilo puede causar una reacción 15 secundaria en la cual el grupo TBDMS que protege al grupo 2’-hidroxilo migra al grupo 3’-hidroxilo durante la fosforamidación del grupo 3’-hidroxilo.
Además, el uso de un sustituyente voluminoso tal como el grupo TBDMS como grupo protector de 2’-hidroxilo puede reducir la tasa de la reacción de condensación para la formación de la unión de internucleótidos debido al impedimento estérico en la cercanía del átomo de fósforo en la posición 3’, resultando posiblemente en la escisión o
reorganización del enlace de los internucleótidos durante la eliminación del grupo protector 2'-hidroxilo luego de la oligomerización.
Con el objetivo de superar los problemas planteados anteriormente, actualmente se están investigando los procedimientos más eficientes para sintetizar oligo-ARN.
Como grupo protector de 2’-hidroxilo, se sabe que el grupo 1- (2-cianoetoxi) etilo (CEE) se elimina junto con el grupo 25 protector de bissililo 3' y 5' en condiciones neutras capaces de eliminar el grupo protector de bissililo (documento no patente 2) .
En base a esta información, Wada desarrolló un compuesto de fosforamidita para producir oligo-ARN en los cuales el grupo CEE, que es capaz de eliminarse en condiciones neutras, se introduce en el grupo 2’-hidroxi (documento no patente 3 y documento no patente 4) . Sin embargo, dado que la introducción del grupo CEE en la posición 2’30 hidroxilo conduce a la formación de un nuevo centro asimétrico, los oligo-ARN en los cuales los grupos 2’-hidroxilo son protegidos por el grupo CEE están en una mezcla diaestereoisomérica. Por lo tanto, la purificación y el aislamiento del oligo-ARN es complicado. Además, dado que los oligo-ARN en los cuales se introdujo el grupo CEE tienen un grupo metilo en el carbono unido al átomo 2’-oxígeno, se espera algún impedimento estérico alrededor del átomo de fósforo unido al grupo 3’-hidroxilo, lo que genera preocupaciones sobre una reducción en la eficiencia de
condensación y la tasa de reacción de condensación.
Documento no patente 1: N. A. Usman et al., Journal of the American Chemical Society, Vol. 109, 7845 (1987)
Documento no patente 2: Wolfgang Pfleiderer et al., Helvetica Chimica Acta, Vol. 81, 1545 (1998)
Documento no patente 3: Takeshi Wada, Bioindustr y , Vol. 21, No. 1, 17 (2004)
Documento no patente 4: T. Umemoto et al., Tetrahedron Letters, Vol. 45, 9529 (2004)
La publicación ORGANIC LETTERS, ACS, COLUMBUS, OH; ESTADOS UNIDOS, vol. 7, No. 16, 1º de enero de 2005 (2005-01-01) , páginas 3477-3480, se refiere a un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general útil para sintetizar oligómeros de ARN.
La publicación TET. LETTERS, vol. 45. No. 52, 20 de diciembre de 2004 (2004-12-20) , páginas 9529-9531, se
refiere a un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general útil para sintetizar oligonucleótidos. El compuesto de fosforamidita se sustituye por metilo en el átomo de carbono que se une al 2’hidroxilo.
La publicación HELVETICA CHIMICA ACTA, CH, vol. 83, 1º de enero de 2000 (2000-01-01) , páginas 1127-1144, se refiere a una preparación de bloques de construcción para la incorporación de ribonucleótidos sustituidos por 2’-O[ (3-bromopropoxi) metilo] representados por la siguiente fórmula general en secuencias de oligonucleótidos. El compuesto es útil para introducir funcionalidades adicionales en la posición 2’-O de oligonucleótidos.
La BASE DE DATOS CAPLUS (en línea) , CHEMICAL ABSTRACTS SERVICE, No. de acceso a la base de datos STN 2001:675264, se refiere a un procedimiento para sintetizar una ribonucleasa artificial que tiene funcionalidades adicionales usando el compuesto intermediario representado por la siguiente fórmula general.
La publicación HELVETICA CHIMICA ACTA, 81 (8) , 1545-1566, divulga compuestos de acetal representados por las 15 siguientes fórmulas generales.
Los compuestos se sustituyen por metilo en el átomo de carbono que se une al 2’-hidroxilo.
El documento JP-A-3 074 398 se refiere a un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general útil para sintetizar oligonucleótidos. El compuesto de fosforamidita se sustituye por metilo en el átomo de 20 carbono que se une al 2’-hidroxilo.
El documento JP-A-7 502 037 en la BASE DE DATOS DE CHEMICAL ABSTRACTS (en línea) , No. de acceso de la base de datos (4063g-i) , no divulga que los compuestos de JP-A-7 502 037 en la BASE DE DATOS DE CHEMICAL ABSTRACTS (en línea) , No. de acceso de base de datos (4063g-i) son útiles como un reactivo para producir el compuesto de fosforamidita (1) de la presente invención.
El documento JP-A-7 502 037 (Estados Unidos 5.504.263) se refiere a un proceso para la producción de hidrofluorocarburos de a-fluoroéteres, tales como FCH2OCH2CH2F, y un proceso para la producción de
a fluoroéteres y novedosos a-fluoroéteres adecuados para el uso en la producción de hidrofluorocarburos.
El documento JP 62 116 533 A (Estados Unidos 4.629.814) se refiere a un proceso mejorado para la preparación de ciertos éteres de bis-bromoalquilo, tales como BrCH2OCH2CH2Br.
El documento JP 49 126 825 A (Estados Unidos 3.956.500) se refiere a una novedosa 1, 3-oxatiolano y 1, 4 oxatiano carbamoiloxima representada por la siguiente fórmula.
El documento US-A-4.925.856 se refiere a una sal de aldoxima útil en el tratamiento de envenenamiento por ciertos productos químicos que contienen fósforo.
La publicación J. ORG. CHEM., vol. 46, No. 3, 1981, páginas 571-577, se refiere a una preparación, un estudio estructural de resonancia magnética y una capacidad alquilante con respecto a iones de (haloalquil) oxonio y (haloalquil) carboxonio.
La publicación TET LETTERS vol. 26, 1973, páginas 2407-2408, se refiere a una reactividad con respecto a 20 vinilcuprato.
La BASE DE DATOS DE CHEMICAL ABSTRACTS (en línea) , No. de acceso de la base de datos (4063g-i) se refiere a una preparación de derivados de fluoroetanol, tales como ClCH2OCH2CH2F.
Divulgación de la invención Problema a solucionar mediante la invención
Un objetivo principal de la presente invención es proporcionar un compuesto de fosforamidita novedoso y útil para un procedimiento de síntesis de alto rendimiento para oligo-ARN.
Otro objetivo de la presente invención es proporcionar un compuesto de éter novedoso que pueda usarse para acoplar un grupo protector al grupo 2’-hidroxilo de ribosa, en donde el grupo protector puede eliminarse en condiciones neutras.
30 Medios para resolver los problemas
Luego de estudios intensivos y diligentes, los inventores de la presente invención encontraron un compuesto que podría lograr los objetivos anteriores y, por lo tanto, se completó la presente invención.
I. Un compuesto de fosforamidita... [Seguir leyendo]
Reivindicaciones:
1. Un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general (1) ,
en donde: Bx representa una nucleobase que puede tener un grupo protector; R1 es un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (2) ,
en donde:
R11, R12 y R13 son iguales o diferentes y cada uno representa hidrógeno o alcoxi;
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógeno adyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico amino opcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo de
nitrógeno adyacente; y
WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno y WG2 representa un grupo de extracción de electrones.
2. El compuesto de fosforamidita de acuerdo con la reivindicación 1, en donde WG1 es ciano.
3. Un procedimiento para producir un oligorribonucleótido representado por la siguiente fórmula general (3) , 20 caracterizado por usar el compuesto de fosforamidita de acuerdo con la reivindicación 1 o 2,
en donde: cada B representa independientemente adenina, guanina, citosina, uracilo, timina o una forma modificada de los
mismos; cada R representa independientemente H o hidroxilo, y al menos uno de Rs es hidroxilo; Z representa H o un grupo fosfato; y n representa un número entero en el rango de 1 a 100.
4. El procedimiento para producir el oligorribonucleótido (3) de acuerdo con la reivindicación 3 que comprende las siguientes etapas A a G,
Etapa A: proceso para producir un compuesto representado por la siguiente fórmula general (5) eliminando el grupo 5’-hidroxilo haciendo reaccionar un ácido con un compuesto representado por la siguiente fórmula general (4) ,
en donde:
n es el mismo que se definió anteriormente;
cada Bx representa independientemente una nucleobase que puede tener un grupo protector; y 10 R1 es un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (2) ,
en donde: R11, R12 y R13 son iguales o diferentes y cada uno representa hidrógeno o alcoxi; 15 cada WG2 representa un grupo de extracción de electrones; y cada R4 representa independientemente H, aciloxi o un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (6) ,
en donde:
WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno; y
E representa acilo o un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (7) ,
en donde: Q representa una unión simple o un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (8) ,
en donde:
WG2 es el mismo que se definió anteriormente; y
T representa H, aciloxi o el sustituyente representado por la fórmula general anterior (6) , con la condición de que ninguno de E o T sea un sustituyente (7) . Etapa B: proceso para producir un compuesto representado por la siguiente fórmula general (9) condensando un
compuesto de monómero de ácido nucleico con el compuesto producido en la etapa A usando un agente activador,
Bx, E, n, R1, R4, T y WG2 son los mismos que se definieron anteriormente,
en donde:
Bx, E, n, R4, T y WG2 son los mismos que se definieron anteriormente; y
R5 representa metilo o fenoximetilo,
Etapa D: proceso para convertir un grupo fosforoso en un grupo fosfato haciendo reaccionar un agente oxidante con 20 el compuesto (9) que se produce en la etapa B,
en donde: Bx, E, n, R1, R4, T y WG2 son los mismos que se definieron anteriormente, Etapa E: proceso para escindir el compuesto (11) producido mediante la etapa D a partir del soporte sólido y luego
desproteger cada nucleobase y cada grupo 2’-hidroxilo,
en donde: B, Bx, E, n, R, R1, R4, T, WG2 y Z son los mismos que se definieron anteriormente, Etapa F: proceso para eliminar el grupo protector de 5’-hidroxilo del compuesto (12) producido mediante la etapa (E) ,
en donde: B, n, R, R1 y Z son como se definieron anteriormente, Etapa G: proceso para aislar y purificar el oligorribonucleótido (3) producido en la etapa F.
5. Un procedimiento para producir un oligonucleótido representado por la siguiente fórmula general (3) que
comprende las siguientes etapas A a D, en donde el compuesto de monómero de ácido nucleico en la etapa B es el compuesto de fosforamidita de acuerdo con la reivindicación 1 o 2,
en donde: cada B representa independientemente adenina, guanina, citosina, uracilo, timina o una forma modificada de los
mismos; cada R representa independientemente H o hidroxilo y al menos uno de R es hidroxilo; Z representa H o un grupo fosfato; y n representa un número entero en el rango de 1 a 100.
Etapa A: proceso para producir un compuesto representado por la siguiente fórmula general (5) eliminando el grupo protector de 5’-hidroxilo haciendo reaccionar un ácido en un compuesto representado por la siguiente fórmula general (4) ,
en donde: n es el mismo que se definió anteriormente; cada Bx representa independientemente una nucleobase que puede tener un grupo protector; y R1 es un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (2) ,
en donde: R11, R 12 y R13 son iguales o diferentes y cada uno representa hidrógeno o alcoxi; cada WG2 representa un grupo de extracción de electrones; y
cada R4 representa independientemente H, aciloxi o un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (6) ,
en donde: WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno; y E representa acilo o un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (7) ,
en donde: 10 Q representa una unión simple o un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (8) ,
en donde: WG2 es el mismo que se definió anteriormente; y T representa H, aciloxi o el sustituyente representado por la fórmula anterior general (6) , con la condición de que E o
T sea un sustituyente (7) , Etapa B: proceso para producir un compuesto representado por la siguiente fórmula general (9) condensando un
en donde: Bx, E, n, R1, R4, T y WG2 son los mismos que se definieron anteriormente, Etapa C: proceso para proteger el grupo 5’-hidroxilo del compuesto sin reaccionar (5) en la etapa B,
en donde: Bx, E, n, R4, T y WG2 son los mismos que se definieron anteriormente; y R5 representa metilo o fenoximetilo, Etapa D: proceso para convertir un grupo fosforoso en un grupo fosfato haciendo reaccionar un agente oxidante en
el compuesto (9) producido en la etapa B,
en donde:
Bx, E, n, R1, R4, T y WG2 son los mismos que se definieron anteriormente.
6. El procedimiento para producir un oligorribonucleótido de acuerdo con la reivindicación 4 o 5 que se caracteriza por la adición de alquilamina, amidina, tiol, un derivado de tiol o mezclas de los mismos en la etapa E.
7. Un procedimiento para producir un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general (1) ,
en donde: Bx representa una nucleobase que puede tener un grupo protector; y 20 R1 representa un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (2) ,
en donde:
R11, R12 y R13 son iguales o diferentes y cada uno representa hidrógeno o alcoxi;
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógeno adyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico amino opcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo de nitrógeno adyacente; y
WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno y WG2 representa un grupo de extracción de 10 electrones,
Etapa a: proceso para producir un derivado de nucleósido representado por las siguientes fórmulas generales (15) y (15’) , en donde un grupo protector de tipo de éter que puede eliminarse en condiciones neutras se introduce en el grupo 2’-hidroxilo, permitiendo que un reactivo alquilante actúe en un derivado de nucleósido representado por la
Bx representa una nucleobase que puede tener un grupo protector; y R1 y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente, 20 Etapa b: proceso para aislar y purificar el derivado de nucleósido (15) producido mediante la etapa a, Etapa c: proceso para producir un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general (1) fosforamiditando el grupo 3’-hidroxilo permitiendo que un reactivo fosforamiditante y si es necesario un agente
en donde:
Bx, R1 yWG1 son los mismos que se definieron anteriormente;
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo, o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógeno adyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico amino opcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo de
nitrógeno adyacente; y
WG2 representa un grupo de extracción de electrones.
8. Un procedimiento para producir un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general (1) , comprendiendo el procedimiento las etapas a2 a d2,
en donde: Bx representa una nucleobase que puede tener un grupo protector; y R1 representa un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (2) ,
en donde:
R11, R12 y R13 son iguales o diferentes y cada uno representa hidrógeno o alcoxi;
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógeno adyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico amino 10 opcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo de nitrógeno adyacente; y
WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno y WG2 representa un grupo de extracción de electrones,
Etapa a2: proceso para producir un compuesto de ácido ribonucleico representado por la siguiente fórmula general 15 (17) , en donde un grupo protector de tipo de éter que puede eliminarse en condiciones neutras se introduce en el grupo 2’-hidroxilo, permitiendo que un reactivo alquilante actúe en un compuesto de ácido ribonucleico representado
en donde: Bx y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente; y
en donde: 25 R6 representa alquilo, Etapa b2: proceso para producir un compuesto de ácido ribonucleico representado por la siguiente fórmula general
(21) eliminando los grupos protectores del grupo hidroxilo 3’ y 5’ del compuesto de ácido ribonucleico (17) producido mediante la etapa a2,
en donde:
A, Bx y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente,
Etapa c2: proceso para producir un compuesto de ácido ribonucleico (15) introduciendo un grupo protector (R1) , que puede eliminarse en condiciones ácidas, en el grupo hidroxilo 5’ del compuesto de ácido ribonucleico (21) producido mediante la etapa b2,
en donde:
Bx R1 y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente; y
X3 representa halógeno,
Etapa d2: proceso para producir un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general (1) fosforamiditando el grupo 3’ hidroxilo permitiendo que un reactivo fosforamiditante y si es necesario un agente activador actúe en un derivado de nucleósido (15) producido mediante la etapa v2,
en donde:
Bx R1 y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente;
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógeno
adyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico amino opcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo de nitrógeno adyacente; y
WG2 representa un grupo de extracción de electrones.
9. Un procedimiento para producir un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general (1) , 25
en donde:
Bx representa una nucleobase que puede tener un grupo protector; y R1 representa un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (2) ,
en donde:
R11, R12 y R13 son iguales o diferentes y cada uno representa hidrógeno o alcoxi;
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógeno adyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico amino opcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo de
nitrógeno adyacente; y
WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno y WG2 representa un grupo de extracción de electrones,
Etapa a3: proceso que se realiza de forma separada de las etapas a a c para producir un compuesto de ácido ribonucleico representado por la siguiente fórmula general (19) permitiendo que dimetilsulfóxido, ácido acético y
A y Bx son los mismos que se definieron anteriormente,
Etapa b3: proceso para producir un compuesto de ácido ribonucleico representado por la siguiente fórmula general
(17) , en donde un grupo protector de tipo de éter que puede eliminarse en condiciones neutras se introduce en el grupo 2’-hidroxilo, permitiendo que un compuesto de alcohol representado por la siguiente fórmula general (20) , un ácido y un agente de halogenación para un átomo de azufre actúen en un derivado de nucleósido (19) producido en
en donde:
A, Bx y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente,
Etapa c3: proceso para producir un compuesto de ácido ribonucleico representado por la siguiente fórmula general
(21) eliminando los grupos protectores del grupo 3’ y 5’ hidroxilo del compuesto de ácido ribonucleico (17) producido en la etapa b3,
en donde: A, Bx y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente,
Etapa d3: proceso para producir un compuesto de ácido ribonucleico (15) introduciendo un grupo protector (R1) que puede eliminarse en condiciones ácidas, en el grupo 5’ hidroxilo del compuesto de ácido ribonucleico (21) producido
Bx, R1 y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente; y
X3 representa halógeno,
Etapa e3: proceso para producir un compuesto de fosforamidita representado por la siguiente fórmula general (1) 10 fosforamiditando el grupo 3’ hidroxilo permitiendo que un reactivo fosforamiditante y si es necesario un agente activador actúe en un derivado de nucleósido (15) producido mediante la etapa d3,
en donde:
Bx, R1 y WG1 son los mismos que se definieron anteriormente;
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógeno adyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico amino opcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo de
nitrógeno adyacente; y
WG2 representa un grupo de extracción de electrones.
10. El procedimiento para producir un compuesto de fosforamidita de acuerdo con las reivindicaciones 7 a 9, en donde el reactivo alquilante es un compuesto de éter representado por la siguiente fórmula general (13) ,
en donde: L representa halógeno, un grupo ariltio, un grupo alquil sulfóxido o un grupo alquiltio; y WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno.
11. El procedimiento para producir un compuesto de fosforamidita de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 7 a 10, en donde WG1 es ciano.
12. El procedimiento para producir un compuesto de fosforamidita de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 7 a 11, en donde el reactivo de fosforamidita es un compuesto representado por la siguiente fórmula general (22) o (23) ,
en donde:
R2a y R2b son iguales o diferentes y cada uno representa alquilo o R2a y R2b tomados junto con el átomo de nitrógeno adyacente pueden formar un grupo cíclico amino saturado de 5 a 6 miembros, teniendo el grupo cíclico amino 5 opcionalmente un átomo de oxígeno o azufre como un miembro que compone el anillo además del átomo de nitrógeno adyacente;
WG2 representa un grupo de extracción de electrones; y
X1 representa halógeno.
13. El procedimiento para producir un compuesto de fosforamidita de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones
7 a 12, en donde el agente activador es 1H-tetrazol, 5-etiltiotetrazol, 5-bencilmercapto-1H-tetrazol, 4, 5dicloroimidazol, 4-5-dicianoimidazol, benzotriazol triflato, imidazol triflato, pridinio triflato, N-N-diisopropieletilamina o 2, 4, 6-colidina/N-metilimidazol.
en donde:
Bx representa una nucleobase que puede tener un grupo protector; y WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno.
15. El compuesto de ácido ribonucleico de acuerdo con la reivindicación 14, en donde WG1 es ciano.
Bx representa una nucleobase que puede tener un grupo protector; R1 es un sustituyente representado por la siguiente fórmula general (2) ,
en donde: R11, R12 y R13 son iguales o diferentes y cada uno representa hidrógeno o alcoxi; y WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno.
17. El compuesto de ácido ribonucleico de acuerdo con la reivindicación 16, en donde WG1 es ciano.
18. Un compuesto de ácido ribonucleico representado por la siguiente fórmula general (17) ,
en donde: Bx representa un nucleobase que puede tener un grupo protector; A representa un sustituyente de silicio representado por la siguiente fórmula general (18a) o (18b) ,
en donde:
R6 representa alquilo;
y
WG1 representa ciano, nitro, alquil C1-C5 sulfonilo o halógeno. 10 19. El compuesto de ácido ribonucleico de acuerdo con la reivindicación 18, en donde WG1 es ciano.
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Proteínas variantes de empalme her2 y her3 solubles, oligonucleótidos de cambio de empalme y su uso en el tratamiento de enfermedades, del 15 de Abril de 2020, de Sarepta Therapeutics, Inc: Una proteína del receptor 2 del factor de crecimiento epidérmico humano (HER2) aislada y soluble que consiste en la secuencia establecida en la SEQ ID NO: […]
Composiciones para modular la expresión de C90RF72, del 18 de Marzo de 2020, de Ionis Pharmaceuticals, Inc: Un oligonucleótido modificado de acuerdo con la siguiente fórmula: **(Ver fórmula)** (SEQ ID NO: 33) o una sal del mismo.
Proteínas insecticidas y métodos para su uso, del 12 de Febrero de 2020, de PIONEER HI-BRED INTERNATIONAL, INC.: Una construcción de ADN que comprende una molécula de ácido nucleico heteróloga que codifica un polipéptido de PIP-72 que tiene actividad insecticida contra el gusano de […]
Oligonucleótido TGF-beta modificado para uso en un método de prevención y/o tratamiento de una enfermedad oftálmica, del 25 de Diciembre de 2019, de ISARNA Therapeutics GmbH: Oligonucleótido antisentido complementario a la secuencia de ácido nucleico de TGF-beta2 de la SEQ ID NO. 2 de la Figura 2, en el que el oligonucleótido […]
Modulación de enfermedades relacionadas con el sistema renina-angiotensina (RAS) mediante angiotensinógenos, del 18 de Diciembre de 2019, de Ionis Pharmaceuticals, Inc: Un compuesto que comprende un oligonucleótido antisentido modificado que consiste de 12 a 30 nucleósidos enlazados, en donde el oligonucleótido antisentido modificado […]