SECUENCIAS DE NUCLEÓTIDOS Y POLIPÉPTIDOS CODIFICADOS POR ELLAS, ÚTILES PARA LA MODIFICACIÓN DE LAS CARACTERÍSTICAS DE EFICACIA DE UTILIZACIÓN DEL NITRÓGENO EN PLANTAS.

Utilización de un ácido nucleico para mejorar las características de eficiencia en el uso del nitrógeno de una planta transgénica,

en comparación con una planta de tipo natural cultivada en las mismas condiciones, en la que el ácido nucleico incluye una molécula aislada de ácido nucleico que comprende: (a) un ácido nucleico con una secuencia de nucleótido que codifique una secuencia de aminoácido que presente al menos una identidad de secuencia del 80% con la ID SEC. Nº 2; (b) un ácido nucleico que sea un complemento de una secuencia de nucleótido de acuerdo con el párrafo (a); en el que la secuencia del nucleótido y/o la secuencia del aminoácido desempeñan una función en la eficiencia del uso del nitrógeno

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2005/014197.

Solicitante: CERES, INC.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1535 RANCHO CONEJO BOULEVARD THOUSAND OAKS, CA 91320-1440 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: SCHNEEBERGER,Richard, MARGOLLES-CLARK,Emilio, MAGPANTAY,Gerard.

Fecha de Publicación: .

Fecha Solicitud PCT: 25 de Abril de 2005.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K14/415 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de vegetales.
  • C12N15/82C4B

Clasificación PCT:

  • C12N15/82 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › para células vegetales.

Clasificación antigua:

  • C12N15/82 C12N 15/00 […] › para células vegetales.

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Eslovenia, Finlandia, Rumania, Chipre, Lituania.

PDF original: ES-2364152_T3.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Secuencias de nucleótidos y polipéptidos codificados por ellas, útiles para la modificación de las características de eficacia de utilización del nitrógeno en plantas.

Campo de la invención

La presente invención se refiere a la utilización de polinucleótidos aislados y los polipéptidos codificados por ellos, para la obtención de plantas transgénicas con una mayor eficacia de utilización del nitrógeno. La presente invención se refiere asimismo a la utilización de dichas secuencias de nucleótidos en el ámbito de la ingeniería genética de las plantas, para la obtención de una mayor capacidad de asimilación y de utilización del nitrógeno, a fin de que crezcan más, de forma más eficaz o con mayor rapidez, y/o tengan un contenido de nitrógeno enriquecido en partes de la planta vegetativas y/o reproductivas y/o un aumento de la biomasa. Más concretamente, esta invención se refiere a la fabricación de plantas transgénicas diseñadas de forma que se altere la expresión de componentes clave en los mecanismos de asimilación y utilización del nitrógeno. Las plantas sometidas al proceso de ingeniería pueden cultivarse de forma productiva en condiciones de bajo aporte de fertilizante nitrogenado o en terrenos pobres en nitrógeno. Alternativamente, las plantas modificadas mediante ingeniería pueden utilizarse para conseguir unos cultivos que crezcan o maduren con mayor rapidez, unas cosechas más abundantes y/o unos productos más nutritivos en condiciones de cultivo ideales.

Antecedentes de la invención

El nitrógeno suele ser con frecuencia el elemento que constituye el factor límite en el crecimiento de la planta, y todos los cultivos agrícolas tienen una dependencia fundamental de fuentes de nitrógeno exógenas. Los abonos nitrogenados, que suelen suministrarse en forma de nitrato de amonio, nitrato potásico, o urea, suelen representar un 40% de los costes asociados a cultivos como el del maíz y el trigo en la agricultura intensiva. Una mayor eficacia en la utilización del nitrógeno por parte de las plantas debería permitir la consecución de unos mayores rendimientos con los actuales aportes de fertilizante y/o permitir la obtención de las cosechas actuales con un menor aporte de fertilizante, o conseguir unos mayores rendimientos en terrenos de baja calidad. También se pueden producir de forma más rentable unas mayores cantidades de proteínas en los cultivos.

Las plantas cuentan con diversos medios para hacer frente a las deficiencias de nutrientes, como una reducida disponibilidad de nitrógeno. Están constantemente tratando de detectar el nitrógeno disponible en el suelo, y responden en consecuencia, modulando la expresión del gen. Aunque se han realizado muchos descubrimientos en torno al nitrógeno y a los componentes que participan en la regulación de su absorción y utilización, todavía se desconocen muchas cosas acerca de un gran número de estas complejas interacciones. Por este motivo, resulta interesante cuando se observa que un gen con una función conocida o desconocida presenta una respuesta al nitrógeno, ya que abre nuevas posibilidades y perspectivas sobre la utilización del nitrógeno y la eficiencia de la utilización del nitrógeno en un entorno competitivo (es decir, con niveles bajos y/o elevados de nitrógeno).

Las plantas cuentan con diversos medios para hacer frente a las deficiencias de nutrientes. Uno de los mecanismos más importantes para ello consiste en secuestrar o almacenar el nitrógeno en épocas de abundancia para su posterior utilización. Los transportadores de péptidos son una de las clases de proteínas que es probable que participen en este proceso. Existen muy pocos informes publicados en relación con los transportadores de péptidos en plantas, lo que indica que su función en el crecimiento y desarrollo de la planta está aún sin explorar. Los transportadores de péptidos son transportadores mediados por portadores y dependientes de la energía. Los péptidos, que se han internalizado en la célula, se descomponen en aminoácidos, que a su vez se utilizan como fuentes de nitrógeno y carbono. La sobreexpresión de un transportador de péptidos puede proporcionar nitrógeno a una planta de forma más adecuada, lo que constituye una ventaja en entornos competitivos en nitrógeno (N). La utilización de un inhibidor de asimilación del nitrógeno como representación de este entorno competitivo proporciona un filtro muy útil para los candidatos que tienen una mejor eficiencia en el uso del nitrógeno (NUE). Este filtro proporciona un método bien definido para la identificación de los candidatos N, ya que elimina el carácter subjetivo de la limitación de los filtros de N en función de ligeros incrementos en el tamaño y verdor.

Resumen de la invención

Por lo tanto, la presente invención se refiere a la utilización de polinucleótidos aislados y los polipéptidos codificados por ellos, para la creación de plantas transgénicas con una NUE.

En el campo agrícola y forestal se realizan constantes esfuerzos para producir plantas con un mayor potencial de crecimiento, para alimentar a la siempre creciente población mundial y garantizar el suministro de materias primas reproducibles. Normalmente, esto se lleva a cabo mediante la cría y selección de las plantas. No obstante, para el proceso de cría suele ser necesario invertir mucho tiempo y trabajo. Además, deben llevarse a cabo los adecuados programas de reproducción para cada especie vegetal correspondiente.

Se han logrado avances parciales mediante la manipulación genética de las plantas, o lo que es lo mismo, introduciendo y expresando moléculas de ácido nucleico recombinantes en plantas. Estos métodos presentan la ventaja de que por lo general no se limitan a una sola especie vegetal, sino que pueden transferirse entre diversas especies de plantas. Por ejemplo, el documento EP-A 0 511 979 describe la expresión de un gen de la asparagina sintetasa procariota en células vegetales, que implica el incremento de la producción de biomasa. Igualmente, el documento WO96/21737 describe plantas con un mayor rendimiento (potencial de crecimiento) como consecuencia de un aumento en la tasa de fotosíntesis y de la expresión de fructosa-1,6-bisfosfatasa desregulada o no regulada.

Sorprendentemente, se observó que la expresión de las proteínas utilizadas de acuerdo con la invención implica específicamente un aumento del potencial de crecimiento.

El término "aumento del potencial de crecimiento" se refiere preferiblemente a un continuo crecimiento a bajos niveles de nitrógeno, con o sin elevadas cantidades de ácido abscísico, una mejor recuperación del suelo tras la exposición a un medio bajo en nitrógeno y abundante en ácido abscísico, y a una mayor tolerancia a la variabilidad de las condiciones del nitrógeno. Preferiblemente, dicho aumento del potencial de crecimiento conlleva un incremento de la NUE.

La invención se refiere al uso de ácidos nucleicos y polipéptidos para mejorar la eficiencia en el uso del nitrógeno, de acuerdo con lo definido en las reivindicaciones.

Breve descripción de las tablas individuales

Las Tablas I-A-J aportan información acerca de cada uno de los nucleótidos, incluyendo la información relativa a la secuencia, la descripción de la función de cada secuencia y los resultados experimentales. Dicha información se presenta en los campos siguientes:

A:Número de informe. B:Esta entrada indica la ID del cDNA de Ceres y la ID del Clon Ceres. C:Esta entrada identifica una función específica que se puede modular utilizando el gen. D:Esta entrada identifica qué rasgo genético modulan el gen, sus productos genéticos y sus homólogos/ortó-logos. E:Esta entrada identifica qué sub-rasgos genéticos pueden modular el gen, sus productos genéticos y sus homólogos/ortólogos. F:Esta entrada resume la función del gen, basada en los datos de expresión y el fenotipo observado. G:Esta entrada proporciona un comentario detallado del uso del gen, en función del análisis experimental y por ordenador. H:En esta entrada se comenta el uso del gen,... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Utilización de un ácido nucleico para mejorar las características de eficiencia en el uso del nitrógeno de una planta transgénica, en comparación con una planta de tipo natural cultivada en las mismas condiciones, en la que el ácido nucleico incluye una molécula aislada de ácido nucleico que comprende:

(a) un ácido nucleico con una secuencia de nucleótido que codifique una secuencia de aminoácido que presente al menos una identidad de secuencia del 80% con la ID SEC. Nº 2;

(b) un ácido nucleico que sea un complemento de una secuencia de nucleótido de acuerdo con el párrafo (a);

en el que la secuencia del nucleótido y/o la secuencia del aminoácido desempeñan una función en la eficiencia del uso del nitrógeno.

2. Utilización de acuerdo con la reivindicación 1, en la que la molécula aislada de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 85% con la ID SEC. Nº 2.

3. Utilización de acuerdo con la reivindicación 2, en la que la molécula aislada de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 90% con la ID SEC. Nº 2.

4. Utilización de acuerdo con la reivindicación 3, en la que la molécula aislada de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 95% con la ID SEC. Nº 2.

5. Utilización de acuerdo con la reivindicación 4, en la que la molécula aislada de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 96% con la ID SEC. Nº 2.

6. Utilización de acuerdo con la reivindicación 5, en la que la molécula aislada de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 97% con la ID SEC. Nº 2.

7. Utilización de acuerdo con la reivindicación 6, en la que la molécula aislada de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 98% con la ID SEC. Nº 2.

8. Utilización de acuerdo con la reivindicación 7, en la que la molécula aislada de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 99% con la ID SEC. Nº 2.

9. Utilización de acuerdo con la reivindicación 8, en la que la molécula aislada de ácido presenta la secuencia de nucleótido de acuerdo con la ID SEC. Nº 1.

10. Utilización de acuerdo con la reivindicación 1, en la que dicha secuencia de aminoácido comprende un polipéptido acorde con la secuencia de consenso recogida en la Tabla 11-A.

11. Utilización de acuerdo con la reivindicación 1, en la que dicha secuencia de aminoácido tiene una secuencia acorde con con la ID SEC. Nº 2.

12. Utilización de un polipéptido para mejorar las características de eficiencia en el uso del nitrógeno de una planta transgénica en comparación con una planta natural cultivada en las mismas condiciones, en la que el polipéptido comprende un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 80% con la ID SEC. Nº 2.

13. Utilización de acuerdo con la reivindicación 12, en la que el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 85% con la ID SEC. Nº 2.

14. Utilización de acuerdo con la reivindicación 13, en la que el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 90% con la ID SEC. Nº 2.

15. Utilización de acuerdo con la reivindicación 14, en la que el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 90% con la ID SEC. Nº 2.

16. Utilización de acuerdo con la reivindicación 15, en la que el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 96% con la ID SEC. Nº 2.

17. Utilización de acuerdo con la reivindicación 16, en la que el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 97% con la ID SEC. Nº 2.

18. Utilización de acuerdo con la reivindicación 17, en la que el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 98% con la ID SEC. Nº 2.

19. Utilización de acuerdo con la reivindicación 18, en la que el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido que presenta al menos una identidad de secuencia del 99% con la ID SEC. Nº 2.

20. Utilización de acuerdo con la reivindicación 19, en la que el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido incluida en la ID SEC. Nº 2.


 

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